Aeglea BioTherapeutics, Inc.
Annual Report 2020

Plain-text annual report

UNITED STATES SECURITIES AND EXCHANGE COMMISSION Washington, DC 20549 FORM 10-K ☒☒ ☐☐ ANNUAL REPORT PURSUANT TO SECTION 13 OR 15(d) OF THE SECURITIES EXCHANGE ACT OF 1934 TRANSITION REPORT PURSUANT TO SECTION 13 OR 15(d) OF THE SECURITIES EXCHANGE ACT OF 1934 For the fiscal year ended December 31, 2020 For the transition period from to Commission file number 001-37722 AEGLEA BIOTHERAPEUTICS, INC. (Exact name of Registrant as specified in its charter) Delaware (State or Other Jurisdiction of Incorporation or Organization) 805 Las Cimas Parkway Suite 100 Austin, TX (Address of Principal Executive Offices) 46-4312787 (I.R.S. Employer Identification No.) 78746 (Zip Code) Registrant’s Telephone Number, including area code: (512) 942-2935 Securities registered pursuant to Section 12(b) of the Exchange Act: Title of each class Common Stock, $0.0001 Par Value Per Share Trading Symbol(s) AGLE Name of each exchange on which registered The Nasdaq Stock Market LLC (Nasdaq Global Market) Securities registered pursuant to Section 12(g) of the Exchange Act: None Indicate by check mark if the Registrant is a well-known seasoned issuer, as defined in Rule 405 of the Securities Act. Yes  ☐   No  ☒ Indicate by check mark if the Registrant is not required to file reports pursuant to Section 13 or 15(d) of the Exchange Act. Yes  ☐   No  ☒ Indicate by check mark whether the Registrant (1) has filed all reports required to be filed by Section 13 or 15(d) of the Securities Exchange Act of 1934 during the preceding 12 months (or for such shorter period that the Registrant was required to file such reports), and (2) has been subject to such filing requirements for the past 90 days. Yes  ☒   No ☐ Indicate by check mark whether the registrant has submitted electronically every Interactive Data File required to be submitted pursuant to Rule 405 of Regulation S-T (§232.405 of this chapter) during the preceding 12 months (or for such shorter period that the registrant was required to submit such files). Yes  ☒   No ☐ Indicate by check mark whether the Registrant is a large accelerated filer, an accelerated filer, a non-accelerated filer, a smaller reporting company, or an emerging growth company. See the definitions of “large accelerated filer,” “accelerated filer,” “smaller reporting company,” and “emerging growth company” in Rule 12b-2 of the Exchange Act. Large accelerated filer Non-accelerated filer ☐ ☒ Accelerated filer Smaller reporting company Emerging growth company ☐ ☒ ☒ If an emerging growth company, indicate by check mark if the registrant has elected not to use the extended transition period for complying with any new or revised financial accounting standards provided pursuant to Section 13(a) of the Exchange Act. ☒ Indicate by check mark whether the registrant has filed a report on and attestation to its management’s assessment of the effectiveness of its internal control over financial reporting under Section 404(b) of the Sarbanes-Oxley Act (15 U.S.C 7262(b)) by the registered public accounting firm that prepared or issued its audit report. ☐ Indicate by check mark whether the Registrant is a shell company (as defined in Rule 12b-2 of the Exchange Act). Yes  ☐   No ☒ The aggregate market value of the voting stock held by non-affiliates of the Registrant on June 30, 2020 (the last business day of the Registrant’s second fiscal quarter), based upon the closing price of $9.25 of the Registrant’s common stock as reported on The Nasdaq Global Market, was approximately $386.0 million. Indicate the number of shares outstanding of each of the issuer’s classes of common stock, as of the latest practicable date. Class Common stock, $0.0001 par value per share Outstanding at March 12, 2021 48,015,892 shares DOCUMENTS INCORPORATED BY REFERENCE Portions of the Registrant’s Definitive Proxy Statement (“Proxy Statement”) relating to the 2021 Annual Meeting of Stockholders will be filed with the Commission within 120 days after the end of the Registrant’s 2020 fiscal year and is incorporated by reference into Part III of this Report. TABLE OF CONTENTS                         PART I Item 1. Item 1A. Item 1B. Item 2. Item 3. Item 4. PART II Item 5. Item 6. Item 7. Item 7A. Item 8. Item 9. Item 9A. Item 9B. PART III Item 10. Item 11. Item 12. Item 13. Item 14. PART IV Item 15. Item 16. Business Risk Factors Unresolved Staff Comments Properties Legal Proceedings Mine Safety Disclosures Market for Registrant’s Common Equity, Related Stockholder Matters and Issuer Purchases of Equity Securities Selected Financial Data Management’s Discussion and Analysis of Financial Condition and Results of Operations Quantitative and Qualitative Disclosures About Market Risk Financial Statements and Supplementary Data Changes in and Disagreements with Accountants on Accounting and Financial Disclosure Controls and Procedures Other Information Directors, Executive Officers and Corporate Governance Executive Compensation Security Ownership of Certain Beneficial Owners and Management and Related Stockholder Matters Certain Relationships and Related Transactions, and Director Independence Principal Accountant Fees and Services Exhibits and Financial Statement Schedules Form 10-K Summary SIGNATURES 2 Page 4 26 72 72 72 72 73 74 75 83 84 109 109 110 111 111 111 111 111 112 114 115   NOTE ABOUT FORWARD-LOOKING STATEMENTS This Annual Report on Form 10-K, or Annual Report, contains forward-looking statements within the meaning of Section 21E of the Securities Exchange Act of 1934, as amended, or the Exchange Act, and section 27A of the Securities Act of 1933, as amended, or the Securities Act. All statements contained in this Annual Report other than statements of historical fact, including statements regarding our future results of operations and financial position, business strategy, market size, potential growth opportunities, nonclinical and clinical development activities, efficacy and safety profile of our product candidates, potential therapeutic benefits and economic value of our product candidates, use of net proceeds from our public offerings, our ability to maintain and recognize the benefits of certain designations received by product candidates, the timing and results of nonclinical studies and clinical trials, commercial collaboration with third parties, the expected impact of the COVID-19 pandemic on our operations, and the receipt and timing of potential regulatory designations, approvals and commercialization of product candidates, are forward-looking statements. The words “believe,” “may,” “will,” “potentially,” “estimate,” “continue,” “anticipate,” “predict,” “target,” “intend,” “could,” “would,” “should,” “project,” “plan,” “expect,” and similar expressions that convey uncertainty of future events or outcomes are intended to identify forward-looking statements, although not all forward-looking statements contain these identifying words. These forward-looking statements are subject to a number of risks, uncertainties and assumptions, including those described in Item 1A, “Risk Factors” and elsewhere in this Annual Report. Moreover, we operate in a very competitive and rapidly changing environment, and new risks emerge from time to time. It is not possible for our management to predict all risks, nor can we assess the impact of all factors on our business or the extent to which any factor, or combination of factors, may cause actual results to differ materially from those contained in any forward-looking statements we may make. In light of these risks, uncertainties, and assumptions, the forward-looking events and circumstances discussed in this Annual Report may not occur and actual results could differ materially and adversely from those anticipated or implied in the forward-looking statements. You should not rely upon forward-looking statements as predictions of future events. Although we believe that the expectations reflected in the forward-looking statements are reasonable, we cannot guarantee that the future results, levels of activity, performance or events and circumstances reflected in the forward-looking statements will be achieved or occur. We undertake no obligation to update publicly any forward-looking statements for any reason after the date of this report to conform these statements to actual results or to changes in our expectations, except as required by law. You should read this Annual Report with the understanding that our actual future results, levels of activity, performance and events and circumstances may be materially different from what we expect. Unless the context indicates otherwise, as used in this Annual Report, the terms “Aeglea,” “the Company,” “we,” “us,” and “our” refer to Aeglea BioTherapeutics, Inc., a Delaware corporation, and its consolidated subsidiaries taken as a whole, unless otherwise noted. “Aeglea” and all product candidate names are our common law trademarks. This Annual Report contains additional trade names, trademarks and service marks of other companies, which are the property of their respective owners. We do not intend our use or display of other companies’ trade names, trademarks or service marks to imply a relationship with, or endorsement or sponsorship of us by, these other companies. 3   ITEM 1. BUSINESS Overview PART I We are a clinical-stage biotechnology company redefining the potential of human enzyme therapeutics to benefit people with rare metabolic diseases with limited treatment options. We believe our expertise in enzyme science, bioengineering and rare disease drug development coupled with an approach focused on diseases with unmet medical needs enables us to develop medicines with the potential to transform the lives of patients and families with rare metabolic diseases. We employ a distinctive platform to fuel our innovative pipeline of human enzymes, which we believe reduces key risks throughout the development process and provides a greater likelihood of clinical success and commercial adoption. Our mission is to provide transformative therapies to patient communities who have inadequate or no therapeutic options available to address these debilitating diseases. Driven by this purpose and urgent patient need, we have taken a focused approach to the selection and development of novel assets into clinical evaluation that is guided by defined strategic considerations: Clear, urgent unmet medical need Rigorous preclinical data and strong scientific rationale Mechanistic opportunity to create or enhance enzymatic activity through novel engineering Meaningful and sustainable commercial opportunities Potential to be first in class or best in class, with little competition - - - - - Our Strategy We continually advance toward our vision to become the premier human enzyme company, dedicated to the discovery, development, and commercialization of next generation human enzyme therapeutics that address defined unmet medical needs and transform lives. With a strategic approach, we are: • • • Pursuing opportunities for novel human enzyme-based therapeutics in areas where regulation of abnormal metabolism may deliver meaningful medical benefits. Our focus is on rare metabolic diseases where there is a plausible link between disease development, progression, and metabolite levels including amino acids, opening an opportunity for novel engineered enzyme therapeutics. Grounded by our enzyme expertise, we purposefully select programs to advance into clinical development based on strong biological rationale and robust preclinical evidence where potential therapy can transform patient outcomes. Implementing patient identification strategies to increase the probability of clinical success. An integral part of our product development approach is to identify patient populations with the greatest potential to benefit from our metabolism focused approaches. This strategy is focused on identifying misdiagnosed and undiagnosed patients. For example, in the United States, we are actively pursuing avenues to improve disease state awareness and diagnosis of Arginase 1 Deficiency. Progressing our most advanced product candidates, pegzilarginase and AGLE-177, through clinical development and into commercialization. We believe pegzilarginase is the only therapeutic in clinical development that addresses the underlying drivers of disease progression for the treatment of Arginase 1 Deficiency. Pegzilarginase is currently being evaluated in two ongoing clinical trials for Arginase 1 Deficiency, consisting of the global pivotal Phase 3 PEACE (Pegzilarginase Effect on Arginase 1 Deficiency Clinical Endpoints) trial and our open label extension study. The PEACE trial is a single, global pivotal trial with a primary endpoint of plasma arginine reduction and secondary endpoints including clinical outcome assessments focused primarily on mobility, in addition to safety and pharmacokinetics. As of mid-March 2021, 24 patients have been enrolled and randomized in the PEACE trial, with an additional nine patients in active screening or scheduled to begin screening in the next two weeks. 4                 Trial enrollment is expected to close in March 2021, with completion of screening and all patients randomized by the end of April 2021. Topline data is expected from the trial in the fourth quarter of 2021. We believe AGLE-177 has the potential to be the first approved therapy that addresses the underlying drivers of disease progression for the treatment of Homocystinuria due to cystathionine β-synthase (CBS) deficiency, also known as Classical Homocystinuria. In the second quarter of 2020, we initiated a Phase 1/2 clinical trial to assess the safety and efficacy of AGLE-177 in patients with CBS deficiency. Dosing of the first patient is still pending given current COVID-19 restrictions at planned clinical trial sites. • Concurrently developing multiple product candidates with the goal of approval and commercialization in the US and internationally. We are building a diversified portfolio with multiple human enzyme therapeutic candidates, with complementary opportunities to evaluate enzyme solutions for patient communities with few options today. With this multi-asset strategy, we are leveraging organizational efficiencies and economies of scale, and are investing in our internal research, development, and commercialization capabilities to continually enrich our portfolio. In developing programs for diseases with substantial unmet medical need, we seek opportunities with meaningful commercial potential and with limited or no current competition. We retain worldwide intellectual property rights to all our product candidates and intend to pursue clinical and regulatory programs for approval in the United States and internationally. Over time, we intend to establish a multi-country commercial organization in rare genetic diseases with commercial partnerships in select regions. Our Focus—Enzyme-based Therapeutic Opportunities We leverage our enzyme engineering capabilities to focus on developing therapeutics to treat diseases with abnormally high levels of metabolites. Many of these diseases arise due to genetic mutations causing abnormal metabolism. Metabolism refers to a network of life sustaining chemical reactions in the body. Metabolism follows specific pathways that are comprised of various biochemical reactions generally catalyzed by proteins known as enzymes. Enzymes accelerate complex reactions and serve as key regulators of metabolic pathways by responding to changes in the cell’s environment or signals from other cells. An in-depth understanding of abnormal metabolic pathways is crucial to developing therapies that may address various disease states, including rare metabolic diseases. Our differentiated protein engineering expertise has allowed us to develop a new generation of human enzyme therapies enhancing specific properties of existing enzymes or generating enzymes with novel activity. By leveraging engineered human enzymes to reduce harmful levels of metabolites, including amino acids, we believe we can deliver transformative therapeutics for multiple diseases where enzyme approaches have not previously been considered. Understanding Rare Metabolic Disease and Arginase 1 Deficiency The incidence of a single metabolic abnormality typically occurs in fewer than one per 100,000 live births. While rare, most of these diseases have severe or life-threatening characteristics and many metabolic abnormalities are likely to be under-diagnosed. Current treatment options for these disorders are limited. While diet modification or nutrient supplementation can provide some benefit to patients, several metabolic abnormalities have been treated successfully with enzyme therapy. We are targeting Arginase 1 Deficiency with our lead product candidate, pegzilarginase. Arginase 1 Deficiency is a serious progressive disease with significant morbidity and early mortality. This disease is caused by deficiency of a key arginine metabolizing enzyme. This leads to two important harmful metabolic effects: (1) the accumulation of high levels of arginine and other arginine derived metabolites, and (2) an impairment of the urea cycle which leads to elevation of ammonia levels, especially at times of stress. The high plasma arginine level is believed to be the key driver of the spasticity, developmental delays, and seizures that develop in early childhood and progress over time. The impairment of the urea cycle also means that these patients are at risk of episodic and sometimes persistent hyperammonemia, which causes irritability, nausea, and vomiting with potential to progress to brain swelling, encephalopathy, reduced life expectancy, and death. There are currently no effective treatment options or approved therapeutic agents specifically indicated for Arginase 1 Deficiency that treat the underlying cause of this disease. Current disease management practice includes a medical diet with protein restriction, ammonia scavengers, and adjustments to essential amino acids. Medical literature suggests that 5   disease progression can be slowed with strict adherence to dietary protein restriction, which often includes the use of specially formulated supplements. Such dietary modification has been shown to partially reduce plasma arginine levels, but generally does not consistently reach the range stipulated by medical guidelines. Therefore, this disease management approach is generally inadequate to treat the majority of patients, unpalatable, and difficult to manage. Ammonia-scavenging drugs such as RAVICTI (glycerol phenylbutyrate) and BUPHENYL (sodium phenylbutyrate) are used to manage elevated ammonia levels. In some cases, liver transplantation has been utilized to treat Arginase 1 Deficiency; however, this intervention is available only to a small fraction of patients and carries significant procedural risk. The lack of effective treatment options that directly address the cause of Arginase 1 Deficiency supports the need for a therapy that manages the harmful metabolic effects caused by accumulation of high levels of arginine and other arginine-derived metabolites (also referred to as guanidino compounds). The development of an arginine-reducing therapeutic introduced early in a patient’s life could potentially minimize the exposure to the neurotoxic effects of elevated arginine and its metabolites, as well as potentially enabling improved protein intake. Reduction and maintenance of plasma arginine levels to within levels recommended by medical guidance for an extended period during the pegzilarginase dosing schedule has the potential to slow or halt the progression of the disease, thereby offering the potential for more normal growth and development in these patients. Arginase 1 Deficiency is a rare disorder, and disease prevalence has not been well established in the medical literature. Based on a genetic prevalence analysis commissioned by us, we estimate that the Arginase 1 Deficiency population is greater than 2,500 patients in the global addressable markets. The genetic prevalence-based methodology has the ability to account for misdiagnosis of the disease and to address limitations in newborn screening methodology, including naturally low arginine levels in newborns and lack of geographic availability or standardization of testing. Presently, only 34 U.S. states and jurisdictions screen for Arginase 1 Deficiency, and screening in Europe is not universal. Because the manifestations of Arginase 1 Deficiency may overlap with other disorders such as hereditary spastic paraplegia, cerebral palsy or epilepsy, the prevalence of Arginase 1 Deficiency may be underestimated in regions that do not mandate newborn screening for this disease. As of January 2021, we have identified over 300 patients in addressable markets, primarily in the U.S. and Europe. In the U.S. we have identified approximately 160 patients, representing approximately 65% of the estimated genetic prevalence population in the U.S. Understanding Homocystinuria Homocystinuria is an inherited disorder of methionine metabolism that results in elevated homocysteine and homocystine, or tHcy, in plasma and urine. This leads to a broad range of serious consequences with irreversible morbidity due to lens dislocation, skeletal abnormality, vascular complication and intellectual dysfunction, as well as reduced life expectancy. CBS deficiency is the most common form of the disease with over 160 genetic mutations identified. These mutations adversely impact CBS enzyme activity to a variable degree impacting the level of tHcy and the response to some treatments. The goal of treatment for Homocystinuria due to CBS deficiency is to maintain consistent plasma tHcy levels below the currently defined biochemical targets. Current disease management is lifelong and includes dietary protein (methionine) restriction with amino acid replacement either alone or with pyridoxine (vitamin B6), and betaine supplementation, which is generally insufficient to effectively control all but the mildest form of the disease. As is the case with other medical diets, adherence is challenging and nutrient supplementation is often necessary to prevent deficiencies that arise from a lack of normal natural dietary protein intake. Some CBS deficient patients respond to very high doses of pyridoxine (vitamin B6) resulting in decreases of methionine and homocysteine and are considered B6 responsive. However, many patients are unable to achieve target levels of tHcy through diet and/or pyridoxine alone and thus betaine is recommended as an adjunctive treatment. Although considered to be generally well tolerated, some subjects dislike the taste and/or fishy odor, and often large doses are required, both of which may lead to poor compliance. Additionally, there is a risk of hypermethioninemia and cerebral edema has been reported. The natural history of CBS deficiency is understood and documented in the medical literature. Due to the variability of effect of different mutations and response to treatment, some subjects have severe childhood-onset multisystem disease, while others may be asymptomatic into adulthood, likewise the spectrum and severity of disease is also variable. Patients can present with Homocystinuria in childhood with a significant event, such as thrombosis, ocular lens dislocation, severe myopia, skeletal fracture, and/or other manifestations such as developmental delay or cognitive impairment. In adulthood, the most common presentation is with a thrombotic event. Untreated, the disease results in higher mortality, with B6 non-responsive patients having a 23% mortality by the age of 30. Medical literature has reported that outcomes are better in patients with lower tHcy with fewer complications and improved intellectual function. While no 6 long-term prospective data exists, recent guidelines based on expert review recommend a target tHcy of less than 100 micromolar, or µM, for those that are unresponsive to pyridoxine, although some physicians aim for even lower targets with a combination approach. There is a significant unmet need for patients in whom tHcy levels remain high, increasing the risk of complications. In addition, many patients find compliance with diet to be restrictive and cannot maintain tHcy levels within the target range. The lack of effective interventions to directly address the consequences of CBS deficiency support the need for a therapy to reduce the harmful effects of persistently raised tHcy. The introduction of a tHcy reducing therapeutic could ultimately prevent major thrombotic, ocular and skeletal complications, offering the potential to reduce morbidity and mortality in these patients. While newborn screening is universally implemented in the U.S. (and widely available elsewhere), for technical reasons it only detects a proportion of cases. We conducted an analysis of published literature and other data sources to assess the estimated prevalence of Homocystinuria and determined the population may exceed 30,000 patients, including B6 responsive and B6-non-responsive patients, with approximately 15,000 to 18,000 estimated B6-non-responsive patients in the global addressable markets and approximately 6,000 to 6,600 estimated B6-non-responsive patients in the key commercial markets of the United States, France, Germany, Italy, Spain, and the United Kingdom. Impacts of the COVID-19 Pandemic The extent of the impact of COVID-19 on our operational and financial performance will depend on certain developments, including the duration and spread of the outbreak, impact on our clinical studies, employee or industry events, and effect on our suppliers and manufacturers, all of which are uncertain and cannot be predicted. The COVID-19 pandemic and its adverse effects have become more prevalent in the locations where we, our CROs, suppliers or third-party business partners conduct business and as a result, we have experienced disruptions and may continue to experience more pronounced disruptions in our operations. With respect to our clinical trials, we have had patients miss scheduled dosings and experienced delays in enrollment. We may continue to experience such delays as well as delays in distribution of clinical trial materials, study monitoring and data analysis that could materially adversely impact our business, results of operations and overall financial performance in future periods. Specifically, we have experienced and expect to continue to experience impact from changes in how we and companies worldwide conduct business due to the COVID-19 pandemic, including but not limited to restrictions on travel and in-person meetings, delays in site activations and enrollment of clinical trials, and prioritization of hospital resources toward pandemic effort. We may also experience delays in review by the FDA and comparable foreign regulatory agencies, and disruptions in our supply chain for our product candidates. As of the filing date of this Annual Report on Form 10-K, the extent to which COVID-19 may impact our financial condition, results of operations or guidance is uncertain. The effect of the COVID-19 pandemic will not be fully reflected in our results of operations and overall financial performance until future periods. See Risk Factors for further discussion of the possible impact of the COVID-19 pandemic on our business. 7 Our Development Programs The following summarizes our most advanced product candidates, each of which is described in further detail below. Pegzilarginase in Arginase 1 Deficiency Overview: Our lead product candidate, pegzilarginase, is a recombinant human Arginase 1 that enzymatically degrades the amino acid arginine. We engineered pegzilarginase with modifications that enhance the stability and arginine-degrading activity of the enzyme in human plasma. For Arginase 1 Deficiency, which is a rare progressive disease, we believe pegzilarginase may reduce the harmful effects caused by the accumulation of high levels of arginine and other arginine-derived metabolites. PEACE - Global Pivotal Phase 3 Study of Pegzilarginase in Patients with Arginase 1 Deficiency: We are currently conducting our Phase 3 PEACE trial to evaluate the safety and efficacy of pegzilarginase. The trial is believed to be the first-ever investigative therapy that directly addresses the high arginine levels that are believed to be the key drivers of this devastating disease for patients with Arginase 1 Deficiency. We designed the PEACE trial based on input from the FDA and EMA. As of mid-March 2021, 24 patients have been enrolled and randomized in the Phase 3 PEACE trial, with an additional nine patients in active screening or scheduled to begin screening in the next two weeks. Trial enrollment is expected to close in March 2021, with completion of screening and all patients randomized by the end of April 2021. Topline data is expected from the trial in the fourth quarter of 2021. PEACE is a single, global, randomized, double-blind, placebo-controlled trial designed to assess the effects of treatment with pegzilarginase versus placebo over 24 weeks with a primary endpoint of statistically significant plasma arginine reduction from baseline. The primary endpoint assesses the effectiveness of pegzilarginase in lowering plasma arginine levels given the evidence that plasma arginine control has the potential to improve the clinical status and slow disease progression in patients with Arginase 1 Deficiency. Secondary endpoints will include clinical outcome assessments focused primarily on mobility, in addition to safety and pharmacokinetics. The pivotal trial will span 7 countries and 31 clinical sites. Upon completion of the 24-week treatment period, patients may participate in a long-term extension study of pegzilarginase. The FDA and EMA indicated that data from this Phase 3 PEACE trial showing plasma arginine reduction in conjunction with improvements in clinically meaningful aspects of the disease may be sufficient to support a marketing application for pegzilarginase in Arginase 1 Deficiency. We plan to enroll approximately 30 (pediatric and adult) patients with Arginase 1 Deficiency. Patients enrolled in the trial are randomized on a two-to-one basis to receive weekly infusions of pegzilarginase (0.1 mg/kg), or placebo for the double-blind treatment period of 24 weeks. Dose adjustments during this period can be made to optimize plasma arginine control for levels outside the range of 50 to 150 µM. Patients will be considered eligible for the Phase 3 PEACE trial during screening if they exhibit average plasma arginine levels of greater than 250 µM, are greater than two years of age and have a deficit in at least one dimension of mobility. All assessments and dose adjustments will be conducted in a blinded fashion at pre-specified intervals. Patients will remain on current disease management for the duration of the Phase 3 PEACE trial. 8   In addition to the primary endpoint of plasma arginine reduction, secondary endpoints in the Phase 3 PEACE trial will evaluate pegzilarginase relative to placebo through a multi-dimensional assessment of clinical response. While the overall design of the trial remains unchanged, based on ongoing dialog with the regulatory authorities we recently updated our statistical analysis plan for the Phase 3 PEACE trial to refine the analysis of the clinical secondary endpoints for the comparison of pegzilarginase to placebo. The statistical analysis plan updates include revising the analysis of the key secondary objective as continuous, rather than categorical, variables and refining the key clinical outcome assessment to focus on 2 Minute Walk Test or Gross Motor Function Measure E (walking, running, and jumping) as components of the key clinical outcome assessment. Other secondary endpoints include the proportion of patients able to achieve specific levels of plasma arginine, additional assessments of mobility, and changes in adaptive behavior. Phase 1/2 Open Label Study of Pegzilarginase in Patients with Arginase 1 Deficiency: We completed a Phase 1/2 clinical trial for the treatment of patients with Arginase 1 Deficiency to assess the safety and clinical activity of pegzilarginase. The Phase 1/2, multi-center, single-arm, open label trial of pegzilarginase enrolled 16 adult and pediatric patients with Arginase 1 Deficiency on background therapy in the United States, Canada, and Europe, exceeding the initial target of 10 patients. The Phase 1/2 dosing was completed in February 2019, with 14 patients completing 8 weeks of repeat dosing. The trial investigated both single ascending doses and repeated dosing. The primary endpoint of the trial was safety and tolerability of intravenous administration of pegzilarginase in patients with Arginase 1 Deficiency. The trial also evaluated the pharmacokinetic and pharmacodynamic effects of repeated doses of pegzilarginase on plasma arginine levels. Additionally, patients who completed the repeat dose part of the Phase 1/2 trial were eligible to enroll in a long-term open label extension study, with 14 out of 14 patients that completed the Phase 1/2 trial enrolling into the extension study.   Phase 2 Open Label Extension Study to Evaluate the Long-Term Safety, Tolerability and Effects of Pegzilarginase in Patients with Arginase 1 Deficiency Who Received Treatment in a Previous Study: After completing the repeat dose portion of the Phase 1/2 study and at least four weeks of post-treatment observation, patients were allowed to continue treatment with pegzilarginase, including subcutaneous administration, by enrolling in a long-term open label extension study. This study is expected to provide important insights into the longer-term clinical effects of reducing plasma arginine. We announced 20-week and 56-week data on 14 and 13 patients, respectively, from our completed Phase 1/2 trial and ongoing Phase 2 open-label extension trial for pegzilarginase in patients with Arginase 1 Deficiency. In each of the interim data announcements, we reported all patients continued to demonstrate marked and sustained reductions in plasma arginine following 20-weeks and 56-weeks of pegzilarginase administration and 79% (11 of 14) and 85% (11 of 13) of patients were clinical responders, respectively, based on a clinical meaningful improvement in one or more of three complementary mobility assessments. For the 6 Minute Walk Test, the mean change from baseline at the 56-week analyses was 45 meters. For Gross Motor Function Measure E, the mean change from baseline at the 56-week analyses was 6 units. When analyzing the subset of patients who had a baseline deficit (equal to seven patients), the mean change for Gross Motor Function Measure E was 9 units. Pegzilarginase was well tolerated and the rates of treatment-related adverse events decreased over time. Serious adverse events included hypersensitivity and hyperammonemia, which were infrequent, expected, and managed with standard treatment and did not lead to any patient discontinuations. As of September 2020, all 13 eligible patients from our ongoing Phase 2 open-label extension trial for pegzilarginase in patients with Arginase 1 Deficiency had been switched to, and remained on, subcutaneously (sc) dosed pegzilarginase, with no patient discontinuations through the announcement date. Administration of pegzilarginase by the subcutaneous route was shown to control plasma arginine levels and was generally well tolerated, with only six mild injection site reactions related to pegzilarginase following more than 850 injections. We are evaluating the pegzilarginase (sc) route of administration in our Phase 2 open-label extension trial and will review data to determine the best path for selecting the preferred route(s) of administration for our biologics license application, or BLA, submission. Regulatory Designations: We have obtained Orphan Drug Designation from the FDA and EMA, as well as Fast Track and Breakthrough Therapy Designations from the FDA, for pegzilarginase for the treatment of patients with Arginase 1 Deficiency. In addition, the FDA granted a Rare Pediatric Disease designation for pegzilarginase for the treatment of Arginase 1 Deficiency. This designation by the FDA confirms our eligibility to receive a Rare Pediatric Disease priority review voucher upon approval of a qualifying BLA for pegzilarginase if approved before October 1, 2026. Given recent developments relating to the COVID-19 global pandemic, we have been taking steps to minimize potential impacts of COVID-19 related disruptions on our Phase 3 PEACE trial. The trial protocol allows for a patient to miss a few dosing appointments without being disqualified from the trial, but an excessive number of missed doses may adversely affect the usefulness of the data collected in the trial or require us to exclude a subject from the per protocol analysis. All patients that had initially paused dosing due to COVID-19 had restarted treatment by September 2020. However, patients may miss dosing appointments in the future, whether due to COVID-19 or other reasons. We have not currently experienced significant impact on our supply chain and we currently have sufficient supply available for completion of our ongoing clinical trials. 9 Patient screening has been impacted by COVID-19, and there is uncertainty as to the cadence of screenings as sites are impacted by COVID-19 related restrictions, including staff members contracting COVID-19 and limiting operations. Trial enrollment is expected to close in March 2021, with completion of screening and all patients randomized by the end of April 2021. Topline data is expected from the trial in the fourth quarter of 2021. AGLE-177 in Homocystinuria Overview: Our product candidate, AGLE-177, is a novel PEGylated, or polyethylene glycol modified, human enzyme engineered to degrade free homocysteine and homocystine. We engineered AGLE-177 by directed mutagenesis of amino acid residues within the active site of human cystathionine γ-lyase, resulting in a molecule that has high substrate specificity for homocysteine and homocystine but not for the native substrate, cystathionine. For Classical Homocystinuria patients, we believe AGLE-177 may ameliorate the adverse impact of CBS enzyme deficiency in the transsulfuration pathway by providing an alternate pathway for enzymatic degradation of high plasma total homocysteine levels. Phase 1/2 Open Label Study of AGLE-177 in Patients with Homocystinuria: We initiated a Phase 1/2 clinical trial for the treatment of patients with Homocystinuria to assess the safety and clinical activity of AGLE-177, however, timing of the first patient dosing will depend on determinations by individual sites given COVID-19 and our priorities at this time are to avoid further overburdening hospital staff and to minimize the risk of trial participants exposure to COVID-19. The primary objective of the trial is to evaluate the safety and tolerability of AGLE-177 in subjects with Homocystinuria due to CBS deficiency. As a secondary objective, the trial will also characterize the pharmacokinetics and pharmacodynamics relationship of AGLE-177 after single and multiple doses following intravenous and subcutaneous administration, as well as the magnitude of change in plasma tHcy. We plan to enroll 16 to 20 patients with Homocystinuria in the Phase 1/2 clinical trial with sites located in the United Kingdom and Australia. Patients will be dosed weekly for four weeks. Regulatory Designations: We have obtained Orphan Drug Designation from the FDA and EMA for AGLE-177 for the treatment of patients with Homocystinuria. In addition, the FDA granted a Rare Pediatric Disease designation for AGLE-177 for the treatment of Homocystinuria. This designation by the FDA confirms our eligibility to receive a Rare Pediatric Disease priority review voucher upon approval of a qualifying BLA for AGLE-177 if approved before October 1, 2026. Preclinical Pipeline Cystinuria Program Cystinuria is a rare genetic disease characterized by frequent and recurrent kidney stone formation requiring multiple procedural interventions, and by an increased risk of chronic kidney disease. Cystinuria occurs due to genetic mutations in amino acid transporters that lead to increased amounts of cystine in the urine. This results in high cystine concentrations in the urine and formation of kidney stones. As such, we engineered our Cystinuria program candidate to reduce plasma cystine and cysteine levels with accompanying reductions in urine cystine concentrations as an approach to inhibit both cystine crystal and kidney stone formation. We have presented data on an early lead molecule from our Cystinuria program demonstrating reductions in plasma and urine cystine levels, accompanied by reduced kidney stone formation in a preclinical model of Cystinuria. In alignment with our strategy of having rigorous preclinical data prior to advancing candidates to clinical evaluation, we continue preclinical work in support of the Cystinuria program. Due to the impact of COVID-19 on laboratory work schedules, we have not provided a timeline for advancement of a therapeutic candidate into the clinic. Research Programs A significant number of metabolic diseases remain without an effective treatment. Our in-house team of scientists and clinicians assess whether human enzymes are available to decrease the potential disease promoting metabolites in diseases with unmet medical need. If a human enzyme is not available, our team of protein engineers will introduce changes into alternative human enzyme to alter their specificity for the proposed disease-causing metabolite. The generation of lead molecules using this approach enables us to investigate the preclinical impact of these molecules in animal models of the disease, and with supporting positive data, additional engineering may be performed to ensure the clinical candidate meets manufacturing requirements and has characteristics that are compatible with the patient needs. Intellectual Property Our success depends in part on our ability to obtain and maintain patents and other forms of intellectual property rights, including in-licenses of intellectual property rights of others, for our product candidates, methods used to manufacture our product candidates and methods for treating patients using our product candidates, as well as our ability 10 to preserve our trade secrets, to prevent third parties from infringing upon our proprietary rights and to operate without infringing upon the proprietary rights of others. Patents We own three granted US Patents directed towards compositions of pegzilarginase as well as to various mutations in the arginase 1 amino acid sequence. These patents will expire in 2029 in the absence of any patent term extension. There are also granted patents directed towards the composition of pegzilarginase in Europe and Japan, as well as pending patent applications in the US, Europe and Canada.  We also own a pending US application and pending foreign counterpart applications directed towards the use of pegzilarginase in the treatment of arginase 1 deficiency. Any patents that issue from these US or PCT applications will expire in 2038, absent any patent term adjustment or patent term extension. We further own a granted US patent and pending US and foreign counterpart applications directed towards the use of pegzilarginase in the treatment of cancer. This patent and any further patents that issue from these applications will expire in 2037, absent any patent term adjustment or patent term extension. We also own a pending US application, a pending Taiwanese application and a pending PCT application directed towards the manufacturing of pegzilarginase, and any patents that issue from these applications will expire in 2040, absent any patent term adjustment or patent term extension. We are the exclusive licensee of a US application and pending foreign counterpart applications directed towards the AGLE-177 program which covers recombinant human enzymes that degrade the amino acid homocysteine and homocystine. Any patents that issue from these applications will expire in 2038 absent any patent term adjustment or patent term extension. We also are the exclusive licensee of US patents and applications, as well as foreign counterpart patents and applications, directed towards modified cystathionine-γ- lyase (CGL) enzymes with activity to degrade plasma cystine and cysteine and the use thereof. These patents and any further patents issued from these applications will expire variously in 2036, 2037 and 2038, absent any patent term adjustment or patent term extension. We are also the exclusive licensee of US patents and foreign counterpart patents and applications directed towards modified cystathionine-y-lyase (CGL) enzymes with activity to degrade the amino acid methionine. These patents and any further patents that issue from these applications will expire in 2034, absent any patent term adjustment or patent term extension. We also license a PCT patent application directed to the Cystinuria program which covers novel recombinant human enzymes that degrade plasma cystine and cysteine, and any patents that issue from this PCT application will expire in 2039 absent any patent term adjustment or patent term extension. We also license patents that cover engineered human enzymes that target the degradation of the amino acid methionine. We own four granted US patents and pending US and foreign patent applications directed towards the compositions of the methioninase. These patents and any further patents that issue from these applications will expire in 2031, absent any patent term adjustment or patent term extension. We aim to take advantage of all of the intellectual property rights that are available to us and believe that this comprehensive approach will provide us with proprietary positions for our product candidates, where available. Patents may extend for varying periods according to the date of patent filing or grant and the legal term of patents in various countries where patent protection is obtained. The actual protection afforded by a patent, which can vary from country to country, depends on the type of patent, the scope of its coverage and the availability of legal remedies in the country. We also protect our proprietary information by requiring our employees, consultants, contractors and other advisors to execute nondisclosure and assignment of invention agreements upon commencement of their respective employment or engagement. In addition, we also require confidentiality or service agreements from third parties that receive our confidential information or materials. Licensing In December 2013, our wholly owned subsidiaries AECase, Inc. and AEMase, Inc. each entered into an exclusive, worldwide license agreement, including the right to grant sublicenses, with the University of Texas at Austin, or the University, for certain intellectual property owned by the University related to cystinase and methioninase. In January 2017, we and the University entered into an Amended and Restated Patent License Agreement, or the Restated License, which consolidated the two license agreements, revised certain obligations, and licensed additional patent applications and invention disclosures to us. The Restated License was amended in August 2017, December 2017, and December 2018 to revise diligence milestones and license additional patent applications, including our program candidates under the AGLE177 and Cystinuria programs. With respect to each program candidate covered by the Restated License, we could be required to pay the University up to $6.4 million in milestone payments based on the achievement of certain development milestones, 11 including clinical trials and regulatory approvals, the majority of which are due upon the achievement of later development milestones, including a $5.0 million payment due on regulatory approval of a product and a $0.5 million payment payable on final regulatory approval of a product for a second indication. In addition, we are required to pay the University a low single digit royalty on worldwide-net sales of products covered under the Restated License, together with a revenue share on non-royalty consideration received from sublicensees. The rate of the revenue share ranges from 6.5% to 25%, depending on the date the sublicense agreement is signed. The term of the Restated License continues until the expiration of the last to expire of the patents licensed thereunder. The University may terminate the agreement under certain circumstances, including for a breach by us that is not cured within 30 or 60 days of notice (depending on the type of breach), or if we or any of our affiliates or sublicensees participate in any proceeding to challenge the licensed patent rights (unless, with respect to sublicensees, we terminate the applicable sublicense). As of December 31, 2020, we have paid $0.2 million under these license agreements. Grant Agreement In June 2015, we entered into a Cancer Research Grant Contract, or the Grant Contract, with the Cancer Prevention and Research Institute of Texas, or CPRIT, under which CPRIT awarded us a grant not to exceed $19.8 million to be used to develop novel cancer treatments by exploiting the unique metabolism of cancer cells. The contract ended in May 2018 with the full $19.8 million in grant proceeds collected and recognized as revenue under the Grant Contract. Pursuant to the Grant Contract, we granted to CPRIT a non-exclusive, irrevocable, royalty-free, perpetual, worldwide license to any technology and intellectual property resulting from the grant-funded activities and any other intellectual property that is owned by us and necessary for the exploitation of the technology and intellectual property resulting from the grant-funded activities, or the Project Results, for and on behalf of CPRIT and other governmental entities and agencies of the State of Texas and private or independent institutions of higher education located in Texas for education, research and other non-commercial purposes only. The terms of the Grant Contract require that we pay tiered royalties in the low- to mid-single digit percentages on revenues from sales and licenses of products or services that are based upon, utilize, are developed from or materially incorporate Project Results. Such royalties reduced to less than one percent after a mid-single-digit multiple of the grant funds have been repaid to CPRIT in royalties. Such royalties are payable for so long as we have marketing exclusivity or patents covering the applicable product or service (or twelve years from first commercial sale of such product or service in certain countries if there is no such exclusivity or patent protection). If we abandon patent applications or patents covering Project Results in certain major market countries, CPRIT can, at its own cost, take over the prosecution and maintenance of such patents and is granted a non-exclusive, irrevocable, royalty-free, perpetual license with right to sublicense in such country to the applicable Project Results. We are required to use diligent and commercially reasonable efforts to commercialize at least one commercial product or service or otherwise bring to practical application the Project Results. If CPRIT notifies us of our failure with respect to the foregoing, and such failure is not owing to material safety concerns, then, at CPRIT’s option, the applicable Project Results would be transferred to CPRIT and CPRIT would be granted a non-exclusive license to any other intellectual property that is owned by us and necessary for the exploitation of the Project Results, and CPRIT, at its own cost, can commercialize products or services that are based upon, utilize, are developed from or materially incorporate Project Results. CPRIT’s option is subject to our ability to cure any failures identified by CPRIT within 60 days and a requirement to negotiate in good faith with us with respect to an alternative commercialization strategy for a period of 180 days. Competition While we believe that our expertise in enzyme science, bioengineering, and rare disease drug development provide us with competitive advantages, we face potential competition from many different sources, including major pharmaceutical companies, specialty pharmaceutical companies, biotechnology companies, and ultimately biosimilar and generic drug companies. Recent advances in gene-based medicine, such as gene therapy have resulted in market approvals of DNA and RNA-based therapeutics in certain rare genetic diseases. However, no gene therapy drugs have yet to demonstrate clinical success in the type of complex diseases targeted by our research approach with novel enzyme therapeutics. Any product candidates that we successfully develop and commercialize will compete with existing therapies and new therapies that may become available in the future. The acquisition or licensing of pharmaceutical products is also very competitive, and a number of more established companies, which have acknowledged strategies to license or acquire products, may have competitive advantages as may other emerging companies taking similar or different approaches to product acquisitions. These established companies may have a competitive advantage over us due to their size, cash flows, and institutional experience. We compete in the segments of the pharmaceutical, biotechnology and other related markets that address rare genetic disease. 12 With respect to pegzilarginase for Arginase 1 Deficiency, there are currently no effective treatment options or approved therapeutics agents that address the underlying cause of the disease and we are not aware of any other therapeutics that do so in clinical development. It is possible that competitors may produce, develop, and commercialize therapeutics, or utilize other approaches to treat Arginase 1 Deficiency. The current disease management practice for patients with Arginase 1 Deficiency includes dietary protein restriction, essential amino acid supplementation, and ammonia scavengers. The dietary restrictions and amino acid supplementation are intended to reduce plasma arginine levels, while ammonia scavengers (such as Horizon Therapeutics’ RAVICTI (glycerol phenylbutyrate) and BUPHENYL (sodium phenylbutyrate)) are used to manage elevated ammonia levels in patients with urea cycle disorders. From a clinical development perspective, Acer Therapeutics Inc. is developing a taste-masked, immediate-release formulation of sodium phenylbutyrate for the treatment of hyperammonemia, and they recently announced their intent to enter a worldwide development and commercialization agreement with Relief Therapeutics Holding AG. A small number of companies have an interest in the role of arginine depletion in other therapeutic areas, but we are not aware of any active preclinical or clinical development activities in Arginase 1 Deficiency. In the oncology field, Polaris Group has conducted numerous clinical trials of ADI-PEG 20, an enzyme derived from mycoplasma, and Athenex has conducted preclinical research with PT01, a PEGylated genetically modified human arginase enzyme, in numerous tumor models. With respect to AGLE-177 for Homocystinuria, there is currently one FDA-approved prescription therapy for the treatment of Homocystinuria and several medical foods for the dietary management of individuals with Homocystinuria. The primary treatment goal in patients with Homocystinuria is to maintain consistent plasma tHcy levels below the currently defined biochemical targets. Current disease management practice for the majority of Homocystinuria patients consists of dietary restriction, vitamin B6, B12, folate supplementation, medical foods, and betaine. CYSTADANE® (betaine anhydrous for oral solution) was approved by the FDA in 1986 for the treatment of Homocystinuria, and Recordati Rare Diseases Inc. currently own the North American marketing rights to this product. Medical foods are manufactured by Breckenridge Pharmaceutical, Inc. and Upsher-Smith Laboratories, LLC. We are also aware of a limited number of investigational therapies for the treatment of Homocystinuria. Travere Therapeutics Inc. recently acquired Orphan Technologies Ltd., a clinical-stage biopharmaceutical company focused on the development of OT-58 (now TVT-058) for the treatment of Classical Homocystinuria. Travere is enrolling a Phase 1/2 study of TVT-058, an enzyme replacement therapy in patients with Homocystinuria due to cystathionine β-synthase deficiency and has stated that topline data from this study will be available in 2021. Additionally, Erytech Pharma SA has a product candidate for Homocystinuria in preclinical development. It is possible that competitors may produce, develop, and commercialize therapeutics, or utilize other approaches to treat Homocystinuria. Many of our competitors may have significantly greater financial resources and expertise in research and development, manufacturing, nonclinical testing, conducting clinical trials, obtaining regulatory approvals and marketing approved medicines than we do. Mergers and acquisitions in the pharmaceutical and biotechnology industries may result in even more resources being concentrated among a smaller number of our competitors. These competitors also compete with us in recruiting and retaining qualified scientific and management personnel and establishing clinical trial sites and patient registration for clinical trials, as well as in acquiring technologies complementary to, or necessary for, our programs. Smaller or early stage companies may also prove to be significant competitors, particularly through collaborative arrangements with large and established companies. The key competitive factors affecting the success of all of our product candidates, if approved, are likely to be their efficacy, safety, convenience, price, the effectiveness of assays or tests that are essential to identifying an appropriate patient population, which we refer to as diagnostics, in guiding the use of related therapeutics, the level of biosimilar competition and the availability of reimbursement from government and other third-party payors. Manufacturing We currently contract with third parties for the process development, manufacturing, and testing of our product candidates for nonclinical and clinical studies and intend to do so for future studies as well. We may qualify additional manufacturers to provide potential alternative sources for the drug substance and fill-and-finish services for pegzilarginase, AGLE- 177, and other pipeline candidates as the compounds progress through clinical development. We believe we have sufficient supplies of pegzilarginase for our ongoing Phase 3 pivotal trial in conjunction with the open label extension study for the treatment of patients with Arginase 1 Deficiency and sufficient supplies of AGLE-177 for our planned Phase 1/2 clinical trial for the treatment of patients with Homocystinuria. The Diosynth Agreement In November 2018, we entered into a master services agreement (Diosynth Agreement) with Fujifilm Diosynth Biotechnologies UK Limited, Fujifilm Diosynth Biotechnologies Texas, LLC, and Fujifilm Diosynth Biotechnologies U.S.A., Inc. (collectively, Fujifilm).  Under the Diosynth Agreement, Fujifilm provides research, development, testing and 13 manufacturing services of certain of our products, which are or will be designated as programs pursuant to scope of work agreements. The fees for such services are or will be set out in each scope of work agreement. We may pay additional fees in consideration of certain research and development and technical consultancy services in relation to the procurement, testing and management of consumables, subcontracted work (including delivery of material to and from such subcontractors), process-specific equipment (including installation and qualification thereof), modifications and special waste. Either party may terminate the Diosynth Agreement by giving six months written notice to the other party, provided there are no uncompleted programs existing at the date such notice is given, or upon material breach. We may also be required to pay Fujifilm cancellation fees in the event that we decide to terminate any scope of work prior to its completion, calculated as a percentage of the fees payable under the applicable scope of work agreement. Additionally, upon providing written notice, we may cancel certain stages or programs for convenience, and Fujifilm may terminate for certain unforeseen technical errors. Government Regulation and Product Approval Government authorities in the United States, at the federal, state and local level, and in other countries and jurisdictions, including the European Union, extensively regulate, among other things, the research, development, testing, manufacture, quality control, approval, packaging, storage, recordkeeping, labeling, advertising, promotion, distribution, marketing, post-approval monitoring and reporting, and import and export of pharmaceutical products. The processes for obtaining regulatory approvals in the United States and in foreign countries and jurisdictions, along with subsequent compliance with applicable statutes and regulations and other regulatory authorities, require the expenditure of substantial time and financial resources. FDA approval process In the United States, pharmaceutical products are subject to extensive regulation by the United States Food and Drug Administration, or the FDA. The Federal Food, Drug, and Cosmetic Act, or the FDC Act, and other federal and state statutes and regulations, govern, among other things, the research, development, testing, manufacture, storage, recordkeeping, approval, labeling, promotion and marketing, distribution, post-approval monitoring and reporting, sampling, and import and export of pharmaceutical products. Biological products used for the prevention, treatment, or cure of a disease or condition of a human being are subject to regulation under the FDC Act, except the section of the FDC Act which governs the approval of new drug applications, or NDAs. Biological products are approved for marketing under provisions of the Public Health Service Act, or PHSA, via a Biologics License Application, or BLA. However, the application process and requirements for approval of BLAs are very similar to those for NDAs, and biologics are associated with similar approval risks and costs as drugs. Failure to comply with applicable U.S. requirements may subject a company to a variety of administrative or judicial sanctions, such as clinical hold, FDA refusal to approve pending NDAs or BLAs, warning or untitled letters, product recalls, product seizures, total or partial suspension of production or distribution, injunctions, fines, civil penalties, and criminal prosecution. 14 Biological product development for a new product or certain changes to an approved product in the United States typically involves preclinical laboratory and animal tests, the submission to the FDA of an investigational new drug application, or IND, which must become effective before clinical testing may commence, and adequate and well-controlled clinical trials to establish the safety and effectiveness of the drug for each indication for which FDA approval is sought. Satisfaction of FDA pre-market approval requirements typically takes many years and the actual time required may vary substantially based upon the type, complexity, and novelty of the product or disease. Preclinical tests include laboratory evaluation of product chemistry, formulation, and toxicity, as well as animal trials to assess the characteristics and potential safety and efficacy of the product. The conduct of some preclinical tests must comply with federal regulations and requirements, including good laboratory practices. The results of preclinical testing are submitted to the FDA as part of an IND along with other information, including information about product chemistry, manufacturing and controls, and a proposed clinical trial protocol. Long term preclinical tests, such as animal tests of reproductive toxicity and carcinogenicity, may continue after the IND is submitted. A 30-day waiting period after the submission of each IND is required prior to the commencement of clinical testing in humans. If the FDA has neither commented on nor questioned the IND within this 30-day period, the clinical trial proposed in the IND may begin. Clinical trials involve the administration of the investigational biologic to healthy volunteers or patients under the supervision of a qualified investigator. Clinical trials must be conducted: (i) in compliance with federal regulations; (ii) in compliance with good clinical practice, or GCP, an international standard meant to protect the rights and health of patients and to define the roles of clinical trial sponsors, administrators, and monitors; as well as (iii) under protocols detailing the objectives of the trial, the parameters to be used in monitoring safety, and the effectiveness criteria to be evaluated. Each protocol involving testing on U.S. patients and subsequent protocol amendments must be submitted to the FDA as part of the IND. The FDA may order the temporary, or permanent, discontinuation of a clinical trial at any time, or impose other sanctions, if it believes that the clinical trial either is not being conducted in accordance with FDA requirements or presents an unacceptable risk to the clinical trial patients. The trial protocol and informed consent information for patients in clinical trials must also be submitted to an institutional review board, or IRB, for approval. An IRB may also require the clinical trial at the site to be halted, either temporarily or permanently, for failure to comply with the IRB’s requirements, or may impose other conditions. Clinical trials to support BLAs for marketing approval are typically conducted in three sequential phases, but the phases may overlap. In Phase 1, the initial introduction of the biologic into healthy human subjects or patients, the product is tested to assess safety, metabolism, pharmacokinetics, pharmacological actions, side effects associated with increasing doses, and, if possible, early evidence on effectiveness. Phase 2 usually involves trials in a limited patient population to determine the effectiveness of the drug or biologic for a particular indication, dosage tolerance, and optimal dosage, and to identify common adverse effects and safety risks. If a compound demonstrates evidence of effectiveness and an acceptable safety profile in Phase 2 evaluations, Phase 3 trials are undertaken to obtain the additional information about clinical efficacy and safety in a larger number of patients, typically at geographically dispersed clinical trial sites, to permit the FDA to evaluate the overall benefit-risk relationship of the drug or biologic and to provide adequate information for the labeling of the product. In most cases, the FDA requires two adequate and well-controlled Phase 3 clinical trials to demonstrate the efficacy of the biologic. A single Phase 3 trial with other confirmatory evidence may be sufficient in rare instances where the trial is a large multicenter trial demonstrating internal consistency and a statistically very persuasive finding of a clinically meaningful effect on mortality, irreversible morbidity or prevention of a disease with a potentially serious outcome and confirmation of the result in a second trial would be practically or ethically impossible. In addition, the manufacturer of an investigational drug in a Phase 2 or Phase 3 clinical trial for a serious or life-threatening disease is required to make available, such as by posting on its website, its policy on evaluating and responding to requests for expanded access to such investigational drug. After completion of the required clinical testing, a BLA is prepared and submitted to the FDA. FDA approval of the BLA is required before marketing of the product may begin in the United States. The BLA must include the results of all preclinical, clinical, and other testing and a compilation of data relating to the product’s pharmacology, chemistry, manufacture, and controls. The cost of preparing and submitting a BLA is substantial. The submission of most BLAs is additionally subject to a substantial application user fee, and the applicant under an approved BLA is also subject to an annual program fee for each prescription product. These fees are typically increased annually. The FDA has 60 days from its receipt of a BLA to determine whether the application will be filed based on the agency’s threshold determination that it is sufficiently complete to permit substantive review. Once the submission is filed, the FDA begins an in-depth review. The FDA has agreed to certain performance goals in the review of BLAs. Most such applications for standard review biologic products are reviewed within ten months of the date the FDA files the BLA; most applications for priority review biologics are reviewed within six months of the date the FDA files the BLA. Priority review can be applied to a biologic that the FDA determines has the potential to treat a serious or life-threatening condition and, if approved, would be a significant improvement in safety or effectiveness compared to available therapies. The review process for both standard and priority review may be extended by the FDA for three additional months to consider certain late-submitted information, or information intended to clarify information already provided in the submission. 15 The FDA may also refer applications for novel biologic products, or biologic products that present difficult questions of safety or efficacy, to an advisory committee—typically a panel that includes clinicians and other experts—for review, evaluation, and a recommendation as to whether the application should be approved. The FDA is not bound by the recommendation of an advisory committee, but it generally follows such recommendations. Before approving a BLA, the FDA will typically inspect one or more clinical sites to assure compliance with GCP. Additionally, the FDA will inspect the facility or the facilities at which the biologic product is manufactured. The FDA will not approve the product unless compliance with current good manufacturing practice, or cGMP, is satisfactory and the BLA contains data that provide substantial evidence that the biologic is safe, pure, potent and effective in the intended indication. After the FDA evaluates the BLA and the manufacturing facilities, it issues either an approval letter or a complete response letter. A complete response letter generally outlines the deficiencies in the submission and may require substantial additional testing, or information, in order for the FDA to reconsider the application. If, or when, those deficiencies have been addressed to the FDA’s satisfaction in a resubmission of the BLA, the FDA will issue an approval letter. The FDA has committed to reviewing such resubmissions in two or six months depending on the type of information included. An approval letter authorizes commercial marketing of the biologic with specific prescribing information for specific indications. As a condition of BLA approval, the FDA may require a risk evaluation and mitigation strategy, or REMS, to help ensure that the benefits of the biologic outweigh the potential risks. REMS can include medication guides, communication plans for healthcare professionals, and elements to assure safe use, or ETASU. ETASU can include, but are not limited to, special training or certification for prescribing or dispensing, dispensing only under certain circumstances, special monitoring, and the use of patient registries. The requirement for a REMS can materially affect the potential market and profitability of the product. Moreover, product approval may require substantial post-approval testing and surveillance to monitor the product’s safety or efficacy. Once granted, product approvals may be withdrawn if compliance with regulatory standards is not maintained or problems are identified following initial marketing. Changes to some of the conditions established in an approved application, including changes in indications, labeling, or manufacturing processes or facilities, require submission and FDA approval of a new BLA or BLA supplement before the change can be implemented. A BLA supplement for a new indication typically requires clinical data similar to that in the original application, and the FDA uses the same procedures and actions in reviewing BLA supplements as it does in reviewing BLAs. Fast track designation and accelerated approval The FDA is required to facilitate the development, and expedite the review, of biologics that are intended for the treatment of a serious or life-threatening disease or condition for which there is no effective treatment and which demonstrate the potential to address unmet medical needs for the condition. Under the fast track program, the sponsor of a new biologic candidate may request that the FDA designate the candidate for a specific indication as a fast track biologic concurrent with, or after, the filing of the IND for the candidate. The FDA must determine if the biologic candidate qualifies for fast track designation within 60 days of receipt of the sponsor’s request. In addition to other benefits such as the ability to engage in more frequent interactions with the FDA, the FDA may initiate review of sections of a fast track product’s BLA before the application is complete. This rolling review is available if the applicant provides, and the FDA approves, a schedule for the submission of the remaining information and the applicant pays applicable user fees. However, the FDA’s time period goal for reviewing an application does not begin until the last section of the BLA is submitted. Additionally, the fast track designation may be withdrawn by the FDA if the FDA believes that the designation is no longer supported by data emerging in the clinical trial process. Under the FDA’s accelerated approval regulations, the FDA may approve a biologic for a serious or life-threatening illness that provides meaningful therapeutic benefit to patients over existing treatments based upon a surrogate endpoint that is reasonably likely to predict clinical benefit, or on a clinical endpoint that can be measured earlier than irreversible morbidity or mortality, that is reasonably likely to predict an effect on irreversible morbidity or mortality or other clinical benefit, taking into account the severity, rarity, or prevalence of the condition and the availability or lack of alternative treatments. In clinical trials, a surrogate endpoint is a measurement of laboratory or clinical signs of a disease or condition that substitutes for a direct measurement of how a patient feels, functions, or survives. Surrogate endpoints can often be measured more easily or more rapidly than clinical endpoints. A biologic candidate approved on this basis is subject to rigorous post-marketing compliance requirements, including the completion of Phase 4 or post-approval clinical trials to confirm the effect on the clinical endpoint. Failure to conduct required post-approval trials, or confirm a clinical benefit during post-marketing trials, will allow the FDA to withdraw the biologic from the market on an expedited basis. All promotional materials for biologic candidates approved under accelerated regulations are subject to prior review by the FDA. 16 Breakthrough therapy designation The FDA is also required to expedite the development and review of the application for approval of biological products that are intended to treat a serious or life-threatening disease or condition where preliminary clinical evidence indicates that the biologic may demonstrate substantial improvement over existing therapies on one or more clinically significant endpoints. Under the breakthrough therapy program, the sponsor of a new biologic candidate may request that the FDA designate the candidate for a specific indication as a breakthrough therapy concurrent with, or after, the filing of the IND for the biologic candidate. The FDA must determine if the biological product qualifies for breakthrough therapy designation within 60 days of receipt of the sponsor’s request. Orphan drug designation Under the Orphan Drug Act, the FDA may grant orphan drug designation to biological products intended to treat a rare disease or condition—generally a disease or condition that affects fewer than 200,000 individuals in the United States, or if it affects more than 200,000 individuals in the United States, there is no reasonable expectation that the cost of developing and making a product available in the United States for such disease or condition will be recovered from sales of the product. Orphan drug designation must be requested before submitting a BLA. After the FDA grants orphan drug designation, the generic identity of the biological product and its potential orphan use are disclosed publicly by the FDA. Orphan drug designation does not convey any advantage in, or shorten the duration of, the regulatory review and approval process. The first BLA applicant to receive FDA approval for a particular active moiety to treat a particular disease with FDA orphan drug designation is entitled to a seven-year exclusive marketing period in the United States for that product for that indication. During the seven-year exclusivity period, the FDA may not approve any other applications to market a biological product containing the same principal molecular structural features for the same disease, except in limited circumstances, such as a showing of clinical superiority to the product with orphan drug exclusivity. A product is clinically superior if it is safer, more effective or makes a major contribution to patient care. Orphan drug exclusivity does not prevent the FDA from approving a different drug or biological product for the same disease or condition, or the same biological product for a different disease or condition. Among the other benefits of orphan drug designation are tax credits for certain research and a waiver of the BLA user fee. Rare pediatric disease priority review voucher program Under the Rare Pediatric Disease Priority Review Voucher program, FDA may award a priority review voucher to the sponsor of an approved marketing application for a product that treats or prevents a rare pediatric disease. The voucher entitles the sponsor to priority review of one subsequent marketing application. A voucher may be awarded only for an approved rare pediatric disease product application. A rare pediatric disease product application is an NDA or BLA for a product that treats or prevents a serious or life-threatening disease in which the serious or life-threatening manifestations primarily affect individuals aged from birth to 18 years; in general, the disease must affect fewer than 200,000 such individuals in the U.S.; the NDA or BLA must be deemed eligible for priority review; the NDA or BLA must not seek approval for a different adult indication (i.e., for a different disease/condition); the product must not contain an active ingredient that has been previously approved by FDA; and the NDA or BLA must rely on clinical data derived from studies examining a pediatric population such that the approved product can be adequately labeled for the pediatric population. Before NDA or BLA approval, FDA may designate a product in development as a product for a rare pediatric disease, but such designation is not required to receive a voucher. To receive a rare pediatric disease priority review voucher, a sponsor must notify FDA, upon submission of the NDA or BLA, of its intent to request a voucher. If FDA determines that the NDA or BLA is a rare pediatric disease product application, and if the NDA or BLA is approved, FDA will award the sponsor of the NDA or BLA a voucher upon approval of the NDA or BLA. FDA may revoke a rare pediatric disease priority review voucher if the product for which it was awarded is not marketed in the U.S. within 365 days of the product’s approval. The voucher, which is transferable to another sponsor, may be submitted with a subsequent NDA or BLA and entitles the holder to priority review of the accompanying NDA or BLA. The sponsor submitting the priority review voucher must notify FDA of its intent to submit the voucher with the NDA or BLA at least 90 days prior to submission of the NDA or BLA and must pay a priority review user fee in addition to any other required user fee. FDA must take action on an NDA or BLA under priority review within six months of receipt of the NDA or BLA. 17 The Rare Pediatric Disease Priority Review Voucher program was reauthorized in the Creating Hope Reauthorization Act in December 2020, allowing a product that is designated as a product for a rare pediatric disease prior to October 1, 2020 to be eligible to receive a rare pediatric disease priority review voucher upon approval of a qualifying NDA or BLA prior to October 1, 2026. Disclosure of clinical trial information Sponsors of clinical trials of FDA-regulated products, including biological products, are required to register and disclose certain clinical trial information. Information related to the product, patient population, phase of investigation, trial sites and investigators, and other aspects of the clinical trial is then made public as part of the registration. Sponsors are also obligated to discuss the results of their clinical trials after completion. Disclosure of the results of these trials can be delayed in certain circumstances for up to two years after the date of completion of the trial. Competitors may use this publicly available information to gain knowledge regarding the progress of development programs. Pediatric information Under the Pediatric Research Equity Act, or PREA, NDAs or BLAs or supplements to NDAs or BLAs must contain data to assess the safety and effectiveness of the biological product for the claimed indications in all relevant pediatric subpopulations and to support dosing and administration for each pediatric subpopulation for which the biological product is safe and effective. The FDA may grant full or partial waivers, or deferrals, for submission of data. Unless otherwise required by statute or regulation, PREA generally does not apply to a drug for an indication for which orphan designation has been granted; however, beginning in 2020, PREA will apply to BLAs for orphan-designated drugs if the drug is a molecularly targeted cancer product intended for the treatment of an adult cancer and is directed at a molecular target that the FDA has determined is substantially relevant to the growth or progression of a pediatric cancer. Additional controls for biologics To help reduce the increased risk of the introduction of adventitious agents and related process impurities, the PHSA emphasizes the importance of manufacturing controls for products whose attributes cannot be precisely defined. The PHSA also provides authority to the FDA to immediately suspend licenses in situations where there exists a danger to public health, to prepare or procure products in the event of shortages and critical public health needs, and to authorize the creation and enforcement of regulations to prevent the introduction or spread of communicable diseases in the United States and between states. After a BLA is approved, the product may also be subject to official lot release as a condition of approval. As part of the manufacturing process, the manufacturer is required to perform certain tests on each lot of the product before it is released for distribution. If the product is subject to official release by the FDA, the manufacturer submits samples of each lot of product to the FDA together with a release protocol showing a summary of the history of manufacture of the lot and the results of all of the manufacturer’s tests performed on the lot. The FDA may also perform certain confirmatory tests on lots of some products, such as viral vaccines, before releasing the lots for distribution by the manufacturer. In addition, the FDA conducts laboratory research related to the regulatory standards on the safety, purity, potency, and effectiveness of biological products. As with drugs, after approval of biologics, manufacturers must address any safety issues that arise, are subject to recalls or a halt in manufacturing, and are subject to periodic inspection after approval. Patent term restoration After approval, owners of relevant drug or biologic patents may apply for up to a five year patent extension. The allowable patent term extension is calculated as half of the drug’s testing phase—the time between IND application and NDA or BLA submission—and all of the review phase—the time between NDA or BLA submission and approval up to a maximum of five years. The time can be shortened if FDA determines that the applicant did not pursue approval with due diligence. The total patent term after the extension may not exceed 14 years. For patents that might expire during the application phase, the patent owner may request an interim patent extension. An interim patent extension increases the patent term by one year and may be renewed up to four times. For each interim patent extension granted, the post-approval patent extension is reduced by one year. The director of the U.S. PTO must determine that approval of the drug covered by the patent for which a patent extension is being sought is likely. Interim patent extensions are not available for a drug or biologic for which an NDA or BLA has not been submitted. 18 Biosimilars The Biologics Price Competition and Innovation Act of 2009, or BPCIA, creates an abbreviated approval pathway for biological products shown to be highly similar to or interchangeable with an FDA-licensed reference biological product. Biosimilarity sufficient to reference a prior FDA-approved product requires that there be no differences in conditions of use, route of administration, dosage form, and strength, and no clinically meaningful differences between the biological product and the reference product in terms of safety, purity, and potency. Biosimilarity must be shown through analytical trials, animal trials, and a clinical trial or trials, unless the Secretary of Health and Human Services waives a required element. A biosimilar product may be deemed interchangeable with a prior approved product if it meets the higher hurdle of demonstrating that it can be expected to produce the same clinical results as the reference product and, for products administered multiple times, the biologic and the reference biologic may be switched after one has been previously administered without increasing safety risks or risks of diminished efficacy relative to exclusive use of the reference biologic. The first biosimilar was approved by FDA in 2015, and no interchangeable products have been approved under the BPCIA. Complexities associated with the larger, and often more complex, structures of biological products, as well as the process by which such products are manufactured, pose significant hurdles to implementation, which is still being evaluated by the FDA. A reference biologic is granted 12 years of exclusivity from the time of first licensure of the reference product, and no application for a biosimilar can be submitted for four years from the date of licensure of the reference product. The first biologic product submitted under the abbreviated approval pathway that is determined to be interchangeable with the reference product has exclusivity against a finding of interchangeability for other biologics for the same condition of use for the lesser of (i) one year after first commercial marketing of the first interchangeable biosimilar, (ii) 18 months after the first interchangeable biosimilar is approved if there is no patent challenge, (iii) eighteen months after resolution of a lawsuit over the patents of the reference biologic in favor of the first interchangeable biosimilar applicant, or (iv) 42 months after the first interchangeable biosimilar’s application has been approved if a patent lawsuit is ongoing within the 42-month period. Post-approval requirements Once a BLA is approved, a product will be subject to certain post-approval requirements. For instance, the FDA closely regulates the post-approval marketing and promotion of biologics, including standards and regulations for direct-to-consumer advertising, off-label promotion, industry-sponsored scientific and educational activities and promotional activities involving the internet. Biologics may be marketed only for the approved indications and in accordance with the provisions of the approved labeling. Adverse event reporting and submission of periodic reports is required following FDA approval of a BLA. The FDA also may require post-marketing testing, known as Phase 4 testing, REMS, and surveillance to monitor the effects of an approved product, or the FDA may place conditions on an approval that could restrict the distribution or use of the product. In addition, quality control, biological product manufacture, packaging, and labeling procedures must continue to conform to cGMPs after approval. Biologic manufacturers and certain of their subcontractors are required to register their establishments with the FDA and certain state agencies. Registration with the FDA subjects entities to periodic unannounced inspections by the FDA, during which the agency inspects manufacturing facilities to assess compliance with cGMPs. Accordingly, manufacturers must continue to expend time, money, and effort in the areas of production and quality-control to maintain compliance with cGMPs. Regulatory authorities may withdraw product approvals or request product recalls if a company fails to comply with regulatory standards, if it encounters problems following initial marketing, or if previously unrecognized problems are subsequently discovered. FDA regulation of companion diagnostics If use of an in vitro diagnostic is essential to safe and effective use of a drug or biologic product, then the FDA generally will require approval or clearance of the diagnostic, known as a companion diagnostic, at the same time that the FDA approves the therapeutic product. The FDA has generally required in vitro companion diagnostics intended to select the patients who will respond to cancer treatment to obtain a pre-market approval, or PMA, for that diagnostic simultaneously with approval of the therapeutic. The review of these in vitro companion diagnostics in conjunction with the review of a cancer therapeutic involves coordination of review by the FDA’s Center for Drug Evaluation and Research and by the FDA’s Center for Devices and Radiological Health. Approval and clearance of a companion diagnostic also requires a high level of coordination between the drug or biologic manufacturer and device manufacturer, if different companies. 19 The PMA process, including the gathering of clinical and preclinical data and the submission to and review by the FDA, can take several years or longer. It involves a rigorous premarket review during which the applicant must prepare and provide the FDA with reasonable assurance of the device’s safety and effectiveness and information about the device and its components regarding, among other things, device design, manufacturing and labeling. PMA applications are subject to a substantial application fee, which is typically increased annually. In addition, PMAs must generally include the results from extensive preclinical and adequate and well-controlled clinical trials to establish the safety and effectiveness of the device for each indication for which FDA approval is sought. In particular, for a diagnostic, the applicant must demonstrate that the diagnostic has adequate sensitivity and specificity, has adequate specimen and reagent stability, and produces reproducible results when the same sample is tested multiple times by multiple users at multiple laboratories. As part of the PMA review, the FDA will typically inspect the manufacturer’s facilities for compliance with the Quality System Regulation, or QSR, which imposes elaborate testing, control, documentation and other quality assurance requirements. PMA approval is not guaranteed, and the FDA may ultimately respond to a PMA submission with a not approvable determination based on deficiencies in the application and require additional clinical trial or other data that may be expensive and time-consuming to generate and that can substantially delay approval. If the FDA’s evaluation of the PMA application is favorable, the FDA typically issues an approvable letter requiring the applicant’s agreement to specific conditions, such as changes in labeling, or specific additional information, such as submission of final labeling, in order to secure final approval of the PMA. If the FDA concludes that the applicable criteria have been met, the FDA will issue a PMA for the approved indications, which can be more limited than those originally sought by the applicant. The PMA can include post-approval conditions that the FDA believes necessary to ensure the safety and effectiveness of the device, including, among other things, restrictions on labeling, promotion, sale and distribution. After a device is placed on the market, it remains subject to significant regulatory requirements. Medical devices may be marketed only for the uses and indications for which they are cleared or approved. Device manufacturers must also register their establishment(s), including payment of an annual establishment registration fee, and list their device(s) with the FDA. A medical device manufacturer’s manufacturing processes and those of its suppliers are required to comply with the applicable portions of the QSR, which cover the methods and documentation of the design, testing, production, processes, controls, quality assurance, labeling, packaging and shipping of medical devices. Domestic facility records and manufacturing processes are subject to periodic unscheduled inspections by the FDA. The FDA also may inspect foreign facilities that export products to the United States. Other U.S. healthcare laws and compliance requirements In the United States, our activities are potentially subject to regulation by various federal, state and local authorities in addition to the FDA, including but not limited to, the Centers for Medicare and Medicaid Services, or CMS, other divisions of the U.S. Department of Health and Human Services (e.g., the Office of Inspector General), the U.S. Department of Justice, or DOJ, and individual U.S. Attorney offices within the DOJ, and state and local governments. For example, sales, marketing and scientific/educational grant programs must comply with the anti-fraud and abuse provisions of the Social Security Act, the false claims laws, the privacy provisions of the Health Insurance Portability and Accountability Act, or HIPAA, and similar state laws, each as amended. The federal Anti-Kickback Statute prohibits, among other things, any person or entity, from knowingly and willfully offering, paying, soliciting or receiving any remuneration, directly or indirectly, overtly or covertly, in cash or in kind, to induce or in return for purchasing, leasing, ordering or arranging for the purchase, lease or order of any item or service reimbursable under Medicare, Medicaid or other federal healthcare programs. The term remuneration has been interpreted broadly to include anything of value. The Anti-Kickback Statute has been interpreted to apply to arrangements between pharmaceutical manufacturers on one hand and prescribers, purchasers, and formulary managers on the other. There are a number of statutory exceptions and regulatory safe harbors protecting some common activities from prosecution. The exceptions and safe harbors are drawn narrowly and practices that involve remuneration that may be alleged to be intended to induce prescribing, purchasing or recommending may be subject to scrutiny if they do not qualify for an exception or safe harbor. Failure to meet all of the requirements of a particular applicable statutory exception or regulatory safe harbor does not make the conduct per se illegal under the Anti-Kickback Statute. Instead, the legality of the arrangement will be evaluated on a case-by-case basis based on a cumulative review of all of its facts and circumstances. Our practices may not in all cases meet all of the criteria for protection under a statutory exception or regulatory safe harbor. Additionally, the intent standard under the Anti-Kickback Statute was amended by the Affordable Care Act, or ACA, to a stricter standard such that a person or entity no longer needs to have actual knowledge of the statute or specific intent to violate it in order to have committed a violation. In addition, the ACA codified case law that a claim including items or services resulting from a violation of the federal Anti-Kickback Statute constitutes a false or fraudulent claim for purposes of the federal False Claims Act (discussed below). 20 The civil monetary penalties statute imposes penalties against any person or entity who, among other things, is determined to have presented or caused to be presented a claim to a federal health program that the person knows or should know is for an item or service that was not provided as claimed or is false or fraudulent. The federal False Claims Act prohibits, among other things, any person or entity from knowingly presenting, or causing to be presented, a false claim for payment to, or approval by, the federal government or knowingly making, using, or causing to be made or used a false record or statement material to a false or fraudulent claim to the federal government. As a result of a modification made by the Fraud Enforcement and Recovery Act of 2009, a claim includes “any request or demand” for money or property presented to the U.S. government. Recently, several pharmaceutical and other healthcare companies have been prosecuted under these laws for allegedly providing free product to customers with the expectation that the customers would bill federal programs for the product. Other companies have been prosecuted for causing false claims to be submitted because of the companies’ marketing of the product for unapproved, and thus generally non-reimbursable, uses. HIPAA created new federal criminal statutes that prohibit knowingly and willfully executing, or attempting to execute, a scheme to defraud or to obtain, by means of false or fraudulent pretenses, representations or promises, any money or property owned by, or under the control or custody of, any healthcare benefit program, including private third-party payors and knowingly and willfully falsifying, concealing or covering up by trick, scheme or device, a material fact or making any materially false, fictitious or fraudulent statement in connection with the delivery of or payment for healthcare benefits, items or services. Also, many states have similar fraud and abuse statutes or regulations that apply to items and services reimbursed under Medicaid and other state programs, or, in several states, apply regardless of the payor. We may be subject to data privacy and security regulations by both the federal government and the states in which we conduct our business. HIPAA, as amended by the Health Information Technology for Economic and Clinical Health Act, or HITECH, and its implementing regulations, imposes requirements relating to the privacy, security and transmission of individually identifiable health information. Among other things, HITECH makes HIPAA’s privacy and security standards directly applicable to business associates, independent contractors or agents of covered entities that receive or obtain protected health information in connection with providing a service on behalf of a covered entity. HITECH also created four new tiers of civil monetary penalties, amended HIPAA to make civil and criminal penalties directly applicable to business associates, and gave state attorneys general new authority to file civil actions for damages or injunctions in federal courts to enforce the federal HIPAA laws and seek attorneys’ fees and costs associated with pursuing federal civil actions. In addition, state laws govern the privacy and security of health information in specified circumstances, many of which differ from each other in significant ways and may not have the same effect, thus complicating compliance efforts. Additionally, the federal Physician Payments Sunshine Act within the ACA, and its implementing regulations, require that certain manufacturers of drugs, devices, biological and medical supplies for which payment is available under Medicare, Medicaid or the Children’s Health Insurance Program (with certain exceptions) to report information related to certain payments or other transfers of value made or distributed to physicians and teaching hospitals, or to entities or individuals at the request of, or designated on behalf of, the physicians and teaching hospitals and to report annually certain ownership and investment interests held by physicians and their immediate family members. The reported data are posted in searchable form on a public website on an annual basis. Failure to submit required information may result in civil monetary penalties. Effective January 1, 2022, we will also be required to report on transfers of value to physician assistants, nurse practitioners or clinical nurse specialists, certified registered nurse anesthetists, and certified nurse-midwives. In order to distribute products commercially, we must comply with state laws that require the registration of manufacturers and wholesale distributors of drug and biological products in a state, including, in certain states, manufacturers and distributors who ship products into the state even if such manufacturers or distributors have no place of business within the state. Some states also impose requirements on manufacturers and distributors to establish the pedigree of product in the chain of distribution, including some states that require manufacturers and others to adopt new technology capable of tracking and tracing product as it moves through the distribution chain. Several states have enacted legislation requiring pharmaceutical and biotechnology companies to establish marketing compliance programs, file periodic reports with the state, make periodic public disclosures on sales, marketing, pricing, clinical trials and other activities, and/or register their sales representatives, as well as to prohibit pharmacies and other healthcare entities from providing certain physician prescribing data to pharmaceutical and biotechnology companies for use in sales and marketing, and to prohibit certain other sales and marketing practices. All of our activities are potentially subject to federal and state consumer protection and unfair competition laws. 21 If our operations are found to be in violation of any of the federal and state healthcare laws described above or any other governmental regulations that apply to us, we may be subject to penalties, including without limitation, civil, criminal and/or administrative penalties, damages, fines, disgorgement, exclusion from participation in government programs, such as Medicare and Medicaid, injunctions, private “qui tam” actions brought by individual whistleblowers in the name of the government, or refusal to allow us to enter into government contracts, contractual damages, reputational harm, administrative burdens, diminished profits and future earnings, and the curtailment or restructuring of our operations, any of which could adversely affect our ability to operate our business and our results of operations. Coverage, pricing and reimbursement Significant uncertainty exists as to the coverage and reimbursement status of any product candidates for which we obtain regulatory approval. In the United States and markets in other countries, sales of any products for which we receive regulatory approval for commercial sale will depend, in part, on the extent to which third-party payors provide coverage, and establish adequate reimbursement levels for such products. In the United States, third-party payors include federal and state healthcare programs, private managed care providers, health insurers and other organizations. The process for determining whether a third-party payor will provide coverage for a product may be separate from the process for setting the price of a product or for establishing the reimbursement rate that such a payor will pay for the product. Third-party payors may limit coverage to specific products on an approved list, also known as a formulary, which might not include all of the FDA-approved products for a particular indication. Third-party payors are increasingly challenging the price, examining the medical necessity and reviewing the cost-effectiveness of medical products, therapies and services, in addition to questioning their safety and efficacy. We may need to conduct expensive pharmaco-economic studies in order to demonstrate the medical necessity and cost-effectiveness of our products, in addition to the costs required to obtain the FDA approvals. Our product candidates may not be considered medically necessary or cost-effective. A payor’s decision to provide coverage for a product does not imply that an adequate reimbursement rate will be approved. Further, one payor’s determination to provide coverage for a product does not assure that other payors will also provide coverage for the product. Adequate third-party reimbursement may not be available to enable us to maintain price levels sufficient to realize an appropriate return on our investment in product development. Different pricing and reimbursement schemes exist in other countries. In the EU, governments influence the price of pharmaceutical products through their pricing and reimbursement rules and control of national health care systems that fund a large part of the cost of those products to consumers. Some jurisdictions operate positive and negative list systems under which products may only be marketed once a reimbursement price has been agreed. To obtain reimbursement or pricing approval, some of these countries may require the completion of clinical trials that compare the cost-effectiveness of a particular product candidate to currently available therapies. Other member states allow companies to fix their own prices for medicines, but monitor and control company profits. The downward pressure on health care costs has become very intense. As a result, increasingly high barriers are being erected to the entry of new products. In addition, in some countries, cross-border imports from low-priced markets exert a commercial pressure on pricing within a country. The marketability of any product candidates for which we receive regulatory approval for commercial sale may suffer if the government and third-party payors fail to provide adequate coverage and reimbursement. In addition, emphasis on managed care in the United States has increased and we expect will continue to increase the pressure on healthcare pricing. Coverage policies and third-party reimbursement rates may change at any time. Even if favorable coverage and reimbursement status is attained for one or more products for which we receive regulatory approval, less favorable coverage policies and reimbursement rates may be implemented in the future. Healthcare reform The ACA has substantially changed some aspects of healthcare financing and delivery by both governmental and private insurers. The ACA has affected existing government healthcare programs and resulted in the development of new programs. Among the ACA provisions of importance to the pharmaceutical and biotechnology industries, in addition to those otherwise described above, are the following: • • an annual, nondeductible fee on any entity that manufactures or imports certain specified branded prescription drugs and biologic agents apportioned among these entities according to their market share in some government healthcare programs, that began in 2011; an increase in the statutory minimum rebates a manufacturer must pay under the Medicaid Drug Rebate Program, retroactive to January 1, 2010, to 23.1% and 13% of the average manufacturer price for most branded and generic drugs, respectively and capped the total rebate amount for innovator drugs at 100% of the Average Manufacturer Price, or AMP; 22     • • • • • a Medicare Part D coverage gap discount program, in which manufacturers must agree to offer 70% point-of-sale discounts off negotiated prices of applicable brand drugs to eligible beneficiaries during their coverage gap period, as a condition for the manufacturers’ outpatient drugs to be covered under Medicare Part D; extension of manufacturers’ Medicaid rebate liability to covered drugs dispensed to individuals who are enrolled in Medicaid managed care organizations; expansion of eligibility criteria for Medicaid programs by, among other things, allowing states to offer Medicaid coverage to additional individuals beginning in 2014 and by adding new mandatory eligibility categories for individuals with income at or below 133% of the federal poverty level, thereby potentially increasing manufacturers’ Medicaid rebate liability; expansion of the entities eligible for discounts under the Public Health Service pharmaceutical pricing program; and a new Patient-Centered Outcomes Research Institute to oversee, identify priorities in, and conduct comparative clinical effectiveness research, along with funding for such research. On January 20, 2017, federal agencies with authorities and responsibilities under the ACA were directed to waive, defer, grant exemptions from, or delay the implementation of any provision of the ACA that would impose a fiscal burden on states or a cost, fee, tax, penalty or regulatory burden on individuals, healthcare providers, health insurers, or manufacturers of pharmaceuticals or medical devices. More recently, the Tax Cuts and Jobs Act was signed into law in December 2017, which eliminated certain requirements of the ACA, including the individual mandate. It is unclear the impact this legislation will have on the ACA because a decision regarding the constitutionality of the ACA after the repeal of the individual mandate was ultimately appealed to the United States Supreme Court. On November 10, 2020, oral arguments were heard in this case. It is unclear when a decision will be made. We cannot predict whether challenges to the ACA will continue or whether other proposals will be made or adopted, or what impact these efforts may have on us. The Foreign Corrupt Practices Act The Foreign Corrupt Practices Act, or FCPA, prohibits any U.S. individual or business from paying, offering, or authorizing payment or offering of anything of value, directly or indirectly, to any foreign official, political party or candidate for the purpose of influencing any act or decision of the foreign entity in order to assist the individual or business in obtaining or retaining business. The FCPA also obligates companies whose securities are listed in the United States to comply with accounting provisions requiring the company to maintain books and records that accurately and fairly reflect all transactions of the corporation, including international subsidiaries, and to devise and maintain an adequate system of internal accounting controls for international operations. Additional regulation In addition to the foregoing, state and federal laws regarding environmental protection and hazardous substances, including the Occupational Safety and Health Act, the Resource Conservancy and Recovery Act and the Toxic Substances Control Act, affect our business. These and other laws govern our use, handling and disposal of various biological, chemical and radioactive substances used in, and wastes generated by, our operations. If our operations result in contamination of the environment or expose individuals to hazardous substances, we could be liable for damages and governmental fines. We believe that we are in material compliance with applicable environmental laws and that continued compliance therewith will not have a material adverse effect on our business. We cannot predict, however, how changes in these laws may affect our future operations. Europe / rest of world government regulation In addition to regulations in the United States, we will be subject to a variety of regulations in other jurisdictions governing, among other things, clinical trials and any commercial sales and distribution of our products. Whether or not we obtain FDA approval of a product, we must obtain the requisite approvals from regulatory authorities in foreign countries prior to the commencement of clinical trials or marketing of the product in those countries. Certain countries outside of the United States have a similar process that requires the submission of a clinical trial application much like the IND prior to the commencement of human clinical trials. In the EU, for example, a clinical trial application must be submitted to each country’s national health authority and an independent ethics committee, much like the FDA and IRB, respectively. Once the clinical trial application is approved in accordance with a country’s requirements, clinical trial development may proceed. Because biologically sourced raw materials are subject to unique contamination risks, their use may be restricted in some countries. 23           The requirements and process governing the conduct of clinical trials, product licensing, pricing and reimbursement vary from country to country. In all cases, the clinical trials are conducted in accordance with GCP and the applicable regulatory requirements and the ethical principles that have their origin in the Declaration of Helsinki. To obtain regulatory approval of an investigational drug or biological product under EU regulatory systems, we must submit a marketing authorization application. The application used to file the BLA in the United States is similar to that required in the EU, with the exception of, among other things, country-specific document requirements. For other countries outside of the EU, such as countries in Eastern Europe, Latin America or Asia, the requirements governing the conduct of clinical trials, product licensing, pricing and reimbursement vary from country to country. In all cases, again, the clinical trials are conducted in accordance with GCP and the applicable regulatory requirements and the ethical principles that have their origin in the Declaration of Helsinki. If we or our potential collaborators fail to comply with applicable foreign regulatory requirements, we may be subject to, among other things, fines, suspension or withdrawal of regulatory approvals, product recalls, seizure of products, operating restrictions and criminal prosecution. Corporate Information We were formed as a limited liability company under the laws of the State of Delaware in December 2013 and converted to a Delaware corporation in March 2015. Our principal executive offices are located at 805 Las Cimas Parkway, Suite 100, Austin, Texas 78746, and our telephone number is (512) 942-2935. Our website address is www.aegleabio.com. The information contained on, or that can be accessed through, our website is not part of this Annual Report, and you should not consider information on our website to be part of this Annual Report. Human Capital Resources As of December 31, 2020, we employed 90 people: 82 employees in the United States and 8 employees in international locations. We also engage temporary employees and consultants to augment our existing workforce. None of our employees are represented by a labor union, we have not experienced any work stoppages, and we consider our relations with our employees to be good. We are committed to providing our employees with a work environment that is free of unlawful discrimination, including any harassment on the basis of any legally protected status. Accordingly, we will not tolerate any form of unlawful harassment against our employees, whether by executives, managers, co-workers, or by third parties, such as vendors, or other third parties with whom our employees interact. In addition, we provide equal employment opportunity to all employees and applicants for employment and do not discriminate on any basis prohibited by law, including race, color, sex, gender, sexual orientation, pregnancy, age, religion, national origin, disability, marital status, and veteran status. We recognize that attracting, motivating, and retaining talent at all levels is vital to continuing our success. We invest in our employees through high-quality benefits and various health and wellness initiatives and offer competitive compensation packages (base salary and incentive plans), ensuring fairness in internal compensation practices. The principal purposes of our incentive plans (bonus and equity) are to protect the long-term interests of our stakeholders and stockholders. To further engage and incentivize our workforce, we offer a wide range of opportunities to support professional development and growth. For our talent pipeline assessment and development, we work closely with individual business functional leaders to identify our high-performing and high-potential employees, by conducting a company-wide talent assessment utilizing a Performance/Potential Matrix assessment tool. This assessment is completed annually to ensure we tie together our incentives, development, and recognition to retain and attract the people we need to drive our success. Financial Information We manage our operations and allocate resources as a single reporting segment. Financial information regarding our operations, assets and liabilities, including our net loss for the years ended December 31, 2020, 2019 and 2018 and our total assets as of December 31, 2020 and 2019, is included in our Consolidated Financial Statements in Item 8 of this Annual Report. 24 Available Information We file Annual Reports on Form 10-K, Quarterly Reports on Form 10-Q, Current Reports on Form 8-K and other information with the Securities and Exchange Commission (SEC). Our filings with the SEC are available free of charge on the SEC’s website at www.sec.gov and on our website under the “Investors” tab as soon as reasonably practicable after we electronically file such material with, or furnish it to, the SEC. 25   ITEM 1A. RISK FACTORS Investing in our common stock involves a high degree of risk. You should carefully consider the risks and uncertainties described below, together with all of the other information in this annual report on Form 10-K, including our consolidated financial statements and related notes and “Management’s Discussion and Analysis of Financial Condition and Results of Operations,” before investing in our common stock. The risks and uncertainties described below are not the only ones we face. Additional risks and uncertainties that we are unaware of, or that we currently believe are not material, may also become important factors that affect us. If any of the following risks occur, our business, operating results and prospects could be materially harmed. In that event, the price of our common stock could decline, and you could lose part or all of your investment. Summary Risk Factors Our business is subject to a number of risks and uncertainties, including those highlighted in the section titled “Risk Factors” immediately following this summary. Some of these risks are: • • • • • • • • • • • • The outbreak of the novel strain of coronavirus, SARS-CoV-2 and its emerging variants, which causes COVID-19, has, and may continue to, adversely impact our business, including the timing of our clinical trials. We have no source of product revenue and we have incurred significant losses since inception. We expect to incur losses for the foreseeable future and may never achieve or maintain profitability. We may not be successful in advancing the clinical development of our product candidates. We will need substantial additional funding. If we are unable to raise capital when needed, we would be compelled to delay, reduce or eliminate our product development programs or commercialization efforts. We depend heavily on the success of our most advanced product candidate, pegzilarginase. Existing and future clinical trials of our product candidates, including pegzilarginase, may not be successful. If we are unable to commercialize our product candidates or experience significant delays in doing so, our business will be materially harmed. Clinical drug development involves a lengthy and expensive process with an uncertain outcome. We may experience delays in completing, or ultimately be unable to complete, the development and commercialization of any of our product candidates. Our engineered human enzyme product candidates represent a novel therapeutic approach, which could result in heightened regulatory scrutiny, delays in clinical development, or delays in our ability to achieve regulatory approval or commercialization of our product candidates. We have only initiated clinical trials for pegzilarginase and AGLE-177 for the treatment of certain conditions and have only dosed pegzilarginase in humans. We have not dosed any of our other product candidates in humans. Our existing and future planned clinical trials may reveal significant adverse events, toxicities or other side effects not seen in our nonclinical studies or early stage clinical trials and may result in a safety profile that could inhibit regulatory approval or market acceptance of any of our product candidates. If we experience delays or difficulties in the enrollment of patients in our ongoing or planned clinical trials, our receipt of necessary regulatory approvals could be delayed or prevented. We contract with third parties for the manufacture of our product candidates for nonclinical studies and our ongoing and future planned clinical testing and expect to continue to do so for commercialization. This reliance on third parties increases the risk that we will not have sufficient quantities of our product candidates at an acceptable cost and quality, which could delay, prevent or impair our development or commercialization efforts. If we are not able to obtain, or if there are delays in obtaining, required regulatory approvals in the United States or in foreign jurisdictions, we will not be able to commercialize our product candidates, and our ability to generate revenue will be materially impaired. If we are unable to obtain and maintain intellectual property protection for our technology and product candidates, or if the scope of the intellectual property protection obtained is not sufficiently broad, our competitors could develop and commercialize technology and product candidates similar or identical to ours, and our ability to successfully commercialize our technology and product candidates may be impaired. 26                         Risks Related to Our Financial Position and Need for Additional Capital Our limited operating history may make it difficult for you to evaluate the success of our business to date and to assess our future viability. We are a clinical-stage biotechnology company. We began operations as a limited liability company in December 2013 and converted to a Delaware corporation in March 2015. Our operations to date have been limited to organizing and staffing our company, business planning, raising capital, acquiring and developing our technology, identifying potential product candidates, undertaking nonclinical studies, and preparing for, commencing and conducting clinical trials of our most advanced product candidates, pegzilarginase and AGLE- 177. We have not yet demonstrated our ability to successfully complete a pivotal clinical trial, obtain marketing approvals, manufacture a commercial scale product or arrange for a third party to do so on our behalf, or conduct sales and marketing activities necessary for successful product commercialization. Products, on average, take ten to 15 years to be developed from the time they are discovered to the time they are approved and available for treating patients. Although we have recruited a team that has experience with clinical trials, as a company we have limited experience in conducting clinical trials. In part because of this limited experience, we cannot be certain that planned or ongoing clinical trials will begin or be completed on time, if at all. Consequently, any predictions you make about our future success or viability based on our short operating history to date may not be as accurate as they could be if we had a longer operating history or an established track record in commercializing products or conducting clinical trials. In addition, as a new business, we may encounter unforeseen expenses, difficulties, complications, delays and other known and unknown factors. We will need to transition from a company with a research focus to a company capable of supporting commercial activities. We may not be successful in such a transition. We have no source of product revenue and we have incurred significant losses since inception. We expect to incur losses for the foreseeable future and may never achieve or maintain profitability. We have a limited operating history and no approved products. Our ability to generate revenue and become profitable depends upon our ability to successfully complete the development of any of our product candidates, including pegzilarginase and AGLE-177, for any of our target indications and to obtain necessary regulatory approvals. To date, we have recognized revenue solely from a fully utilized government grant and have not generated any product revenue. Even if we receive regulatory approval for any of our product candidates, we do not know when these product candidates will generate revenue for us, if at all. In addition, since inception, we have incurred significant operating losses. For the years ended December 31, 2020 and 2019, we reported a net loss of $80.9 million and $78.3 million, respectively. As of December 31, 2020, we had an accumulated deficit of $276.0 million. We have financed our operations primarily through private placements of our preferred stock, the initial public offering of our common stock, follow-on public offerings of our common stock and pre-funded warrants, and collection of a research grant. We have devoted substantially all of our efforts to research and development. Currently, we are conducting clinical development for pegzilarginase for the treatment of Arginase 1 Deficiency and for AGLE-177 for the treatment of Homocystinuria. We initiated a Phase 1/2 clinical trial of AGLE-177 for the treatment of patients with Homocystinuria in the second quarter of 2020, however, timing of first patient dosing will depend on determinations by individual sites given COVID-19. We have not initiated clinical development of our other product candidates and none of our product candidates are ready for commercialization. We expect to continue to incur significant expenses and increasing operating losses for the foreseeable future, and the net losses we incur may fluctuate significantly from quarter to quarter. We anticipate that our expenses will increase substantially if and as we: • • • • • • • continue our research, nonclinical and clinical development of our product candidates; seek to identify additional product candidates; conduct additional nonclinical studies and initiate clinical trials for our product candidates; seek marketing approvals for any of our product candidates that successfully complete clinical trials, including pivotal trials; establish a sales, marketing and distribution infrastructure to commercialize any product candidates for which we may obtain marketing approval; maintain, expand and protect our intellectual property portfolio; hire additional executive, clinical, quality control and scientific personnel; 27               • • add operational, financial and management information systems and personnel, including personnel to support our product development; and acquire or in-license other product candidates and technologies. We are unable to predict the timing or amount of increased expenses, or when, or if, we will be able to achieve or maintain profitability because of the numerous risks and uncertainties associated with product development. In addition, our expenses could increase significantly beyond expectations if we are required by the FDA, EMA, MHRA, or other relevant regulatory authorities, or the Health Authorities, to modify protocols of our clinical trials or perform studies in addition to those that we currently anticipate. Even if pegzilarginase, or any of our other product candidates, is approved for commercial sale, we anticipate incurring significant costs associated with the commercial launch of any product candidate. To become and remain profitable, we must develop and eventually commercialize a product candidate or product candidates with significant market potential. This will require us to be successful in a range of challenging activities, including completing nonclinical testing, initiating and completing clinical trials of one or more of our product candidates, obtaining marketing approval for these product candidates, manufacturing, marketing and selling those product candidates for which we obtain marketing approval and satisfying any post- marketing requirements. We may never succeed in these activities and, even if we do, we may never generate revenues that are significant or large enough to achieve profitability. We are currently advancing clinical development for pegzilarginase for the treatment of Arginase 1 Deficiency and have initiated a Phase 1/2 clinical trial of AGLE-177 for the treatment of patients with Homocystinuria. We are in the nonclinical development stages for our remaining product candidates. If we do achieve profitability, we may not be able to sustain or increase profitability on a quarterly or annual basis. Our failure to become and remain profitable would decrease the value of the company and could impair our ability to raise capital, maintain or expand our research and development efforts, expand our business or continue our operations. A decline in the value of our company would also cause you to lose part or even all of your investment. We will need substantial additional funding. If we are unable to raise capital when needed, we would be compelled to delay, reduce or eliminate our product development programs or commercialization efforts. We expect our expenses to increase in parallel with our ongoing activities, particularly as we continue our research and nonclinical development to identify new clinical candidates and initiate and continue clinical trials of, and seek marketing approval for, our product candidates. In addition, if we obtain marketing approval for any of our product candidates, we expect to incur significant commercialization expenses related to product sales, marketing, manufacturing and distribution. Furthermore, we expect to continue to incur additional costs associated with operating as a public company. Accordingly, we will need to obtain substantial additional funding to support our continuing operations. If we are unable to raise capital when needed for any reason, including but not limited to a federal government shutdown, or on acceptable terms, we would be forced to delay, reduce or eliminate our discovery and nonclinical development programs, our ongoing clinical development, or any future clinical development or commercialization efforts. Based upon our planned use of our cash, cash equivalents, marketable securities, and restricted cash as of December 31, 2020, we estimate such funds will be sufficient for us to (i) to advance the clinical development of pegzilarginase through our Phase 3 PEACE trial and Biologics License Application, or BLA, submission, (ii) fund completion of our ongoing open-label extension study for patients with Arginase 1 Deficiency, and (iii) to advance the clinical development of AGLE-177 through our Phase 1/2 clinical trial and preparation for a potential Phase 3 trial for the treatment of patients with Homocystinuria. Our future capital requirements will depend on many factors, including: • • • • • the costs associated with the scope, progress and results of compound discovery, nonclinical development, laboratory testing and clinical trials for our product candidates; the costs related to the extent to which we enter into partnerships or other arrangements with third parties in order to further develop our product candidates; the costs and fees associated with the discovery, acquisition or in-license of product candidates or technologies; our ability to establish collaborations on favorable terms, if at all; the costs of future commercialization activities, if any, including product sales, marketing, manufacturing and distribution, for any of our product candidates for which we receive marketing approval; 28                 • • revenue, if any, received from commercial sales of our product candidates, should any of our product candidates receive marketing approval; and the costs of preparing, filing and prosecuting patent applications, maintaining and enforcing our intellectual property rights and defending intellectual property-related claims. Our product candidates, if approved, may not achieve commercial success. Our commercial revenues, if any, will be derived from sales of product candidates that we do not expect to be commercially available for many years, if at all. Accordingly, we will continue to rely on additional financing to achieve our business objectives, which may not be available to us on acceptable terms, or at all. Raising additional capital may cause dilution to our stockholders, restrict our operations or require us to relinquish rights to our technologies or product candidates. Until such time, if ever, as we can generate substantial product revenues, we expect to finance our cash needs through a combination of equity or equity-linked offerings, debt financings, grants from research organizations and license and collaboration agreements. We do not have any committed external source of funds. To the extent that we raise additional capital through the sale of equity or convertible debt securities, or if existing holders of warrants exercise their rights to purchase common stock, your ownership interest will be diluted, and the terms of these securities may rank senior to our common stock and include liquidation or other preferences, covenants or other terms that adversely affect your rights as a common stockholder. Further, any future sales of our common stock by us or resale of our common stock by our existing stockholders could cause the market price of our common stock to decline. Debt financing and preferred equity financing, if available, may involve agreements that include covenants limiting or restricting our ability to take specific actions, such as incurring additional debt, making capital expenditures or declaring dividends. If we raise additional funds through collaborations, strategic alliances or marketing, distribution or licensing arrangements with third parties, we may have to relinquish valuable rights to our technologies, future revenue streams, research programs or product candidates or grant licenses on terms that may not be favorable to us and/or that may reduce the value of our common stock. Risks Related to Our Product Development and Regulatory Approval We may not be successful in advancing the clinical development of our product candidates, including pegzilarginase and AGLE-177. In order to execute on our strategy of advancing the clinical development of our product candidates, we are conducting a global pivotal Phase 3 PEACE (Pegzilarginase Effect on Arginase 1 Deficiency Clinical Endpoints) clinical trial, an ongoing open-label extension study of our completed Phase 1/2 clinical trial for the treatment of Arginase 1 Deficiency and a Phase 1/2 clinical trial of AGLE-177 for the treatment of patients with Homocystinuria, however, the timing of first patient dosing of AGLE-177 will depend on determinations by individual sites given COVID-19. If our product candidates fail to work as we expect, or if we need to conduct additional studies to better understand the relationship between our product candidates and clinical activity, our ability to assess the therapeutic effect, seek regulatory approval or otherwise begin or further clinical development, could be compromised. For instance, we discontinued clinical development of pegzilarginase for the treatment of the hematological malignancies acute myeloid leukemia, or AML, and myelodysplastic syndrome, or MDS, in December 2017 due to lack of evidence of clinical benefit.  Additionally, we completed our Phase 1 clinical trial of pegzilarginase for the treatment of advanced solid tumors to study small cell lung cancer, uveal melanoma, and cutaneous melanoma and our combination trial of pegzilarginase with pembrolizumab for the treatment of patients with SCLC. We are currently exploring partnership opportunities for further development in oncology. Also, while we have shown in our Phase 1/2 trial for the treatment of Arginase 1 Deficiency that a reduction of arginine and its metabolites appears to result in clinical benefit, the Health Authorities may not agree with our assessment. Such an event may result in longer development times, larger trials and a greater likelihood of terminating the trial or not obtaining regulatory approval. 29     We depend heavily on the success of our most advanced product candidate, pegzilarginase. Existing and future clinical trials of our product candidates, including pegzilarginase, may not be successful. If we are unable to commercialize our product candidates or experience significant delays in doing so, our business will be materially harmed. We have invested a significant portion of our efforts and financial resources in the nonclinical and clinical development and testing of our most advanced product candidate, pegzilarginase, for the treatment of patients with Arginase 1 Deficiency and in certain oncology trials. Our ability to generate product revenues, which we do not expect will occur for many years, if ever, will depend heavily on the successful development and commercialization of pegzilarginase. The success of pegzilarginase, AGLE-177, and our other product candidates will depend on many factors, including the following: • • • • • • • • • • successful enrollment of patients in, and the completion of, our ongoing and planned clinical trials, including our global pivotal Phase 3 PEACE clinical trial; receiving required regulatory approvals for the development and commercialization of our product candidates as monotherapy or in combination with other products; establishing commercial manufacturing capabilities or making arrangements with third-party manufacturers; obtaining and maintaining patent and trade secret protection and non-patent exclusivity for our product candidates and their components; enforcing and defending intellectual property rights and claims; achieving desirable therapeutic properties for our product candidates’ intended indications; launching commercial sales of our product candidates, if and when approved, whether alone or in collaboration with third parties; acceptance of our product candidates, if and when approved, by patients, the medical community and third-party payors; effectively competing with other therapies; and maintaining an acceptable safety profile of our product candidates through clinical trials and following regulatory approval. If we do not achieve one or more of these factors in a timely manner or at all, we could experience significant delays or an inability to successfully commercialize our product candidates, which would materially harm our business. The outbreak of the novel strain of coronavirus, SARS-CoV-2 and its emerging variants, which causes COVID-19, has, and may continue to, adversely impact our business, including our clinical trials and nonclinical studies. Public health crises such as pandemics or similar outbreaks could adversely impact our business. In December 2019, a novel strain of coronavirus, SARS-CoV-2, which causes COVID-19, surfaced in Wuhan, China. Since then, COVID-19 has spread to multiple countries, including the United States. In response to the spread of COVID-19, we have closed our executive offices with our administrative employees continuing their work outside of our offices, restricted on-site staff to only those required to execute their job responsibilities and limited the number of staff in any given research and development laboratory. Timely enrollment in our clinical trials is dependent upon global clinical trial sites which may be adversely affected by global health matters, such as pandemics. We are currently conducting clinical trials for our product candidates in many countries, including the United States, Australia, United Kingdom and throughout the European Union. The regions in which we operate are currently being or may in the future be affected by COVID-19. 30                     As a result of the COVID-19 outbreak, or similar pandemics, we have experienced and may continue to experience disruptions that could severely impact our business, clinical trials and nonclinical studies, including: • • • • • • • • • • • delays or difficulties in enrolling patients in our clinical trials; delays or difficulties in clinical site initiation, including difficulties in recruiting clinical site investigators and clinical site staff; delays or disruptions in nonclinical experiments and supplies for such experiments, including animals required for such experiments; delays or disruptions in investigational new drug application-enabling good laboratory practice standard toxicology studies due to unforeseen circumstances in our supply chain; increased rates of patients missing dosing appointments or withdrawing from our clinical trials following enrollment as a result of contracting COVID-19, being forced to quarantine, and other travel restrictions, or not accepting home health visits; diversion of healthcare resources away from the conduct of clinical trials, including the diversion of hospitals serving as our clinical trial sites and hospital staff supporting the conduct of our clinical trials, or restricted access to clinical trial sites for on-site monitoring activities; interruption of key clinical trial activities, such as clinical assessments at pre-specified timepoints during the trial and clinical trial site data monitoring, due to limitations on travel imposed or recommended by federal or state governments, employers and others or interruption of clinical trial subject visits and study procedures (particularly any procedures that may be deemed non-essential), which may impact the integrity of subject data and clinical study endpoints; interruption or delays in the operations of the FDA and comparable foreign regulatory agencies, which may impact feedback and approval timelines; limitations on employee resources that would otherwise be focused on the conduct of our nonclinical studies and clinical trials, including because of sickness of employees or their families, the desire of employees to avoid contact with large groups of people, an increased reliance on working from home or mass transit disruptions; interruption of, or delays in receiving, supplies of our product candidates from our CMOs due to staffing shortages, production slowdowns or stoppages, disruptions in delivery systems and commandeering of manufacturing facilities for COVID-19 vaccines; and reduced ability to engage with the medical and investor communities due to the cancellation of conferences scheduled throughout the year. For example, the timing of our Phase 3 PEACE trial has been impacted by COVID-19 as a result of all of our clinical trial sites temporarily suspending screening. Due to this impact, we now expect the Phase 3 PEACE trial enrollment to close in March 2021, with completion of screening and all patients randomized by the end of April 2021. All patients that had initially paused dosing due to COVID-19 had restarted treatment by September 2020. However, patients may miss dosing appointments in the future, whether due to COVID-19 or other reasons. While the Phase 3 PEACE trial protocol allows for a patient to miss a few dosing appointments without being disqualified from the trial, an excessive number of missed doses may adversely affect the usefulness of the data collected in the trial or require us to exclude a subject from the per protocol analysis. In addition, although we have initiated our Phase 1/2 open label clinical trial of AGLE-177 for the treatment in patients with Homocystinuria, the protocol requires in-person visits to clinical trial sites. These sites are located in areas experiencing significant impacts to their healthcare systems due to COVID-19 and consequently many have suspended patient recruitment. While we initiated this trial in the second quarter of 2020, the timing of first patient dosing will depend on determinations by individual sites as they adjust to impacts from COVID-19. These and other factors arising from the COVID-19 pandemic could worsen in countries that are already afflicted with COVID-19, could continue to spread to additional countries, or could return to countries where the pandemic has been partially contained, each of which could further adversely impact our ability to conduct clinical trials and our business generally, and could have a material adverse impact on our operations and financial condition and results. In addition, the trading prices for our common stock and other biopharmaceutical companies, as well as the broader equity and debt markets, have been highly volatile as a result of the COVID-19 pandemic and the resulting impact on economic activity. As a result, we may face difficulties raising capital when needed, and any such sales may be on 31                         unfavorable terms to us. Further, to the extent we raise additional capital through the sale of equity or convertible debt securities, the ownership interest of existing stockholders will be diluted. The COVID-19 outbreak continues to rapidly evolve. The extent to which the outbreak may impact our business, clinical trials and nonclinical studies will depend on future developments, which are highly uncertain and cannot be predicted with confidence, such as the ultimate geographic spread of COVID-19, the duration of the outbreak, travel restrictions and actions to contain the outbreak or treat its impact, such as social distancing and quarantines or lock-downs in the United States and other countries, business closures or business disruptions and the effectiveness of actions taken in the United States and other countries to contain and treat the disease. Clinical drug development involves a lengthy and expensive process with an uncertain outcome. We may experience delays in completing, or ultimately be unable to complete, the development and commercialization of any of our product candidates. We have initiated clinical trials with our lead product candidate, pegzilarginase and AGLE-177. The risk of failure for all of our product candidates is high. Before obtaining marketing approval from regulatory authorities for the sale of any product candidate, we must complete nonclinical development and then conduct extensive clinical trials to demonstrate the safety and efficacy of our product candidates in humans for the respective target indications. Clinical testing is expensive, difficult to design and implement, can take many years to complete, and its outcome is inherently uncertain. Failure can occur at any time during the clinical trial process. The results of nonclinical studies and early clinical trials of our product candidates may not be predictive of the results of later-stage clinical trials that will likely differ in design and size from early-stage clinical trials, and interim results of a clinical trial do not necessarily predict final results. For example, while we have observed a reduction in blood arginine and arginine metabolite levels due to administration of pegzilarginase in patients with Arginase 1 Deficiency, and a reduction in blood arginine levels due to pegzilarginase in patients with advanced solid tumors, this data may not necessarily be predictive of the final results of all patients intended to be enrolled in our ongoing or future clinical trials, and may also not be predictive of pegzilarginase’s ability to reduce arginine or arginine metabolite levels for these patients over a longer term nor predictive of positive clinical outcomes. In addition, while we intend to announce interim data from our clinical trials from time to time, such reports may be based on unaudited data provided by our clinical trial investigators. An audit or subsequent review of this data may change the conclusions drawn from this unaudited data provided by our clinical trial investigators indicating less promising results than we anticipate. In addition, our observations of clinical improvements, through clinician and assessor feedback or assessment tools in the Phase 1/2 clinical trial and Phase 2 open label study of pegzilarginase in patients with Arginase 1 Deficiency after cumulative doses, may not be representative of our observations with subsequently dosed patients out to a similar or longer duration of cumulative dosing. We have begun dosing in our single, global pivotal Phase 3 PEACE clinical trial to evaluate the safety and efficacy of pegzilarginase. Due to COVID-19, all of our clinical trial sites temporarily suspended screening, limiting patient access, and resulting in some missed dosing appointments for patients. All patients that had initially paused dosing due to COVID-19 had restarted treatment by September 2020. However, patients may miss dosing appointments in the future, whether due to COVID-19 or other reasons. The Phase 3 PEACE trial protocol allows for a patient to miss a few dosing appointments without being disqualified from the trial, but an excessive number of missed doses may adversely affect the usefulness of the data collected in the trial or require us to exclude a subject from the per protocol analysis. Furthermore, while our completed Phase 1/2 clinical trial for the treatment of patients with Arginase 1 Deficiency primarily evaluated the safety of our product candidate, such nonclinical and clinical data are often susceptible to varying interpretations and analyses, and many companies that have believed their product candidates performed satisfactorily in nonclinical studies and clinical trials have nonetheless failed to obtain marketing approval of their products. Further, while we have conducted prior clinical trials of pegzilarginase in certain oncology indications, we are currently exploring partnership opportunities for further development in oncology. It is impossible to predict when or if any of our product candidates will prove effective or safe in humans or will receive regulatory approval. We may experience delays in our ongoing and planned clinical trials and we do not know whether planned clinical trials will begin or enroll subjects on time, whether enrolled subjects will complete trials on time or at all, whether they will need to be redesigned or whether they will be able to be completed on schedule, if at all. There can be no assurance that the Health Authorities will allow us to begin clinical trials or that they will not put any of the trials for any of our product candidates that enter or have entered clinical development on clinical hold in the future. We may experience numerous unforeseen events during, or as a result of, clinical trials that could delay or prevent our ability to receive marketing 32 approval or commercialize our product candidates. Clinical trials may be delayed, suspended or prematurely terminated because costs are greater than we anticipate or for a variety of reasons, such as: • • • • • • • • • • • • • • • • • • • delay or failure in reaching agreement with the Health Authorities on a trial design that we are able to execute; delay or failure in obtaining authorization to commence a trial or inability to comply with conditions imposed by a regulatory authority regarding the scope or design of a clinical trial; delays in reaching, or failure to reach, agreement on acceptable clinical trial contracts or clinical trial protocols with planned trial sites; modifications to our ongoing and planned clinical trial protocols due to regulatory requirements or decisions made by regulatory authorities; geographic complexities of managing the design and completion of clinical trials across different Health Authorities in the United States, Canada, Europe, etc.; reports of safety issues, side effects or dose-limiting toxicities, or any additional or more severe safety issues in addition to those observed to date; inability, delay, or failure in identifying and maintaining a sufficient number of trial sites, many of which may already be engaged in other clinical programs; delay or failure in recruiting and enrolling suitable subjects to participate in one or more clinical trials; delay or failure in having subjects complete a trial or return for post-treatment follow-up. For instance, two patients previously dosed in our Phase 1/2 clinical trial of pegzilarginase for the treatment of Arginase 1 Deficiency withdrew from the trial due to personal reasons; clinical sites and investigators deviating from the trial protocol, failing to conduct the trial in accordance with regulatory requirements, or dropping out of a trial; a clinical hold for any of our ongoing or planned clinical trials, including for pegzilarginase, where a clinical hold in a trial in one indication could result in a clinical hold for clinical trials in other indications; clinical trials of our product candidates may produce negative or inconclusive results, and we may decide, or regulators may require us, to conduct more clinical trials than we anticipate or abandon product development programs; the number of patients required for clinical trials of our product candidates may be larger than we anticipate, enrollment in these clinical trials may be slower than we anticipate or insufficient or participants may drop out of these clinical trials at a higher rate than we anticipate; we may experience delays or difficulties in the enrollment of patients, including the identification of patients with Arginase 1 Deficiency and Homocystinuria; our third-party contractors may fail to comply with regulatory requirements or meet their contractual obligations to us in a timely manner, or at all; we may have difficulty partnering with experienced CROs that can run our clinical trials effectively; regulators may require that we or our investigators suspend or terminate clinical research for various reasons, including noncompliance with regulatory requirements or a finding that the participants are being exposed to unacceptable health risks or privacy concerns; the supply or quality of our product candidates or other materials necessary to conduct clinical trials of our product candidates may be insufficient or inadequate; or there may be changes in governmental regulations or administrative actions. If we are required to modify our ongoing clinical trial protocols, conduct additional clinical trials or other testing of our product candidates beyond those that we currently contemplate, if we are unable to successfully initiate or complete clinical trials of our product candidates or other testing, if the results of these trials or tests do not demonstrate sufficient clinical benefit or if our product candidates do not have an acceptable safety profile, we may: • • be delayed in obtaining marketing approval for our product candidates; not obtain marketing approval at all; 33                                           • • • • • cease development of our product candidates; obtain approval for indications or patient populations that are not as broad as intended or desired; obtain approval with labeling that includes significant use or distribution restrictions or safety warnings that would reduce the potential market for our product candidates or inhibit our ability to successfully commercialize our product candidates; be subject to additional post-marketing restrictions and/or testing requirements; or have the product removed from the market after obtaining marketing approval. We do not know whether any of our planned or current nonclinical studies, or ongoing or planned clinical trials, will need to be restructured or will be completed on schedule, or at all. For example, in June 2017, we delayed enrollment of pediatric patients in our Phase 1/2 clinical trial of pegzilarginase for the treatment of Arginase 1 Deficiency due to a difference in opinion with the FDA on data required to support inclusion of pediatric patients. Although we reached an agreement with the FDA in November 2017 and began dosing pediatric patients, the FDA may require additional information or studies to be conducted, or impose conditions that could further delay or restrict our other planned clinical activities in the future. We began our global pivotal Phase 3 PEACE clinical trial in which we are studying plasma arginine reduction from baseline over 24 weeks as our primary endpoint. However, evidence of stabilization or improvement of clinical signs and symptoms of Arginase 1 Deficiency, such as our secondary endpoints, consisting of clinical outcome assessments focused primarily on mobility, as well as clinician and caregiver global impressions of effectiveness, may be required in addition to the primary endpoint to support approval. Certain of our clinical outcome secondary endpoints will be measured using motor assessments that have not been previously validated for Arginase 1 Deficiency, including the gross motor function classification system. Such motor assessments have only been validated in ambulatory children with cerebral palsy. We believe these motor functional assessments are translatable to Arginase 1 Deficiency patients given the similarities in symptoms of children with cerebral palsy and the Arginase 1 Deficiency populations, however the FDA or other Health Authorities may disagree. If we are unable to demonstrate sufficient improvement on such clinical endpoints, the FDA may determine that there is insufficient direct evidence of effectiveness or inadequate justification to support a full approval based on the biomarker endpoint we have chosen. The failure to demonstrate improvement on such clinical endpoints could be due to an insufficient duration on treatment to see such an effect. For example, the FDA indicated that our dosing duration for our Phase 3 PEACE clinical trial may not be adequate to assess for clinically meaningful changes. Similarly, our dosing duration for our Phase 3 PEACE clinical trial may not be adequate to assess safety and immunogenicity assessment of pegzilarginase. Significant nonclinical or clinical trial delays also could shorten any periods during which we may have the exclusive right to commercialize our product candidates or allow our competitors to bring products to market before we do and impair our ability to successfully commercialize our product candidates and may materially harm our business and results of operations. We may not be able to submit INDs, or foreign equivalents outside of the United States, to commence clinical trials for product candidates on the timeframes we expect, and even if we are able to, the Health Authorities may not permit us to proceed with planned clinical trials. We are currently conducting nonclinical development of our product candidates other than our clinical trials for pegzilarginase for the treatment of patients with Arginase 1 Deficiency and AGLE-177 for the treatment of patients with Homocystinuria. Progression of any candidate into clinical trials is inherently risky and dependent on the results obtained in nonclinical programs, and other potential results such as the results of other clinical programs and results of third-party programs. If results are not available when expected or problems are identified during therapy development, we may experience significant delays in clinical development. This may also impact our ability to achieve certain financial milestones and the expected timeframes to market any of our product candidates. Additionally, commencing any future clinical trials is subject to finalizing the trial design and submitting an IND, CTA or comparable submission in other jurisdictions. Even after we submit an IND, CTA or comparable submission in other jurisdictions, the Health Authorities could disagree that we have satisfied their requirements to commence our clinical trials, disagree with our study design, or may change their guidance criteria, which may require us to complete additional nonclinical studies or amend our protocols or impose stricter conditions on the commencement of clinical trials. Failure to submit or have effective INDs, CTAs or other comparable foreign equivalents and commence clinical programs will significantly limit our opportunity to generate revenue. 34             Our engineered human enzyme product candidates represent a novel therapeutic approach, which could result in heightened regulatory scrutiny, delays in clinical development, or delays in our ability to achieve regulatory approval or commercialization of our product candidates. Engineered human enzyme products are a new category of therapeutics. Because this is a relatively new and expanding area of novel therapeutic interventions, there can be no assurance as to the length of the trial period, the manufacturing and quality control standards required to be met by regulators, the number of patients the Health Authorities will require to be enrolled in the trials in order to establish the safety, efficacy, purity and potency of engineered human enzyme products, or that the data generated in these trials will be acceptable to the FDA or another applicable regulatory authority to support marketing approval. We have only initiated clinical trials for pegzilarginase and AGLE-177 for the treatment of certain conditions and have only dosed pegzilarginase in humans. We have not dosed any of our other product candidates in humans. Our existing and future planned clinical trials may reveal significant adverse events, toxicities or other side effects not seen in our nonclinical studies or early stage clinical trials and may result in a safety profile that could inhibit regulatory approval or market acceptance of any of our product candidates. In order to obtain marketing approval for any of our product candidates, we must demonstrate the safety and efficacy of the product candidate for the relevant clinical indication or indications through nonclinical studies and clinical trials as well as additional supporting data. If our product candidates are associated with undesirable side effects in nonclinical studies or clinical trials, in monotherapy or combination therapy, or have characteristics that are unexpected, we may need to interrupt, delay or abandon their development or limit development to more narrow uses or subpopulations in which the undesirable side effects or other characteristics are less prevalent, less severe or more acceptable from a risk-benefit perspective. We are currently conducting clinical trials for pegzilarginase for the treatment of patients with Arginase 1 Deficiency and AGLE-177 for the treatment of patients with Homocystinuria. Given the nature of the patient populations enrolled in these trials, we have observed and expect to continue to observe serious adverse events that could be related or unrelated to pegzilarginase and could impact the safety or efficacy of pegzilarginase and we may observe serious adverse events that could be related or unrelated to AGLE-177 and could impact the safety or efficacy of AGLE-177. We have also dosed, and may continue to dose, patients with pegzilarginase following compassionate use requests. While such patients are not monitored as part of our ongoing clinical trials, the occurrence of significant adverse events in such patients may negatively impact the prospects of our programs. In our prior clinical trials of pegzilarginase for the treatment of patients with advanced solid tumors and for the treatment of the patients with hematological malignancies AML and MDS, we have observed serious adverse events in some patients, including death. We have reported results from these trials in which we observed serious adverse events that were considered possibly or probably related to the administration of pegzilarginase including asthenia, fatigue, failure to thrive, hypertension, diarrhea, nausea, vomiting, dehydration, dizziness, intracranial hemorrhage, and encephalopathy. In our completed combination trial of pegzilarginase and pembrolizumab in patients with previously-treated small cell lung cancer, safety observations were consistent with prior studies of pegzilarginase in patients with cancer. In a completed Phase 1/2 clinical trial and an ongoing open-label extension study of pegzilarginase for the treatment of patients with Arginase 1 Deficiency, we have observed serious adverse events in some patients, including hypersensitivity and hyperammonemia, which were infrequent, expected and manageable. Hyperammonemia is an important metabolic effect experienced by some patients with Arginase 1 Deficiency. None of the patients in these trials discontinued due to adverse events, while three patients discontinued for non-medical reasons.   Subjects in our ongoing and planned clinical trials with pegzilarginase and AGLE-177 may suffer minor, significant, serious, or even life-threatening adverse events, including those that are drug-related. Subjects in our ongoing and planned clinical trials may also suffer side effects not yet observed in any of our prior and ongoing clinical or nonclinical studies, including, but not limited to, toxicities to the nervous system, liver, heart, lung, kidney, blood, pulmonary or immune system. We have not dosed any of our other product candidates in humans. Testing in animals, such as our primate studies for pegzilarginase and AGLE-177, may not uncover all side effects in humans or any observed side effects in animals may be more severe in humans. For example, it is possible that patients’ immune systems may recognize our engineered human enzymes as foreign and trigger an immune response. This risk is heightened in patients with many genetic enzyme deficiencies who lack the target enzyme, including patients with Arginase 1 Deficiency that we are treating in our global pivotal Phase 3 PEACE trial, our Phase 2 trial open label 35 extension study, and any future clinical trials we conduct for this rare genetic disease or in trials in patients with Homocystinuria with AGLE-177. In addition, our product candidates such as pegzilarginase and AGLE-177 break down target amino acids, thereby releasing metabolites into the bloodstream. Some patients may be sensitive to these metabolites, increasing the risk of an adverse reaction due to treatment, which risk may not be able to be mitigated through dosing. Finally, although our engineered human enzyme product candidates such as pegzilarginase and AGLE-177 are engineered from the human genome, pegzilarginase and AGLE-177 are produced in E. coli. This manufacturing process could lead to the products being more likely to trigger an immune response than we expect. To the extent significant adverse events or other side effects are observed in any of our clinical trials, we may have difficulty recruiting patients to the clinical trial, patients may drop out of our trial, or we may be required to abandon the trial or our development efforts of that product candidate altogether. Some potential therapeutics developed in the biotechnology industry that initially showed therapeutic promise in early-stage studies have later been found to cause side effects that prevented their further development. Even if the side effects do not preclude the drug from obtaining or maintaining marketing approval, undesirable side effects may inhibit market acceptance of the approved product due to its tolerability versus other therapies. Any of these developments could materially harm our business, financial condition and prospects. Further, toxicities associated with our product candidates may also develop after regulatory approval and lead to the withdrawal of the product from the market. We cannot predict whether our product candidates will cause organ or other injury in humans that would preclude or lead to the revocation of regulatory approval based on nonclinical studies or early stage clinical testing. If we experience delays or difficulties in the enrollment of patients in our ongoing or planned clinical trials, our receipt of necessary regulatory approvals could be delayed or prevented. We may not be able to initiate or continue our ongoing or planned clinical trials if we are unable to locate and enroll a sufficient number of eligible patients to participate in these trials as required by the Health Authorities. For example, the timing of our Phase 3 PEACE trial has been impacted by COVID-19. All of our clinical trial sites temporarily suspended screening, limiting patient access, and resulting in some missed dosing appointments for patients. All patients that had initially paused dosing due to COVID-19 had restarted treatment by September 2020. However, patients may miss dosing appointments in the future, whether due to COVID-19 or other reasons. Furthermore, we have initiated a Phase 1/2 clinical trial of AGLE-177 for Homocystinuria in the second quarter of 2020, however, the timing of first patient dosing will depend on determinations by individual sites given COVID-19 and our priorities at this time are to avoid further overburdening hospital staff and to minimize the risk of trial participants exposure to COVID-19. Also, many of our product candidates, including pegzilarginase and AGLE-177, initially target indications that may be characterized as orphan markets, which can prolong the clinical trial timeline if sufficient patients cannot be enrolled in a timely manner. Arginase 1 Deficiency is a rare disorder, and there are no published reports of disease prevalence. We commissioned a genetic prevalence analysis and based on that analysis estimate the Arginase 1 Deficiency population is greater than 2,500 patients in the global addressable markets. The genetic prevalence-based methodology is intended to account for misdiagnosis of the disease and to address limitations in newborn screening methodology, including naturally low arginine levels in newborns and lack of geographic availability or standardization of testing. Presently, only 34 U.S. states and jurisdictions perform newborn screening for Arginase 1 Deficiency, and newborn screening is not currently widely performed in European countries. Due to screening requirements and enrollment restrictions in our clinical trial protocol, or any additional restrictions that may be imposed by regulatory agencies, not all patients may be eligible for inclusion in our planned global pivotal Phase 3 PEACE clinical trial. As of January 2021, we have identified over 300 Arginase 1 Deficiency patients in the global addressable markets, primarily in the U.S. and France, Germany, Italy, Spain and the United Kingdom, referred to as the EU5, representing approximately 65% and 30% of the estimated genetic prevalence populations in the U.S. and EU5, respectively. We estimate the patient population for Homocystinuria may exceed 30,000 in global addressable markets, but we may not be able to initiate the trial as expected or locate and enroll a sufficient number of eligible patients as required by the Health Authorities, and the necessary regulatory approvals could be delayed or prevented. Delays in patient enrollment could result in increased costs, delays in advancing our product development, delays in testing the effectiveness of our technology or termination of the clinical trials altogether. Patient enrollment is affected by factors including: • • the severity of the disease under investigation; the design of the clinical trial protocol; 36     • • • • • • • • • • the novelty of the product candidate and acceptance by physicians; the patient eligibility criteria for the study in question; the size of the total patient population; the design of the clinical trials; the perceived risks and benefits of the product candidate under study; the availability and efficacy of competing therapies and clinical trials; our payments for conducting clinical trials; the patient referral practices of physicians; the ability to monitor patients adequately during and after treatment with the product candidate; and the proximity and availability of clinical trial sites for prospective patients. In addition, some patients with Arginase 1 Deficiency suffer from heightened levels of ammonia, or hyperammonemia. Horizon Therapeutics plc actively markets both RAVICTI (glycerol phenylbutyrate) and BUPHENYL (sodium phenylbutyrate) to treat patients with urea cycle disorders suffering from hyperammonemia. Some patients who may be eligible for our ongoing or planned clinical trials may instead pursue treatment for this aspect of their condition by taking RAVICTI (glycerol phenylbutyrate). Our inability to enroll a sufficient number of patients for any of our clinical trials could result in significant delays and could require us to abandon one or more clinical trials altogether. Enrollment delays in our clinical trials may result in increased development costs for our product candidates and in delays to commercially launching our product candidates, if approved, which would cause the value of our company to decline and limit our ability to obtain additional financing. The safety or efficacy profile of pegzilarginase, or any current or future product candidates, may differ in combination therapy with other existing or future drugs, and therefore may preclude its further development or approval, which would materially harm our business. From time to time, our commercialization strategy may include the combination of our product candidates with third-parties’ products or product candidates. For example, we completed a combination trial with Merck to evaluate the combination of pegzilarginase with Merck’s anti-PD-1 therapy, KEYTRUDA® (pembrolizumab), for the treatment of patients with small cell lung cancer. Such combination studies involve additional risks due to their reliance on circumstances outside our control, such as those relating to the availability and marketability of the third-party product involved in the study. Additionally, we may be unable to secure and maintain a sufficient supply of such third-party products when needed on commercially reasonably terms. Any such shortages could cause us to delay or terminate our combination trials. It is also difficult to predict the way in which pegzilarginase, or any current or future product candidate, will interact with third-party products used in combination clinical trials. As a result, such combination trials may demonstrate reduced efficacy, increase or exacerbate side effects that have been seen with pegzilarginase, or any current or future product candidate, alone, or result in new side effects that have not previously been identified with pegzilarginase, or any current or future product candidate, alone. In addition, data obtained from any combination trials may be subject to a variety of interpretations. For instance, positive data may not guarantee the ability to move forward due to changes in the competitive or regulatory environment for the treatment of targeted indications, and failure to achieve our primary endpoints may not necessarily preclude a viable commercial path. Any undesirable side effects, lack of efficacy seen in combination trials, changing regulatory and commercial requirements for approval, differing interpretation of clinical data or other unforeseen circumstances may affect our ability to continue with and obtain regulatory approval for the combination therapy, as well as our ability to continue with and obtain regulatory approval for pegzilarginase monotherapy. Further, evaluating pegzilarginase, or any current or future product candidate, in combination with other products in clinical development may require us to establish collaborations, licensing arrangements or alliances with third parties. There is no assurance that we will be able to enter into such arrangements on favorable terms, or at all. Even though we have obtained orphan drug designation for pegzilarginase in the United States and Europe for the treatment of hyperargininemia, and for AGLE-177 in the United States and Europe for the treatment of patients with Homocystinuria, we may not obtain or maintain orphan drug exclusivity for pegzilarginase or AGLE- 37                       177 and we may not obtain orphan drug designation or exclusivity for any of our other product candidates or indications. Regulatory authorities in some jurisdictions, including the United States and Europe, may designate drugs or biologics for relatively small patient populations as orphan drugs. Under the Orphan Drug Act, the FDA may designate a product as an orphan drug if it is a drug or biologic intended to treat a rare disease or condition, which is generally defined as a patient population of fewer than 200,000 individuals in the United States. Similarly, the European Commission may designate a product as an orphan drug under certain circumstances. Generally, if a product with an orphan drug designation subsequently receives the first marketing approval for the indication for which it has such designation, the product is entitled to a period of marketing exclusivity, which precludes the FDA or the EMA from approving another marketing application for the same drug for the same disease for that time period. The applicable period is seven years in the United States and ten years in the European Union. The European exclusivity period can be reduced to six years if a drug no longer meets the criteria for orphan drug designation or if the drug is sufficiently profitable so that market exclusivity is no longer justified. Orphan drug exclusivity may be lost if the FDA or EMA determines that the request for designation was materially defective or if the manufacturer is unable to assure sufficient quantity of the drug to meet the needs of patients with the rare disease or condition. We have obtained orphan drug designation in the United States and Europe for pegzilarginase for the treatment of patients with Arginase 1 Deficiency. We have also received orphan drug designation in the United States and Europe for AGLE-177 for the treatment of patients with Homocystinuria. A company that first obtains FDA or EMA approval for a designated orphan drug for the designated rare disease or condition receives orphan drug marketing exclusivity for that drug for the designated disease for a period of seven years in the United States or ten years in the European Union, respectively. This orphan drug exclusivity prevents the FDA or EMA from approving another application, including a Biologics License Application, or BLA, in the United States or a MAA in the European Union, to market a drug containing the same principal molecular structural features for the same orphan indication, except in very limited circumstances, including when the FDA or the EMA concludes that the later drug is safer, more effective or makes a major contribution to patient care. In addition, a designated orphan drug may not receive orphan drug exclusivity if it is approved for a use that is broader than the indication for which it received orphan designation. Even though we have received orphan drug designation for pegzilarginase for the treatment of Arginase 1 Deficiency in the United States and Europe, and for AGLE-177 for the treatment of patients with Homocystinuria in the United States and Europe, we may not be the first to obtain marketing approval for the orphan-designated indication in these jurisdictions due to the uncertainties associated with developing pharmaceutical product candidates. We may also seek to obtain orphan drug designations in other international jurisdictions. However, there is no guarantee that we would be able to do so on a timely basis, or at all. Further, even if we obtain orphan drug exclusivity for a product, that exclusivity may not effectively protect the product from competition because different drugs with different active moieties can be approved for the same condition or a drug with the same principal molecular structural features can be approved for a different indication. Orphan drug designation neither shortens the development time or regulatory review time of a drug nor gives the drug any advantage in the regulatory review or approval process. In addition, even if we intend to seek orphan drug designation for other product candidates or indications, we may never receive such designations or obtain orphan drug exclusivity. A Rare Pediatric Disease designation by the FDA does not guarantee that the NDA or BLA for the product will qualify for a priority review voucher upon approval, and it does not lead to a faster development or regulatory review process, or increase the likelihood that any of our product candidates will receive marketing approval. Under the Rare Pediatric Disease Priority Review Voucher program, upon the approval of a qualifying BLA or NDA for the treatment of a rare pediatric disease, the sponsor of such an application would be awarded a rare pediatric disease priority review voucher that can be used to obtain priority review for a subsequent BLA or NDA. In September 2018, the FDA notified us that we obtained Rare Pediatric Disease designation for pegzilarginase for the treatment of patients with Arginase 1 Deficiency, and in November 2020, the FDA notified us that we obtained Rare Pediatric Disease designation for AGLE-177 for the treatment of Homocystinuria. On December 27, 2020, the Creating Hope Reauthorization Act extended the Rare Pediatric Disease Priority Review Voucher Program, and after September 30, 2024, the FDA may only award a voucher for an approved rare pediatric disease product application if the sponsor has rare pediatric disease designation for the drug, and that designation was granted by September 30, 2024. After September 30, 2026, FDA may not award any rare pediatric disease priority review vouchers. However, there is no guarantee that any of our product candidates will be approved by that date, or at all, and, therefore, we may not be in a position to obtain a priority review voucher prior to expiration of the program, unless Congress further reauthorizes the program. Additionally, designation of a drug for a rare pediatric disease does not guarantee that a BLA will meet the other eligibility criteria for a rare pediatric disease priority review voucher at the time the application is approved. Finally, a Rare Pediatric Disease designation does not lead to faster development or regulatory review of the product, or increase the likelihood that it will receive marketing approval. 38 Failure to obtain marketing approval in international jurisdictions would prevent our product candidates from being marketed abroad.  In order to market and sell our products in the European Union and many other jurisdictions, we or our third-party collaborators must obtain separate marketing approvals and comply with numerous and varying regulatory requirements. The approval procedure varies among countries and can involve additional testing and different criteria for approval. The time required to obtain approval may differ substantially from that required to obtain FDA approval. The regulatory approval process outside the United States generally includes all of the risks associated with obtaining FDA approval. In addition, in many countries outside the United States, it is required that the product be approved for reimbursement before the product can be approved for sale in that country. We, or our third-party collaborators, may not obtain approvals from regulatory authorities outside the United States on a timely basis, if at all. Approval by the FDA does not ensure approval by regulatory authorities in other countries or jurisdictions, and approval by one regulatory authority outside the United States does not ensure approval by regulatory authorities in other countries or jurisdictions or by the FDA. However, failure to obtain approval in some countries or jurisdictions may compromise our ability to obtain approval elsewhere. We may not be able to file for marketing approvals and may not receive necessary approvals to commercialize our products in any market. We or third parties may not be successful in developing diagnostic assays, if required for our product candidates. In developing a product candidate for some indications, we may decide to use a biomarker-based test to identify patients for enrollment and, or, monitor patients in clinical trials. In such case, the FDA may require the development and regulatory approval of a companion diagnostic assay as a condition to approval of the product candidate. Alternatively, there may be clinical benefits for some enzyme-based therapies in enhancing currently available biochemical monitoring approaches. While we are not aware of any precedents requiring such approaches for regulatory approval, FDA or other regulatory authorities could request that new biochemical monitoring approaches are available to support some product candidates. Clinical trials that utilize a biomarker-based test to select patients are likely to take longer and require additional funding. We do not have experience or capabilities in developing or commercializing these companion diagnostics and plan to rely in large part on third parties to perform these functions. Some diagnostic assays are subject to regulation by the FDA as medical devices and require separate regulatory approval prior to the use of such diagnostic assays with a therapeutic product candidate. If we, or any third parties that we engage to assist us, are unable to successfully develop companion diagnostic assays for use with our product candidates, or experience delays in development, we may be unable to identify patients with the specific profile targeted by our product candidates for enrollment in our clinical trials. Accordingly, further investment may be required to further develop or obtain the required regulatory approval for the relevant diagnostic assay, which would delay or substantially impact our ability to conduct further clinical trials or obtain regulatory approval. In addition, if a companion diagnostic is necessary for any of our product candidates, a delay in the development of the assay, or the delay or failure to obtain regulatory approval of the companion diagnostic would delay or prevent the approval of the therapeutic product candidate. Alternatively, we may also make the decision that our therapy does not require a companion diagnostic, however the Health Authorities may disagree and require the development and regulatory approval of a companion diagnostic assay as a condition of approval of the product candidate, creating additional costs and a delay in bringing our product candidate to market. We expect to expand our development and regulatory capabilities and potentially implement sales, marketing and distribution capabilities, and, as a result, we may encounter difficulties in managing our growth, which could disrupt our operations. We expect to experience significant growth in the number of our employees and the scope of our operations, particularly in the areas of product candidate development, regulatory affairs and, if any of our product candidates receives marketing approval, sales, marketing and distribution. We currently do not have a marketing or sales team for the marketing, sales and distribution of any of our product candidates that are potentially able to obtain regulatory approval. In order to commercialize any product candidates, we must build on a territory-by-territory basis marketing, sales, distribution, managerial and other non-technical capabilities or make arrangements with third parties to perform these services, and we may not be successful in doing so. If our product candidates receive regulatory approval, we intend to establish an internal sales or marketing team with technical expertise and supporting distribution capabilities to commercialize our product candidates, which will be expensive and time consuming and will require significant attention of our executive officers to manage. We will also have to compete with other pharmaceutical and biotechnology companies to recruit, hire, train and retain marketing and sales personnel. Any failure or delay in the development of our internal sales, marketing and distribution capabilities would adversely impact the commercialization of any of our product candidates that we obtain approval to market. 39 With respect to the commercialization of all or certain of our product candidates, we may choose to collaborate, either globally or on a territory-by-territory basis, with third parties that have direct sales forces and established distribution systems, either to augment our own sales force and distribution systems or in lieu of our own sales force and distribution systems. We may have little or no control over the marketing and sales efforts of such third parties and our revenue from product sales may be lower than if we had commercialized our product candidates ourselves. We also face competition in our search for third parties to assist us with the sales and marketing efforts of our product candidates. If we are unable to enter into such arrangements when needed on acceptable terms, or at all, we may not be able to successfully commercialize any of our product candidates that receive regulatory approval or any such commercialization may experience delays or limitations. If we are not successful in commercializing our product candidates, either on our own or through collaborations with one or more third parties, our future product revenue will suffer and we may incur significant additional losses. To manage our anticipated future growth, we must continue to implement and improve our managerial, operational and financial systems, expand our facilities and continue to recruit and train additional qualified personnel. Due to our limited financial resources and the limited experience of our management team in managing a public company with such anticipated growth, we may not be able to effectively manage the expansion of our operations or recruit and train additional qualified personnel. The expansion of our operations may lead to significant costs and may divert our management and business development resources. Any inability to manage growth could delay the execution of our business plans or disrupt our operations. We may not be successful in our efforts to identify additional product candidates. Due to our limited resources and access to capital, we must prioritize development of certain product candidates, which may prove to be wrong and may adversely affect our business. Although we intend to explore other therapeutic opportunities, in addition to the product candidates that we are currently developing, we may fail to identify viable new product candidates for clinical development for a number of reasons. If we fail to identify additional potential product candidates, our business could be materially harmed. Research programs to pursue the development of our existing and planned product candidates for additional indications and to identify new product candidates and disease targets require substantial technical, financial and human resources whether or not they are ultimately successful. Our research programs may initially show promise in identifying potential indications and/or product candidates, yet fail to yield results for clinical development for a number of reasons, including: • • • • the research methodology used may not be successful in identifying potential indications and/or product candidates; potential product candidates may, after further study, be shown to have harmful adverse effects or other characteristics that indicate they are unlikely to be effective drugs; it may take greater human and financial resources than we will possess to identify additional therapeutic opportunities for our product candidates or to develop suitable potential product candidates through internal research programs, thereby limiting our ability to develop, diversify and expand our product portfolio; or alternative research or therapeutic methodologies may be more efficient than the research approaches provided by Aeglea.   Because we have limited financial and human resources, we intend to initially focus on research programs and product candidates for a limited set of indications. As a result, we may forego or delay pursuit of opportunities with other product candidates or for other indications that later prove to have greater commercial potential or a greater likelihood of success. Our resource allocation decisions may cause us to fail to capitalize on viable commercial products or profitable market opportunities. Accordingly, there can be no assurance that we will ever be able to identify additional therapeutic opportunities for our product candidates or to develop suitable potential product candidates through internal research programs, which could materially adversely affect our future growth and prospects. We may focus our efforts and resources on potential product candidates or other potential programs that ultimately prove to be unsuccessful. 40         Risks Related to Commercialization If the market opportunities for our product candidates are smaller than we believe they are, our future product revenues may be adversely affected, and our business may suffer. Our understanding of both the number of people who suffer from conditions such as Arginase 1 Deficiency or Homocystinuria, as well as the potential subset of those who have the potential to benefit from treatment with our product candidates, are based on estimates. We expect our product candidates targeting rare diseases to target the smaller patient populations that suffer from the respective diseases we seek to treat. These estimates may prove to be incorrect and new studies may reduce the estimated incidence or prevalence of these diseases. The number of patients in the United States, Europe or elsewhere may turn out to be lower than expected, may not be otherwise amenable to treatment with our product candidates or patients may become increasingly difficult to identify and access, all of which would adversely affect our business, financial condition, results of operations and prospects. Further, there are several factors that could contribute to making the actual number of patients who receive our potential product candidates less than the potentially addressable market. These include the lack of widespread availability of, and limited reimbursement for, new therapies in many underdeveloped markets. Additionally, our assumptions regarding the addressable market may be incorrect and the addressable market may change over time, including from the announcement date of a product candidate to the approval by Health Authorities and commercialization. Even if we obtain significant market share for our product candidates, because certain of the potential target populations are small, we may never achieve profitability without obtaining regulatory approval for additional indications. Even if any of our product candidates receives marketing approval, it may fail to achieve the degree of market acceptance by physicians, patients, third-party payors and others in the medical community necessary for commercial success. Even if any of our product candidates receives marketing approval, it may nonetheless fail to gain sufficient market acceptance by physicians, patients, third-party payors and others in the medical community necessary for commercial success. Current treatments for Arginase 1 Deficiency and Homocystinuria include dietary protein restrictions and for Arginase 1 Deficiency, in some instances, ammonia-scavenging drugs such as RAVICTI (glycerol phenylbutyrate). If our product candidates do not achieve an adequate level of acceptance, we may never generate significant product revenues and we may not become profitable. The degree of market acceptance of our product candidates, if approved for commercial sale, will depend on a number of factors, including: • • • • • • • • • • • their efficacy, safety and other potential advantages compared to alternative treatments; our ability to offer them for sale at competitive prices; their convenience and ease of administration compared to alternative treatments; the willingness of the target patient population to try new therapies and of physicians to prescribe these therapies; the ability of healthcare professionals to accurately identify and diagnose patients with the relevant/indicated condition; the strength of marketing and distribution support; the availability of third-party coverage and adequate reimbursement for our product candidates; the prevalence and severity of their side effects; any restrictions on the use of our product candidates together with other medications; interactions of our product candidates with other products patients are taking; and inability of patients with certain medical histories to take our product candidates. We face significant competition from other biotechnology and pharmaceutical companies and our operating results will suffer if we fail to compete effectively. The biotechnology and pharmaceutical industries are intensely competitive. We have competitors both in the United States and internationally, including major multinational pharmaceutical companies, biotechnology companies, universities and other research institutions. Many of our competitors have substantially greater financial, technical and other resources, such as larger research and development staff and experienced marketing and manufacturing organizations and well-established sales forces. Competition may increase further as a result of advances in the commercial 41                       applicability of technologies and greater availability of capital for investment in these industries. Our competitors may succeed in developing, acquiring or licensing, on an exclusive basis, product candidates that are more effective or less costly than any product candidate that we are currently developing or that we may develop. There are multiple approved treatments and investigational therapies for the management of hyperammonemia commonly experienced by patients with urea cycle disorders. While these products – known as ammonia scavengers – do not target the core metabolic defect of Arginase 1 Deficiency, they can help patients manage their elevated ammonia levels. Horizon Therapeutics plc actively markets two branded ammonia scavenger therapies (RAVICTI (glycerol phenylbutyrate) and BUPHENYL (sodium phenylbutyrate)), and at least one generic formulation of sodium phenylbutyrate is commercially available. From a clinical development perspective, Acer Therapeutics Inc. is developing a taste-masked, immediate- release formulation of sodium phenylbutyrate for the treatment of hyperammonemia and recently announced their intent to enter a global development and commercialization agreement with Relief Therapeutics Holding AG. We anticipate a competitive landscape in Homocystinuria. There is currently one FDA-approved therapy for the treatment of Homocystinuria and multiple medical foods. CYSTADANE® (betaine anhydrous for oral solution) was approved by the FDA in 1986 and is currently marketed in North America by Recordati Rare Diseases Inc. We are also aware of one investigational therapy in clinical development for the treatment of Homocystinuria. Travere Therapeutics Inc. recently acquired Orphan Technologies Ltd., a clinical-stage biopharmaceutical company focused on the development of OT-58 (now TVT-058) for the treatment of Classical Homocystinuria. Travere is enrolling a Phase 1/2 study of TVT-058, an enzyme replacement therapy in patients with Homocystinuria due to cystathionine β-synthase deficiency and has stated that topline data from this study will be available in 2021. Additionally, Erytech Pharma SA has a product candidate for Homocystinuria in preclinical development. It is possible that competitors may produce, develop, and commercialize therapeutics, or utilize other approaches to treat Homocystinuria. Our ability to compete successfully will depend largely on our ability to leverage our experience in product candidate discovery and development to: • • • • • • discover and develop product candidates that are sufficiently differentiated from other products in the market; attract qualified management, scientific, product development and commercial personnel; obtain and maintain patent and/or other proprietary protection for our product candidates and technologies; obtain required regulatory approvals; successfully launch and commercialize our approved products; and successfully collaborate with research institutions or pharmaceutical companies in the discovery, development and commercialization of new product candidates. The availability and price of our competitors’ products could limit the demand, and the price we are able to charge, for any of our product candidates, if approved. We will not achieve our business plan if acceptance is inhibited by price competition or the reluctance of patients, physicians, or payers to accept our product candidates. Established biotechnology companies may invest heavily to accelerate discovery and development of products that could make our product candidates less competitive. In addition, any new product that competes with an approved product must demonstrate compelling advantages in efficacy, convenience, tolerability and/or safety to establish a meaningfully differentiated value proposition for patients, physicians, and payers. Accordingly, our competitors may succeed in obtaining patent protection, receiving FDA or non-U.S. regulatory approval or discovering, developing and commercializing product candidates before we do, which would have a material adverse impact on our business. Many of our competitors have greater resources than we do and have established sales, marketing, and market access capabilities, whether internally or through third parties. We will not be able to successfully commercialize our product candidates without establishing sales and marketing capabilities internally or through strategic partners. The insurance coverage and reimbursement status of newly-approved products is uncertain. Failure to obtain or maintain adequate coverage and reimbursement for new or current product candidates could limit our ability to market those product candidates and decrease our ability to generate revenue. The availability and extent of reimbursement by governmental and private payors is essential for most patients to be able to afford expensive treatments. Sales of any of our product candidates that receive marketing approval will depend substantially, both in the United States and internationally, on the extent to which the costs of our product candidates will be paid by health maintenance, managed care, pharmacy benefit and similar healthcare management organizations, or reimbursed by government health administration authorities, private health coverage insurers and other third-party payors. 42             If reimbursement is not available, or is available only to limited levels, we may not be able to successfully commercialize our product candidates. Even if coverage is provided, the approved reimbursement amount may not be high enough to allow us to establish or maintain pricing sufficient to realize a sufficient return on our investment. There is significant uncertainty related to the insurance coverage and reimbursement of newly approved products. In the United States, the principal decisions about reimbursement for new products are typically made by the Centers for Medicare & Medicaid Services, or CMS, an agency within the U.S. Department of Health and Human Services since CMS decides whether and to what extent a new product will be covered and reimbursed under Medicare. Private payors tend to follow CMS to a substantial degree. It is difficult to predict what CMS will decide with respect to reimbursement for novel products such as ours since there is no body of established practices and precedents for these new products. Reimbursement agencies in Europe may be more conservative than CMS. For example, a number of cancer drugs have been approved for reimbursement in the United States and have not been approved for reimbursement in certain European countries. Outside the United States, international operations are generally subject to extensive governmental price controls and other market regulations, and we believe the increasing emphasis on cost-containment initiatives in Europe, Canada and other countries has and will continue to put pressure on the pricing and usage of therapeutics such as our product candidates. In many countries, particularly the countries of the European Union, the prices of medical products are subject to varying price control mechanisms as part of national health systems. In these countries, pricing negotiations with governmental authorities can take considerable time after the receipt of marketing approval for a product. To obtain reimbursement or pricing approval in some countries, we may be required to conduct a clinical trial that compares the cost-effectiveness of our product candidate to other available therapies. In general, the prices of products under such systems are substantially lower than in the United States. Other countries allow companies to fix their own prices for products but monitor and control company profits. Additional foreign price controls or other changes in pricing regulation could restrict the amount that we are able to charge for our product candidates. Accordingly, in markets outside the United States, the reimbursement for our products may be reduced compared with the United States and may be insufficient to generate commercially reasonable revenues and profits. Moreover, increasing efforts by governmental and third-party payors, in the United States and internationally, to cap or reduce healthcare costs may cause such organizations to limit both coverage and level of reimbursement for new products approved and, as a result, they may not cover or provide adequate payment for our product candidates. The U.S. government has similarly expressed concerns over the pricing of pharmaceutical products and there can be no assurance as to how this scrutiny will impact future pricing of pharmaceutical products generally. We expect to experience pricing pressures in connection with the sale of any of our product candidates due to the trend toward managed healthcare, the increasing influence of health maintenance organizations and additional legislative changes. The downward pressure on healthcare costs in general, particularly prescription drugs and surgical procedures and other treatments, has become very intense. As a result, increasingly high barriers are being erected to the entry of new products into the healthcare market. In addition to CMS and private payors, professional organizations such as the National Comprehensive Cancer Network and the American Society of Clinical Oncology can influence decisions about reimbursement for new products by determining standards for care. In addition, many private payors contract with commercial vendors who sell software that provide guidelines that attempt to limit utilization of, and therefore reimbursement for, certain products deemed to provide limited benefit to existing alternatives. Such organizations may set guidelines that limit reimbursement or utilization of our product candidates. Furthermore, some of our target indications, including for Arginase 1 Deficiency for pegzilarginase and for Homocystinuria for AGLE-177, are orphan indications where patient populations are small. In order for therapeutics that are designed to treat smaller patient populations to be commercially viable, the reimbursement for such therapeutics must be higher, on a relative basis, to account for the lack of volume. Accordingly, we will need to implement a coverage and reimbursement strategy for any approved product candidate that accounts for the smaller potential market size. If we are unable to establish or sustain coverage and adequate reimbursement for any future product candidates from third-party payors, the adoption of those products and sales revenue will be adversely affected, which, in turn, could adversely affect the ability to market or sell those product candidates, if approved, and ultimately our financial results. 43 Our product candidates for which we intend to seek approval as biologic products may face competition sooner than anticipated. With the enactment of the Biologics Price Competition and Innovation Act of 2009, or BPCIA, an abbreviated pathway for the approval of biosimilar biological products (both highly similar and interchangeable biological products) was created. The abbreviated regulatory pathway establishes legal authority for the FDA to review and approve biosimilar biologics, including the possible designation of a biosimilar as interchangeable based on its similarity to an existing reference product. Under the BPCIA, an application for a biosimilar product cannot be approved by the FDA until 12 years after the first licensure of date of the reference product licensed under a BLA. On March 6, 2015, the FDA approved the first biosimilar product under the BPCIA. However, the law is complex and is still being interpreted and implemented by the FDA. As a result, its ultimate impact, implementation, and meaning are subject to uncertainty. While it is uncertain when the processes intended to implement BPCIA may be fully adopted by the FDA, any such processes could have a material adverse effect on the future commercial prospects for our biological products. A biological product submitted for licensure under a BLA is eligible for a period of exclusivity that commences on the date of its licensure, unless its date of licensure is not considered a date of first licensure because it falls within an exclusion under the BPCIA. There is a risk that this exclusivity could be shortened due to congressional action or otherwise, potentially creating the opportunity for biosimilar competition sooner than anticipated. Additionally, this period of regulatory exclusivity does not apply to companies pursuing regulatory approval via their own traditional BLA, rather than via the abbreviated pathway. Most states have enacted substitution laws that permit substitution of only interchangeable biosimilars. The extent to which a highly similar biosimilar, once approved, will be substituted for any one of our reference products that may be approved in a way that is similar to traditional generic substitution for non-biological products is not yet clear, and will depend on a number of marketplace and regulatory factors that are still developing. If we fail to develop additional product candidates, our commercial opportunity will be limited. Developing and obtaining regulatory approval for and commercializing any additional product candidates we identify will require substantial additional funding and is prone to the risks of failure inherent in medical product development. We cannot provide you any assurance that we will be able to successfully advance additional product candidates, if any, through the development process. Even if we receive FDA approval to market additional product candidates for the treatment of the diseases we target, we cannot assure you that any such product candidates will be successfully commercialized, widely accepted in the marketplace or more effective than other commercially available alternatives. If we are unable to successfully develop and commercialize additional product candidates, our commercial opportunity will be limited. Moreover, a failure in obtaining regulatory approval of additional product candidates may have a negative effect on the approval process of other product candidates of ours or result in losing approval of any approved product candidate. If in the future we are unable to establish U.S. or global sales and marketing capabilities or enter into agreements with third parties to sell and market our product candidates, we may not be successful in commercializing our product candidates if they are approved and we may not be able to generate any revenue We currently do not have a marketing or sales team for the marketing, sales and distribution of any of our product candidates that may receive regulatory approval. In order to commercialize any product candidates after approval, we must build on a territory-by-territory basis marketing, sales, distribution, managerial and other non-technical capabilities or make arrangements with third parties to perform these services, and we may not be successful in doing so. If our product candidates receive regulatory approval, we may decide to establish an internal sales or marketing team with technical expertise and supporting distribution capabilities to commercialize our product candidates, which will be expensive and time- consuming and will require significant attention of our executive officers to manage. Any failure or delay in the development of our internal sales, marketing and distribution capabilities would adversely impact the commercialization of any of our product candidates that we obtain approval to market. With respect to the commercialization of all or certain of our product candidates, we may choose to collaborate, either globally or on a territory-by-territory basis, with third parties that have direct sales forces and established distribution systems, either to augment our own sales force and distribution systems or in lieu of our own sales force and distribution systems. If we are unable to enter into or maintain such arrangements when needed on acceptable terms, or at all, we may not be able to successfully commercialize any of our product candidates that receive regulatory approval or any such commercialization may experience delays or limitations. If we are not successful in commercializing our product candidates, either on our own or through collaborations with one or more third parties, our future product revenue will suffer and we may incur significant additional losses. 44   Risks Related to Our Reliance on Third Parties We currently rely and will rely on third parties to conduct our ongoing and future planned clinical trials, and those third parties may not perform satisfactorily, including failing to meet deadlines for the completion of such trials. We currently rely and will continue to rely on third parties to provide manufacturing and clinical development capabilities. For example, we currently rely on third party contract manufacturing organizations, to manufacture and supply nonclinical and clinical trial quantities of the biological substance of our lead product candidate, pegzilarginase, AGLE-177 in Homocystinuria, and for additional pipeline product candidates. We also expect to continue to rely on such third parties to manufacture and supply commercial quantities of pegzilarginase, as well as AGLE-177 for our Phase 1/2 clinical trial. We rely on third-party CROs to conduct our ongoing and future planned clinical trials of pegzilarginase and AGLE-177. We do not plan to independently conduct clinical trials of our other product candidates. These agreements might terminate for a variety of reasons, including a failure to perform by the third parties. If we need to enter into alternative arrangements, that would delay our product development activities. Our reliance on these third parties for research and development activities will reduce our control over these activities but will not relieve us of our responsibilities. For example, we will remain responsible for ensuring that each of our ongoing and future planned clinical trials is conducted in accordance with the general investigational plan and protocols for the trial. Moreover, the FDA requires us to comply with regulatory standards, commonly referred to as good clinical practices for conducting, recording and reporting the results of clinical trials to assure that data and reported results are credible and accurate and that the rights, integrity and confidentiality of trial participants are protected. Other countries’ regulatory agencies also have requirements for clinical trials with which we must comply. We also will be required to register ongoing clinical trials and post the results of completed clinical trials on a government-sponsored database, ClinicalTrials.gov, within specified timeframes. Failure to do so can result in fines, adverse publicity and civil and criminal sanctions. Furthermore, these third parties may also have relationships with other entities, some of which may be our competitors. If these third parties do not successfully carry out their contractual duties, meet expected deadlines or conduct our ongoing and future planned clinical trials in accordance with regulatory requirements or our stated protocols, we will not be able to complete our clinical trials, obtain, or may be delayed in obtaining, marketing approvals for our product candidates and will not be able to, or may be delayed in our efforts to, successfully commercialize our product candidates. Further, to meet the demand for COVID-19 vaccine production, manufacturers are required to prioritize rated orders issued by the Federal Emergency Management Agency pursuant to the U.S. Defense Production Act of 1950, or the DPA. The potential for manufacturing facilities and materials to be commandeered under the DPA, or equivalent foreign legislation, could make it more difficult to obtain materials or manufacturing slots for the products needed for our clinical trials or commercialization of our product candidates, which could lead to delays in these trials and successful commercialization. We also expect to rely on other third parties to store and distribute drug supplies for our clinical trials. Any performance failure, including due to COVID-19, on the part of our distributors could delay clinical development or marketing approval of our product candidates or commercialization of our product candidates, producing additional losses and depriving us of potential product revenue. We contract with third parties for the manufacture of our product candidates for nonclinical studies and our ongoing and future planned clinical testing and expect to continue to do so for commercialization. This reliance on third parties increases the risk that we will not have sufficient quantities of our product candidates at an acceptable cost and quality, which could delay, prevent or impair our development or commercialization efforts. We do not own or operate facilities for the manufacture of our product candidates. We currently have no plans to build our own clinical or commercial scale manufacturing capabilities. We rely, and expect to continue to rely, on third parties, for the manufacture of our product candidates for nonclinical studies and for our existing and future planned clinical trials. We also expect to rely on third parties, for commercial manufacture if any of our product candidates receive marketing approval. This reliance on third parties increases the risk that we will not have sufficient quantities of our product candidates or such quantities at an acceptable cost or quality, which could delay, prevent or impair our development or commercialization efforts. Any performance failure, including due to COVID-19, on the part of our existing or future manufacturers could delay clinical development or marketing approval. We do not currently have arrangements in place for redundant supply or a 45 source for bulk drug substance. Currently, third party manufacturers are supplying, and are expected to continue to supply, the drug substance requirements for our ongoing and planned clinical trials with pegzilarginase and AGLE-177. If such third party manufacturers cannot supply us with sufficient amounts, pursuant to product requirements as agreed, we may be required to identify alternative manufacturers, which would lead us to incur added costs and delays in identifying and qualifying any replacement. The formulation used in early studies is not a final formulation for commercialization. If we are unable to demonstrate that our commercial scale product is comparable to the product used in clinical trials, we may not receive regulatory approval for that product without additional clinical trials. We have contracted with third party manufacturers for certain studies related to potential commercial scale manufacturing of pegzilarginase, but there is no guarantee that such studies, the transfer of technology to or any potential manufacturing at such facility, will be completed successfully, on time, or at all. We also cannot guarantee that we will be able to make any required modifications within currently anticipated timeframes or that such modifications, if and when made, will obtain regulatory approval or that the new processes or modified processes will be successfully implemented by or transferred to any third-party contract suppliers within currently anticipated timeframes. These may require additional studies and may delay our clinical trials and/or commercialization. We expect to rely on third-party manufacturers, or third-party strategic partners for the manufacture of commercial supply of any product candidates for which our strategic partners or we obtain marketing approval. We may be unable to establish any additional agreements with third-party manufacturers, or to do so on acceptable terms. Even if we are able to establish agreements with third-party manufacturers on acceptable terms, such third-party manufacturers may have limited experience manufacturing pharmaceutical drugs for commercialization, and reliance on third-party manufacturers for the commercial supply of our products may expose us to various risks, including: • • • • possible noncompliance by the third party with regulatory requirements and quality assurance; the possible breach of the manufacturing agreement by the third party; the possible misappropriation of our proprietary information, including our trade secrets and know-how; and the possible termination or nonrenewal of the agreement by the third party at a time that is costly or inconvenient for us. Third-party manufacturers may not be able to comply with current good manufacturing practices, or cGMP, or similar regulatory requirements outside the United States. Although we do not have day-to-day control over third-party manufacturers’ compliance with these regulations and standards, we are responsible for ensuring compliance with such regulations and standards. Our failure, or the failure of our third-party manufacturers, to comply with applicable regulations could result in sanctions being imposed on us, including clinical holds, fines, injunctions, civil penalties, delays, suspension or withdrawal of approvals, license revocation, seizures or recalls of product candidates, operating restrictions and criminal prosecutions, any of which would significantly and adversely affect supplies of our product candidates and our business. If a third-party manufacturer’s facilities do not pass a pre-approval inspection or do not have a cGMP compliance status acceptable to the FDA or a comparable foreign regulatory agency, our product candidate will not be approved. In addition, the process of manufacturing and administering our product candidates is complex and highly regulated. As a result of the complexities, our manufacturing and supply costs are likely to be higher than those at more traditional manufacturing processes and the manufacturing process is less reliable and more difficult to reproduce. We also expect to rely on other third parties to store and distribute drug supplies for our clinical trials. Any performance failure on the part of our distributors could delay clinical development or marketing approval of our product candidates or commercialization of our product candidates, producing additional losses and depriving us of potential product revenue. Our product candidates and any products that we may develop may compete with other product candidates and products for access to manufacturing facilities. There are a limited number of manufacturers that operate under cGMP regulations and that might be capable of manufacturing for us. Our current and anticipated future dependence upon others for the manufacture of our product candidates may adversely affect our future profit margins and our ability to commercialize any product candidates that receive marketing approval on a timely and competitive basis. 46         Failure of any future third-party collaborators to successfully commercialize diagnostics developed for use with our therapeutic product candidates could harm our ability to commercialize these product candidates. We do not plan to develop diagnostics internally and, as a result, we are dependent on the efforts of our third-party strategic partners to successfully commercialize any needed diagnostics or monitoring assays. Our strategic partners: • • • • • • • may not perform their obligations as expected; may encounter production difficulties that could constrain the supply of the diagnostics; may have difficulties gaining acceptance of the use of the diagnostics in the clinical community; may not pursue commercialization of any diagnostics; may elect not to continue or renew commercialization programs based on changes in the strategic partners’ strategic focus or available funding, or external factors, such as an acquisition, that divert resources or create competing priorities; may not commit sufficient resources to the marketing and distribution of such diagnostic product candidates; and may terminate their relationship with us. If diagnostics needed for use with our therapeutic product candidates fail to gain market acceptance, our ability to derive revenues from sales of these therapeutic product candidates could be harmed. If our strategic partners fail to develop and commercialize these diagnostics, it could adversely affect and delay the development or commercialization of our therapeutic product candidates. We may not be successful in finding strategic partners for continuing development or commercialization of certain of our product candidates. We may seek to develop strategic partnerships for developing certain of our product candidates, due to capital costs required to develop the product candidates or manufacturing constraints. We may not be successful in our efforts to establish such a strategic partnership or other alternative arrangements for our product candidates because our research and development pipeline may be insufficient, our product candidates may be deemed to be at too early of a stage of development for collaborative effort or third parties may not view our product candidates as having the requisite potential to demonstrate safety and efficacy. In addition, we may be restricted under existing collaboration agreements from entering into future agreements with potential strategic partners. We cannot be certain that, following a strategic transaction or license, we will achieve an economic benefit that justifies such transaction. If we are unable to reach agreements with suitable strategic partners on a timely basis, on acceptable terms or at all, we may have to curtail the development of a product candidate, reduce or delay its development program, delay its potential commercialization, reduce the scope of any sales or marketing activities or increase our expenditures and undertake development or commercialization activities at our own expense. If we elect to fund development or commercialization activities on our own, or our existing or future partners are not able to adequately fund their development or commercialization activities pursuant to our arrangements, we may need to obtain additional expertise and additional capital, which may not be available to us on acceptable terms or at all. If we fail to enter into collaborations and do not have sufficient funds or expertise to undertake the necessary development and commercialization activities, we may not be able to further develop our product candidates and our business, financial condition, results of operations and prospects may be materially and adversely affected. We may be subject to claims by third parties asserting that our employees or we have misappropriated their intellectual property, or claiming ownership of what we regard as our own intellectual property. Many of our employees were previously employed at universities or other biotechnology or pharmaceutical companies, including our competitors or potential competitors. Although we try to ensure that our employees do not use the proprietary information or know-how of others in their work for us, we may be subject to claims that these employees or we have used or disclosed intellectual property, including trade secrets or other proprietary information, of any such employee’s former employer. Litigation may be necessary to defend against these claims. In addition, while it is our policy to require our employees and contractors who may be involved in the development of intellectual property to execute agreements assigning such intellectual property to us, we may be unsuccessful in executing such an agreement with each party who in fact develops intellectual property that we regard as our own. Our and their assignment agreements may not be self-executing or may be breached, and we may be forced to bring claims 47               against third parties, or defend claims they may bring against us, to determine the ownership of what we regard as our intellectual property. If we fail in prosecuting or defending any such claims, in addition to paying monetary damages, we may lose valuable intellectual property rights or personnel. Even if we are successful in prosecuting or defending against such claims, litigation could result in substantial costs and be a distraction to management. Risks Related to Government Regulation If we are not able to obtain, or if there are delays in obtaining, required regulatory approvals in the United States or in foreign jurisdictions, we will not be able to commercialize our product candidates, and our ability to generate revenue will be materially impaired. Our product candidates must be approved by the FDA pursuant to a BLA in the United States, and by the EMA pursuant to an MAA, and by other comparable regulatory authorities outside the United States prior to commercialization. The process of obtaining marketing approvals, both in the United States and internationally, is expensive and takes many years, if approval is obtained at all, and can vary substantially based upon a variety of factors, including the type, complexity and novelty of the product candidates involved. The approval procedure varies among countries and can involve additional testing. The time required to obtain approval in Europe or another non-U.S. jurisdiction may differ substantially from that required to obtain FDA approval. The regulatory approval process outside the United States generally includes all of the risks associated with obtaining FDA approval. In addition, in many countries outside the United States, it is required that the product be approved for reimbursement before the product can be approved for sale in that country. We or our third-party strategic partners may not obtain approvals from regulatory authorities outside the United States on a timely basis, if at all. Approval by the FDA does not ensure approval by regulatory authorities in other countries or jurisdictions, and approval by one regulatory authority outside the United States does not ensure approval by regulatory authorities in other countries or jurisdictions or by the FDA. Furthermore, the implementation of Brexit may disrupt the operation of any pre-and post-authorization clinical trial infrastructure and regulatory frameworks in Europe, as discussed further below. We may not be able to file for marketing approvals and may not receive necessary approvals to commercialize our product candidates in any market. Failure to obtain marketing approval for a product candidate will prevent us from commercializing the product candidate. We have not received approval to market any of our product candidates from regulatory authorities in any jurisdiction. We have no experience in filing and supporting the applications necessary to gain marketing approvals and expect to rely on third-party CROs to assist us in this process. Securing marketing approval requires the submission of extensive nonclinical and clinical data and supporting information to regulatory authorities for each therapeutic indication to establish the product candidate’s safety and efficacy. Securing marketing approval also requires the submission of information about the product manufacturing process to, and inspection of manufacturing facilities by, the regulatory authorities. Our product candidates may not be effective, may be only moderately effective or may prove to have undesirable or unintended side effects, toxicities or other characteristics that may preclude our obtaining marketing approval or prevent or limit commercial use. Regulatory authorities have substantial discretion in the approval process and may refuse to accept any application or may decide that our data are insufficient for approval and require additional nonclinical, clinical or other studies. In addition, varying interpretations of the data obtained from nonclinical and clinical testing could delay, limit or prevent marketing approval of a product candidate. Changes in marketing approval policies during the development period, changes in or the enactment of additional statutes or regulations, or changes in regulatory review for each submitted product application, may also cause delays in or prevent the approval of an application. Approval of our product candidates may be delayed or refused for many reasons, including the following: • • • • • • the Health Authorities may disagree with the design or implementation of our clinical trials; we may be unable to demonstrate to the satisfaction of the Health Authorities that our product candidates are safe and effective for any of their proposed indications; the results of clinical trials may not meet the level of statistical significance required by the Health Authorities for approval; we may be unable to demonstrate that our product candidates’ clinical and other benefits outweigh their safety risks; the Health Authorities may disagree with our interpretation of data from nonclinical programs or clinical trials; the data collected from clinical trials of our product candidates may not be sufficient to the satisfaction of the Health Authorities to support the submission of a BLA, MAA or other comparable submission in other jurisdictions or to obtain regulatory approval in the United States or elsewhere; 48             • • • the potential disruptions and uncertainty caused by Brexit implementation, as discussed below; the facilities of the third-party manufacturers with which we partner may not be adequate to support approval of our product candidates; and the approval policies or regulations of the Health Authorities may significantly change in a manner rendering our clinical data insufficient for approval. New products for the treatment of cancer frequently are initially indicated only for patient populations that have not responded to an existing therapy or have relapsed. If any of our product candidates receives marketing approval, the approved labeling may limit the use of our product candidates in this way, which could limit sales of the product. Also, any marketing approval we ultimately obtain may be limited or subject to restrictions or post-approval commitments that render the approved product not commercially viable. Additionally, the implementation of the United Kingdom’s exit from the European Union, or “Brexit”, may cause disruptions and uncertainty in the current regulatory framework in Europe. Brexit has resulted in the EMA moving from the United Kingdom to the Netherlands. In the United Kingdom, this transition may cause disruption in the administrative and medical scientific links between the EMA and MHRA. Following the United Kingdom’s departure from the European Union, it no longer automatically complies with the standards of clinical efficacy, safety and chemistry control, and manufacture as applied by the European Medicines Directive. Applications submitted for marketing authorization under the centralized EMA procedure will no longer be automatically validated for authorization in the United Kingdom, and the benefit-risk assessments conducted by the United Kingdom may not be consistent with the EMA conclusions. The cumulative effects of the disruption to the regulatory framework may add considerably to the development lead time to marketing authorization and commercialization of products in the European Union and/or the United Kingdom. In view of the current lack of detail and resolution with regard to the Brexit transition, we are unable to confidently predict the effects of such disruption to the regulatory framework in Europe, and as to how this may delay or impair any potential regulatory approvals, commercialization of any of our product candidates, and our ability to generate potential revenues.  If we experience delays in obtaining approval or if we fail to obtain approval of our product candidates, the commercial prospects for our product candidates may be harmed and our ability to generate revenues will be materially impaired. Any Fast Track Designation by the FDA, even if granted for any of our product candidates, may not lead to a faster development or regulatory review or approval process, and does not increase the likelihood that our product candidates will receive marketing approval. We have received Fast Track Designation from the FDA for our lead product candidate pegzilarginase for the treatment of hyperargininemia secondary to Arginase 1 Deficiency and may seek such designation for some or all of our product candidates. If a drug or biologic is intended for the treatment of a serious or life-threatening condition and the drug or biologic demonstrates the potential to address unmet medical needs for this condition, the drug or biologic sponsor may apply for FDA Fast Track Designation. The FDA has broad discretion whether or not to grant this designation. Even if we believe a particular product candidate is eligible for this designation, we cannot assure you that the FDA would decide to grant it. Even though we have received Fast Track Designation for pegzilarginase for the treatment of hyperargininemia secondary to Arginase 1 Deficiency, and even if we receive Fast Track Designation for other product candidates or indications in the future, we may not experience a faster development process, review or approval compared to conventional FDA procedures. The FDA may withdraw Fast Track Designation if it believes that the designation is no longer supported by data from our clinical development program. Many drugs or biologics that have received Fast Track Designation have failed to obtain approval. We may also seek approval of our products from the FDA through the use of the accelerated approval program, but such mechanism may not lead to a faster development or regulatory review or approval process. Even if we receive approval from the FDA under the accelerated approval program, if our confirmatory postmarketing trial does not verify clinical benefit, or if we do not comply with rigorous postmarketing requirements, the FDA may seek to withdraw the approval. Under the FDA’s accelerated approval program, the FDA may approve a drug or biologic for a serious or life-threatening illness that provides meaningful therapeutic benefit to patients over existing treatments based upon a surrogate endpoint that is reasonably likely to predict clinical benefit, or on a clinical endpoint that is thought to predict clinical benefit but is not itself a measure of clinical benefit, or a biomarker that can be measured earlier than irreversible morbidity or mortality, that is reasonably likely to predict an effect on irreversible morbidity or mortality or other clinical benefit, taking into account the severity, rarity, or prevalence of the condition and the availability or lack of alternative treatments. The FDA bases its decision on whether to accept the proposed surrogate or intermediate clinical endpoint on 49       the scientific support for that endpoint. Studies that demonstrate a drug’s effect on a surrogate or intermediate clinical endpoint must be adequate and well controlled as required by the FDC Act. If we were to seek accelerated approval for pegzilarginase, AGLE-177, or any future product candidates, FDA may determine there is inadequate justification to support that our surrogate endpoint is reasonably likely to predict clinical benefit in patients. For example, FDA may determine there is inadequate justification that a reduction in plasma arginine is reasonably likely to predict clinical benefit in patients with Arginase 1 Deficiency. For drugs or biologics granted accelerated approval, post-marketing well-controlled, adequately powered confirmatory trials of sufficient duration are typically required to describe the anticipated effect on irreversible morbidity or mortality or other clinical benefit. These confirmatory trials must be completed with due diligence, and the FDA could require that the trial be designed, initiated, and/or fully enrolled at the time of BLA submission. Moreover, the FDA may withdraw approval of our product candidate or indication approved under the accelerated approval pathway if, for example: • • • • the trial or trials required to verify the predicted clinical benefit of our product candidate fail to verify such benefit or do not demonstrate sufficient clinical benefit to justify the risks associated with the drug; other evidence demonstrates that our product candidate is not shown to be safe or effective under the conditions of use; we fail to conduct any required post-approval trial of our product candidate with due diligence; or we disseminate false or misleading promotional materials relating to the relevant product candidate. A Breakthrough Therapy Designation by the FDA, even if granted for any of our product candidates, may not lead to a faster development or regulatory review or approval process, and does not increase the likelihood that our product candidates will receive marketing approval. We have received Breakthrough Therapy Designation from the FDA for our lead product candidate pegzilarginase for the treatment of Arginase 1 Deficiency and may seek such designation for some or all of our product candidates. A Breakthrough Therapy is defined as a drug or biologic that is intended, alone or in combination with one or more other drugs, to treat a serious or life-threatening disease or condition, and preliminary clinical evidence indicates that the drug or biologic may demonstrate substantial improvement over existing therapies with respect to one or more clinically significant endpoints, such as substantial treatment effects observed early in clinical development. For drugs or biologics that have been designated as Breakthrough Therapies, interaction and communication between the FDA and the sponsor can help to identify the most efficient path for development. Designation as a Breakthrough Therapy is within the discretion of the FDA. Accordingly, even if we believe, after completing early clinical trials, that one of our product candidates meets the criteria for designation as a Breakthrough Therapy, the FDA may disagree and instead determine not to make such designation. Even though we have received Breakthrough Therapy Designation for pegzilarginase for the treatment of Arginase 1 Deficiency, or even if we receive Breakthrough Therapy Designation for other product candidates or indications in the future, we may not experience a faster development process, review or approval compared to drugs or biologics considered for approval under conventional FDA procedures and such a designation does not assure ultimate approval by the FDA. In addition, even though we have received Breakthrough Therapy Designation for pegzilarginase for the treatment of Arginase 1 Deficiency, or if one or more of our other product candidates qualify as Breakthrough Therapies, the FDA may later decide that such product candidates no longer meet the conditions for qualification. We may seek priority review designation for one or more of our other product candidates, but we might not receive such designation, and even if we do, such designation may not lead to a faster regulatory review or approval process. If the FDA determines that a product candidate offers a treatment for a serious condition and, if approved, the product would provide a significant improvement in safety or effectiveness, the FDA may designate the application for such product candidate for priority review. A priority review designation means that the goal for the FDA to review an application is six months, rather than the standard review period of ten months. We may request priority review for applications for our product candidates. The FDA has broad discretion with respect to whether or not to grant priority review designation to an application, so even if we believe an application for a particular product candidate is eligible for such designation, the FDA may decide not to grant it. Moreover, a priority review designation does not necessarily result in an expedited regulatory review or approval process or confer any advantage with respect to approval compared to 50         conventional FDA procedures. Receiving priority review from the FDA does not guarantee approval within the six-month review cycle or at all. Any product candidate for which we obtain marketing approval will be subject to extensive post-approval marketing regulatory requirements and could be subject to post- approval marketing restrictions or withdrawal from the market, and we may be subject to penalties if we fail to comply with regulatory requirements or if we experience unanticipated problems with our product candidates, when and if any of them are approved. Our product candidates and the activities associated with their development and commercialization, including their testing, manufacture, recordkeeping, labeling, storage, approval, advertising, promotion, sale and distribution, are subject to comprehensive regulation by the FDA and other regulatory authorities. These requirements include submissions of safety and other post-marketing information and reports, registration and listing requirements, cGMP, requirements relating to manufacturing, quality control, quality assurance and corresponding maintenance of records and documents, including periodic inspections by the FDA and other regulatory authorities, requirements regarding the distribution of samples to physicians and recordkeeping. The FDA closely regulates the post-approval marketing and promotion of drugs and biologics to ensure drugs and biologics are marketed only for the approved indications and in accordance with the provisions of the approved labeling. The FDA imposes stringent restrictions on manufacturers’ communications regarding use of their products and if we promote our product candidates beyond their approved indications, we may be subject to enforcement action for off-label promotion. Violations of the Federal Food, Drug, and Cosmetic Act relating to the promotion of prescription drugs may lead to investigations alleging violations of federal and state healthcare fraud and abuse laws, as well as state consumer protection laws. The FDA may also impose requirements for costly post-approval marketing studies or clinical trials and surveillance to monitor the safety or efficacy of any approved product. In particular, certain of our product candidates, if approved, are expected to be dosed chronically, and therefore could require follow-up studies and close monitoring of our patients after regulatory approval has been granted, to establish broader, longer-term understanding of potential for adverse effects than is plausible for clinical research. These studies may be expensive and time-consuming to conduct and may reveal side effects or other harmful effects in patients that use our therapeutic products after they are on the market, which may result in the limitation or withdrawal of our drugs from the market. Alternatively, we may not be able to conduct such additional clinical trials, which might force us to abandon our efforts to develop or commercialize certain product candidates. Even if post-approval studies are not requested or required, after our products are approved and on the market, there might be safety issues that emerge over time that require a change in product labeling or that require withdrawal of the product from the market, which would cause our revenue to decline.  If we fail to comply with any such post-approval regulatory requirements, approval for our products may be withdrawn, and product sales may be suspended. We may not be able to regain compliance, or we may only be able to regain compliance after a lengthy delay, significant expense, lost revenues and damage to our reputation. In addition, later discovery of previously unknown adverse events or other problems with our product candidates, manufacturers or manufacturing processes, or failure to comply with regulatory requirements, may yield various results, including: • • • • • • • • • • • restrictions on such product candidates, manufacturers or manufacturing processes; restrictions on the labeling or marketing of a product; restrictions on product distribution or use; requirements to conduct post-marketing studies or clinical trials; warning or untitled letters; withdrawal of any approved product from the market; refusal to approve pending applications or supplements to approved applications that we submit; recall of product candidates; fines, restitution or disgorgement of profits or revenues; suspension or withdrawal of marketing approvals; refusal to permit the import or export of our product candidates; 51                       • • product seizure; or injunctions or the imposition of civil or criminal penalties. Non-compliance with European requirements regarding safety monitoring or pharmacovigilance, and with requirements related to the development of products for the pediatric population, can also result in significant financial penalties. Similarly, failure to comply with Europe’s requirements regarding the protection of personal information can also lead to significant penalties and sanctions. Our relationships with customers and third-party payors will be subject to applicable anti-kickback, fraud and abuse and other healthcare laws and regulations, which could expose us to criminal sanctions, civil penalties, contractual damages, reputational harm and diminished profits and future earnings. Healthcare providers, physicians and third-party payors will play a primary role in the recommendation and prescription of any product candidates for which we obtain marketing approval. Our future arrangements with third-party payors and customers may expose us to broadly applicable fraud and abuse and other healthcare laws and regulations that may constrain the business or financial arrangements and relationships through which we market, sell and distribute any product candidates for which we obtain marketing approval. Restrictions under applicable U.S. federal and state healthcare laws and regulations include the following: • • • • • • the federal Anti-Kickback Statute prohibits, among other things, persons from knowingly and willfully soliciting, offering, receiving or providing remuneration, directly or indirectly, in cash or in kind, to induce or reward, or in return for, either the referral of an individual for, or the purchase, order or recommendation of, any good or service, for which payment may be made under a federal healthcare program such as Medicare and Medicaid; the federal False Claims Act imposes criminal and civil penalties, including civil whistleblower or qui tam actions, against individuals or entities for knowingly presenting, or causing to be presented, to the federal government, claims for payment that are false or fraudulent or making a false statement to avoid, decrease or conceal an obligation to pay money to the federal government; the federal Health Insurance Portability and Accountability Act of 1996, or HIPAA, imposes criminal and civil liability for executing a scheme to defraud any healthcare benefit program or making false statements relating to healthcare matters; HIPAA, as amended by the Health Information Technology for Economic and Clinical Health Act and its implementing regulations, also imposes obligations, including mandatory contractual terms, with respect to safeguarding the privacy, security and transmission of individually identifiable health information; federal law requires applicable manufacturers of covered drugs to report payments and other transfers of value to physicians and teaching hospitals, which includes annual data collection and reporting obligations, with reported information disclosed on a searchable website on an annual basis; and analogous state and foreign laws and regulations, such as state anti-kickback and false claims laws, may apply to sales or marketing arrangements and claims involving healthcare items or services reimbursed by non-governmental third-party payors, including private insurers. Some state laws require pharmaceutical companies to comply with the pharmaceutical industry’s voluntary compliance guidelines and the relevant compliance guidance promulgated by the federal government and may require drug manufacturers to report information related to payments and other transfers of value to physicians and other healthcare providers or marketing expenditures. Other states require reporting of pricing information, including price increases. State and foreign laws also govern the privacy and security of health information in some circumstances, many of which differ from each other in significant ways and often are not preempted by HIPAA, thus complicating compliance efforts. Efforts to ensure that our business arrangements with third parties will comply with applicable healthcare laws and regulations will involve substantial costs. It is possible that governmental authorities will conclude that our business practices may not comply with current or future statutes, regulations or case law involving applicable fraud and abuse or other healthcare laws and regulations. If our operations are found to be in violation of any of these laws or any other governmental regulations that may apply to us, we may be subject to significant civil, criminal and administrative penalties, damages, fines, imprisonment, exclusion of product candidates from government funded healthcare programs, such as Medicare and Medicaid, and the curtailment or restructuring of our operations. If any of the physicians or other healthcare providers or entities with whom we expect to do business is found to be not in compliance with applicable laws, they may be subject to criminal, civil or administrative sanctions, including exclusions from government funded healthcare programs. 52                   Recently enacted and future legislation may increase the difficulty and cost for us to obtain marketing approval of and commercialize our product candidates and affect the prices we may obtain. In the United States and some foreign jurisdictions, there have been a number of legislative and regulatory changes and proposed changes regarding the healthcare system that could prevent or delay marketing approval of our product candidates, restrict or regulate post-approval activities and affect our ability to profitably sell any product candidates for which we obtain marketing approval. In the United States, the Medicare Prescription Drug, Improvement, and Modernization Act of 2003, or the MMA, changed the way Medicare covers and pays for pharmaceutical products. The legislation expanded Medicare coverage for drug purchases by the elderly and introduced a new reimbursement methodology based on average sales prices for physician-administered drugs. In addition, this legislation provided authority for limiting the number of drugs that will be covered in any therapeutic class. Cost reduction initiatives and other provisions of this legislation could decrease the coverage and price that we receive for any approved product candidates. While the MMA only applies to drug benefits for Medicare beneficiaries, private payors often follow Medicare coverage policy and payment limitations in setting their own reimbursement rates. Therefore, any reduction in reimbursement that results from the MMA may result in a similar reduction in payments from private payors. The Patient Protection and Affordable Care Act, as amended by the Health Care and Education Reconciliation Act, or collectively the ACA, is a sweeping law intended to broaden access to health insurance, reduce or constrain the growth of healthcare spending, enhance remedies against fraud and abuse, add transparency requirements for the healthcare and health insurance industries, impose new taxes and fees on the health industry and impose additional health policy reforms. Among the provisions of the ACA of importance to our potential product candidates are the following: • • • • • • • • • • an annual, nondeductible fee on any entity that manufactures, or imports specified branded prescription drugs and biologic agents; an increase in the statutory minimum rebates a manufacturer must pay under the Medicaid Drug Rebate Program; expansion of healthcare fraud and abuse laws, including the False Claims Act and the Anti-Kickback Statute, new government investigative powers, and enhanced penalties for noncompliance; a Medicare Part D coverage gap discount program, in which manufacturers must agree to offer 70% point-of-sale discounts off negotiated prices; extension of manufacturers’ Medicaid rebate liability to managed care utilization; expansion of eligibility criteria for Medicaid programs; expansion of the entities eligible for discounts under the Public Health Service pharmaceutical pricing program; requirements to report financial arrangements with physicians and teaching hospitals; a requirement to annually report drug samples that manufacturers and distributors provide to physicians; and a Patient-Centered Outcomes Research Institute to oversee, identify priorities in, and conduct comparative clinical effectiveness research, along with funding for such research. In addition, other legislative changes have been proposed and adopted since the ACA was enacted. These changes included aggregate reductions to Medicare payments to providers of up to 2% per fiscal year, starting in 2013. In January 2013, the American Taxpayer Relief Act of 2012 was signed into law, which, among other things, reduced Medicare payments to several providers, and increased the statute of limitations period for the government to recover overpayments to providers from three to five years. On January 20, 2017, federal agencies with authorities and responsibilities under the ACA were directed to waive, defer, grant exemptions from, or delay the implementation of any provision of the ACA that would impose a fiscal burden on states or a cost, fee, tax, penalty or regulatory burden on individuals, healthcare providers, health insurers, or manufacturers of pharmaceuticals or medical devices. More recently, the Tax Cuts and Jobs Act was signed into law, which eliminated certain requirements of the ACA, including the individual mandate. It is unclear the impact this legislation will have on the ACA because a decision regarding the constitutionality of the ACA after the repeal of the individual mandate was ultimately appealed to the United States Supreme Court. On November 10, 2020, oral arguments were heard in this case. It is unclear when a decision will be made. We cannot predict whether the challenges to the ACA will continue or whether other proposals will be made or adopted, or what impact these efforts may have on us. 53                     We expect that the ACA, as well as other healthcare reform measures that may be adopted in the future, may result in more rigorous coverage criteria and in additional downward pressure on the price that we receive for any approved product. Any reduction in reimbursement from Medicare or other government programs may result in a similar reduction in payments from private payors. The implementation of cost containment measures or other healthcare reforms may prevent us from being able to generate revenue, attain profitability, or commercialize our product candidates. Legislative and regulatory proposals have been made to expand post-approval requirements and restrict sales and promotional activities for pharmaceutical products. We cannot be sure whether additional legislative changes will be enacted, or whether FDA regulations, guidance or interpretations will be changed, or what the impact of such changes on the marketing approvals of our product candidates, if any, may be. In addition, increased scrutiny by the U.S. Congress of the FDA’s approval process may significantly delay or prevent marketing approval, as well as subject us to more stringent product labeling and post-marketing testing and other requirements. Comprehensive tax reform bills could increase the tax burden on our orphan drug programs and adversely affect our business and financial condition. In December 2017, the U.S. government enacted comprehensive tax legislation that includes significant changes to the taxation of business entities. These changes include, among others, (i) a permanent reduction to the corporate income tax rate, (ii) a partial limitation on the deductibility of business interest expense, (iii) a shift of the U.S. taxation of multinational corporations from a tax on worldwide income to a territorial system (along with certain rules designed to prevent erosion of the U.S. income tax base) and (iv) a one-time tax on accumulated offshore earnings held in cash and illiquid assets, with the latter taxed at a lower rate. Further, the comprehensive tax legislation, among other things, reduces the orphan drug credit from 50% to 25% of qualifying expenditures. When and if we become profitable, this reduction in tax credits may result in an increased federal income tax burden on our orphan drug programs as it may cause us to pay federal income taxes earlier under the revised tax law than under the prior law and, despite being partially off-set by a reduction in the corporate tax rate from a top marginal rate of 35% to a flat rate of 21%, may increase our total federal tax liability attributable to such programs. Notwithstanding the reduction in the corporate income tax rate, the overall impact of this tax reform is uncertain, and our business and financial condition could be adversely affected. In addition, it is uncertain if and to what extent various states will conform to the newly enacted federal tax law. On March 27, 2020, the Coronavirus Aid, Relief and Economic Security, or CARES, Act was enacted and signed into law in response to COVID-19. The CARES Act includes changes to the tax provisions that benefit business entities and makes certain technical corrections to the 2017 Tax Cuts and Jobs Act. The tax relief measures for businesses include a five-year net operating loss carryback, suspension of annual deduction limitation of 80% of taxable income from net operating losses generated in a tax year beginning after December 31, 2017 for taxable years beginning after December 31, 2017 and beginning on or prior to December 31, 2020, changes in the deductibility of interest, acceleration of alternative minimum tax credit refunds, payroll tax relief, technical corrections on net operating loss carryforwards for fiscal year taxpayers and allowing accelerated deductions for qualified improvement property. The CARES Act also provides other non-tax benefits to assist those impacted by the pandemic. While we have evaluated the impact of the CARES Act and to date have determined that there is no material impact to the income tax provision for the quarter, the overall impact of this tax reform is uncertain, and our business and financial condition could be adversely affected. Risks Related to Our Intellectual Property If we are unable to obtain and maintain intellectual property protection for our technology and product candidates, or if the scope of the intellectual property protection obtained is not sufficiently broad, our competitors could develop and commercialize technology and product candidates similar or identical to ours, and our ability to successfully commercialize our technology and product candidates may be impaired. We rely upon a combination of patents, trade secret protection and confidentiality agreements to protect the intellectual property related to our technology and product candidates. In particular, our success depends in large part on our ability, and our licensors’ ability, to obtain and maintain patent protection in the United States and other countries with respect to our proprietary technology and product candidates, including any diagnostic developed by us or a third-party strategic partner. We seek to protect our proprietary position by filing patent applications in the United States and abroad related to our novel technologies and product candidates and rely on our licensors to obtain patent protection for our licensed intellectual property. Our patent portfolio includes patents and patent applications we own or we exclusively license from the University of Texas at Austin. This patent portfolio includes issued patents and pending patent applications covering compositions of matter and methods of use. 54 The patent prosecution process is expensive and time-consuming, and we may not be able to file, prosecute, maintain, enforce or license all necessary or desirable patent applications at a reasonable cost or in a timely manner, or in all jurisdictions. We may choose not to seek patent protection for certain innovations and may choose not to pursue patent protection in certain jurisdictions, and under the laws of certain jurisdictions, patents or other intellectual property rights may be unavailable or limited in scope. It is also possible that we will fail to identify patentable aspects of our discovery and nonclinical and clinical development output before it is too late to obtain patent protection. Moreover, the risks pertaining to our patents and intellectual property rights also apply to the intellectual property rights that we license from third parties. In some circumstances, we do not have the right to control the preparation, filing and prosecution of patent applications, or to maintain the patents, covering technology that we license from third parties. We may also require the cooperation of our licensors in order to enforce the licensed patent rights, and such cooperation may not be provided. Therefore, these patents and applications may not be prosecuted and enforced in a manner consistent with the best interests of our business and the rights we have licensed may be reduced or eliminated. The patent position of biotechnology and pharmaceutical companies generally is highly uncertain, involves complex legal and factual questions and has in recent years been the subject of much litigation. The U.S. Patent and Trademark Office, or U.S. PTO, has not established a consistent policy regarding the breadth of claims that it will allow in biotechnology patents. In addition, the laws of foreign jurisdictions may not protect our rights to the same extent as the laws of the United States. Publications of discoveries in the scientific literature often lag behind the actual discoveries, and patent applications in the United States and other jurisdictions are typically not published until 18 months after filing, or in some cases not at all. Therefore, we cannot know with certainty whether we were the first to make the inventions claimed in our owned or licensed patents or pending patent applications, or that we were the first to file for patent protection of such inventions, nor can we know whether those from whom we license patents were the first to make the inventions claimed or were the first to file. As a result, the issuance, scope, validity, enforceability and commercial value of our patent rights are highly uncertain. Our pending and future patent applications may not result in patents being issued that protect our technology or product candidates, in whole or in part, or which effectively prevent others from commercializing competitive technologies and product candidates. Changes in either the patent laws or interpretation of the patent laws in the United States and other countries may diminish the value of our patents or narrow the scope of our patent protection. In addition, during prosecution of any patent application, the issuance of any patents based on an application may depend upon our ability to generate additional nonclinical or clinical data that supports the patentability of our proposed claims. We may not be able to generate such data on a timely basis, to the satisfaction of the U.S. PTO, or at all. Moreover, we may be subject to a third-party preissuance submission of prior art to the U.S. PTO or patent offices in foreign jurisdictions, or become involved in opposition, derivation, reexamination, inter partes review, post-grant review or interference proceedings challenging our patent rights or the patent rights of others. An adverse determination in any such submission, proceeding or litigation could reduce the scope of, or invalidate, our patent rights, allow third parties to commercialize our technology or product candidates and compete directly with us, without payment to us, or result in our inability to manufacture or commercialize product candidates without infringing third-party patent rights. In addition, if the breadth or strength of protection provided by our patents and patent applications is threatened, it could dissuade companies from collaborating with us to license, develop or commercialize current or future product candidates. Even if our owned and licensed patent applications issue as patents, they may not issue in a form that will provide us with any meaningful protection, prevent competitors from competing with us or otherwise provide us with any competitive advantage. Our competitors may be able to circumvent our owned or licensed patents by developing similar or alternative technologies or product candidates in a non-infringing manner. 55 The issuance of a patent, while given the presumption of validity under the law, is not conclusive as to its inventorship, scope, validity or enforceability, and our owned and licensed patents may be challenged in the courts or patent offices in the United States and abroad. Such challenges may result in loss of exclusivity or freedom to operate or in patent claims being narrowed, invalidated or held unenforceable, in whole or in part, which could limit our ability to stop others from using or commercializing similar or identical technology and product candidates, or limit the duration of the patent protection of our technology and product candidates. In addition, patents have a limited lifespan. In the United States, the natural expiration of a patent is generally 20 years after the first non-provisional filing in the patent family. Given the amount of time required for the development, testing and regulatory review of new product candidates, patents protecting such candidates might expire before or shortly after such candidates are commercialized. As a result, our owned and licensed patent portfolio may not provide us with sufficient rights to exclude others from commercializing product candidates similar or identical to ours. Any inability on our part to adequately protect our intellectual property may have a material adverse effect on our business, operating results and financial position. Obtaining and maintaining our patent protection depends on compliance with various procedural, document submission, fee payment and other requirements imposed by governmental patent agencies, and our patent protection could be reduced or eliminated for non-compliance with these requirements. Periodic maintenance fees, renewal fees, annuity fees and various other governmental fees on patents and/or applications will be due to be paid to the U.S. PTO and various governmental patent agencies outside the United States in several stages over the lifetime of the patents and/or applications. We have systems in place to remind us to pay these fees, and we employ an outside firm and rely on our outside counsel to pay these fees due to non-U.S. patent agencies. The U.S. PTO and various non-U.S. governmental patent agencies require compliance with a number of procedural, documentary, fee payment and other similar provisions during the patent application process. We employ reputable law firms and other professionals to help us comply, and in some cases, an inadvertent lapse can be cured by payment of a late fee or by other means in accordance with the applicable rules. However, we also rely on licensors to effect such payments with respect to the patents and patent applications that we in-license. Moreover, there are situations in which non-compliance can result in abandonment or lapse of the patent or patent application, resulting in partial or complete loss of patent rights in the relevant jurisdiction. In such an event, our competitors might be able to enter the market and this circumstance would have a material adverse effect on our business. Third parties may initiate legal proceedings alleging that we are infringing their intellectual property rights, the outcome of which would be uncertain and could have a material adverse effect on the success of our business. Our commercial success depends upon our ability, and the ability of our collaborators, to develop, manufacture, market and sell our product candidates and use our proprietary technologies without infringing the proprietary rights of third parties. There is considerable intellectual property litigation in the biotechnology and pharmaceutical industries. We may become party to, or threatened with, future adversarial proceedings or litigation regarding intellectual property rights with respect to our product candidates and technology, including interference or derivation proceedings before the U.S. PTO and similar bodies in other jurisdictions. Third parties may assert infringement claims against us based on existing patents or patents that may be granted in the future. It is also possible that we have failed to identify relevant third-party patents or applications. For example, applications filed before November 29, 2000 and certain applications filed after that date that will not be filed outside the United States remain confidential until patents issue. Moreover, it is difficult for industry participants, including us, to identify all third- party patent rights that may be relevant to our product candidates and technologies because patent searching is imperfect due to differences in terminology among patents, incomplete databases and the difficulty in assessing the meaning of patent claims. We may fail to identify relevant patents or patent applications or may identify pending patent applications of potential interest but incorrectly predict the likelihood that such patent applications may issue with claims of relevance to our technology. In addition, we may be unaware of one or more issued patents that would be infringed by the manufacture, sale or use of a current or future product candidate, or we may incorrectly conclude that a third-party patent is invalid, unenforceable or not infringed by our activities. Additionally, pending patent applications that have been published can, subject to certain limitations, be later amended in a manner that could cover our technologies, our products or the use of our products. 56 If we are found to infringe a third party’s intellectual property rights, we could be required to obtain a license from such third party to continue developing and marketing our product candidates and technology. However, we may not be able to obtain any required license on commercially reasonable terms or at all. Even if we were able to obtain a license, it could be non-exclusive, thereby giving our competitors access to the same technologies licensed to us. We could be forced, including by court order, to cease commercializing the infringing technology or product. In addition, we could be found liable for monetary damages, including treble damages and attorneys’ fees, if we are found to have willfully infringed a patent. A finding of infringement could prevent us from commercializing our product candidates or force us to cease some of our business operations, which could materially harm our business. Claims that we have misappropriated the confidential information or trade secrets of third parties could have a similar negative impact on our business. We may be subject to claims that our employees, consultants or independent contractors have wrongfully used or disclosed confidential information or trade secrets of third parties or that our employees, consultants or independent contractors have wrongfully used or disclosed alleged trade secrets of former or other employers. Many of our employees, independent contractors and consultants, including our senior management, have been previously employed or retained by universities or other biotechnology or pharmaceutical companies, including our competitors or potential competitors. Further, many of our consultants are currently retained by other biotechnology or pharmaceutical companies and may be subject to conflicting obligations to these third parties. Although we try to ensure that our employees, consultants and independent contractors do not use the proprietary information or know-how of third parties in their work for us, and do not perform work for us that is in conflict with their obligations to another employer or any other entity, we may be subject to claims that we or our employees, consultants or independent contractors have inadvertently or otherwise improperly used or disclosed confidential information, including trade secrets or other proprietary information, of a former employer or other third parties. We may also be subject to claims that an employee, advisor, consultant, or independent contractor performed work for us that conflicts with that person's obligations to a third party, such as an employer, and thus, that the third party has an ownership interest in the intellectual property arising out of work performed for us. We are not aware of any threatened or pending claims related to these matters, but in the future litigation may be necessary to defend against such claims. In addition, while it is our policy to require our employees, independent contractors and consultants who may be involved in the development of intellectual property to execute agreements assigning such intellectual property to us, we may be unsuccessful in timely obtaining such an agreement with each party who in fact develops intellectual property that we regard as our own. Even if timely obtained, such agreements may be breached, and we may be forced to bring claims against third parties, or defend claims they may bring against us, to determine the ownership of what we regard as our intellectual property. If we fail in defending any such claims, in addition to paying monetary damages, we may lose valuable personnel or intellectual property rights, such as exclusive ownership of, or right to use, valuable intellectual property. As a result, we may also elect to enter into license agreements in order to settle patent infringement claims or to resolve disputes prior to litigation, and any such license agreements may require us to pay royalties and other fees that could be significant. Such an outcome could have a material adverse effect on our business. Even if we are successful in defending against such claims, litigation could result in substantial costs and be a distraction to management. The illegal distribution and sale by third parties of counterfeit versions of our products or stolen products could have a negative impact on our reputation and business. Third parties might illegally distribute and sell counterfeit or unfit versions of our approved products, if any, which do not meet our rigorous manufacturing and testing standards. A patient who receives a counterfeit or unfit drug may be at risk for a number of dangerous health consequences. Our reputation and business could suffer harm as a result of counterfeit or unfit drugs sold under our brand name. In addition, thefts of inventory at warehouses, plants or while in-transit, which are not properly stored and which are sold through unauthorized channels, could adversely impact patient safety, our reputation and our business. 57 Any lawsuits relating to infringement of intellectual property rights necessary to defend ourselves or enforce our rights will be costly and time consuming, and could be unsuccessful. Because competition in our industry is intense, competitors may infringe or otherwise violate our issued patents, patents of our licensors or other intellectual property. To counter infringement or unauthorized use, we may be required to file infringement claims, which can be expensive and time consuming. Any claims we assert against perceived infringers could provoke these parties to assert counterclaims against us alleging, among other claims, that we infringe their patents. In addition, in a patent infringement proceeding there are many grounds upon which a party may assert invalidity or unenforceability of a patent, and a court may decide that a patent of ours is invalid or unenforceable, in whole or in part, construe the patent’s claims narrowly or refuse to stop the other party from using the technology at issue on the grounds that our patents do not cover the technology in question. Litigation is uncertain and we cannot predict whether we would be successful in any such litigation. Such litigation or proceedings could substantially increase our operating losses and reduce the resources available for development activities or any future sales, marketing or distribution activities. We may not have sufficient financial, managerial or other resources to adequately conduct such litigation or proceedings. Some of our competitors may be able to sustain the costs of such litigation or proceedings more effectively than we can because of their greater financial, managerial and other resources. Uncertainties resulting from the initiation and continuation of patent litigation or other proceedings could have a material adverse effect on our business. Furthermore, because of the substantial amount of discovery required in connection with intellectual property litigation, there is a risk that some of our confidential information could be compromised by disclosure. Intellectual property disputes could cause us to spend substantial resources and distract our personnel from their normal responsibilities. Even if resolved in our favor, litigation or other legal proceedings relating to intellectual property claims may cause us to incur significant expenses and could distract our technical and/or management personnel from their normal responsibilities. In addition, there could be public announcements of the results of hearings, motions or other interim proceedings or developments and if securities analysts or investors perceive these results to be negative, it could have a substantial adverse effect on the market price of our common stock. In some cases, we may choose not to pursue litigation against those that have infringed on our patents, or used them without authorization, due to the associated expenses and time commitment of monitoring these activities. If we fail to protect or to enforce our intellectual property rights successfully, our competitive position could suffer, which could harm our results of operations. We may not be successful in obtaining or maintaining necessary rights for our development pipeline through acquisitions and in-licenses. Presently we have rights to intellectual property to develop our product candidates, including patents and patent applications we own or exclusively license from the University of Texas at Austin. Because our programs may involve additional product candidates that may require the use of proprietary rights held by third parties, the growth of our business may depend in part on our ability to acquire, in-license or use these proprietary rights. We may be unable to acquire or in-license any compositions, methods of use, processes or other third- party intellectual property rights from third parties that we identify as necessary for our product candidates. The licensing and acquisition of third-party intellectual property rights is a competitive area, and a number of more established companies are also pursuing strategies to license or acquire third-party intellectual property rights that we may consider attractive. These established companies may have a competitive advantage over us due to their size, cash resources and greater clinical development and commercialization capabilities. In addition, companies that perceive us to be a competitor may be unwilling to assign or license rights to us. We also may be unable to license or acquire third-party intellectual property rights on terms that would allow us to make an appropriate return on our investment. If we are unable to successfully obtain rights to required third-party intellectual property rights, our business, financial condition and prospects for growth could suffer. If we are not able to prevent disclosure of our trade secrets and other proprietary information, the value of our technology and product candidates could be significantly diminished. We rely on trade secret protection to protect our interests in proprietary know-how and in processes that are unpatentable or for which patents are difficult to obtain or enforce. We may not be able to protect our trade secrets adequately. We have a policy of requiring our consultants, advisors and strategic partners to enter into confidentiality agreements and our employees to enter into invention, non-disclosure and non-compete agreements. However, no assurance can be given that we have entered into appropriate agreements with all parties that have had access to our trade secrets, know-how or other proprietary information, or that such agreements will provide for a meaningful protection of our trade secrets, know- how or other proprietary information in the event of any unauthorized use or disclosure of information. Enforcing a claim that a party illegally disclosed or misappropriated a trade secret is difficult, expensive and 58 time-consuming, and the outcome is unpredictable. Even if we are successful in prosecuting such claims, any remedy awarded may be insufficient to fully compensate us for the improper disclosure or misappropriation. Furthermore, although we seek to preserve the integrity and confidentiality of our data, trade secrets and know-how by maintaining physical security of our premises and physical and electronic security of our information technology systems, it is also possible that our trade secrets, know-how or other proprietary information could be obtained by third parties as a result of breaches of such systems. Any disclosure of confidential information into the public domain or to third parties could allow our competitors to learn our trade secrets and use the information in competition against us. In addition, others may independently discover or develop our trade secrets and proprietary information or substantially equivalent techniques. Any action to enforce our rights is likely to be time consuming and expensive, and may ultimately be unsuccessful, or may result in a remedy that is not commercially valuable. These risks are accentuated in foreign countries where laws or law enforcement practices may not protect proprietary rights as fully as in the United States or Europe. Any unauthorized disclosure of our trade secrets or confidential information could harm our competitive position. We may not be able to protect our intellectual property rights throughout the world. Filing, prosecuting and defending patents on all of our product candidates throughout the world would be prohibitively expensive, and our patent rights in some countries outside the United States can be less extensive than those in the United States. The requirements for patentability may differ in certain countries, particularly developing countries. In addition, the laws of some foreign countries do not protect intellectual property rights to the same extent as federal and state laws in the United States. Consequently, we may not be able to prevent third parties from practicing our inventions in all countries outside the United States, or from selling or importing products made using our inventions in and into the United States or other jurisdictions. As part of ordinary course prosecution and maintenance activities, we determine whether to seek patent protection outside the United States and in which countries. This also applies to patents we have acquired or in-licensed from third parties. In some cases, this means that we, or our predecessors in interest or licensors of patents within our portfolio, have sought patent protection in a limited number of countries for patents covering our product candidates. Competitors may use our technologies in jurisdictions where we have not pursued and obtained patent protection to develop their own products and, further, may export otherwise infringing products to territories where we have patent protection but where enforcement is not as strong as in the United States. These products may compete with our products in jurisdictions where we do not have any issued patents and, even in jurisdictions where we have or are able to obtain issued patents, our patent claims or other intellectual property rights may not be effective or sufficient to prevent them from so competing. Many companies have encountered significant problems in protecting and defending intellectual property rights in foreign jurisdictions. The legal systems of certain countries, particularly certain developing countries, do not favor the enforcement of patents and other intellectual property protection, particularly those relating to biopharmaceuticals, which could make it difficult for us to stop the infringement of our patents or marketing of competing products in violation of our proprietary rights generally. Proceedings to enforce our patent rights in foreign jurisdictions could result in substantial cost and divert our efforts and attention from other aspects of our business, could put our patents at risk of being invalidated or interpreted narrowly and our patent applications at risk of not issuing and could provoke third parties to assert claims against us. We may not prevail in any lawsuits that we initiate and the damages or other remedies awarded, if any, may not be commercially meaningful. In addition, certain countries have compulsory licensing laws under which a patent owner may be compelled to grant licenses to third parties. In those countries, we may have limited remedies if our patents are infringed or if we are compelled to grant a license to our patents to a third party, which could materially diminish the value of those patents. In addition, there may be patent law reforms in foreign jurisdictions that could increase the uncertainties and costs surrounding the prosecution of our patent applications and the enforcement or defense of our issued patents in those foreign jurisdictions. This could limit our potential revenue opportunities. Accordingly, our efforts to obtain, register, and enforce our intellectual property rights around the world may be inadequate to obtain a significant commercial advantage from the intellectual property that we own or license. Moreover, patent protection must ultimately be sought on a country-by-country basis, which is an expensive and time-consuming process with uncertain outcomes. Accordingly, we may choose not to seek patent protection in certain countries, and we will not have the benefit of patent protection in such countries. 59 If we breach any of the agreements under which we license patent rights to use, develop and commercialize our product candidates or our technologies from third parties or, in certain cases, we fail to meet certain development deadlines, we could lose license rights that are important to our business. We are a party to license agreements under which we are granted rights to intellectual property that are important to our business and we expect that we may need to enter into additional license agreements in the future. In December 2013, our wholly owned subsidiaries AECase, Inc. and AEMase, Inc. each entered into an exclusive, worldwide license agreement, including the right to grant sublicenses, with the University of Texas at Austin for certain intellectual property owned by the University of Texas at Austin related to our program candidates related to cystinase and methioninase. In January 2017, we and the University of Texas at Austin entered into an Amended and Restated Patent License Agreement, or the Restated License, which consolidated the two license agreements, revised certain obligations, and licensed additional patent applications and invention disclosures to us. The Restated License was amended in August 2017, December 2017, and December 2018 to revise diligence milestones and license additional patent applications, including our program candidates under the AGLE177 and cystinuria programs. The intellectual property licensed under the Restated License includes an invention that was made with U.S. government support. The U.S. government therefore has certain rights in such inventions under the applicable funding agreements and under applicable law. In addition, we are subject to a requirement that the products covered by the applicable patents that are sold or used in the United States must be manufactured substantially in the United States unless a written waiver is obtained in advance from the U.S. government. The Restated License obligates us to make certain payments at the achievement of certain milestones and at regular intervals throughout the life of the license. The University of Texas at Austin may terminate the Restated License under certain circumstances, including for a breach by us that is not cured within 30 or 60 days of notice (depending on the type of breach), or if we or any of our affiliates or sublicensees participate in any proceeding to challenge the licensed patent rights (unless, with respect to sublicensees, we terminate the applicable sublicense).   Licensing of intellectual property is of critical importance to our business and involves complex legal, business and scientific issues. Any other licenses or other intellectual property agreements we may enter into may impose various diligence, milestone payment, royalty and other obligations on us. If disputes arise between us and our licensor or if we fail to comply with our obligations under current or future intellectual property agreements, potentially giving our counterparties the right to terminate these agreements, we might not be able to develop, manufacture or market any product that is covered by the agreement or face other penalties under the agreement. Such an occurrence could materially adversely affect the value of the product candidate being developed under any such agreement. Termination of these agreements or reduction or elimination of our rights under these agreements may result in our having to negotiate new or reinstated agreements with less favorable terms, or cause us to lose our rights under these agreements, including our rights to important intellectual property or technology. The loss of any one of our current licenses, or any other license we may acquire in the future, could prevent or impair our ability to successfully develop and commercialize the affected product candidates and thus materially harm our business, prospects, financial condition and results of operations. Intellectual property rights do not necessarily address all potential threats to our competitive advantage. The degree of future protection afforded by our intellectual property rights is uncertain because intellectual property rights have limitations, and may not adequately protect our business, provide a barrier to entry against our competitors or potential competitors, or permit us to maintain our competitive advantage. Moreover, if a third party has intellectual property rights that cover the practice of our technology or product candidates, we may not be able to fully exercise or extract value from our intellectual property rights. The following examples are illustrative: • • • • • others may be able to make compounds that are similar to our product candidates but that are not covered by the claims of the patents that we own or license; we or our licensors or collaborators might not have been the first to make the inventions covered by an issued patent or pending patent application that we own or license; we or our licensors or collaborators might not have been the first to file patent applications covering an invention; others may independently develop similar or alternative technologies or duplicate any of our technologies without infringing or misappropriating our intellectual property rights; pending patent applications that we own or license may not lead to issued patents; 60           • • • • issued patents that we own or license may not provide us with any competitive advantages, or may be narrowly construed or held invalid or unenforceable, as a result of legal challenges by our competitors; our competitors might conduct research and development activities in countries where we do not have patent rights and then use the information learned from such activities to develop competitive products for sale in our major commercial markets; we may not develop or in-license additional proprietary technologies that are patentable; and the patents of others may have an adverse effect on our business. Any of these events could significantly harm our business, results of operations and prospects. Changes in patent law could diminish the value of patents in general, thereby impairing our ability to protect our products, and recent patent legislation could increase the uncertainties and costs surrounding the prosecution of our patent applications and the enforcement or defense of our issued patents. As is the case with other biotechnology companies, our success is heavily dependent on patents. Obtaining and enforcing patents in the biotechnology industry involve both technological and legal complexity, and is therefore costly, time-consuming and inherently uncertain. In addition, the United States has recently enacted patent reform legislation. In addition to increasing uncertainty with regard to our ability to obtain patents in the future, this has created greater uncertainty with respect to the value of patents, once obtained. Depending on decisions by the U.S. Congress, the federal courts, and the U.S. PTO, the laws and regulations governing patents could change in unpredictable ways that would weaken our ability to obtain new patents or to enforce our existing patents and patents that we might obtain in the future. On September 16, 2011, the Leahy-Smith America Invents Act, or the Leahy-Smith Act, was signed into law. The U.S. PTO has promulgated regulations and developed procedures to govern administration of the Leahy-Smith Act. The Leahy-Smith Act and its implementation could increase the uncertainties and costs surrounding the prosecution of our patent applications and the enforcement or defense of our issued patents, all of which could have a material adverse effect on our business and financial condition. The Leahy-Smith Act also requires an inventor to file a patent application on their invention prior to any other bone fide independent inventor. Since patent applications in the United States and most other countries are confidential for a period of time after filing, we cannot be certain that we were the first to either (i) file any patent application related to our product candidates or (ii) invent any of the inventions claimed in our patents or patent applications. The Leahy-Smith Act allows a third party to provide evidence in a U.S. PTO proceeding that could invalidate our patent claims. Accordingly, a third party may use the U.S. PTO procedures to invalidate our patent claims. In such an event, this circumstance could have a material adverse effect on our business. If we do not obtain patent term extensions under the Hatch-Waxman Act and similar legislation, thereby not extending the term of our marketing exclusivity for our product candidates, our business may be materially harmed. Depending upon the timing, duration and specifics of FDA marketing approval of our product candidates, if any, one of the U.S. patents covering each of such approved product(s) or the use thereof may be eligible for up to five years of patent term restoration. Patent term extension allows a maximum of one patent to be extended per FDA-approved product. Patent term extension also may be available in certain foreign countries upon regulatory approval of our product candidates. Nevertheless, we may not be granted patent term extension either in the United States or in any foreign country because of, for example, failing to apply within applicable deadlines, failing to apply prior to expiration of relevant patents or otherwise failing to satisfy applicable requirements. Moreover, the term of extension, as well as the scope of patent protection during any such extension, afforded by the governmental authority could be less than we request. In addition, if a patent we wish to extend is owned by another party and licensed to us, we may need to obtain approval and cooperation from our licensor to request the extension. If we are unable to obtain patent term extension or restoration, or the term of any such extension is less than we request, the period during which we will have the right to exclusively market our product will be shortened and our competitors may obtain approval of competing products following our patent expiration, and our revenue could be reduced, possibly materially. 61           We have not yet registered our trademarks in all of our potential markets, and failure to secure those registrations could adversely affect our business. We attempt to protect our pharmaceutical developments, services, and products under trademark laws. However, our trademark applications may not be allowed for registration, and registered trademarks may not be maintained or enforced. During trademark registration proceedings, we may receive rejections. Although we are given an opportunity to respond to those rejections, we may be unable to overcome such rejections. In addition, in the U.S. Patent and Trademark Office and in comparable agencies in many foreign jurisdictions, third parties are given an opportunity to oppose pending trademark applications and to seek to cancel registered trademarks. Opposition or cancellation proceedings may be filed against our trademarks, and our trademarks may not survive such proceedings. If we do not secure registrations for our trademarks, we may encounter more difficulty in enforcing them against third parties than we otherwise would. Third parties may pursue trademark infringement actions against us, potentially resulting in substantial costs and material delays. As our industry grows, we may be subject to an increasing amount of litigation that is common in the pharmaceutical industry based on allegations of infringement or other alleged violations of trademarks. Any claims of infringement, with or without merit, could be time consuming, costly, and difficult to defend. Moreover, intellectual property litigation or claims could require us to redesign packaging and advertising materials associated with our packaging, which could result in substantial costs and material delays. Risks Related to Employee Matters, Managing Growth and Other Risks Related to Our Business Our future success depends on our ability to retain key executives and to attract, retain and motivate qualified personnel. We are a clinical-stage biotechnology company with a limited operating history, and, as of December 31, 2020, had 90 employees, including four executive officers. We are highly dependent on the research and development, clinical and business development expertise of our executive officers, as well as the other principal members of our management, scientific and clinical team. Any of our management team members may terminate their employment with us at any time. We do not maintain “key person” insurance for any of our executives or other employees. Recruiting and retaining qualified scientific, clinical, manufacturing and sales and marketing personnel will also be critical to our success. The loss of the services of our executive officers or other key employees could impede the achievement of our research, development and commercialization objectives and seriously harm our ability to successfully implement our business strategy. Furthermore, replacing executive officers and key employees may be difficult and may take an extended period of time because of the limited number of individuals in our industry with the breadth of skills and experience required to successfully develop, facilitate regulatory approval of and commercialize product candidates. Competition to hire from this limited pool is intense, and we may be unable to hire, train, retain or motivate these key personnel on acceptable terms given the competition among numerous pharmaceutical and biotechnology companies for similar personnel. We also experience competition for the hiring of scientific and clinical personnel from universities and research institutions. In addition, we rely on consultants and advisors, including scientific and clinical advisors such as our scientific advisory board, to assist us in formulating our discovery and nonclinical and clinical development and commercialization strategy. Our consultants and advisors, including members of our scientific advisory board, may be employed by employers other than us and may have commitments under consulting or advisory contracts with other entities that may limit their availability to us. If we are unable to continue to attract and retain high quality personnel, our ability to pursue our growth strategy will be limited. Our employees may engage in misconduct or other improper activities, including non-compliance with regulatory standards and requirements, which could cause significant liability for us and harm our reputation. We are exposed to the risk of employee fraud or other misconduct, including intentional failures to (i) comply with FDA regulations or similar regulations of comparable non-U.S. regulatory authorities, (ii) provide accurate information to the FDA or comparable non-U.S. regulatory authorities, (iii) comply with manufacturing standards we have established, (iv) comply with the Foreign Corrupt Practices Act and federal and state healthcare fraud and abuse laws and regulations and similar laws and regulations established and enforced by comparable non-U.S. regulatory authorities, or (v) report financial information or data accurately or disclose unauthorized activities to us. Employee misconduct could also involve the improper use of information obtained in the course of clinical trials, which could result in regulatory sanctions and 62 serious harm to our reputation. It is not always possible to identify and deter employee misconduct, and the precautions we take to detect and prevent this activity may not be effective in controlling unknown or unmanaged risks or losses or in protecting us from governmental investigations or other actions or lawsuits stemming from a failure to be in compliance with such laws, standards or regulations. If any such actions are instituted against us, and we are not successful in defending ourselves or asserting our rights, those actions could have a significant impact on our business and results of operations, including the imposition of significant fines or other sanctions. If product liability lawsuits are brought against us, we may incur substantial liabilities and may be required to limit commercialization of our product candidates. We face an inherent risk of product liability as a result of testing our product candidates in clinical trials and will face an even greater risk if we commercialize any products. For example, we may be sued if our product candidates cause or are perceived to cause injury or are found to be otherwise unsuitable during clinical trials, manufacturing, marketing or sale. Any such product liability claims may include allegations of defects in manufacturing, defects in design, a failure to warn of dangers inherent in the product, negligence, strict liability or a breach of warranties. Claims could also be asserted under state consumer protection acts. If we cannot successfully defend ourselves against product liability claims, we may incur substantial liabilities or be required to limit commercialization of our product candidates. Even successful defense would require significant financial and management resources. Regardless of the merits or eventual outcome, liability claims may result in: • • • • • • • • • • • • • inability to bring a product candidate to the market; decreased demand for our products; injury to our reputation; withdrawal of clinical trial participants and inability to continue clinical trials; initiation of investigations by regulators; costs to defend the related litigation; diversion of management's time and our resources; substantial monetary awards to trial participants or patients; product recalls, withdrawals or labeling, marketing or promotional restrictions; loss of revenue; exhaustion of any available insurance and our capital resources; the inability to commercialize any product candidate; and decline in our share price. Our product liability insurance policies may also have various exclusions, and we may be subject to a product liability claim for which we have no coverage. We may have to pay any amounts awarded by a court or negotiated in a settlement that exceed our coverage limitations or that are not covered by our insurance, and we may not have, or be able to obtain, sufficient capital to pay such amounts. Even if our agreements with any future corporate collaborators entitle us to indemnification against losses, such indemnification may not be available or adequate should any claim arise. Our ability to use our net operating loss carryforwards and certain other tax attributes may be limited. Under Section 382 of the Internal Revenue Code of 1986, as amended, if a corporation undergoes an “ownership change,” generally defined as a greater than 50% change (by value) in its equity ownership over a three-year period, the corporation’s ability to use its pre-change net operating loss carryforwards, or NOLs, and other pre-change tax attributes (such as research tax credits) to offset its post-change income or taxes may be limited. It is possible that we may have triggered an “ownership change” limitation. We may also experience ownership changes in the future as a result of subsequent shifts in our stock ownership (some of which are outside of our control). As a result, if we earn net taxable income, our ability to use our pre-change NOLs and other pre-change tax attributes to offset U.S. federal taxable income or taxes may be subject to limitations, which could potentially result in increased future tax liability to us. Our NOLs and other tax attributes arising before our conversion from a Delaware limited liability company to a Delaware corporation in 2015 also may be limited by the Separate Return Limitation Year rule, which could increase our U.S. federal tax liability. In addition, at the state level, there may be periods during which the use of NOLs is suspended or otherwise limited, which could accelerate or permanently increase state taxes owed. 63                           Risks Related to Our Common Stock Our executive officers, directors and principal stockholders, if they choose to act together, may continue to have the ability to control all matters submitted to stockholders for approval. We have a concentrated stockholder base and our executive officers and directors, combined with our stockholders who, to our knowledge, each owned more than 5% of our outstanding common stock, in the aggregate, beneficially own shares representing a substantial number of our capital stock as of December 31, 2020. As a result, if these stockholders were to choose to act together, they may be able to control all matters submitted to our stockholders for approval, as well as our management and affairs. For example, these persons, if they choose to act together, would likely control the election of directors and approval of any merger, consolidation or sale of all or substantially all of our assets. This concentration of ownership control may: • • • delay, defer or prevent a change in control; entrench our management and the board of directors; or impede a merger, consolidation, takeover or other business combination involving us that other stockholders may desire or may result in you obtaining a premium for your shares. Failure to achieve and maintain effective internal control over financial reporting in accordance with Section 404 of the Sarbanes-Oxley Act could have a material adverse effect on our business and stock price. Pursuant to Section 404, we have been required to furnish a report by our management on our internal control over financial reporting. However, while we remain an emerging growth company, we will not be required to include an attestation report on internal control over financial reporting issued by our independent registered public accounting firm. Internal control over financial reporting is a process designed to provide reasonable assurance regarding the reliability of financial reporting and the preparation of financial statements in accordance with generally accepted accounting principles in the United States. We may encounter problems or delays in implementing any changes necessary to make a favorable assessment of our internal control over financial reporting. If we cannot favorably assess the effectiveness of our internal control over financial reporting, or if our independent registered public accounting firm is unable to provide an unqualified attestation report on our internal controls when required, investors could lose confidence in our financial information and the price of our common stock could decline. Additionally, the existence of any material weakness or significant deficiency would require management to devote significant time and incur significant expense to remediate any such material weaknesses or significant deficiencies and management may not be able to remediate any such material weaknesses or significant deficiencies in a timely manner. The existence of any material weakness in our internal control over financial reporting could also result in errors in our financial statements that could require us to restate our financial statements causing us to fail to meet our reporting obligations and cause stockholders to lose confidence in our reported financial information, all of which could materially and adversely affect us. Provisions in our corporate charter documents and under Delaware law could make an acquisition of our company, which may be beneficial to our stockholders, more difficult and may prevent attempts by our stockholders to replace or remove our current management. Provisions in our certificate of incorporation and our bylaws may discourage, delay or prevent a merger, acquisition or other change in control of our company that stockholders may consider favorable, including transactions in which you might otherwise receive a premium for your shares. These provisions could also limit the price that investors might be willing to pay in the future for shares of our common stock, thereby depressing the market price of our common stock. In addition, because our board of directors is responsible for appointing the members of our management team, these provisions may frustrate or prevent any attempts by our stockholders to replace or remove our current management by making it more difficult for stockholders to replace members of our board of directors. Among other things, these provisions: • • • • establish a classified board of directors such that only one of three classes of directors is elected each year; allow the authorized number of our directors to be changed only by resolution of our board of directors; limit the manner in which stockholders can remove directors from our board of directors; establish advance notice requirements for stockholder proposals that can be acted on at stockholder meetings and nominations to our board of directors; 64               • • • • require that stockholder actions must be effected at a duly called stockholder meeting and prohibit actions by our stockholders by written consent; limit who may call stockholder meetings; authorize our board of directors to issue preferred stock without stockholder approval, which could be used to institute a “poison pill” that would work to dilute the stock ownership of a potential hostile acquirer, effectively preventing acquisitions that have not been approved by our board of directors; and require the approval of the holders of at least two-thirds of the votes that all our stockholders would be entitled to cast to amend or repeal specified provisions of our certificate of incorporation or bylaws. Moreover, we are governed by the provisions of Section 203 of the Delaware General Corporation Law, which prohibits a person who owns in excess of 15% of our outstanding voting stock from merging or combining with us for a period of three years after the date of the transaction in which the person acquired in excess of 15% of our outstanding voting stock, unless the merger or combination is approved in a prescribed manner. Any of these provisions of our charter documents or Delaware law could, under certain circumstances, depress the market price of our common stock. Our amended and restated certificate of incorporation designates the Court of Chancery of the State of Delaware as the sole and exclusive forum for certain types of actions and proceedings that may be initiated by our stockholders, and our amended and restated bylaws designates the federal courts of the United States as the exclusive forum for actions arising under the Securities Act, each of which could limit our stockholders’ ability to obtain a favorable judicial forum for disputes with us or our directors, officers, employees or agents. Our amended and restated certificate of incorporation provides that, unless we consent in writing to an alternative forum, the Court of Chancery of the State of Delaware will be the sole and exclusive forum for any derivative action or proceeding brought on our behalf, any action asserting a claim of breach of a fiduciary duty owed by any of our directors, officers, employees or agents to us or our stockholders, any action asserting a claim arising pursuant to any provision of the DGCL, our amended and restated certificate of incorporation or our amended and restated bylaws or any action asserting a claim that is governed by the internal affairs doctrine, in each case subject to the Court of Chancery having personal jurisdiction over the indispensable parties named as defendants therein and the claim not being one which is vested in the exclusive jurisdiction of a court or forum other than the Court of Chancery or for which the Court of Chancery does not have subject matter jurisdiction. Any person purchasing or otherwise acquiring any interest in any shares of our capital stock shall be deemed to have notice of and to have consented to this provision of our amended and restated certificate of incorporation. In March 2020, we amended and restated our restated bylaws to provide that the federal district courts of the United States of America will, to the fullest extent permitted by law, be the exclusive forum for resolving any complaint asserting a cause of action arising under the Securities Act (a Federal Forum Provision). Our decision to adopt a Federal Forum Provision followed a decision by the Supreme Court of the State of Delaware holding that such provisions are facially valid under Delaware law. While there can be no assurance that federal or state courts will follow the holding of the Delaware Supreme Court or determine that the Federal Forum Provision should be enforced in a particular case, application of the Federal Forum Provision means that suits brought by our stockholders to enforce any duty or liability created by the Securities Act must be brought in federal court and cannot be brought in state court. These choice of forum provisions may limit our stockholders’ ability to bring a claim in a judicial forum that it finds favorable for disputes with us or our directors, officers, employees or agents, which may discourage such lawsuits against us and our directors, officers, employees and agents even though an action, if successful, might benefit our stockholders. Stockholders who do bring a claim in the specified courts could face additional litigation costs in pursuing any such claim. The specified courts may also reach different judgments or results than would other courts, including courts where a stockholder considering an action may be located or would otherwise choose to bring the action, and such judgments or results may be more favorable to us than to our stockholders. Alternatively, if a court were to find these provisions of our governance documents inapplicable to, or unenforceable in respect of, one or more of the specified types of actions or proceedings, we may incur additional costs associated with resolving such matters in other jurisdictions, which could have a material adverse effect on our business, financial condition or results of operations. 65         The price of our common stock has been and may be volatile and fluctuate substantially, which could result in substantial losses for purchasers of our common stock. Our stock price is volatile. The stock market in general and the market for smaller biotechnology companies in particular have experienced extreme volatility that has often been unrelated to the operating performance of particular companies. The market price for our common stock may be influenced by many factors, including: • • • • • • • • • • • • • • the success or failure of competitive products or technologies; results of ongoing or planned clinical trials of our product candidates or those of our competitors; regulatory or legal developments in the United States and other countries; developments or disputes concerning patent applications, issued patents or other proprietary rights; the recruitment or departure of key personnel; the level of expenses related to any of our product candidates or clinical development programs; the results of our efforts to discover, develop, acquire or in-license additional product candidates or products; actual or anticipated changes in estimates as to financial results, development timelines or recommendations by securities analysts; operating results that fail to meet expectations of securities analysts that cover our company; variations in our financial results or those of companies that are perceived to be similar to us; changes in the structure of healthcare payment systems; market conditions in the pharmaceutical and biotechnology sectors; general economic and market conditions; and the other factors described in this “Risk Factors” section. We have broad discretion in the use of the net proceeds from our public offerings and may not use them effectively. Our management has broad discretion in the application of the net proceeds from our public offerings, and you will not have the opportunity as part of your investment decision to assess whether the net proceeds are being used appropriately. Our management could spend the net proceeds from our public offerings in ways that do not improve our results of operations or enhance the value of our common stock. The failure by our management to apply these funds effectively could result in financial losses that could have a material adverse effect on our business, cause the price of our common stock to decline and delay the development of our product candidates. Pending their use, we may invest the net proceeds from our public offerings in a manner that does not produce income or that loses value. Future sales of our common stock in the public market could cause the market price of our common stock to drop significantly, even if our business is doing well. Sales of a substantial number of shares of our common stock in the public market, or the perception in the market that the holders of a large number of shares intend to sell shares, could reduce the market price of our common stock and make it more difficult for you to sell your common stock at a time and price that you deem appropriate. Moreover, we have also registered under the Securities Act shares of common stock that we may issue under our equity compensation plans. In addition, in February 2019, our shelf registration statement on Form S-3 for the potential offering, issuance and sale by us of up to $200.0 million of our common stock, preferred stock, debt securities, warrants to purchase our common stock, preferred stock and debt securities, subscription rights to purchase our common stock, preferred stock and debt securities, and units consisting of all or some of these securities was declared effective by the SEC. In connection with this shelf registration statement, on April 16, 2020, we entered into an “at-the-market” offering of our common stock pursuant to a sales agreement between us and JonesTrading Institutional Services LLC, or JonesTrading. Subject to certain limitations in the sales agreement and compliance with applicable law, we have the discretion to deliver a placement notice to JonesTrading at any time throughout the term of the sales agreement, which has a term equal to the term of the registration statement on Form S-3 unless otherwise terminated earlier by us or JonesTrading pursuant to the terms of the sales agreement. The number of shares that are sold by JonesTrading after delivering a placement notice will fluctuate based on the market price of our common stock during the sales period and limits we set with JonesTrading. Because the price per share of each share sold will fluctuate based on the market price of our common stock during the 66                             sales period, it is not possible at this stage to predict the number of shares that will be ultimately issued. Issuances of any shares sold pursuant to the sales agreement will have a dilutive effect on our existing stockholders. In July 2020, we filed a new shelf registration statement on Form S-3 that was declared effective in July 2020 by the SEC for the potential offering, issuance and sale by us of up to $400.0 million of our common stock, preferred stock, debt securities, warrants to purchase common stock, preferred stock and debt securities, subscription rights to purchase common stock and units consisting of all or some of these securities. If we sell common stock, preferred stock, convertible securities and other equity securities in other transactions pursuant to our shelf registration statements on Form S-3, existing investors may be materially diluted by such subsequent sales and new investors could gain rights superior to our existing stockholders. In addition, in the future, we may issue additional shares of common stock or other equity or debt securities convertible into common stock in connection with a financing, acquisition, litigation settlement, employee arrangements or otherwise, including upon exercise of our pre-funded warrants. For example, in April 2020, we sold an aggregate of 15,442,303 shares of common stock and pre-funded warrants to purchase up to 13,610,328 shares of common stock in an underwritten public offering. Any such issuance could result in substantial dilution to our existing stockholders and could cause our stock price to decline. We will not receive a significant amount, or potentially any, additional funds upon the exercise of our pre-funded warrants; however, any exercise would increase the number of shares eligible for future resale in the public market and result in substantial dilution to our stockholders. To date, we have issued pre-funded warrants to purchase a total of 17,610,328 shares of our common stock, and all such pre-funded warrants are currently outstanding. Each pre-funded warrant is exercisable for $0.0001 per share of common stock underlying such pre-funded warrant, which may be paid by way of a cashless exercise, meaning that the holder may not pay a cash purchase price upon exercise, but instead would receive upon such exercise the net number of shares of common stock determined according to the formula set forth in the pre-funded warrant. Accordingly, we will not receive a significant amount, or potentially any, additional funds upon the exercise of the pre-funded warrants. To the extent such pre-funded warrants are exercised, additional shares of common stock will be issued for nominal or no additional consideration, which will result in substantial dilution to the then existing holders of our common stock and will increase the number of shares eligible for resale in the public market. Sales of substantial numbers of such shares in the public market could adversely affect the market price of the common stock, causing our stock price to decline. There is no public market for our pre-funded warrants. There is no public trading market for our pre-funded warrants issued in the February 2019 and April 2020 public offerings, and we do not expect a market to develop. In addition, we do not intend to apply to list the pre-funded warrants on any securities exchange or nationally recognized trading system, including the Nasdaq Global Market. Without an active market, the liquidity of the pre-funded warrants will be limited and their value may be adversely impacted. Additionally, each holder of pre-funded warrants will not be entitled to exercise any portion of any pre-funded warrant, which, upon giving effect to such exercise, would cause (i) the aggregate number of shares of our common stock beneficially owned by the holder (together with its affiliates) to exceed 9.99% of the number of shares of our common stock outstanding immediately after giving effect to the exercise, or (ii) the combined voting power of our securities beneficially owned by the holder (together with its affiliates) to exceed 9.99% of the combined voting power of all of our securities then outstanding immediately after giving effect to the exercise. However, any holder may increase or decrease such percentage to any other percentage (not in excess of 19.99% for the majority of such warrants) upon at least 61 days’ prior notice from the holder to us. 67 We are an “emerging growth company,” and the reduced disclosure requirements applicable to emerging growth companies may make our common stock less attractive to investors. We are an “emerging growth company,” as defined in the Jumpstart Our Business Startups Act of 2012, or the JOBS Act, and may remain an emerging growth company through December 31, 2021. For so long as we remain an emerging growth company, we are permitted and intend to rely on exemptions from certain disclosure requirements that are applicable to other public companies that are not emerging growth companies. These exemptions include: • • • • • being permitted to provide only two years of audited financial statements, in addition to any required unaudited interim financial statements, with correspondingly reduced “Management’s Discussion and Analysis of Financial Condition and Results of Operations” disclosure; not being required to comply with the auditor attestation requirements in the assessment of our internal control over financial reporting of Section 404(b) of the Sarbanes-Oxley Act; not being required to comply with any requirement that may be adopted by the Public Company Accounting Oversight Board regarding mandatory audit firm rotation or a supplement to the auditor’s report providing additional information about the audit and the financial statements; reduced disclosure obligations regarding executive compensation; and exemptions from the requirements of holding a nonbinding advisory vote on executive compensation and shareholder approval of any golden parachute payments not previously approved. The JOBS Act provides that an emerging growth company can take advantage of an extended transition period for complying with new or revised accounting standards. This allows an emerging growth company to delay the adoption of these accounting standards until they would otherwise apply to private companies. We have irrevocably elected not to avail ourselves of this exemption and, therefore, we will be subject to the same new or revised accounting standards as other public companies that are not emerging growth companies. We will continue to incur increased costs as a result of operating as a public company, and our management will be required to devote substantial time to new compliance initiatives and corporate governance practices. As a public company, and particularly after we are no longer an emerging growth company, we incur significant legal, accounting and other expenses that we did not incur as a private company. The Sarbanes-Oxley Act of 2002, the Dodd-Frank Wall Street Reform and Consumer Protection Act, the listing requirements of The Nasdaq Global Market and other applicable securities rules and regulations impose various requirements on public companies, including establishment and maintenance of effective disclosure and financial controls and corporate governance practices. Our management and other personnel will need to devote a substantial amount of time to these compliance initiatives. Moreover, these rules and regulations will continue to increase our legal and financial compliance costs and will make some activities more time-consuming and costly. For example, we expect that these rules and regulations may make it more difficult and more expensive for us to obtain and maintain director and officer liability insurance, which in turn could make it more difficult for us to attract and retain qualified members of our board of directors. We are evaluating these rules and regulations, and cannot predict or estimate the amount of additional costs we may incur or the timing of such costs. These rules and regulations are often subject to varying interpretations, in many cases due to their lack of specificity, and, as a result, their application in practice may evolve over time as new guidance is provided by regulatory and governing bodies. This could result in continuing uncertainty regarding compliance matters and higher costs necessitated by ongoing revisions to disclosure and governance practices. Pursuant to Section 404, we are required to furnish a report by our management on our internal control over financial reporting. As discussed above, if we cease to be an emerging growth company, we will be required to include an attestation report on internal control over financial reporting issued by our independent registered public accounting firm as required by Section 404(b). To achieve compliance with Section 404 within the prescribed period, we will be engaged in a process to document and evaluate our internal control over financial reporting, which is both costly and challenging. In this regard, we will need to continue to dedicate internal resources, potentially engage outside consultants and adopt a detailed work plan to assess and document the adequacy of internal control over financial reporting, continue steps to improve control processes as appropriate, validate through testing that controls are functioning as documented and implement a continuous reporting and improvement process for internal control over financial reporting. Despite our efforts, there is a risk that we will not be able to conclude, within the prescribed timeframe or at all, that our internal control over financial reporting is effective as required by Section 404. If we identify one or more material weaknesses, it could result in an adverse reaction in the financial markets due to a loss of confidence in the reliability of our consolidated financial statements. 68           Since we do not anticipate paying any cash dividends on our capital stock in the foreseeable future, stock price appreciation, if any, will be your sole source of gain. We have never declared or paid cash dividends on our capital stock. We currently intend to retain all of our future earnings, if any, to finance the growth and development of our business. In addition, the terms of any future debt agreements may preclude us from paying dividends. As a result, appreciation, if any, in the market price of our common stock will be your sole source of gain for the foreseeable future. General Risk Factors If we fail to comply with environmental, health and safety laws and regulations, we could become subject to fines or penalties or incur costs that could harm our business. We are subject to numerous environmental, health and safety laws and regulations, including those governing laboratory procedures and the handling, use, storage, treatment and disposal of hazardous materials and wastes. Our operations involve the use of hazardous and flammable materials, including chemicals and biological materials. Our operations also produce hazardous waste products. We generally contract with third parties for the disposal of these materials and wastes. We cannot eliminate the risk of contamination or injury from these materials. In the event of contamination or injury resulting from our use of hazardous materials, we could be held liable for any resulting damages, and any liability could exceed our resources. We also could incur significant costs associated with civil or criminal fines and penalties for failure to comply with such laws and regulations. Although we maintain workers’ compensation insurance that we believe is consistent with industry norms to cover us for costs and expenses we may incur due to injuries to our employees resulting from the use of hazardous materials, we cannot assure you that it will be sufficient to cover our liability in such cases. We do not maintain insurance for environmental liability or toxic tort claims that may be asserted against us in connection with our storage or disposal of biological, hazardous or radioactive materials. In addition, we may incur substantial costs in order to comply with current or future environmental, health and safety laws and regulations. These current or future laws and regulations may impair our discovery, nonclinical and clinical development or production efforts. Our failure to comply with these laws and regulations also may result in substantial fines, penalties or other sanctions. Our information technology systems, or those used by our CROs, third-party vendors, contractors or consultants, may fail or suffer security breaches, cyber-attacks, and loss of data, which could harm our business, reputation, financial condition, and operations. Cyber-attacks are increasing in their frequency, sophistication and intensity, and have become increasingly difficult to detect. Despite the implementation of security measures, our information technology systems and those of our strategic partners and third parties on whom we rely are vulnerable to cyber-attacks, security breaches, damage from computer viruses, unauthorized access, natural disasters, terrorism, war and telecommunication and electrical failures. Cyber-attacks could include the deployment of harmful malware, ransomware, denial-of-service attacks, social engineering and other means to affect service reliability and threaten the confidentiality, integrity and availability of information. Cyber- attacks also could include phishing attempts or e-mail fraud to cause payments or information to be transmitted to an unintended recipient. Furthermore, we have little or no control over the security measures and computer systems of third parties including any CROs we may work with in the future. While we and, to our knowledge, our third-party strategic partners have not experienced any such system failure, accident or security breach to date, if such an event were to occur, it could result in material negative consequences for us including interruptions in our operations, the operations of our strategic partners, or our manufacturers or suppliers, misappropriation of confidential business information and trade secrets, disclosure of corporate strategic plans, and result in material disruptions of our product candidate development programs. Additionally, the costs to us or our CROs, third-party vendors, or other contractors or consultants we may utilize to mitigate network security problems, bugs, viruses, worms, malicious software programs and security vulnerabilities could be significant, and while we have implemented security measures to protect our data security and information technology systems, our efforts to address these problems may not be successful, and these problems could result in unexpected system failures, interruptions, delays, cessation of service and other harm to our business and our competitive position. For example, the loss of clinical trial data from completed or ongoing or planned clinical trials could result in delays in our regulatory approval efforts, and we may incur substantial costs to attempt to recover or reproduce the data. If any disruption or security breach resulted in a loss of or damage to our data or applications, or inappropriate disclosure of confidential or proprietary information, including personal information or health information, we could incur liability, or the further development of our product candidates could be delayed. Moreover, if a security breach affects our systems or results in the unauthorized access, use or disclosure of personal information, our reputation could be materially damaged. In addition, such a breach may require notification to 69 governmental agencies, the media and/or affected individuals pursuant to various federal, state and international privacy and security laws, if applicable, including HIPAA or HITECH and its implementing rules and regulations, as well as regulations promulgated by the Federal Trade Commission and state breach notification laws. We would also be exposed to a risk of loss or litigation and potential liability under laws, regulations and contracts that protect the privacy and security of personal information. For example, the California Consumer Privacy Act, or the CCPA, imposes a private right of action for security breaches that could lead to some form of remedy including regulatory scrutiny, fines, private right of action settlements, and other consequences. The financial exposure from the events referenced above could either not be insured against or not be fully covered through any insurance that we may maintain, and there can be no assurance that the limitations of liability in any of our contracts would be enforceable or adequate or would otherwise protect us from liabilities or damages as a result of the events referenced above. Any of the foregoing could have a material adverse effect on our business, reputation, results of operations, financial condition and prospects. We depend on our information technology and infrastructure, and disruptions could compromise sensitive information related to our business or other personal information or prevent us from accessing critical information, which could adversely affect our business, reputation, results of operations, financial condition and prospects. We rely on the efficient and uninterrupted operation of information technology systems to manage our operations, to process, transmit, and store electronic and financial information, and to comply with regulatory, legal and tax requirements. We also depend on our information technology infrastructure for communications among our personnel, contractors, consultants and suppliers. System failures or outages could materially compromise our ability to perform these functions in a timely manner, which could harm our ability to conduct business or delay our financial reporting, and could otherwise compromise the security of sensitive information, including personal information and health information. In addition, our remediation efforts for system failures, outages, or security breaches may not be successful. If we do not allocate and effectively manage the resources necessary to build and sustain the proper technology and cybersecurity infrastructure, we could suffer significant business disruption, including transaction errors, supply chain or manufacturing interruptions, processing inefficiencies, data loss or the loss of or damage to intellectual property or other proprietary information, including personal information and health information. In addition, we depend on third parties to operate and support our information technology systems. Failure by these providers to adequately deliver the contracted services could have an adverse effect on our business, which in turn may materially adversely affect our operating results and financial condition. We are subject to a variety of stringent and changing privacy and data security laws, regulations and standards, as well as contractual obligations related to data privacy and security, and our actual or perceived failure to comply with them could harm our business and reputation and subject us to significant fines and liability. We maintain a large quantity of sensitive information, including confidential business and patient health information in connection with our clinical trials, and are subject to laws and regulations governing the privacy and security of such information. In the United States, there are numerous federal and state privacy and data security laws and regulations governing the collection, use, disclosure and protection of personal information, including federal and state health information privacy laws, federal and state security breach notification laws, and federal and state consumer protection laws. Each of these laws is subject to varying interpretations and constantly evolving. In May 2018, a new privacy regime, the General Data Protection Regulation, or GDPR, took effect in the European Economic Area, or EEA. The GDPR increases our obligation with respect to clinical trials conducted in the EEA by expanding the definition of “personal data” and requiring changes to informed consent practices, as well as more detailed notices for clinical trial subjects and investigators. The GDPR authorizes fines for certain violations of up to 4% of global annual revenue or €20 million, whichever is greater, and other administrative penalties. In addition, the GDPR increases the scrutiny of transfers of personal information from clinical trial sites located in the EEA to the United States. For example, on July 16, 2020, the Court of Justice of the European Union (the Court of Justice) invalidated the European Union-United States (EU-U.S.) Privacy Shield on the grounds that the EU-U.S. Privacy Shield failed to offer adequate protections to EU personal information transferred to the United States. While the Court of Justice upheld the use of other data transfer mechanisms, such as the Standard Contractual Clauses, or SCCs, the decision has led to some uncertainty regarding the use of such mechanisms for data transfers to the United States, and the court made clear that reliance on SCCs alone may not necessarily be sufficient in all circumstances. The use of SCCs for the transfer of personal information specifically to the United States also remains under review by a number of European data protection supervisory authorities. For example, German and Irish supervisory authorities have indicated that the SCCs alone provide inadequate protection for EU-U.S. data transfers. Use of the data transfer mechanisms must now be assessed on a case-by-case basis taking into account the legal regime applicable in the destination country, in particular applicable surveillance laws and rights of individuals. The European Data Protection Board, or the EDPB, issued additional guidance regarding the Court of Justice’s decision on November 11, 2020 which imposes higher burdens on the use of data transfer mechanisms, such as the SCCs, for 70 cross-border data transfers. To comply with this guidance, we may need to implement additional safeguards to further enhance the security of data transferred out of the EEA, which could increase our compliance costs, expose us to further regulatory scrutiny and liability, and adversely affect our business. Further, the European Commission published new versions of the SCCs for comment. While the comment period ended in December 2020, the European Commission is expected to finalize and implement the new Standard Contractual Clauses in early 2021. These obligations may be interpreted and applied in a manner that is inconsistent from one jurisdiction to another and may conflict with other requirements or our practices. Furthermore, Brexit has caused some uncertainty in this regulatory framework. For example, since the transition period for Brexit ended December 31, 2020, there remains some uncertainty regarding cross-border data transfers from the EEA to the United Kingdom. The EU is expected to either issue an adequacy decision for such transfers in early 2021, or an adequacy mechanism such as the SCCs will be required for transfer of personal information from the EEA to the United Kingdom. Additionally, the United Kingdom implemented the Data Protection Act effective in May 2018 and statutorily amended in 2019, that substantially implements the GDPR and contains provisions, including UK-specific derogations, for how GDPR is applied in the United Kingdom. Since the end of the Brexit transition period ended, we have to continue to comply with the GDPR and also the Data Protection Act, with each regime having the ability to fine up to the greater of €20 million (£17 million) or 4% of global turnover. Compliance with these privacy and data security laws and regulations is a rigorous and time-intensive process and if we fail to comply with any such laws or regulations, we may face significant fines and penalties that could adversely affect our business, financial condition and results of operations. In the United States, in addition to HIPAA, various federal and state regulators have adopted, or are considering adopting, laws and regulations concerning personal information and data security.  Certain state laws may be more stringent or broader in scope, or offer greater individual rights, with respect to personal information than federal, international or other state laws, and such laws may differ from each other, all of which may complicate compliance efforts.  For example, the CCPA, which increases privacy rights for California residents and imposes obligations on companies that process their personal information, came into effect on January 1, 2020, and became enforceable by the California Attorney General on July 1, 2020, along with related regulations which came into force on August 14, 2020. Additionally, although not effective until January 1, 2023, the California Privacy Rights Act, or the CPRA, which expands upon the CCPA, was passed in the recent election on November 3, 2020.  Among other things, the CCPA requires covered companies to provide new disclosures to California consumers about their data collection, use and sharing practices and provide such consumers new data protection and privacy rights, including the ability to opt out of certain sales of personal information, right to request correction, access, and deletion of their personal information, the right to opt out of certain personal information sharing, and the right to receive detailed information about how their personal information is processed.  The CCPA provides for civil penalties for violations, as well as a private right of action for data breaches that result in the loss of personal information, as mentioned above.  This private right of action may increase the likelihood of, and risks associated with, data breach litigation. The CPRA significantly modifies the CCPA, including by expanding consumers’ rights with respect to certain personal information and creating a new state agency to oversee implementation and enforcement efforts. The CCPA and CPRA may increase our compliance costs and potential liability, particularly in the event of a data breach, and could have a material adverse effect on our business, including how we use personal information, our financial condition, the results of our operations or prospects. State laws are changing rapidly and there is discussion in the U.S. of a new comprehensive federal data privacy law to which we would become subject if it is enacted. All of these evolving compliance and operational requirements impose significant costs, such as costs related to organizational changes, implementing additional protection technologies, training employees and engaging consultants, which are likely to increase over time.  In addition, such requirements may require us to modify our data processing practices and policies, distract management or divert resources from other initiatives and projects, all of which could have a material adverse effect on our business, financial condition, results of operations and prospects.  Any failure or perceived failure by us to comply with any applicable federal, state or similar foreign laws and regulations relating to data privacy and security could result in damage to our reputation, as well as proceedings or litigation by governmental agencies or other third parties, including class action privacy litigation in certain jurisdictions, which would subject us to significant fines, sanctions, awards, injunctions, penalties or judgments. Any of the foregoing could have a material adverse effect on our business, results of operations, financial condition and prospects. We and our strategic partners that we rely on may be adversely affected by natural disasters, and our business continuity and disaster recovery plans may not adequately protect us from a serious disaster. Natural disasters could severely disrupt our operations or the operations of our third party manufacturers’ facilities and have a material adverse effect on our business, financial condition, results of operations and prospects. If a natural disaster, power outage, global epidemic, pandemic or contagious disease, or other event occurred that prevented us from 71 using all or a significant portion of our headquarters or research laboratory, that damaged critical infrastructure, such as our third party manufacturers’ facilities, or that otherwise disrupted operations, it may be difficult or, in certain cases, impossible for us to continue our business for a substantial period of time. The disaster recovery and business continuity plans we have in place currently are limited and may not prove adequate in the event of a serious disaster or similar event. Substantially all of our current supply of product candidates are located at a single third party manufacturer’s facilities, and we do not have any existing back-up facilities in place or plans for such back-up facilities. We may incur substantial expenses as a result of the limited nature of our disaster recovery and business continuity plans, which could have a material adverse effect on our business, financial condition, results of operations and prospects. We may be subject to securities litigation, which is expensive and could divert management attention. Our stock price is volatile, and in the past companies that have experienced volatility in the market price of their stock have been subject to an increased incidence of securities class action litigation. We may be the target of this type of litigation in the future. Securities litigation against us could result in substantial costs and divert our management’s attention from other business concerns, which could seriously harm our business. If securities or industry analysts do not publish research or reports about our business, or publish negative reports about our business, our stock price and trading volume could decline. The trading market for our common stock will depend in part on the research and reports that securities or industry analysts publish about us or our business. We do not have any control over these analysts. There can be no assurance that analysts will cover us or provide favorable coverage. If one or more of the analysts who cover us downgrade our stock or change their opinion of our stock, our stock price would likely decline. If one or more of these analysts cease coverage of our company or fail to regularly publish reports on us, we could lose visibility in the financial markets, which could cause our stock price or trading volume to decline.   ITEM 1B. UNRESOLVED STAFF COMMENTS None. ITEM 2. PROPERTIES In April 2019, we entered into a lease agreement (the “Las Cimas Lease”) for corporate headquarters and laboratory space located in Austin, Texas. The Las Cimas Lease includes approximately 30,000 square feet and commenced on April 30, 2019, with an expiration date of April 30, 2028. Moreover, we lease approximately 4,560 square feet of additional laboratory space in Austin, Texas. The lease for the additional laboratory space will expire in September 2021. We intend to lease additional space if we add employees and expand geographically. We believe that our facilities are adequate to meet our needs for the immediate future, and that, should it be needed, suitable additional space will be available on commercially reasonable terms to accommodate any such expansion of our operations. ITEM 3. LEGAL PROCEEDINGS From time to time, we may become involved in legal proceedings arising in the ordinary course of our business. Regardless of outcome, litigation can have an adverse impact on us due to defense and settlement costs, diversion of management resources, negative publicity and reputational harm, and other factors.  ITEM 4. MINE SAFETY DISCLOSURES Not applicable. 72 PART II ITEM 5. MARKET FOR REGISTRANT’S COMMON EQUITY, RELATED STOCKHOLDER MATTERS AND ISSUER PURCHASES OF EQUITY SECURITIES Market Information and Holders Our common stock is traded on The Nasdaq Global Market under the symbol “AGLE.” As of March 12, 2021, there were approximately 21 stockholders of record of our common stock based on information provided by our transfer agent.  The actual number of stockholders is greater than this number of record holders, and includes stockholders who are beneficial owners, but whose shares are held in street name by brokers and other nominees.  This number of holders of record also does not include stockholders whose shares may be held in trust by other entities. Stock Price Performance Graph This graph shall not be deemed “soliciting material” or be deemed “filed” for purposes of Section 18 of the Exchange Act, or otherwise subject to the liabilities under that Section, and shall not be deemed to be incorporated by reference into any of our filings under the Securities Act whether made before or after the date hereof and irrespective of any general incorporation language in any such filing. The following stock performance graph compares our total stock return with the total return for (i) the Nasdaq Composite Index and the (ii) the Nasdaq Biotechnology Index for the period from April 7, 2016 (the date our common stock commenced trading on the Nasdaq Global Market) through December 31, 2020. The figures represented below assume an investment of $100 in our common stock at the closing price of $9.77 on April 7, 2016 and in the Nasdaq Composite Index and the Nasdaq Biotechnology Index on April 7, 2016 and the reinvestment of dividends into shares of common stock. The comparisons in the table are required by the SEC and are not intended to forecast or be indicative of possible future performance of our common stock. 73   $100 investment in stock or index Aeglea Biotherapeutics, Inc. Nasdaq Composite Index Nasdaq Biotechnology Index Dividends Ticker April 7, 2016 December 31, 2016 December 31, 2017 December 31, 2018 December 31, 2019 December 31, 2020   AGLE   IXIC   NBI   $   $   $ 100.00    $ 100.00    $ 100.00    $ 44.52    $ 102.12    $ 98.88    $ 55.37    $ 126.43    $ 118.33    $ 76.66    $ 121.42    $ 107.34    $ 78.20    $ 165.98    $ 134.30    $ 80.55  240.53  169.78   We have never declared or paid any cash dividends on our capital stock. We currently intend to retain all available funds and any future earnings to support our operations and finance the growth and development of our business. We do not intend to pay cash dividends on our common stock for the foreseeable future. Securities Authorized for Issuance under Equity Compensation Plans The information required by this item will be included in an amendment to this Annual Report on Form 10-K or incorporated by reference from our definitive proxy statement to be filed pursuant to Regulation 14A. Recent Sales of Unregistered Securities None. Purchases of Equity Securities by the Issuer and Affiliated Purchasers None. ITEM 6. SELECTED CONSOLIDATED FINANCIAL DATA We are a smaller reporting company and emerging growth company, as defined by Rule 12b-2 of the Exchange Act, and are not required to provide this information. 74     ITEM 7. MANAGEMENT’S DISCUSSION AND ANALYSIS OF FINANCIAL CONDITION AND RESULTS OF OPERATIONS You should read the following discussion and analysis of our financial condition and results of operations together with our financial statements and related notes appearing in this Annual Report. Some of the information contained in this discussion and analysis or set forth elsewhere in this Annual Report, including information with respect to our plans and strategy for our business and related financing, includes forward-looking statements that involve risks and uncertainties. As a result of many factors, including those factors set forth in the “Risk Factors” section of this Annual Report, our actual results could differ materially from the results described in or implied by the forward-looking statements contained in the following discussion and analysis. As used in this report, unless the context suggests otherwise, “we,” “us,” “our,” “the Company” or “Aeglea” refer to Aeglea BioTherapeutics, Inc. Overview We are a clinical-stage biotechnology company redefining the potential of human enzyme therapeutics to benefit people with rare metabolic diseases with limited treatment options. We believe our expertise in enzyme science, bioengineering and rare disease drug development coupled with an approach focused on diseases with unmet medical needs enables us to develop medicines with the potential to transform the lives of patients and families with rare metabolic diseases. We employ a distinctive platform to fuel our innovative pipeline of human enzymes, which we believe reduces key risks throughout the development process and provides a greater likelihood of clinical success and commercial adoption. Our mission is to provide transformative therapies to patient communities who have inadequate or no therapeutic options available to address these debilitating diseases. Driven by this purpose and urgent patient need, we have taken a focused approach to the selection and development of novel assets into clinical evaluation that is guided by defined strategic considerations: - - - - - Clear, urgent unmet medical need Rigorous preclinical data and strong scientific rationale Mechanistic opportunity to create or enhance enzymatic activity through novel engineering Meaningful and sustainable commercial opportunities Potential to be first in class or best in class, with little competition Our lead product candidate, pegzilarginase, is a recombinant human Arginase 1 that enzymatically degrades the amino acid arginine to lower arginine levels in patients with Arginase 1 Deficiency. We engineered pegzilarginase with modifications that enhance the stability and arginine-degrading activity of the enzyme in human plasma. For Arginase 1 Deficiency, which is a rare genetic progressive disease, that presents in early childhood and results in severe complications and early mortality, we believe pegzilarginase may reduce the harmful metabolic effects caused by the accumulation of high levels of arginine and other arginine-derived metabolites. We are currently evaluating pegzilarginase in a global pivotal Phase 3 PEACE (Pegzilarginase Effect on Arginase 1 Deficiency Clinical Endpoints) trial and in a Phase 2 open-label extension study for patients with Arginase 1 Deficiency. Our product candidate, AGLE-177, is a novel PEGylated, or polyethylene glycol modified, human enzyme engineered to degrade free homocysteine and homocystine in patients with Homocystinuria, a serious metabolic disorder characterized by elevated plasma homocysteine which leads to a wide range of life-altering complications and reduced life expectancy. We engineered AGLE-177 by directed mutagenesis of amino acid residues within the active site of human cystathionine γ-lyase, resulting in a molecule that has high substrate specificity for homocysteine and homocystine but not for the native substrate, cystathionine. For Homocystinuria due to cystathionine β-synthase, or CBS, enzyme deficiency, which is the most common form of an inherited disorder of methionine metabolism that results in elevated homocysteine and homocystine, we believe AGLE-177 may reduce the adverse impact of CBS enzyme deficiency in the transsulfuration pathway by providing an alternate pathway for enzymatic degradation of high plasma total homocysteine levels. We have initiated a Phase 1/2 clinical trial for the treatment of patients with Homocystinuria. Cystinuria is a rare genetic disease characterized by frequent and recurrent kidney stone formation requiring multiple procedural interventions, and by an increased risk of chronic kidney disease. Cystinuria occurs due to genetic mutations in amino acid transporters that lead to increased amounts of cystine in the urine. This results in high cystine concentrations in the urine and formation of kidney stones. As such, we engineered our Cystinuria program candidate to reduce plasma cystine and cysteine levels with accompanying reductions in urine cystine concentrations as an approach 75           to inhibit both cystine crystal and kidney stone formation. Due to the impact of COVID-19 on laboratory work schedules, we have not provided a timeline for advancement of a therapeutic candidate into the clinic. Since inception, we have devoted substantially all of our efforts and resources to identifying and developing product candidates, conducting nonclinical studies, initiating and conducting clinical trials, recruiting personnel and raising capital. To date, we have financed our operations primarily through private placements of our preferred stock, the initial public offering of our common stock, follow-on public offerings of our common stock, and collection of a research grant. We have incurred net losses in each year since inception. Our net losses were $80.9 million, $78.3 million, and $44.3 million for the years ended December 31, 2020, 2019, and 2018, respectively, and have resulted from costs incurred in connection with our research and development programs and from general and administrative expenses associated with our operations. As of December 31, 2020, we had an accumulated deficit of $276.0 million. We expect to continue to incur operating losses over the next several years. Our net losses may fluctuate significantly from quarter to quarter and from year to year. We anticipate that our expenses will increase as we continue our clinical development activities for our product candidates and prepare for the potential commercialization of our lead product candidate, pegzilarginase; concurrently develop our pipeline product candidates; expand and protect our intellectual property portfolio; hire additional personnel; and continue to operate as a public company. Components of Operating Results Revenue To date, we recognized revenue solely from a research grant from the Cancer Prevention and Research Institute of Texas, or CPRIT, and have not generated any revenue from the sale of any of our product candidates. Our ability to generate product revenues in the future will depend heavily on the successful development, regulatory approval, and eventual commercialization of our product candidates. In June 2015, we entered into a grant agreement with CPRIT, or the Grant Contract, for $19.8 million for use in developing cancer treatments by exploiting the metabolism of cancer cells. The Grant Contract covered a four-year period from June 1, 2014 through May 31, 2018. We recorded the revenue as qualifying costs were incurred and there was reasonable assurance that the conditions of the award had been met for collection. The contract ended in 2018 with the full $19.8 million grant received and recognized as revenue over the life of the award. Research and development expenses Research and development expenses consist primarily of costs incurred for the discovery and development of our product candidates, including, our lead product candidate, pegzilarginase, and AGLE-177. In addition to operating an internal research laboratory, we contract with external providers for nonclinical studies and clinical trials. Our research and development expenses include: • • • costs from acquiring clinical trial materials and services performed for contracted services with contract manufacturing organizations; fees paid to clinical trial sites, clinical research organizations, contract research organizations, contract manufacturing organizations, nonclinical research companies, and academic institutions; and employee and consultant-related expenses incurred, which include salaries, benefits, travel and stock-based compensation. Research and development costs are expensed as incurred. Advance payments for goods or services to be rendered in the future for use in research and development activities are deferred and capitalized. The capitalized amounts are expensed as the related goods are delivered or the services are performed. Research and development expenses have historically represented the largest component of our total operating expenses. 76       Our expenditures on current and future nonclinical and clinical development programs are subject to numerous uncertainties in timing and cost to completion. The duration, costs, and timing of clinical trials and development of our product candidates will depend on a variety of factors, including: • • • • • • • • the scope, rate of progress, and expenses of our ongoing research activities as well as any additional clinical trials and other research and development activities; future clinical trial results; uncertainties in clinical trial enrollment rates or drop-out or discontinuation rates of patients; changes in the competitive drug development environment; potential safety monitoring or other studies requested by regulatory agencies; significant and changing government regulation; the timing and receipt of regulatory approvals, if any; and developments relating to the COVID-19 global pandemic. The process of conducting the necessary clinical research to obtain FDA and other regulatory approval is costly and time consuming and the successful development of our product candidates is highly uncertain. The risks and uncertainties associated with our research and development projects are discussed more fully in Part I, Item 1A of this Annual Report titled “Risk Factors.” As a result of these risks and uncertainties, we are unable to determine with any degree of certainty the duration and completion costs of our research and development projects, or if, when, or to what extent we will generate revenues from the commercialization and sale of any of our product candidates that obtain regulatory approval. We may never succeed in achieving regulatory approval for any of our product candidates. General and administrative expenses General and administrative expenses consist primarily of salaries and other related costs, including stock-based compensation, for personnel in executive, finance, accounting, commercial development, operations, and human resources functions. Other significant costs include legal fees relating to corporate matters and fees for insurance, accounting, consulting, facilities, and recruiting services. We expect that our general and administrative expenses will increase in the future to support our continued research and development activities and ramp up of commercialization capabilities for pegzilarginase. These increases will likely include higher costs related to the hiring of additional personnel and fees to outside consultants, lawyers and accountants, among other expenses. Additionally, we have incurred and expect to continue to incur increased costs associated with being a public company, including expenses related to services associated with maintaining compliance with Nasdaq listing rules and SEC requirements, insurance, and investor relations costs. Interest income Interest income consists of interest earned on our cash, cash equivalents, marketable securities, and restricted cash. Income taxes We serve as a holding company for our nine wholly owned subsidiary corporations in the United States, United Kingdom, and European Union. We file a consolidated U.S. corporate federal income tax return for seven subsidiaries. Additionally, we operate in the U.K. and our income tax return is subject to audit and adjustment by local tax authorities. We use the asset and liability method of accounting for income taxes. Under this method, deferred tax assets and liabilities are recognized for the expected future tax consequences of temporary differences between the financial statements and the tax bases of assets and liabilities. A valuation allowance is established against the deferred tax assets to reduce their carrying value to an amount that is more likely than not to be realized. The deferred tax assets and liabilities are classified as noncurrent along with the related valuation allowance. Due to our lack of earnings history, the net deferred tax assets have been fully offset by a valuation allowance. We recognize benefits of uncertain tax positions if it is more likely than not that such positions will be sustained upon examination based solely on the technical merits, as the largest amount of benefits that is more likely than not to be realized upon the ultimate settlement. Our policy is to recognize interest and penalties related to the unrecognized tax benefits as a component of income tax expense. 77                 On March 27, 2020, the Coronavirus Aid, Relief and Economic Security, or CARES, Act was enacted and signed into law in response to COVID-19. The CARES Act includes changes to the tax provisions that benefit business entities and makes certain technical corrections to the 2017 Tax Cuts and Jobs Act. The tax relief measures for businesses include a five-year net operating loss carryback, suspension of annual deduction limitation of 80% of taxable income from net operating losses generated in a tax year beginning after December 31, 2017, changes in the deductibility of interest, acceleration of alternative minimum tax credit refunds, payroll tax relief, technical corrections on net operating loss carryforwards for fiscal year taxpayers and allowing accelerated deductions for qualified improvement property. The CARES Act also provides other non-tax benefits to assist those impacted by the pandemic. We have evaluated the impact and determined the CARES Act did not have a material impact on our consolidated financial condition or results of operations as of and for the year ended December 31, 2020. Critical Accounting Policies and Estimates Our consolidated financial statements are prepared in accordance with generally accepted accounting principles in the United States, or GAAP. The preparation of these consolidated financial statements requires us to make estimates and assumptions that affect the reported amounts of assets, liabilities, revenue, costs and expenses, and related disclosures. These estimates form the basis for judgments we make about the carrying values of our assets and liabilities, which are not readily apparent from other sources. We base our estimates on historical experience and on various other assumptions that we believe are reasonable under the circumstances. On an ongoing basis, we evaluate our estimates and assumptions. Our actual results may differ materially from these estimates under different assumptions or conditions. Our critical accounting policies are those policies which require the most significant judgments and estimates in the preparation of our consolidated financial statements. We believe that the assumptions and estimates associated with our most critical accounting policies are those relating to accrued research and development costs. We define our critical accounting policies as those accounting principles generally accepted in the United States that require us to make subjective estimates and judgments about matters that are uncertain and are likely to have a material impact on our financial condition and results of operations, as well as the specific manner in which we apply those principles. Our significant accounting policies are more fully described in Note 2 to our audited consolidated financial statements appearing elsewhere in this annual report. Accrued research and development costs We record the costs associated with research nonclinical studies, clinical trials, and manufacturing development as incurred. These costs are a significant component of our research and development expenses, with a substantial portion of our on-going research and development activities conducted by third-party service providers, including contract research organizations, or CROs, and contract manufacturing organizations, or CMOs. We accrue for expenses resulting from obligations under agreements with CROs, CMOs, and other outside service providers for which payment flows do not match the periods over which materials or services are provided to us. We record accruals based on estimates of services received and efforts expended pursuant to agreements established with CROs, CMOs, and other outside service providers. These estimates are typically based on contracted amounts applied to the proportion of work performed and determined through analysis with internal personnel and external service providers as to the progress or stage of completion of the services. We make significant judgments and estimates in determining the accrual balance in each reporting period. In the event advance payments are made to a CRO, CMO, or outside service provider, the payments will be recorded as a prepaid asset which will be amortized as the contracted services are performed. As actual costs become known, we adjust our accruals. Inputs, such as the services performed, the number of patients enrolled, or the study duration, may vary from our estimates, resulting in adjustments to research and development expense in future periods. Changes in these estimates that result in material changes to our accruals could materially affect our results of operations. 78 Results of Operations Comparison of the Years Ended December 31, 2020 and 2019 A discussion and analysis of our financial condition and results of operations for the year ended December 31, 2018 is included in Item 7 of Part II, “Management’s Discussion and Analysis of Financial Condition and Results of Operations” in our Annual Report on Form 10-K for the year ended December 31, 2019 filed with the SEC on February 24, 2020. The following table summarizes our results of operations for the years ended December 31, 2020 and 2019, together with the changes in those items in dollars and as a percentage: Operating expenses: Research and development General and administrative Total operating expenses Loss from operations Interest income Other expense, net Net loss Year Ended December 31, 2019 2020 Dollar Change (dollars in thousands) % Change   $   $ 59,638    $ 21,843    81,481    (81,481)   593    (5)   (80,893)   $ 64,600    $ 15,734    80,334    (80,334)   2,143    (63)   (78,254)   $ (4,962)   6,109    1,147    (1,147)   (1,550)   58    (2,639)   8% 39% 1% 1% 72% 92% 3% Research and Development Expenses.  Research and development expenses decreased by $5.0 million, or 8%, to $59.6 million for the year ended December 31, 2020 from $64.6 million for the year ended December 31, 2019. The change in research and development expenses was due to: • • • lower clinical and nonclinical development expenses, which decreased by $6.9 million as a result of completing our Phase 1/2 clinical trial for pegzilarginase in patients with Arginase 1 Deficiency and cancer related trials, along with completing supporting toxicology studies for the Homocystinuria program; and lower manufacturing expenses, which decreased by $0.6 million as a result of completing certain manufacturing and pre-commercial activities for pegzilarginase, which was partially offset by a ramp-up in manufacturing activities for our Homocystinuria program; offset by higher personnel-related expenses, which increased by $2.5 million as a result of additional headcount to expand our medical and biometrics support. General and Administrative Expenses.  General and administrative expenses increased by $6.1 million, or 39%, to $21.8 million for the year ended December 31, 2020 from $15.7 million for the year ended December 31, 2019. The increase in general and administrative expenses was primarily due to a $2.6 million increase in compensation and other personnel expenses, including $1.0 million in non-cash stock compensation, driven by additional headcount to develop our commercial team and support, $2.5 million of expenses related to professional service and legal costs primarily to support the ramp up of our commercial capabilities, and $0.8 million in facility-related expenses driven by additional office space to support company growth. Interest Income.   The decrease in interest income to $0.6 million for the year ended December 31, 2020 from $2.1 million for the year ended December 31, 2019 was primarily due to decreasing yield rates during the year ended December 31, 2020 as compared to the prior year. Liquidity and Capital Resources Sources of liquidity We are a clinical-stage biotechnology company with a limited operating history, and due to our significant research and development expenditures, we have generated operating losses since our inception and have not generated any revenue from the sale of any products. Since our inception and through December 31, 2020, we have funded our operations primarily by raising an aggregate of $437.6 million of gross proceeds from the sale and issuance of convertible preferred and common equity securities, pre-funded stock warrants, and the collection of grant proceeds. During the year ended December 31, 2020, we raised $163.3 million of gross proceeds through an underwritten public offering and an at-the-market offering program. We sold 15,442,303 shares of common stock and pre-funded 79                                                                                               warrants to purchase up to 13,610,328 shares of common stock in an underwritten public offering, or the 2020 Public Offering, for gross proceeds of $138.0 million, resulting in net proceeds of $129.0 million after deducting underwriting discounts, commissions, and offering costs. Additionally, we sold an aggregate of 3,245,077 shares of common stock under an at-the-market offering program, or the 2020 ATM, for gross proceeds of $25.3 million, resulting in net proceeds of $24.6 million, after deducting underwriting discounts, commissions, and offering costs. The shares of common stock and pre-funded warrants sold in the 2020 Public Offering were pursuant to a shelf registration statement on Form S-3, declared effective in February 2019 by the SEC for the potential offering, issuance and sale by us of up to $200.0 million of our common stock, warrants to purchase common stock, and other security types and subscription rights. The shares of common stock sold under the 2020 ATM were pursuant to an April 2020 sales agreement with JonesTrading Institutional Services LLC, as sales agent, to issue and sell shares of our common stock for an aggregate offering price of $60.0 million. As of the date of the filing of this report, $34.7 million of our common stock remained available for sale under the sales agreement. In July 2020, we filed a new shelf registration statement on Form S-3 that was declared effective by the SEC for the potential offering, issuance and sale by us of up to $400.0 million of our common stock, preferred stock, debt securities, warrants to purchase common stock, preferred stock and debt securities, subscription rights to purchase common stock and units consisting of all or some of these securities. During the year ended December 31, 2019, we raised $69.0 million of gross proceeds from the sale of 4,625,000 shares of common stock and pre-funded warrants to purchase up to 4,000,000 shares of common stock in an underwritten public offering, resulting in net proceeds of $64.5 million after deducing underwriting discounts, commissions, and offering costs. Our primary use of cash is to fund the development of our product candidates, prepare for the potential commercialization of our lead product candidate, pegzilarginase and advance our pipeline. This includes both the research and development costs and the general and administrative expenses required to support those operations. Since we are a clinical- stage biotechnology company, we have incurred significant operating losses since our inception and we anticipate such losses, in absolute dollar terms, to increase as we continue clinical development of our product candidates, prepare for the potential commercialization of pegzilarginase, and expand our development efforts in our pipeline of nonclinical candidates. Future funding requirements and operational plan Our operational plan for the near future is to continue clinical trials for our lead product candidate pegzilarginase in Arginase 1 Deficiency and for our AGLE-177 product candidate for the treatment of Homocystinuria, prepare for the potential commercialization of pegzilarginase, and to advance development activities for our Cystinuria program. As such, we plan to focus our research and development expenditures and general and administrative expenditures on nonclinical studies, clinical trials, manufacturing, and commercial development. We expect our principal expenditures during this time period to include expenses for the following: • • • funding the continuing development of pegzilarginase and AGLE-177; funding the advancement of additional product candidates; and funding working capital, including general operating expenses. Due to our significant research and development expenditures, we have generated substantial losses in each period since inception. We have an accumulated deficit of $276.0 million as of December 31, 2020. We anticipate that we will continue to generate losses into the foreseeable future as we develop our product candidates, seek regulatory approval of those candidates and begin to commercialize any approved products. Until such time as we can generate substantial product revenue, we expect to finance our cash needs through a combination of equity or debt financings, research grants, collaborations, or other sources. We currently have no debt, credit facility or additional committed capital. To the extent that we raise additional equity, the ownership interest of our stockholders will be diluted. Based on our available cash, cash equivalents, marketable securities, and restricted cash of $148.1 million as of December 31, 2020, we believe that we have sufficient resources to fund our operations into 2023. We have based this estimate on assumptions that may prove to be incorrect, however, and we could deplete our capital resources sooner than we expect. 80       Cash flows A discussion and analysis of our financial condition and cash flows for the year ended December 31, 2018 is included in Item 7 of Part II, “Management’s Discussion and Analysis of Financial Condition and Results of Operations” in our Annual Report on Form 10-K for the year ended December 31, 2019 filed with the SEC on February 24, 2020. The following table summarizes our cash flows for the periods indicated (in thousands): Net cash and cash equivalents (used in) provided by: Operating activities Investing activities Financing activities Effect of exchange rate on cash, cash equivalents, and    restricted cash Net increase (decrease) in cash and cash equivalents Year Ended December 31, 2020 2019   $   $ (75,775)   $ (7,604)   154,512    51    71,184    $ (65,692) (1,739) 65,723  —  (1,708) Cash used in operating activities Cash used in operating activities for the year ended December 31, 2020 was $75.8 million and reflected a net loss of $80.9 million. The cash impact of our net loss was offset by non-cash expenses of $6.3 million for stock-based compensation, $1.0 million for depreciation and amortization, and $0.6 million for operating lease expense. The net change in operating assets and liabilities of $2.5 million was primarily related to a $1.7 million decrease in accrued liabilities and accounts payable due to payments for manufacturing and a $1.1 million increase in prepaid expenses and other assets due to advanced payments associated with manufacturing for Arginase 1 Deficiency and nonclinical studies for Homocystinuria. Cash used in operating activities for the year ended December 31, 2019 was $65.7 million and reflected a net loss of $78.3 million. The cash impact of our net loss was offset by non-cash expenses of $4.9 million for stock-based compensation, $0.5 million for operating lease expense, $0.4 million for depreciation and amortization, and $0.3 million for net accretion of discounts on marketable securities exceeding the purchased discounts for the period. The net change in operating assets and liabilities of $7.1 million was related to a $7.7 million increase in accounts payable and accrued liabilities due to additional research and development costs associated with the clinical trials and manufacturing activities for pegzilarginase in patients with Arginase 1 Deficiency, which was partially offset by a $0.3 million increase in prepaid expenses and other assets due to advanced payments associated with our on-going clinical trials to treat Arginase 1 Deficiency and a $0.3 million decrease in operating lease liabilities. Cash used in investing activities Cash used in investing activities for the year ended December 31, 2020 was $7.6 million and consisted of $129.0 million in purchases of marketable securities and $4.3 million in purchases of property and equipment offset by $125.7 million in maturities of marketable securities. Cash used in investing activities for the year ended December 31, 2019 was $1.7 million and consisted of $91.9 million in purchases of marketable securities and $1.5 million in purchases of property and equipment offset by $91.7 million in maturities and sales of marketable securities. Cash provided by financing activities Cash provided by financing activities for the year ended December 31, 2020 was $154.5 million, which consisted of $138.0 million from the public offering of our common stock, offset by $9.0 million in paid underwriting and offering costs, $25.3 million from the sale of our common stock under an at-the-market program, offset by $0.7 million in paid underwriting and offering costs, and $0.8 million in proceeds received from stock option exercises and sale of common stock under our 2016 Employee Stock Purchase Plan. 81                         Cash provided by financing activities for the year ended December 31, 2019 was $65.7 million, which consisted of $69.0 million from the public offering of our common stock in February 2019, offset by $4.1 million in underwriting discounts and commissions and $0.6 million in paid offering costs related to the offering and Form S-3 registration statement, and $1.4 million in proceeds received from stock option exercises and sale of common stock under our 2016 Employee Stock Purchase Plan. Contractual Obligations The following table summarizes our contractual obligations as of December 31, 2020 (in thousands): Operating leases Finance lease Total Less than 1 year 1 to 3 years Payments Due by Period 4 to 5 years More than 5 years   $   $ 995    $ 32    1,027    $ 2,097    $ 49    2,146    $ 2,225    $ —    2,225    $ 2,765  —  2,765   $  $ Total 8,082  81  8,163   We have entered into agreements in the normal course of business with contract research organizations for clinical trials and contract manufacturing organizations, and with vendors for preclinical research studies and other services and products for operating purposes. These contractual obligations are cancelable at any time by us, generally upon 30 to 60 days’ prior written notice to the vendor. Contingent contractual obligations The terms of the Grant Contract require that we pay CPRIT tiered royalties in the low- to mid-single digit percentages on revenues from sales and license of products or services that are based upon, utilize, are developed from or materially incorporate the intellectual property resulting from the grant-funded activities for pegzilarginase. Such royalties reduce to less than one percent after a mid-single digit multiple of the grant funds have been repaid to CPRIT in royalties. Such royalties are payable for so long as we have marketing exclusivity or patents covering the applicable product or service (or twelve years from commercial sale of product or service in certain countries if there is no such exclusivity or patent protection). In December 2013, our wholly owned subsidiaries AECase, Inc. and AEMase, Inc. each entered into an exclusive, worldwide license agreement, including the right to grant sublicenses, with the University of Texas at Austin, or the University, for certain intellectual property owned by the University related to our program candidates for cystinase and methioninase. In January 2017, we and the University entered into an Amended and Restated Patent License Agreement, or the Restated License, which consolidated the two license agreements, revised certain obligations, and licensed additional patent applications and invention disclosures to us. The Restated License was amended in August 2017, December 2017, and December 2018 to revise diligence milestones and license additional patent applications, including our program candidates under our AGLE177 and Cystinuria programs. With respect to each program candidate covered by the Restated License, we could be required to pay the University up to $6.4 million in milestone payments based on the achievement of certain development milestones, including clinical trials and regulatory approvals, the majority of which are due upon the achievement of later development milestones, including a $5.0 million payment due on regulatory approval of a product and a $0.5 million payment payable on final regulatory approval of a product for a second indication. In addition, we are required to pay the University a low single digit royalty on worldwide-net sales of products covered under the Restated License, together with a revenue share on non- royalty consideration received from sublicensees. The rate of the revenue share ranges from 6.5% to 25% depending on the date the sublicense agreement is signed. The University may terminate the agreement under certain circumstances, including for a breach by us that is not cured within 30 or 60 days of notice (depending on the type of breach), or if we or any of our affiliates or sublicensees participate in any proceeding to challenge the licensed patent rights (unless, with respect to sublicensees, we terminate the applicable sublicense). Off Balance Sheet Arrangements Through December 31, 2020, we do not have any off-balance sheet arrangements, as defined by applicable SEC regulations. 82                    JOBS Act Accounting Election We are an “emerging growth company,” as defined in the JOBS Act. Under the JOBS Act, emerging growth companies can delay adopting new or revised accounting standards issued subsequent to the enactment of the JOBS Act until such time as those standards apply to private companies. We have irrevocably elected not to avail ourselves of this exemption from new or revised accounting standards, and, therefore, are subject to the same new or revised accounting standards as other public companies that are not emerging growth companies. Recently Adopted Accounting Pronouncements Please refer to Note 2, Summary of Significant Accounting Policies, to the consolidated financial statements included elsewhere in this Annual Report on Form 10-K. ITEM 7A. QUANTITATIVE AND QUALITATIVE DISCLOSURES ABOUT MARKET RISK We are exposed to market risks in the ordinary course of our business. Our primary exposure to market risk is interest rate sensitivity, which is affected by changes in the general level of U.S. interest rates, particularly because our investments are in marketable securities. Our marketable securities are subject to interest rate risk and could fall in value if market interest rates increase. However, we believe that our exposure to interest rate risk is not significant as the majority of our investments are short-term in duration and due to the low risk profile of our investments, a 10% change in interest rates would not have a material effect on the total market value of our investment portfolio. We have the ability to hold our marketable securities until maturity, and therefore we would not expect our operating results or cash flows to be affected to any significant degree by the effect of a change in market interest rates on our investments. As of December 31, 2020, we held $148.1 million in cash, cash equivalents, marketable securities, and restricted cash, all of which was denominated in U.S. dollar assets, and consisting primarily of investments in money market funds, U.S. treasury securities, U.S. government agency securities, and corporate bonds. We are also exposed to market risk related to changes in foreign currency exchange rates, as a result of entering into transactions denominated in currencies other than U.S. dollars. Due to the uncertain timing of expected payments in foreign currencies, we do not utilize any forward exchange contracts. All foreign transactions settle on the applicable spot exchange basis at the time such payments are made. For the year ended December 31, 2020, a majority of our expenditures were denominated in U.S. dollars. A hypothetical 10% change in foreign exchange rates during any of the periods presented would not have had a material impact on our consolidated financial statements. 83 ITEM 8. FINANCIAL STATEMENTS AND SUPPLEMENTARY DATA AEGLEA BIOTHERAPEUTICS, INC. INDEX TO CONSOLIDATED FINANCIAL STATEMENTS Audited Consolidated Financial Statements Report of Independent Registered Public Accounting Firm Consolidated Balance Sheets Consolidated Statements of Operations Consolidated Statements of Comprehensive Loss Consolidated Statements of Changes in Stockholders’ Equity Consolidated Statements of Cash Flows Notes to Consolidated Financial Statements 84 Page 85 86 87 88 89 90 91                     To the Board of Directors and Stockholders of Aeglea BioTherapeutics, Inc. Opinion on the Financial Statements Report of Independent Registered Public Accounting Firm We have audited the accompanying consolidated balance sheets of Aeglea BioTherapeutics, Inc. and its subsidiaries (the “Company”) as of December 31, 2020 and 2019, and the related consolidated statements of operations, of comprehensive loss, of changes in stockholders’ equity and of cash flows for each of the three years in the period ended December 31, 2020, including the related notes (collectively referred to as the “consolidated financial statements”). In our opinion, the consolidated financial statements present fairly, in all material respects, the financial position of the Company as of December 31, 2020 and 2019, and the results of its operations and its cash flows for each of the three years in the period ended December 31, 2020 in conformity with accounting principles generally accepted in the United States of America. Basis for Opinion These consolidated financial statements are the responsibility of the Company’s management. Our responsibility is to express an opinion on the Company’s consolidated financial statements based on our audits. We are a public accounting firm registered with the Public Company Accounting Oversight Board (United States) (PCAOB) and are required to be independent with respect to the Company in accordance with the U.S. federal securities laws and the applicable rules and regulations of the Securities and Exchange Commission and the PCAOB. We conducted our audits of these consolidated financial statements in accordance with the standards of the PCAOB. Those standards require that we plan and perform the audits to obtain reasonable assurance about whether the consolidated financial statements are free of material misstatement, whether due to error or fraud. The Company is not required to have, nor were we engaged to perform, an audit of its internal control over financial reporting. As part of our audits we are required to obtain an understanding of internal control over financial reporting but not for the purpose of expressing an opinion on the effectiveness of the Company's internal control over financial reporting. Accordingly, we express no such opinion. Our audits included performing procedures to assess the risks of material misstatement of the consolidated financial statements, whether due to error or fraud, and performing procedures that respond to those risks. Such procedures included examining, on a test basis, evidence regarding the amounts and disclosures in the consolidated financial statements. Our audits also included evaluating the accounting principles used and significant estimates made by management, as well as evaluating the overall presentation of the consolidated financial statements. We believe that our audits provide a reasonable basis for our opinion. /s/ PricewaterhouseCoopers LLP Austin, Texas March 18, 2021 We have served as the Company’s auditor since 2014. 85     Aeglea BioTherapeutics, Inc. Consolidated Balance Sheets (In thousands, except share and per share amounts) ASSETS December 31, 2020 2019 CURRENT ASSETS Cash and cash equivalents Marketable securities Prepaid expenses and other current assets Total current assets Restricted cash Property and equipment, net Operating lease right-of-use assets Other non-current assets TOTAL ASSETS CURRENT LIABILITIES Accounts payable Operating lease liabilities Accrued and other current liabilities Total current liabilities Non-current operating lease liabilities Other non-current liabilities TOTAL LIABILITIES Commitments and Contingencies (Note 14) STOCKHOLDERS’ EQUITY LIABILITIES AND STOCKHOLDERS’ EQUITY Preferred stock, $0.0001 par value; 10,000,000 shares authorized as of    December 31, 2020 and 2019; no shares issued and outstanding as of    December 31, 2020 and 2019 Common stock, $0.0001 par value; 500,000,000 shares authorized as of    December 31, 2020 and 2019, 47,959,086 shares and 29,084,437 shares    issued and outstanding as of December 31, 2020 and 2019, respectively Additional paid-in capital Accumulated other comprehensive income Accumulated deficit TOTAL STOCKHOLDERS’ EQUITY TOTAL LIABILITIES AND STOCKHOLDERS’ EQUITY   $   $   $   $ 90,095    $ 56,178    3,516    149,789    1,842    5,642    4,230    115    161,618    $ 2,254    $ 319    13,870    16,443    5,129    214    21,786    19,253  52,696  2,556  74,505  1,500  2,385  4,726  67  83,183  3,154  351  14,854  18,359  4,712  31  23,102  —    —  5    415,824    11    (276,008)   139,832    161,618    $ 3  255,142  51  (195,115) 60,081  83,183   The accompanying notes are an integral part of these consolidated financial statements. 86                                                                                                                                                                                                               Aeglea BioTherapeutics, Inc. Consolidated Statements of Operations (In thousands, except share and per share amounts) Revenues: Grant Operating expenses: Research and development General and administrative Total operating expenses Loss from operations Other income (expense): Interest income Other expense, net Total other income Net loss Net loss per share, basic and diluted Weighted-average common shares outstanding, basic and diluted 2020 Year Ended December 31, 2019 2018   $ —    $ —    $ 3,888  59,638    21,843    81,481    (81,481)   593    (5)   588    (80,893)   $ 64,600    15,734    80,334    (80,334)   2,143    (63)   2,080    (78,254)   $ 36,719  12,632  49,351  (45,463) 1,172  (57) 1,115  (44,348) (1.52)   $ (2.45)   $ 53,371,730    31,949,633    (2.13) 20,822,560     $   $ The accompanying notes are an integral part of these consolidated financial statements. 87                                                                                                                                                                                                         Aeglea BioTherapeutics, Inc. Consolidated Statements of Comprehensive Loss (In thousands) Net loss Other comprehensive income (loss): Foreign currency translation adjustment Unrealized (loss) gain on marketable securities Total comprehensive loss 2020 Year Ended December 31, 2019 2018   $ (80,893)   $ (78,254)   $ 19    (59)   (80,933)   $ —    78    (78,176)   $   $ (44,348) —  75  (44,273) The accompanying notes are an integral part of these consolidated financial statements. 88                                              Balances—December 31, 2017 Issuance of common stock in connection with employee    stock purchase plan Issuance of common stock in connection with exercise    of stock options Issuance of common stock in connection with public    and at-the-market offerings, net of offering costs Stock-based compensation expense Unrealized gain on marketable securities Net loss Balances—December 31, 2018 Issuance of common stock in connection with employee    stock purchase plan Issuance of common stock in connection with exercise    of stock options Issuance of common stock and pre-funded warrants in    connection with public offering, net of offering costs Stock-based compensation expense Unrealized gain on marketable securities Net loss Balances—December 31, 2019 Issuance of common stock in connection with employee    stock purchase plan Issuance of common stock in connection with exercise    of stock options Issuance of common stock and pre-funded warrants in    connection with public and at-the-market offerings, net    of offering costs Stock-based compensation expense Foreign currency translation adjustment Unrealized loss on marketable securities Net loss Balances—December 31, 2020 Aeglea BioTherapeutics, Inc. Consolidated Statements of Changes in Stockholders’ Equity (In thousands) Common Stock Shares Amount Additional Paid-in Capital Accumulated Other Comprehensive Income (Loss) Accumulated Deficit Total Stockholders’ Equity 16,670    $ 2    $ 122,950    $ (102)   $ (72,513 )   $ 50,337  56  521  6,893  —  —  —  24,140  45  274  4,625  —  —  —  29,084  60  127  18,688  —  —  —  —  47,959    $   $   $ —  —  —  —  —  —  2  —  —  1  —  —  —  3  —  —  2  —  —  —  —  5    $   $   $ 207  2,829  54,048  4,280  —  —  184,314  307  1,143  64,502  4,876  —  —  255,142  366  490  153,570  6,256  —  —  —  415,824    $   $   $ The accompanying notes are an integral part of these consolidated financial statements. 89 —  —  —  —  75  —  (27)   $ —  —  —  —  —  (44,348 )   (116,861 )   $ —  —  —  —  —    $ (78,254 )   (195,115 )   $ —  —  —  —  78  —  51  —  —  —  —  —  —  —  —  (80,893 )   (276,008 )   $ —  —  19  (59)   —  11    $ 207  2,829  54,048  4,280  75  (44,348 ) 67,428  307  1,143  64,503  4,876  78  (78,254 ) 60,081  366  490  153,572  6,256  19  (59) (80,893 ) 139,832                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         Aeglea BioTherapeutics, Inc. Consolidated Statements of Cash Flows (In thousands) CASH FLOWS FROM OPERATING ACTIVITIES Net loss Adjustments to reconcile net loss to net cash used in operating activities: Depreciation and amortization Purchase net (premium) discount on marketable securities Net amortization of premium (accretion of discount) on marketable securities Stock-based compensation Research and development services settled with stock Non-cash operating lease expense Other Changes in operating assets and liabilities: Accounts receivable - grant Prepaid expenses and other assets Accounts payable Deferred revenue Operating lease liabilities Accrued and other liabilities Net cash used in operating activities CASH FLOWS FROM INVESTING ACTIVITIES Purchases of property and equipment Purchases of marketable securities Proceeds from maturities and sales of marketable securities Net cash used in investing activities CASH FLOWS FROM FINANCING ACTIVITIES Proceeds from issuance of common stock and pre-funded warrants in public    and at-the-market offerings, net of offering costs Proceeds from employee stock plan purchases and stock option    exercises Principal payments on finance lease obligation Net cash provided by financing activities Effect of exchange rate on cash, cash equivalents, and restricted cash NET INCREASE (DECREASE) IN CASH, CASH EQUIVALENTS, AND    RESTRICTED CASH CASH, CASH EQUIVALENTS, AND RESTRICTED CASH Beginning of period End of period Supplemental Disclosure of Non-Cash Investing and Financing Information: Leased assets obtained in exchange for lease obligations Unpaid amounts related to purchase of property and equipment 2020 Year Ended December 31, 2019 2018   $ (80,893)   $ (78,254)   $ (44,348) 996  (286)   73  6,256  —  628  (9)   —  (1,101)   (544)   —  251  (1,146)   (75,775)   (4,280)   (129,000)   125,676  (7,604)   153,716  816  (20)   154,512  51  71,184  418    504    (818)   4,876    —    483    (5)   —    (346)   2,583    —    (258)   5,125    (65,692)   (1,492)   (91,926)   91,679    (1,739)   64,298    1,450    (25)   65,723    —    (1,708)   20,753  91,937    $ 22,461    20,753    $ 293  907  (593) 4,280  107  —  (40) 3,078  (261) 239  (20) —  4,165  (32,193) (422) (62,179) 47,370  (15,231) 54,048  3,020  —  57,068  —  9,644  12,817  22,461  172  224    $   $ 5,294    $ 356    $ —  92     $   $   $ The accompanying notes are an integral part of these consolidated financial statements. 90                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          Aeglea BioTherapeutics, Inc. Notes to Consolidated Financial Statements 1. The Company and Basis of Presentation Aeglea BioTherapeutics, Inc. (“Aeglea” or the “Company”) is a clinical-stage biotechnology company redefining the potential of human enzyme therapeutics to benefit people with rare metabolic diseases with limited treatment options. The Company was formed as a Limited Liability Company (LLC) in Delaware on December 16, 2013 under the name Aeglea BioTherapeutics Holdings, LLC and was converted from a Delaware LLC to a Delaware corporation on March 10, 2015. The Company operates in one segment and has its principal offices in Austin, Texas. Liquidity As of December 31, 2020, the Company had working capital of $133.3 million, an accumulated deficit of $276.0 million, and cash, cash equivalents, marketable securities, and restricted cash of $148.1 million. The Company has not generated any product revenues and has not achieved profitable operations. There is no assurance that profitable operations will ever be achieved, and, if achieved, could be sustained on a continuing basis. In addition, development activities, clinical and nonclinical testing, and commercialization of the Company’s products will require significant additional financing. The Company is subject to a number of risks similar to other life science companies, including, but not limited to, risks related to the successful discovery, development, and commercialization of product candidates, raising additional capital, development of competing drugs and therapies, protection of proprietary technology and market acceptance of the Company’s products. As a result of these and other factors and the related uncertainties, there can be no assurance of the Company’s future success. Based upon the Company’s current operating plans, the Company believes that it has sufficient resources to fund operations into 2023 with its existing cash, cash equivalents, and marketable securities. The Company will need to secure additional funding in the future, in order to carry out all of its planned research and development activities. If the Company is unable to obtain additional financing or generate license or product revenue, the lack of liquidity could have a material adverse effect on the Company’s future prospects. Basis of Presentation The consolidated financial statements have been prepared in conformity with generally accepted accounting principles in the United States (“U.S. GAAP”) as defined by the Financial Accounting Standards Board (“FASB”) and include the accounts of the Company and its wholly owned subsidiaries. All intercompany balances and transactions have been eliminated in consolidation. 2. Summary of Significant Accounting Policies Use of Estimates The preparation of financial statements in conformity with U.S. GAAP requires management to make estimates and assumptions that affect the amounts reported in the consolidated financial statements and accompanying notes. Such management estimates include those related to accruals of research and development related costs, stock-based compensation, and certain company income tax related items. Management bases its estimates on historical experience and on various other market-specific and relevant assumptions that management believes to be reasonable under the circumstances. Actual results could differ significantly from those estimates. Cash and Cash Equivalents The Company considers all highly liquid investments with original maturities of three months or less from the date of purchase to be cash equivalents. Cash equivalents consist of money market funds and debt securities and are stated at fair value. 91 Marketable Securities All investments have been classified as available-for-sale and are carried at estimated fair value as determined based upon quoted market prices or pricing models for similar securities. Management determines the appropriate classification of its investments in debt securities at the time of purchase. The Company may or may not hold securities with stated maturities greater than one year until maturity. All available-for-sale securities are considered available to support current operations and are classified as current assets. The Company presents credit losses as an allowance rather than as a reduction in the amortized cost of the available-for-sale securities. For available-for-sale debt securities in an unrealized loss position, the Company first assesses whether it intends to sell, or it is more likely than not that it will be required to sell the security before recovery of its amortized cost basis. If either of the criteria regarding intent or requirement to sell is met, the security’s amortized cost basis is written down to fair value and recognized in other income (expense) in the results of operations. For available-for-sale debt securities that do not meet the aforementioned criteria, the Company evaluates whether the decline in fair value has resulted from credit losses or other factors. In making this assessment, management considers the extent to which fair value is less than amortized cost, any changes to the rating of the security by a rating agency, and adverse conditions specifically related to the security, among other factors. If this assessment indicates that a credit loss exists, an allowance is recorded for the difference between the present value of cash flows expected to be collected and the amortized cost basis of the security. Impairment losses attributable to credit loss factors are charged against the allowance when management believes an available-for-sale security is uncollectible or when either of the criteria regarding intent or requirement to sell is met. Any unrealized losses from declines in fair value below the amortized cost basis as a result of non-credit loss factors is recognized as a component of accumulated other comprehensive (loss) income, along with unrealized gains. Realized gains and losses and declines in fair value, if any, on available-for-sale securities are included in other income (expense) in the results of operations. The cost of securities sold is based on the specific-identification method. Restricted Cash Restricted cash consists of money market accounts held by financial institutions as collateral for the Company’s obligations under a credit agreement and a facility lease for the Company’s corporate headquarters in Austin, TX. Concentration of Credit Risk Financial instruments that potentially subject the Company to a concentration of credit risk consist of cash, cash equivalents, marketable securities, and restricted cash. The Company’s investment policy limits investments to high credit quality securities issued by the U.S. government, U.S. government-sponsored agencies, highly rated banks, and corporate issuers, subject to certain concentration limits and restrictions on maturities. The Company’s cash, cash equivalents, marketable securities, and restricted cash are held by financial institutions that management believes are of high credit quality. Amounts on deposit may at times exceed federally insured limits. The Company has not experienced any losses on its deposits of cash, cash equivalents, and restricted cash and its accounts are monitored by management to mitigate risk. The Company is exposed to credit risk in the event of default by the financial institutions holding its cash, cash equivalents, and restricted cash, and bond issuers. Property and Equipment Property and equipment are stated at cost, net of accumulated depreciation and amortization. Depreciation and amortization are computed using the straight-line method over the estimated useful lives of the assets. Repairs and maintenance that do not extend the life or improve an asset are expensed as incurred. Upon retirement or sale, the cost of disposed assets and their related accumulated depreciation and amortization are removed from the balance sheet. Any gain or loss is credited or charged to operations. The useful lives of the property and equipment are as follows: Laboratory equipment Furniture and office equipment Computer equipment Software Leasehold improvements   5 years   5 years   3 years   3 years   Shorter of remaining lease term or estimated useful life 92   Impairment of Long-Lived Assets Long-lived assets are reviewed for indications of possible impairment whenever events or changes in circumstances indicate that the carrying amount of an asset may not be recoverable. Recoverability is measured by comparison of the carrying amounts to the future undiscounted cash flows attributable to these assets. An impairment loss is recognized to the extent an asset group is not recoverable, and the carrying amount exceeds the projected discounted future cash flows arising from these assets. There were no impairments of long- lived assets for the years ended December 31, 2020, 2019, and 2018. Accrued Research and Development Costs The Company records the costs associated with research nonclinical studies, clinical trials, and manufacturing development as incurred. These costs are a significant component of the Company’s research and development expenses, with a substantial portion of the Company’s on-going research and development activities conducted by third-party service providers, including contract research and manufacturing organizations. The Company accrues for expenses resulting from obligations under agreements with contract research organizations (“CROs”), contract manufacturing organizations (“CMOs”), and other outside service providers for which payment flows do not match the periods over which materials or services are provided to the Company. Accruals are recorded based on estimates of services received and efforts expended pursuant to agreements established with CROs, CMOs, and other outside service providers. These estimates are typically based on contracted amounts applied to the proportion of work performed and determined through analysis with internal personnel and external service providers as to the progress or stage of completion of the services. The Company makes significant judgments and estimates in determining the accrual balance in each reporting period. In the event advance payments are made to a CRO, CMO, or outside service provider, the payments will be recorded as a prepaid asset which will be amortized as the contracted services are performed. As actual costs become known, the Company adjusts its accruals. Inputs, such as the services performed, the number of patients enrolled, or the study duration, may vary from the Company’s estimates, resulting in adjustments to research and development expense in future periods. Changes in these estimates that result in material changes to the Company’s accruals could materially affect the Company’s results of operations. Historically, the Company has not experienced any material deviations between accrued and actual research and development expenses. Leases The Company determines if an arrangement is a lease at inception. Right-of-use ("ROU") assets represent the Company's right to use an underlying asset for the lease term and lease liabilities represent the Company's obligation to make lease payments arising from the lease. The classification of the Company's leases as operating or finance leases along with the initial measurement and recognition of the associated ROU assets and lease liabilities is performed at the lease commencement date. The measurement of lease liabilities is based on the present value of future lease payments over the lease term. As the Company's leases do not provide an implicit rate, the Company uses its incremental borrowing rate based on the information available at the lease commencement date in determining the present value of future lease payments. The ROU asset is based on the measurement of the lease liability and also includes any lease payments made prior to or on lease commencement and excludes lease incentives and initial direct costs incurred, as applicable. The lease terms may include options to extend or terminate the lease when it is reasonably certain the Company will exercise any such options. Rent expense for the Company's operating leases is recognized on a straight-line basis over the lease term. Amortization expense for the ROU asset associated with its finance leases is recognized on a straight-line basis over the term of the lease and interest expense associated with its finance leases is recognized on the balance of the lease liability using the effective interest method based on the estimated incremental borrowing rate. The Company has lease agreements with lease and non-lease components. As allowed under Topic 842, the Company has elected to not separate lease and non-lease components for any leases involving real estate and office equipment classes of assets and, as a result, accounts for the lease and non-lease components as a single lease component. The Company has also elected to not apply the recognition requirement of Topic 842 to leases with a term of 12 months or less for all classes of assets. Fair Value of Financial Instruments The Company uses fair value measurements to record fair value adjustments to certain financial and non-financial assets and liabilities and to determine fair value disclosures. The accounting standards define fair value, establish a framework for measuring fair value, and require disclosures about fair value measurements. Fair value is defined as the price that would be received from selling an asset or paid to transfer a liability in an orderly transaction between market 93   participants at the measurement date. When determining the fair value measurements for assets and liabilities required to be recorded at fair value, the principal or most advantageous market in which the Company would transact are considered along with assumptions that market participants would use when pricing the asset or liability, such as inherent risk, transfer restrictions, and risk of nonperformance. The accounting standard for fair value establishes a fair value hierarchy based on three levels of inputs, the first two of which are considered observable and the last unobservable, that requires an entity to maximize the use of observable inputs and minimize the use of unobservable inputs when measuring fair value. A financial instrument’s categorization within the fair value hierarchy is based upon the lowest level of input that is significant to the fair value measurement. The three levels of inputs that may be used to measure fair value are as follows: Level 1: Level 2: Level 3: Observable inputs, such as quoted prices in active markets for identical assets or liabilities. Observable inputs other than Level 1 prices, such as quoted prices for similar assets or liabilities, or other inputs that are observable or can be corroborated by observable market data for substantially the full term of the assets or liabilities. Valuations based on unobservable inputs to the valuation methodology and including data about assumptions that market participants would use in pricing the asset or liability based on the best information available under the circumstances. Financial instruments carried at fair value include cash, cash equivalents, marketable securities, and restricted cash. The carrying amount of accounts payable and accrued liabilities approximate fair value due to their relatively short maturities. Revenue Recognition The Company’s sole source of revenue was grant revenue related to a $19.8 million research grant received from the Cancer Prevention and Research Institute of Texas (“CPRIT”), covering a four-year period from June 1, 2014 through May 31, 2018. Grant revenue was recognized when qualifying costs were incurred and there was reasonable assurance that the conditions of the award had been met for collection. Proceeds received prior to the costs being incurred or the conditions of the award being met were recognized as deferred revenue until the services were performed and the conditions of the award were met (see Note 9). Research and Development Costs Research and development costs are expensed as incurred. Research and development costs include, but are not limited to, salaries, benefits, travel, stock-based compensation, consulting costs, contract research service costs, laboratory supplies and facilities, contract manufacturing costs, and costs paid to other third parties that conduct research and development activities on the Company’s behalf. Amounts incurred in connection with license agreements are also included in research and development expense. Advance payments for goods or services to be rendered in the future for use in research and development activities are recorded as a prepaid asset and expensed as the related goods are delivered or the services are performed. Stock-Based Compensation The Company recognizes the cost of stock-based awards granted to employees and non-employees based on the estimated grant-date fair values of the awards. The fair values of stock options are estimated on the date of grant using the Black-Scholes option pricing model. The fair values of restricted stock units (“RSUs”) are based on the fair value of the Company’s common stock on the date of the grant. The value of the award is recognized as compensation expense on a straight-line basis over the requisite service period. Forfeitures are recognized when they occur, which may result in the reversal of compensation costs in subsequent periods as the forfeitures arise. Compensation expense for employee and non-employee share-based payment awards with performance conditions is recognized when the performance condition is deemed probable. 94       Income Taxes The Company and its nine wholly owned subsidiary corporations use the asset and liability method of accounting for income taxes. Under this method, deferred tax assets and liabilities are recognized for the expected future tax consequences of temporary differences between the financial statements and the tax bases of assets and liabilities. Additionally, any changes in income tax laws are immediately recognized in the year of enactment. A valuation allowance is established against the deferred tax assets to reduce their carrying value to an amount that is more likely than not to be realized. The deferred tax assets and liabilities are classified as noncurrent along with the related valuation allowance. Due to a lack of earnings history, the net deferred tax assets have been fully offset by a valuation allowance. The Company recognizes benefits of uncertain tax positions if it is more likely than not that such positions will be sustained upon examination based solely on the technical merits, as the largest amount of benefits that is more likely than not to be realized upon the ultimate settlement. The Company’s policy is to recognize interest and penalties related to the unrecognized tax benefits as a component of income tax expense, if applicable. On March 27, 2020, the Coronavirus Aid, Relief and Economic Security (“CARES”) Act was enacted and signed into law in response to COVID-19. The CARES Act includes changes to the tax provisions that benefit business entities and makes certain technical corrections to the 2017 Tax Cuts and Jobs Act. The tax relief measures for businesses include a five-year net operating loss carryback, suspension of annual deduction limitation of 80% of taxable income from net operating losses generated in a tax year beginning after December 31, 2017, changes in the deductibility of interest, acceleration of alternative minimum tax credit refunds, payroll tax relief, technical corrections on net operating loss carryforwards for fiscal year taxpayers and allowing accelerated deductions for qualified improvement property. The CARES Act also provides other non-tax benefits to assist those impacted by the pandemic. The Company evaluated the impact and determined the CARES Act did not have a material impact on its consolidated financial condition or results of operations as of and for the year ended December 31, 2020. Comprehensive Loss Comprehensive loss is the change in stockholders’ equity from transactions and other events and circumstances other than those resulting from investments by stockholders and distributions to stockholders. The Company’s other comprehensive income (loss) is currently comprised of changes in unrealized losses and gains on available-for-sale securities and foreign currency translation adjustments reflecting the cumulative effect of changes in exchange rates between the foreign entity’s functional currency and the reporting currency. Recently Adopted Accounting Pronouncements In June 2016, the FASB issued ASU No. 2016-13, Financial Instruments – Credit Losses (Topic 326): Measurement of Credit Losses on Financial Instruments, which changes the impairment model for most financial assets and certain other instruments. For available-for-sale debt securities with unrealized credit losses, the credit losses will be recognized as allowances rather than as reductions in the amortized cost of the securities. On January 1, 2020, the Company adopted ASU 2016-13 using the modified retrospective approach and no cumulative effect adjustment to accumulated deficit was needed as of the adoption date. Additionally, no prior period amounts were adjusted and continue to be reported in accordance with the legacy other-than-temporary impairment model. The adoption of ASU 2016-13 did not have a material impact on the Company’s consolidated financial statements. In August 2018, the FASB issued ASU No. 2018-15, Intangibles – Goodwill and Other – Internal Use Software (Subtopic 350-40), to align the requirements for capitalizing implementation costs incurred in a hosting arrangement that is a service contract with the requirements for capitalizing implementation costs incurred to develop or obtain internal-use software (and hosting arrangements that include an internal-use software license). The amendments in the update require an entity in a hosting arrangement that is a service contract to follow the guidance in Subtopic 350-40 to determine which implementation costs to capitalize as an asset related to the service contract and which costs to expense. Capitalized implementation costs are recorded in prepaid expenses and other current assets or other non-current assets on the statement of financial position and the related amortization expense is recorded in operating expenses in the results of operations. On January 1, 2020, the Company adopted ASU 2018-15 on a prospective basis and no prior period amounts were adjusted. The adoption of ASU 2018-15 did not have a material impact on the Company’s consolidated financial statements. 95 3.  Fair Value Measurements The Company measures and reports certain financial instruments as assets and liabilities at fair value on a recurring basis. The following tables sets forth the fair value of the Company’s financial assets and liabilities at fair value on a recurring basis based on the three-tier fair value hierarchy (in thousands): Financial Assets Money market funds U.S. treasury securities U.S. government agency securities Corporate bonds Total financial assets Financial Assets Money market funds Reverse repurchase agreements Commercial paper Corporate bonds Total financial assets Level 1 Level 2 Level 3 Total December 31, 2020 6,700    $ —    —    —    6,700   $ —    $ 57,181  66,893  3,001  127,075    $ —    $ —  —  —  —   $ 6,700  57,181  66,893  3,001  133,775   Level 1 Level 2 Level 3 Total December 31, 2019 7,023    $ —    —    —    7,023   $ —    $ 6,250  15,193  39,750  61,193    $ —    $ —  —  —  —   $ 7,023  6,250  15,193  39,750  68,216     $   $   $   $ The Company measures the fair value of money market funds and U.S. treasury securities on quoted prices in active markets for identical asset or liabilities. The Level 2 assets include U.S. treasury securities, U.S. government agency securities, reverse repurchase agreements, commercial paper, and corporate bonds and are valued based on quoted prices for similar assets in active markets and inputs other than quoted prices that are derived from observable market data. The Company evaluates transfers between levels at the end of each reporting period. There were no transfers between Level 1 and Level 2 during the periods presented. 4. Cash Equivalents and Marketable Securities The following tables summarize the estimated fair value of the Company’s cash equivalents and marketable securities and the gross unrealized gains and losses (in thousands): Cash equivalents: Money market funds U.S. treasury securities U.S. government agency securities Total cash equivalents Marketable securities: U.S. treasury securities Corporate bonds Total marketable securities Amortized Cost December 31, 2020 Gross Unrealized Gains Gross Unrealized Losses Estimated Fair Value 6,700    $ 4,005    66,895    77,600  53,183    3,000    56,183    $   $   $ 96 —    $ —    —    —  1    1    2    $ —    $ (1)   (2)   (3) (7)   —    (7)   $ 6,700  4,004  66,893  77,597  53,177  3,001  56,178                                                                                                                                                                                                                                                                                          Cash equivalents: Money market funds Reverse repurchase agreements Commercial paper Total cash equivalents Marketable securities: Commercial paper Corporate bonds Total marketable securities Amortized Cost December 31, 2019 Gross Unrealized Gains Gross Unrealized Losses Estimated Fair Value   $   $ 7,023    $ 6,250      2,247      15,520  12,931      39,714      52,645    $ —    $ —      —      —  15      45      60    $ —    $ —      —      —  —      (9)     (9)   $ 7,023  6,250  2,247  15,520  12,946  39,750  52,696   The reverse repurchase agreements are settled in cash nightly, and as such are classified as cash equivalents. The following table summarizes the available-for-sale securities in an unrealized loss position for which an allowance for credit losses has not been recorded as of December 31, 2020 and 2019, aggregated by major security type and length of time in a continuous unrealized loss position: U.S. treasury securities U.S. government agency securities Total marketable securities Less Than 12 Months December 31, 2020 12 Months or Longer Fair Value   $   $ 43,183    $ 66,893    110,076    $ Unrealized Losses Fair Value Unrealized Losses (8) (2) (10)  $  $ —    $ —    —    $ Total Fair Value —  —  —   $  $ 43,183    $ 66,893    110,076    $ Unrealized Losses (8) (2) (10) Less Than 12 Months Fair Value Unrealized Losses December 31, 2019 12 Months or Longer Fair Value Unrealized Losses Fair Value Total Unrealized Losses Corporate bonds   $ 13,022    $ (9)  $ —    $ —   $ 13,022    $ (9) As of December 31, 2020 and 2019, the Company held 16 and 13 debt securities, respectively, that were in an unrealized loss position. The Company evaluated its securities for credit losses and considered the decline in market value to be primarily attributable to current economic and market conditions and not to a credit loss or other factors. Additionally, the Company does not intend to sell the securities in an unrealized loss position and does not expect they will be required to sell the securities before recovery of the unamortized cost basis. As of December 31, 2020 and 2019, an allowance for credit losses had not been recognized. Given our intent and ability to hold such securities until recovery, and the lack of significant change in credit risk of these investments, we do not consider these marketable securities to be impaired as of December 31, 2020 and 2019. There were no realized gains or losses on marketable securities for the years ended December 31, 2020 and 2018. A realized gain is included in other expense, net for the year ended December 31, 2019. Interest on marketable securities is included in interest income. Accrued interest receivable on available-for-sale debt securities totaled $0.2 million and $0.3 million as of December 31, 2020 and 2019, respectively, and is excluded from the estimate of credit losses. The following table summarizes the contractual maturities of the Company's marketable securities at estimated fair value (in thousands): Due in one year or less Due in 1 - 2 years Total marketable securities 97 December 31, 2020 2019   $   $ 56,178    $ —    56,178    $ 49,687  3,009  52,696                                                                                                                                                                                                                     The Company may sell investments at any time for use in current operations even if they have not yet reached maturity. As a result, the Company classifies marketable securities, including securities with maturities beyond twelve months as current assets. 5. Property and Equipment, Net Property and equipment, net consist of the following (in thousands): Laboratory equipment Furniture and office equipment Computer equipment Software Leasehold improvements Property and equipment, gross Less: Accumulated depreciation and amortization Property and equipment, net December 31, 2020 2019   $   $ 1,916    $ 747    56    132    4,774    7,625    (1,983)   5,642    $ 1,085  396  50  96  1,813  3,440  (1,055) 2,385   Depreciation and amortization expense for the years ended December 31, 2020, 2019, and 2018 was $1.0 million, $0.4 million, and $0.3 million, respectively. All of the Company’s long-lived assets are located in the United States. 6. Accrued and Other Current Liabilities Accrued and other current liabilities consist of the following (in thousands): Accrued compensation Accrued contracted research and development costs Accrued professional and consulting fees Other Total accrued and other current liabilities December 31, 2020 2019   $   $ 3,712    $ 8,620    1,074    464    13,870    $ 3,273  10,485  627  469  14,854   7. Leases The Company leases certain office space, laboratory facilities, and equipment. These leases require monthly lease payments that may be subject to annual increases throughout the lease term. Certain of these leases also include renewal options at the election of the Company to renew or extend the lease for an additional three to five years. These optional periods have not been considered in the determination of the right-of-use-assets or lease liabilities associated with these leases as the Company did not consider it reasonably certain it would exercise the options. The Company performed evaluations of its contracts and determined it has both operating and finance leases. Variable lease expense for these leases primarily consists of common area maintenance and other operating costs. In April 2019, the Company entered into a lease agreement (the “Las Cimas Lease”) for its corporate headquarters and laboratory space located in Austin, TX. The Las Cimas Lease includes approximately 30,000 square feet and commenced on April 30, 2019, with an expiration on April 30, 2028. The Company posted a customary letter of credit in the amount of $1.5 million as security, which is subject to automatic reductions per the terms of the Las Cimas Lease. A tenant allowance of up to $1.0 million is provided by the lessor. As of December 31, 2020, the Company has been reimbursed $0.9 million of the tenant allowance. 98                                                                     The following table summarizes the Company’s recognition of its operating and finance leases (in thousands): Classification December 31, 2020 2019 Assets Operating Finance Total leased assets Leases Current Operating Finance Non-current Operating Finance Total lease liabilities   Operating lease right-of-use assets   Other non-current assets   Operating lease liabilities Accrued and other current liabilities   Non-current operating lease liabilities   Other non-current liabilities $ $ $ 4,230    68    4,298    319    27    5,129    45    5,520    $ 4,726  56  4,782  351  28  4,712  31  5,122   The following table summarizes the weighted-average remaining lease term and discount rates for the Company’s operating and finance leases: Lease term (years) Operating leases Finance leases Discount rate Operating leases Finance leases December 31, 2020 2019 7.3  2.6  10.7%     10.2%     7.7  2.0  10.6% 9.5% The following table summarizes the lease costs pertaining to the Company’s operating leases (in thousands): Operating lease cost Variable lease cost Total lease cost Year Ended December 31, 2020 2019 2018   $   $ 1,258    $ 665    1,923    $ 946    $ 331    1,277    $ 401  198  599   Cash paid for amounts included in the measurement of operating lease liabilities during the years ended December 31, 2020 and 2019 was $1.3 million and $0.7 million, respectively, and was included within net cash used in operating activities in the cash flows. 99                                                                                                                                                                                                                                              The maturities of the Company’s operating and finance lease liabilities as of December 31, 2020 were as follows (in thousands): 2021 2022 2023 2024 2025 Thereafter Total lease payments Less: Imputed interest Tenant allowance Total Operating Leases Finance Leases $ $ $ 995    1,033    1,064    1,096    1,129    2,765    8,082    (2,525)   (109)   5,448    $ 32  32  17  —  —  —  81  (9) —  72   8. Stockholders’ Equity The Company is authorized to issue 510,000,000 shares of capital stock of which 500,000,000 shares are designated as common stock and 10,000,000 shares are designated as preferred stock, all with a par value of $0.0001 per share. Each holder of common stock is entitled to one vote for each share of common stock held. The Company’s common stock is not entitled to preemptive rights, and is not subject to conversion, redemption or sinking fund provisions. Subject to preferences that may apply to any shares of preferred stock outstanding at the time, the holders of common stock are entitled to receive dividends out of funds legally available if the board of directors, in its discretion, determines to issue dividends and then only at the times and in the amounts that the board of directors may determine. As of December 31, 2020 and 2019, no common stock dividends had been declared by the board of directors and there were no shares of preferred stock outstanding. Follow-on Public Offerings In April 2018, the Company issued and sold 5,046,510 shares of common stock in an underwritten public offering pursuant to a shelf registration statement on Form S-3 at a public offering price of $8.00 per share, including 546,510 shares of common stock issued upon the partial exercise by the underwriters of their option to purchase additional shares. The net proceeds to the Company from this public offering were $37.7 million, after deducting underwriting discounts and commissions of $2.4 million and offering costs of $0.3 million. In February 2019, the Company issued and sold 4,625,000 shares of common stock at a public offering price of $8.00 per share and pre-funded warrants to purchase up to 4,000,000 shares of common stock at a public offering price of $7.9999 per warrant in an underwritten public offering pursuant to a shelf registration statement on Form S-3. This includes the full exercise by the underwriters of their option to purchase up to 1,125,000 additional shares of common stock. The net proceeds to the Company from this public offering were $64.5 million, after deducting underwriting discounts and commissions of $4.1 million and offering costs of $0.4 million. In April 2020, the Company issued and sold 15,442,303 shares of common stock at a public offering price of $4.75 per share and pre-funded warrants to purchase up to 13,610,328 shares of common stock at a public offering price of $4.7499 per warrant in an underwritten public offering pursuant to a shelf registration statement on Form S-3. This includes the full exercise by the underwriters of their option to purchase up to 3,789,473 additional shares of common stock. The net proceeds to the Company from this public offering were $129.0 million, after deducting underwriting discounts and commissions of $8.2 million and offering costs of $0.8 million. The public offering price for the pre-funded warrants sold in February 2019 and April 2020 was equal to the public offering price of the common stock, less the $0.0001 per share exercise price of each warrant. The warrants were recorded as a component of stockholders’ equity within additional paid-in capital and have no expiration date. Per the terms of the warrant agreements, the outstanding warrants to purchase shares of common stock may not be exercised if the holder’s ownership of the Company’s common stock would exceed 4.99% (“Maximum Ownership Percentage”). By written notice to the Company, the holders of the pre-funded warrants purchased in February 2019 may increase or decrease the Maximum Ownership Percentage, and the holders of the pre-funded warrants purchased in April 2020 may increase or decrease the Maximum Ownership Percentage to any other percentage not in excess of 19.99%. The revised Maximum Ownership Percentage would be effective 61 days after the notice is received by the Company. 100                                                                         As of December 31, 2020, the following pre-funded warrants to purchase common stock were issued and outstanding: Issue Date Expiration Date Exercise Price Number of Warrants Outstanding February 8, 2019 April 30, 2020 Total pre-funded warrants At-The-Market Offering   None   None   $   $ 0.0001    0.0001    4,000,000  13,610,328  17,610,328   In May 2017, the Company entered into a sales agreement with JonesTrading Institutional Services LLC, as sales agent and underwriter, to issue and sell shares of its common stock for an aggregate offering price of $20.0 million under an at-the-market (“2017 ATM’) offering program. In October 2018, the Company issued and sold 1,845,820 shares of common stock in a single transaction under the 2017 ATM, for gross proceeds $17.0 million, resulting in net proceeds of $16.4 million, after deducting underwriting discounts, commissions, and offering costs. The 2017 ATM agreement was subsequently terminated in December 2018. In April 2020, the Company entered into a new sales agreement with JonesTrading Institutional Services LLC, as sales agent, to issue and sell shares of its common stock for an aggregate offering price of $60.0 million under an at-the-market (“2020 ATM”) offering program. In the fourth quarter of 2020, the Company issued and sold 3,245,077 shares of common stock under the 2020 ATM for gross proceeds of $25.3 million, resulting in net proceeds of $24.6 million, after deducting underwriting discounts, commissions, and offering costs. As of the date of the filing of this report, $34.7 million of our common stock remained available for sale pursuant to the 2020 ATM. 9. Grant Revenues In June 2015, the Company entered into a Cancer Research Grant Contract (“Grant Contract”) with CPRIT, under which CPRIT awarded a grant not to exceed $19.8 million for use in developing cancer treatments by exploiting the metabolism of cancer cells. The Grant Contract covered a four-year period from June 1, 2014 through May 31, 2018. Upon commercialization of the product, the terms of the Grant Contract require the Company to pay tiered royalties in the low to mid-single digit percentages. Such royalties reduce to less than one percent after a mid-single-digit multiple of the grant funds have been paid to CPRIT as royalties. The contract ended in May 2018 with the full $19.8 million grant recognized as revenue over the life of the award. For the years ended December 31, 2020 and 2019, the Company recognized no grant revenue. For the year ended December 31, 2018, the Company recognized $3.9 million in grant revenues for qualified expenditures under the grant. 10. Stock-Based Compensation 2015 Equity Incentive Plan In March 2015, the Company adopted the 2015 Equity Incentive Plan (“2015 Plan”), administered by the board of directors, and provides for the Company to sell or issue common stock or restricted common stock, or to grant incentive stock options or nonqualified stock options for the purchase of common stock, to employees, members of the board of directors and consultants of the Company. Under the terms of the 2015 Plan, the exercise prices, vesting and other restrictions may be determined at the discretion of the board of directors, or their committee if so delegated, except that the exercise price per share of stock options may not be less than 100% of the fair market value of the share of common stock on the date of grant, the term of stock options may not be greater than ten years for all grants, and for grantees holding more than 10% of the total combined voting power of all classes of stock, the term may not be greater than five years. The Company granted options under the 2015 Plan until April 2016 when it was terminated as to future awards, although it continues to govern the terms of options that remain outstanding under the 2015 Plan. As of December 31, 2020, a total of 204,482 shares of common stock are subject to options outstanding under the 2015 Plan and will become available under the 2016 Equity Incentive Plan (“2016 Plan”) to the extent the options are forfeited or lapse unexercised. 101                         2016 Equity Incentive Plan The 2016 Plan became effective in April 2016 and serves as the successor to the 2015 Plan. Under the 2016 Plan, the Company may grant stock options, stock appreciation rights, restricted stock awards, restricted stock units, performance awards, and stock bonuses. The 2016 Plan provides for an initial reserve of 1,100,000 shares of common stock, plus 509,869 shares of common stock remaining under the 2015 Plan, and any share awards that subsequently are forfeited or lapse unexercised under the 2015 Plan. The shares reserved exclude shares of common stock reserved for issuance under the 2015 Plan. In October 2018, the 2016 plan was amended to increase the number of shares of common stock reserved for issuance thereunder by 1,759,602 shares, extend the term of the 2016 Plan through August 7, 2028, and provide for an automatic increase in the number of shares reserved for issuance thereunder on January 1 of each year for the remaining term of the plan equal to (a) 4.0% of the number of issued and outstanding shares of common stock on December 31 of the immediately preceding year, or (b) a lesser amount as approved by the board each year. The superseded 2016 Plan provision to provide an annual increase in the number of shares available for issuance required the Company’s board of directors to approve the increase, up to 4%, prior to January 1 of each relevant year. As a result of the operation of each of these provisions, on January 1, 2020, 2019, and 2018, an additional 1,163,377, 965,603, and 666,807 shares, respectively, became available for issuance under the 2016 Plan. As of December 31, 2020, the total number of shares reserved for issuance under the 2016 Plan was 6,883,659, of which 5,299,662 shares were subject to outstanding option awards and restricted unit awards. 2018 Equity Inducement Plan In February 2018, the board of directors approved and adopted the 2018 Equity Inducement Plan (“2018 Plan”), which became effective on the same date. The board of directors approved an initial reserve of 1,100,000 shares of common stock to be used exclusively for individuals who were not previously employees or directors, or following a bona fide period of non-employment, as an inducement material to the individual entering into employment with the Company. Nonqualified stock options or restricted stock units may be granted under the 2018 Plan at the discretion of the Compensation Committee or the board of directors. The Company did not seek stockholder approval of the 2018 Plan pursuant to Nasdaq Rule 5635(c)(4). As of December 31, 2020, the total number of shares reserved for issuance under the 2018 Plan was 1,100,000, of which 81,900 shares were subject to outstanding option awards. Under the 2016 Plan and 2018 Plan, the Company may grant stock-based awards with service conditions (“service-based” awards), performance conditions (“performance- based” awards), and market conditions (“market-based” awards). Service-based awards granted under the 2018 Plan, 2016 Plan, and 2015 Plan generally vest over four years and expire after ten years, although awards have been granted with vesting terms less than four years. 2016 Employee Stock Purchase Plan The 2016 Employee Stock Purchase Plan (“2016 ESPP”) became effective in April 2016. A total of 165,000 shares of common stock were reserved for issuance under the 2016 ESPP. Eligible employees may purchase shares of common stock under the 2016 ESPP at 85% of the lower of the fair market value of the Company’s common stock as of the first or the last day of each offering period. Employees are limited to contributing 15% of the employee’s eligible compensation and may not purchase more than $25,000 of stock during any calendar year or more than 2,000 shares during any one purchase period or a lesser amount determined by the board of directors. The 2016 ESPP will terminate ten years from the first purchase date under the plan, unless terminated earlier by the board of directors. In June 2018, the 2016 ESPP was amended to provide for an automatic annual increase in the number of shares reserved for issuance thereunder on January 1 of each year for the remaining term of the year equal to (a) 1.0% of the number of issued and outstanding shares of common stock on December 31 of the immediately preceding year, or (b) a lesser amount as approved by the board of directors each year. As a result of the operation of this provision, on January 1, 2020 and 2019, an additional 290,844 and 241,400 shares, respectively, became available for issuance under the 2016 ESPP. As of December 31, 2020, the reserve remaining and available for future issuance under the 2016 ESPP was 478,298 shares. 102   The following table summarizes employee and non-employee stock option activity for the year ended December 31, 2020: Outstanding as of December 31, 2019 Granted Exercised Forfeited Outstanding as of December 31, 2020 Options vested and expected to vest as of December 31, 2020 Options exercisable as of December 31, 2020 Shares Issuable Under Options Weighted Average Exercise Price 3,889,188    $ 1,963,100    (127,376)   (367,068)   5,357,844    $ 5,003,406    $ 2,654,899    $ 7.37    7.97    3.85    7.84    7.64    7.58    7.24    Weighted Average Remaining Contractual Term (in years) Aggregate Intrinsic Value (in thousands) 8.10    $ 3,642  7.92    $ 7.86    $ 7.11    $ 3,788  3,783  3,041   The aggregate intrinsic value of options outstanding, exercisable, vested and expected to vest were calculated as the difference between the exercise price of the options and the fair value of the Company’s common stock as of the reporting date. For the years ended December 31, 2020, 2019, and 2018, the weighted-average grant date fair value of options granted was $4.68, $8.09, and $8.03, respectively. The total intrinsic value of options exercised during the years ended December 31, 2020, 2019, and 2018 was $0.4 million, $1.0 million and $1.9 million, respectively. There were no stock options issued to non-employees during the years ended December 31, 2020, 2019, and 2018. For the years ended December 31, 2020 and 2018, 1,663 and 6,626 non-employee stock options, respectively, vested in the period. For the year ended December 31, 2019, no non-employee stock options vested in the period.  Restricted Common Stock Units The Company granted 228,200 restricted stock units (“RSUs”) during the year ended December 31, 2020 to certain employees with regulatory, commercial, and clinical milestones in addition to a service condition. As of December 31, 2020, the performance conditions of these RSUs were not probable of being achieved. If and when the performance milestones are deemed probable of being achieved within the required time frame, the Company may recognize up to $1.9 million of stock-based compensation. The following table summarizes employee restricted stock activity for the year ended December 31, 2020: Unvested restricted stock units as of December 31, 2019 Granted Vested Forfeited Unvested restricted stock units as of December 31, 2020 There were no RSUs granted to non-employees during the year ended December 31, 2020. 103 Shares —    $ 228,200    —    —    228,200    $ Weighted Average Grant Date Fair Value —  8.13  —  —  8.13                                                                                                                           Stock-Based Compensation Expense Total stock-based compensation expense recognized from the Company’s equity incentive plans, 2018 Plan, and the 2016 ESPP for the years ended December 31, 2020, 2019, and 2018 was as follows (in thousands): Research and development General and administrative Total stock-based    compensation expense   $   $ Employees 2020 Non- Employees 2,168    $ 4,052    Year Ended December 31, 2019 Employees 36    $ —    1,828    $ 3,048    Non- Employees 2018 Employees —    $ —    1,440    $ 2,606    Non- Employees 6,220    $ 36    $ 4,876    $ —    $ 4,046    $ 234  —  234   No related tax benefits were recognized for the years ended December 31, 2020, 2019, and 2018 (see Note 12). The employee and non-employee awards contain both performance and service-based vesting conditions. No expense was recognized for the unvested employee and non- employee awards with only a performance condition for the years ended December 31, 2020, 2019, and 2018. The performance-based vesting conditions represent specific performance targets. Compensation expense for employee and non-employee share-based payment awards with performance conditions is recognized when the performance condition is deemed probable of achievement. In November 2018, one of the board of directors resigned. Upon his resignation, the Company’s board of directors approved the immediate vesting of all unvested stock options and restricted stock and an extension in the exercise period for all outstanding equity awards from 90 days to 180 days. The result was a modification of 86,252 outstanding stock options and 43,290 restricted stock awards. The incremental fair value of $0.3 million, in connection with the modification of the awards, was recognized as stock compensation expense upon resignation with no future service or performance conditions required. As of December 31, 2020, the Company had an aggregate of $12.3 million of unrecognized stock-based compensation expense for options outstanding, which is expected to be recognized over a weighted average period of 2.5 years. In determining the fair value of the stock-based awards, the Company uses the Black-Scholes option-pricing model and assumptions discussed below. Each of these inputs is subjective and generally requires significant judgment to determine. Expected Term The Company’s expected term represents the period that the Company’s stock-based awards are expected to be outstanding and is determined using the simplified method (based on the mid-point between the vesting date and the end of the contractual term). The Company utilizes this method due to lack of historical exercise data and the plain-vanilla nature of the Company’s stock-based awards. Expected Volatility Since the Company was privately held through April 2016, it alone does not have the relevant company-specific historical data to support its expected volatility. As such, the Company has used an average of expected volatilities based on the volatilities of a representative group of publicly traded biopharmaceutical companies over a period equal to the expected term of the stock option grants. Subsequent to the Company’s initial public offering, it began to consider the Company’s own historic volatility. However, due to its limited history as a public company, the Company still uses peer company data to assist in this analysis. For purposes of identifying comparable companies, the Company selected companies with comparable characteristics to it, including enterprise value, risk profiles, position within the industry, and with historical share price information sufficient to meet the expected life of the stock-based awards. The historical volatility data was computed using the daily closing prices for the selected companies’ shares during the equivalent period of the calculated expected term of the stock-based awards. The Company intends to consistently apply this process using the same or similar comparable entities until a sufficient amount of historical information regarding the volatility of the Company’s own share price becomes available. 104                     Risk-Free Interest Rate The risk-free interest rate is based on the U.S. Treasury zero coupon issues in effect at the time of grant for periods corresponding with the expected term of option. Expected Dividend The Company has never paid dividends on its common stock and has no plans to pay dividends on its common stock. Therefore, the Company used an expected dividend yield of zero. The fair value of the stock options granted under the 2018 Plan, 2016 Plan, and 2015 Plan and the shares available for purchase under the 2016 ESPP were determined using the Black-Scholes option-pricing model. The following table summarizes the weighted-average assumptions used in calculating the fair value of the awards: 2018 Plan, 2016 Plan, and 2015 Plan Expected term (in years) Expected volatility Risk-free interest Dividend yield 2016 ESPP Expected term (in years) Expected volatility Risk-free interest Dividend yield 11. Defined Contribution Plan 2020 Year Ended December 31, 2019 2018 6.10  76%   1.06%   0%   0.50  76%   0.75%   0%   6.01  80%   2.32%   0%   0.50  70%   2.11%   0%   5.20  74% 2.42% 0% 0.50  66% 2.20% 0% The Company sponsors a 401(k) retirement plan in which substantially all of its full-time employees are eligible to participate. Participants may contribute a percentage of their annual compensation to this plan, subject to statutory limitations. During the years ended December 31, 2020, 2019, 2018, the Company provided $0.5 million, $0.3 million, and $0.2 million, respectively, in contributions to the plan. 12. Income Taxes For the years ended December 31, 2020, 2019, and 2018, the Company recognized no provision or benefit from income taxes. The difference between the Company’s provision for income taxes and the amounts computed by applying the statutory federal income tax rate to income before income taxes is as follows (in thousands): Tax provision derived by applying the federal statutory    rate to income before income taxes Permanent differences and other Federal tax credits State tax credits Change in the valuation allowance Income tax expense /(benefit) 2020 Year Ended December 31, 2019 2018   $   $ (16,988)   $ 482    (3,905)   (251)   20,662    —    $ (16,433)   $ (98)   (3,599)   (229)   20,359    —    $ (9,313) 264  (1,211) 464  9,796  —   105                                                                                                                       The components of the deferred tax assets and liabilities consist of the following (in thousands): Deferred tax assets Net operating loss carryforward Intangible assets Accrued expense Stock-based compensation Federal tax credits State tax credits Other Total deferred tax assets Deferred tax liabilities Depreciable assets Total deferred tax liabilities Less: Valuation allowance Deferred tax assets, net December 31, 2020 2019   $ 51,708    $ 51    598    2,087    14,764    839    299    70,346    (203)   (203)   (70,143)     $ —    $ 36,093  45  605  1,237  10,859  588  126  49,553  (72) (72) (49,481) —   The Company has established a full federal and state valuation allowance equal to the net deferred tax assets due to uncertainties regarding the realization of the deferred tax asset based on the Company’s lack of earnings history. The valuation allowance increased by $20.7 million, $20.4 million, and $9.8 million during the years ended December 31, 2020, 2019, and 2018, respectively, primarily due to continuing loss from operations. As of December 31, 2020 and 2019, the Company had U.S. net operating loss carryforwards (“NOL”) of $246.2 million and $171.9 million, respectively. As of December 31, 2020 and 2019, the Company had U.S. tax credit carryforwards of $14.8 million and $10.9 million, respectively, and state tax credit carryforwards of $0.8 million and $0.6 million, respectively. The net operating loss and tax credit carryforwards of $58.4 million and $11.1 million, respectively, will begin to expire in 2033, if not utilized. The net operating loss and credit carryforwards are subject to Internal Revenue Service adjustments until the statute closes on the year the net operating loss or tax credits are utilized. The Company has not completed a study to assess whether an ownership change has occurred or whether there have been multiple ownership changes since the Company’s formation due to the complexity and cost associated with such a study, and the fact that there may be additional such ownership changes in the future. If the Company has experienced an ownership change at any time since its formation, utilization of the NOL or R&D credit carryforwards would be subject to an annual limitation under Section 382 or 383 of the Internal Revenue Code, which is determined by first multiplying the value of the Company’s stock at the time of the ownership change by the applicable long-term, tax-exempt rate, and then could be subject to additional adjustments, as required. Additionally, the separate return limitation year (“SRLY”) rules may apply to losses of the Company’s seven wholly owned U.S. subsidiary corporations. The SRLY rules limit the consolidated group’s use of a subsidiary corporation’s net operating losses to the amount of income generated by the subsidiary corporation after it becomes a member of the group. Any limitation may result in expiration of a portion of the NOL or R&D credit carryforwards before utilization. Further, until a study is completed and any limitation known, no amounts are being considered as an uncertain tax position or disclosed as an unrecognized tax benefit. Additionally, the Company does not expect any unrecognized tax benefits to change significantly over the next twelve months. Due to the existence of the valuation allowance, future changes in the Company’s unrecognized tax benefits will not impact its effective tax rate. Any carryforwards that will expire prior to utilization as a result of such limitations will be removed from deferred tax assets with a corresponding reduction of the valuation allowance. The Company is subject to examination by taxing authorities in its significant jurisdictions for the 2017 and subsequent years. However, due to NOL and tax attribute carryovers, the taxing authorities have the ability to adjust the NOLs and other tax attributes related to closed years. As of December 31, 2020 and 2019, there were no amounts recorded for uncertain tax positions. As of December 31, 2020, undistributed earnings of the Company’s newly incorporated foreign subsidiaries are immaterial. Under the Global Intangible Low- Taxed Income (“GILTI”) provisions of the 2017 Tax Cuts and Jobs Act, U.S. income taxes have been incurred on the undistributed earnings of the foreign subsidiaries and therefore, the tax impact upon distribution is limited to state income and withholding taxes and is not material. 106                                                                                               13. Net Loss Per Share Basic and diluted net loss per share is computed by dividing net loss by the weighted-average number of common stock and pre-funded warrants outstanding during the period. The pre-funded warrants are included in the computation of basic net loss per share as the exercise price is negligible and they are fully vested and exercisable. For periods in which the Company generated a net loss, the Company does not include the potential impact of dilutive securities in diluted net loss per share, as the impact of these items is anti-dilutive. The following weighted-average equity instruments were excluded from the calculation of diluted net loss per share because their effect would have been anti-dilutive for the periods presented: Options to purchase common stock Unvested restricted stock units 14. Research and License Agreements License Agreements 2020 Year Ended December 31, 2019 5,049,435    105,995    3,874,817    —    2018 3,014,984  —   In December 2013, two of the Company’s wholly owned subsidiaries AECase, Inc. and AEMase, Inc. each entered into an exclusive, worldwide license agreement, including the right to grant sublicenses, with the University of Texas at Austin (the “University”) for certain intellectual property owned by the University related to cystinase and methioninase. In January 2017, the Company and the University entered into an Amended and Restated Patent License Agreement (the “Restated License”), which consolidated the two license agreements, revised certain obligations, and licensed additional patent applications and invention disclosures to us. The Restated License was amended in August 2017, December 2017, and December 2018 to revise diligence milestones and license additional patent applications, including our program candidates under the AGLE177 and Cystinuria Programs. Pursuant to the terms of the Restated License, the Company may be required to pay the University up to $6.4 million in milestone payments based on the achievement of certain development milestones, including clinical trials and regulatory approvals, the majority of which are due upon the achievement of later development milestones, including a $5.0 million payment due on regulatory approval of a product and a $0.5 million payment payable on final regulatory approval of a product for a second indication. In addition, the Company is required to pay the University a low single-digit royalty on worldwide-net sales of products covered under the Restated License, together with a revenue share on non-royalty consideration received from sublicensees. The rate of the revenue share ranges from 6.5% to 25% depending on the date the sublicense agreement is signed. For the years ended December 31, 2020, 2019 and 2018, the Company paid $0.1 million in license fees annually. 15. Selected Quarterly Financial Data (Unaudited) Selected quarterly results from operations for the years ended December 31, 2020 and 2019 are as follows (in thousands, except per share amounts): Loss from operations Net loss Basic and diluted net loss per common share Loss from operations Net loss Basic and diluted net loss per common share 2020 Quarter Ended March 31, June 30, September 30, December 31, (19,022)   $ (18,728)   (0.57)   $ (21,560)   $ (21,418)   (0.40)   $ (18,123)   $ (18,033)   (0.29)   $ (22,776) (22,714) (0.35) 2019 Quarter Ended March 31, June 30, September 30, December 31, (17,657)   $ (17,167)   (0.59)   $ (18,622)   $ (18,019)   (0.55)   $ (22,146)   $ (21,573)   (0.66)   $ (21,909) (21,495) (0.65)   $   $   $   $ 107                                                             16. Subsequent Events On December 9, 2020 certain pre-funded warrant holders notified the Company that pursuant to the terms of its warrant to purchase common stock they would like to raise the amount of the Maximum Ownership Percentage to 9.9% from its current level of 4.99%. This change became effective on February 8, 2021. 108     ITEM 9. CHANGES IN AND DISAGREEMENTS WITH ACCOUNTANTS ON ACCOUNTING AND FINANCIAL DISCLOSURE None. ITEM 9A. CONTROLS AND PROCEDURES Evaluation of Disclosure Controls and Procedures Our management, with the participation of our principal executive officer and our principal financial officer, evaluated, as of the end of the period covered by this Annual Report on Form 10-K, the effectiveness of our disclosure controls and procedures. Based on that evaluation of our disclosure controls and procedures as of December 31, 2020, our principal executive officer and principal financial officer concluded that our disclosure controls and procedures as of such date are effective at the reasonable assurance level. The term “disclosure controls and procedures,” as defined in Rules 13a-15(e) and 15d-15(e) under the Securities Exchange Act of 1934, as amended, or the Exchange Act, means controls and other procedures of a company that are designed to ensure that information required to be disclosed by a company in the reports that it files or submits under the Exchange Act are recorded, processed, summarized and reported within the time periods specified in the SEC’s rules and forms. Disclosure controls and procedures include, without limitation, controls and procedures designed to ensure that information required to be disclosed by us in the reports we file or submit under the Exchange Act is accumulated and communicated to our management, including our principal executive officer and principal financial officer, as appropriate to allow timely decisions regarding required disclosure. Management recognizes that any controls and procedures, no matter how well designed and operated, can provide only reasonable assurance of achieving their objectives and our management necessarily applies its judgment in evaluating the cost-benefit relationship of possible controls and procedures. Management’s Annual Report on Internal Control Over Financial Reporting Our management is responsible for establishing and maintaining adequate internal control over financial reporting. Internal control over financial reporting is defined in Rules 13a-15(f) and 15d-15(f) promulgated under the Exchange Act as a process designed by, or under the supervision of, our principal executive and principal financial officers and effected by our board of directors, management and other personnel to provide reasonable assurance regarding the reliability of financial reporting and the preparation of financial statements for external purposes in accordance with U.S. GAAP. Our internal control over financial reporting includes those policies and procedures that: • • • pertain to the maintenance of records that, in reasonable detail, accurately and fairly reflect our transactions and dispositions of our assets; provide reasonable assurance that transactions are recorded as necessary to permit preparation of financial statements in accordance with U.S. GAAP, and that our receipts and expenditures are being made only in accordance with authorizations of our management and directors; and provide reasonable assurance regarding prevention or timely detection of unauthorized acquisition, use or disposition of our assets that could have a material effect on our financial statements. Because of its inherent limitations, internal control over financial reporting may not prevent or detect misstatements. Therefore, even those systems determined to be effective can provide only reasonable assurance with respect to financial statement preparation and presentation. Projections of any evaluation of effectiveness to future periods are subject to the risk that controls may become inadequate because of changes in conditions, or that the degree of compliance with the policies or procedures may deteriorate. Our management, with the participation of our principal executive officer and principal financial officer, assessed the effectiveness of our internal control over financial reporting as of December 31, 2020. In making this assessment, management used the criteria set forth by the Committee of Sponsoring Organizations of the Treadway Commission (COSO) in its 2013 Internal Control – Integrated Framework. Based on our assessment, our management has concluded that, as of December 31, 2020, our internal control over financial reporting is effective based on those criteria. 109           This Annual Report on Form 10-K does not include an attestation report of our registered public accounting firm regarding internal control over financial reporting. For as long as we remain an “emerging growth company” as defined in Section 2(a) of the Securities Act of 1933, or the Securities Act, as modified by the Jumpstart Our Business Startups Act of 2012, we intend to take advantage of the exemption permitting us not to comply with the requirement that our independent registered public accounting firm provide an attestation on the effectiveness of our internal control over financial reporting. Changes in Internal Control over Financial Reporting There were no changes in our internal control over financial reporting that occurred during the quarter ended December 31, 2020 that have materially affected, or are reasonably likely to materially affect, our internal control over financial reporting. ITEM 9B. OTHER INFORMATION Entry into Registration Rights Agreement On March 16, 2021, we entered into a registration rights agreement, or the Registration Rights Agreement, with Baker Brothers Life Sciences, L.P. and 667, L.P., or the Baker Funds, pursuant to which the Baker Funds are entitled to certain resale registration rights with respect to shares of our common stock held by the Baker Funds, or Registrable Securities. Under the Registration Rights Agreement, following a request by the Baker Funds, we are obligated to file a resale registration statement on Form S-3, or other appropriate form, covering Registrable Securities. Under the Registration Rights Agreement, the Baker Funds also have the right to up to two underwritten public offerings or block trades per calendar year, but no more than three underwritten public offerings and eight block trades in total, to effect the sale or distribution of their Registrable Securities, subject to specified exceptions, conditions and limitations. The Registration Rights Agreement also includes customary indemnification obligations in connection with registrations conducted pursuant to the Registration Rights Agreement. The rights of the Baker Funds under the Registration Rights Agreement terminate automatically upon the earlier to occur of the following events: (i) all Registrable Securities covered by the Registration Rights Agreement have been sold pursuant to an effective registration statement; (ii) all Registrable Securities covered by the Registration Rights Agreement have been sold pursuant to Rule 144, or other similar rule; (iii) at any time after the Baker Funds are no longer our affiliate, all Registrable Securities covered by the Registration Rights Agreement may be resold by the Baker Funds without limitations as to volume or manner of sale pursuant to Rule 144; or (iv) ten (10) years after the date of the Registration Rights Agreement. The foregoing is only a brief description of the terms of the Registration Rights Agreement and the transactions contemplated thereby and is qualified in its entirety by reference to the Agreement that is filed as Exhibit 4.5 hereto. Appointment of Principal Financial Officer As previously disclosed, Charles N. York resigned from his position as Chief Financial Officer and principal financial officer as of February 12, 2021. On March 16, 2021, the Board of Directors appointed Anthony Quinn, age 59, our current Chief Executive Officer as our principal financial officer, effective immediately. Dr. Quinn has served as a director since March 2016 and has served as our President and Chief Executive Officer since July 2018. Dr. Quinn previously served as our interim Chief Medical Officer between April 2017 and July 2017 and served as our interim Chief Executive Officer between July 2017 and July 2018. Since October 2015, Dr. Quinn has worked as a private consultant for IDBioPharm Consulting LLC. Dr. Quinn received a B.MSc in General Pathology and a M.B Ch.B in Medicine from the University of Dundee. Dr. Quinn later earned a Ph.D. in Cancer Research from the University of Newcastle upon Tyne. 110 ITEM 10. DIRECTORS, EXECUTIVE OFFICERS AND CORPORATE GOVERNANCE PART III The information required by this item is incorporated herein by reference to our Proxy Statement with respect to our 2021 Annual Meeting of Stockholders to be filed with the SEC within 120 days of the end of the fiscal year covered by this Annual Report on Form 10-K. ITEM 11. EXECUTIVE COMPENSATION The information required by this item is incorporated herein by reference to our Proxy Statement with respect to our 2021 Annual Meeting of Stockholders to be filed with the SEC within 120 days of the end of the fiscal year covered by this Annual Report on Form 10-K. ITEM 12. SECURITY OWNERSHIP OF CERTAIN BENEFICIAL OWNERS AND MANAGEMENT AND RELATED STOCKHOLDER MATTERS The information required by this item is incorporated herein by reference to our Proxy Statement with respect to our 2021 Annual Meeting of Stockholders to be filed with the SEC within 120 days of the end of the fiscal year covered by this Annual Report on Form 10-K. ITEM 13. CERTAIN RELATIONSHIPS AND RELATED TRANSACTIONS, AND DIRECTOR INDEPENDENCE The information required by this item is incorporated herein by reference to our Proxy Statement with respect to our 2021 Annual Meeting of Stockholders to be filed with the SEC within 120 days of the end of the fiscal year covered by this Annual Report on Form 10-K. ITEM 14. PRINCIPAL ACCOUNTANT FEES AND SERVICES The information required by this item is incorporated herein by reference to our Proxy Statement with respect to our 2021 Annual Meeting of Stockholders to be filed with the SEC within 120 days of the end of the fiscal year covered by this Annual Report on Form 10-K. 111 PART IV ITEM 15. EXHIBITS AND FINANCIAL STATEMENT SCHEDULES The following documents are filed as part of this report: 1. Financial Statements See Index to Financial Statements at Item 8 herein. 2. Financial Statement Schedules All schedules are omitted because they are not applicable or the required information is shown in the financial statements or notes thereto. 3. Exhibits Exhibit Number Description of Document Incorporate by Reference Form File No. Date of Filing Exhibit No. Filed Herewith   3.1   3.2   4.1   4.2   4.3   4.4   4.5 10.1 10.2‡ 10.3‡ 10.4‡ 10.5‡ 10.6‡ 10.7‡ 10.8†   Restated Certificate of Incorporation   Amended and Restated Bylaws   Form of Common Stock Certificate.   Form of Pre-Funded Warrants 2019   Description of the Registrant's securities   Form of Pre-Funded Warrants 2020 S-1/A   333-205001 9/14/2015 8-K 001-37722 4/3/2020 S-1/A   333-205001 9/14/2015 8-K 001-37722 2/7/2019 3.2 3.1 4.1 4.1 8-K 001-37722 4/28/2020 4.1   Registration Rights Agreement, dated March 16, 2021, by and among the Registrant and Baker Brothers Life Sciences, L.P. and 667, L.P.   Form of Amended and Restated Indemnification Agreement. 10-Q   001-37722 8/9/2018   2015 Equity Incentive Plan and forms of award agreements. S-1 333-205001 6/16/2015   2016 Equity Incentive Plan and forms of award agreements, as amended. 10-Q   001-37722 11/8/2018   2016 Employee Stock Purchase Plan and forms of award agreements, as amended. 10-K   001-37722 3/7/2019   2018 Equity Inducement Plan   Form of Stock Restriction Agreement.   Form of Severance Agreement S-8 S-1 8-K 333-223614 3/13/2018 333-205001 6/16/2015 001-37722 4/16/2018 10.1 10.2 10.2 10.4 99.2 10.5 10.1 Sponsored Research Agreement No. UTA13-001113, dated December 24, 2013, between The University of Texas at Austin (“UT-Austin”) and Aeglea BioTherapeutics, Inc., Aeglea Development Company, Inc., AERase, Inc., AEMase, Inc., AECase, Inc., AE4ase, Inc., AE5ase, Inc. and AE6ase., Inc., as amended. 112 10-Q   001-37722 11/7/2017 10.3 X X                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       Exhibit Number Description of Document Office Lease, dated November 24, 2014, between Barton Oaks Office Center, LLC and the Registrant. First Amendment to Office Lease and Assignment and Assumption of Lease dated September 20, 2016 to Office Lease dated November 24, 2014, between Barton Oaks Office Center, LLC, Aeglea Development Company, Inc., and Aeglea BioTherapeutics, Inc. Amended and Restated Patent License Agreement No. PM1401501, dated January 31, 2017, between the Registrant and The University of Texas at Austin on behalf of the Board of Regents of the University of Texas system Incorporate by Reference File No. Date of Filing Exhibit No. Filed Herewith 333-205001 6/16/2015 10.11   Form S-1 10-Q   001-37722 11/9/2016 10.1 10-K   001-37722 3/7/2019 10.12   Cancer Research Grant Contract, dated June 15, 2015, between AERase, Inc. and the Cancer Prevention Research Institute of Texas. S-1 333-205001 6/16/2015 10.15     Offer Letter, dated June 16, 2014, issued by the Registrant to Mr. Charles N. York II. 10-K   001-37722 3/23/2017 10.19     Offer Letter, dated July 18, 2018, by and between the Registrant and Anthony G. Quinn   8-K 001-37722 7/23/2018 Severance Agreement, dated July 18, 2018, by and between the Registrant and Anthony G. Quinn 8-K 001-37722 7/23/2018 10.1 10.2 Master Services Agreement, dated November 26, 2018, between the Registrant, Fujifilm Diosynth Biotechnologies UK Limited, Fujifilm Diosynth Biotechnologies Texas, LLC, and Fujifilm Diosynth Biotechnologies U.S.A, Inc. 10-K   001-37722 3/7/2019 10.18   Lease Agreement dated April 30, 2019, between Las Cimas Owner LP and the Registrant 10-Q   001-37722 5/7/2019 10.18‡   Offer letter, dated March 13, 2020 issued by the Registrant to Dr. Leslie Sloan 10-Q   001-37722 5/7/2020 10.1 10.1 10.2 Severance Agreement dated August 7, 2019 by and between the Registrant and Dr. Leslie Sloan 10-Q   001-37722 5/7/2020 Capital on DemandTM Sales Agreement, dated April 16, 2020, by and between Aeglea BioTherapeutics, Inc. and JonesTrading Institutional Services LLC 8-K 001-37722 4/16/2020 1.1   Subsidiaries of the Registrant.   Consent of independent registered public accounting firm.   Power of Attorney. Reference is made to the signature page hereto. 113 X X X 10.9 10.10 10.11† 10.12† 10.13‡ 10.14‡ 10.15‡ 10.16† 10.17 10.19‡ 10.20 21.1 23.1 24.1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     Exhibit Number Description of Document 31.1 32.1(1) 101.INS Certification of the Principal Executive Officer and Prinicipal Financial Officer pursuant to Rule 13a-14(a) or 15d-14(a) of the Securities Exchange Act of 1934. Certification of the Principal Executive Officer and Principal Financial Officer pursuant to 18 U.S.C. Section 1350, as adopted pursuant to Section 906 of the Sarbanes-Oxley Act of 2002. Inline XBRL Instance Document - the instance document does not appear in the Interactive Data File because its XBRL tags are embedded within the Inline XBRL document. 101.SCH Inline XBRL Taxonomy Extension Schema Document. 101.CAL Inline XBRL Taxonomy Extension Calculation Linkbase Document. 101.DEF Inline XBRL Taxonomy Extension Definition Linkbase Document. 101.LAB Inline XBRL Taxonomy Extension Labels Linkbase Document. 101.PRE Inline XBRL Taxonomy Extension Presentation Linkbase Document Incorporate by Reference Form File No. Date of Filing Exhibit No. Filed Herewith X X X X X X X X 104 † ‡ (1) The cover page of this Annual Report on Form 10-K for the year ended December 31, 2020, formatted in Inline XBRL and contained in Exhibit 101 Confidential treatment has been granted for portions of this exhibit pursuant to Rule 406 of the Securities Act, or Rule 24b-2 of the Exchange Act. The Registrant has omitted and filed separately with the SEC the confidential portions of this exhibit. Indicates management contract or compensatory plan. The certifications on Exhibit 32 hereto are deemed not “filed” for purposes of Section 18 of the Exchange Act or otherwise subject to the liability of that Section.  Such certifications will not be deemed incorporated by reference into any filing under the Securities Act or the Exchange Act. ITEM 16. FORM 10-K SUMMARY None. 114                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   Pursuant to the requirements of Section 13 or 15(d) of the Securities Exchange Act of 1934, the registrant has duly caused this report to be signed on its behalf by the SIGNATURES undersigned, thereunto duly authorized. Date: March 18, 2021 AEGLEA BIOTHERAPEUTICS, INC. By:   /s/ Anthony G. Quinn, M.B Ch.B, Ph.D.   Anthony G. Quinn, M.B Ch.B, Ph.D.   President, Chief Executive Officer and Director   (Principal Executive Officer and Principal Financial Officer) POWER OF ATTORNEY KNOW ALL PERSONS BY THESE PRESENTS, that each person whose signature appears below constitutes and appoints Anthony G. Quinn, M.B. Ch.B, Ph.D., jointly and severally, his or her attorneys-in-fact, each with the power of substitution, for him or her in any and all capacities, to sign any amendments to this Report on Form 10-K and to file same, with exhibits thereto and other documents in connection therewith, with the Securities and Exchange Commission, hereby ratifying and confirming all that each of said attorneys-in-fact, or his substitutes, may do or cause to be done by virtue hereof. Pursuant to the requirements of the Securities Exchange Act of 1934, this Report has been signed below by the following persons on behalf of the Registrant and in the capacities and on the dates indicated. Signature Title /s/ Anthony G. Quinn, M.B Ch.B, Ph.D. Anthony G. Quinn, M.B. Ch.B, Ph.D. President, Chief Executive Officer and Director (Principal Executive Officer and Principal Financial Officer) /s/ Steven Weber Steven Weber /s/ Russell J. Cox Russell J. Cox /s/ Sandesh Mahatme, LLM Sandesh Mahatme, LLM /s/ Armen Shanafelt, Ph.D. Armen Shanafelt, Ph.D. /s/ Ivana Magovcevic-Liebisch, Ph.D. Ivana Magovcevic-Liebisch, Ph.D. /s/ Bryan Lawlis, Ph.D. Bryan Lawlis, Ph.D. /s/ Alison Lawton Alison Lawton /s/ Sara Brownstein Sara Brownstein Vice President and Corporate Controller (Principal Accounting Officer) Director Director Director Director Director Director Director 115 Date March 18, 2021 March 18, 2021 March 18, 2021 March 18, 2021 March 18, 2021 March 18, 2021 March 18, 2021 March 18, 2021 March 18, 2021                                                                                                                                                                                                                               DESCRIPTION OF CAPITAL STOCK EXHIBIT 4.3 General Our authorized capital stock consists of 500,000,000 shares of common stock, $0.0001 par value per share, and 10,000,000 shares of undesignated preferred stock, $0.0001 par value per share. The following description summarizes the most important terms of our capital stock. Because it is only a summary, it does not contain all the information that may be important to you. For a complete description, you should refer to our restated certificate of incorporation and amended and restated bylaws, which are included as exhibits to our most recent Annual Report on Form 10-K, and to the applicable provisions of Delaware law. Common Stock Dividend rights Subject to preferences that may apply to any shares of preferred stock outstanding at the time, the holders of our common stock are entitled to receive dividends out of funds legally available if our board of directors, in its discretion, determines to issue dividends and then only at the times and in the amounts that our board of directors may determine. Voting rights Holders of our common stock are entitled to one vote for each share held on all matters submitted to a vote of stockholders. We have not provided for cumulative voting for the election of directors in our restated certificate  of incorporation. Accordingly, pursuant to our restated certificate of incorporation holders  of a majority of the shares of our common stock are able to elect all of our directors. Our restated certificate of incorporation establishes a classified board of directors, divided into three classes with staggered three-year terms. Only one class of directors will be elected at each annual meeting of our stockholders, with the other classes continuing for the remainder of their respective three-year terms. No preemptive or similar rights Our common stock is not entitled to preemptive rights, and is not subject to conversion, redemption or sinking fund provisions. Right to receive liquidation distributions Upon our liquidation, dissolution or winding-up, the assets legally available for distribution to our stockholders would be distributable ratably among the holders of our common stock and any participating preferred stock outstanding at that time, subject to prior satisfaction of all outstanding debt and liabilities and the preferential rights of and the payment of liquidation preferences, if any, on any outstanding shares of preferred stock. Preferred Stock Our board of directors is authorized, subject to limitations prescribed by Delaware law, to issue preferred stock in one or more series, to establish from time to time the  number  of  shares  to  be  included  in  each  series  and  to  fix  the  designation,  powers,  preferences  and  rights  of  the  shares  of  each  series  and  any  of  their  qualifications, limitations or restrictions, in each case without further vote or action by our stockholders. Our board of directors  can also increase or decrease the number of shares of any series of   preferred stock, but not below the number of shares of that series then outstanding, without any further vote or action by our stockholders. Our board of directors may authorize the issuance of preferred stock with voting or conversion rights that could adversely affect the voting power or other rights of the holders of our common stock. The issuance of preferred  stock,  while  providing  flexibility  in  connection  with  possible  acquisitions  and  other  corporate  purposes,  could,  among  other  things,  have  the  effect  of  delaying, deferring or preventing a change in control of our company and might adversely affect the market price of our common stock and the voting and other rights of the holders of our common stock. We have no current plan to issue any shares of preferred stock.  Registration Rights Pursuant to the terms of our registration rights agreement, entered into on March 16, 2021, with  Baker Brothers Life Sciences, L.P. and 667, L.P. (the “Baker Funds”), the Baker Funds are entitled to certain resale registration rights with respects to shares of our common stock held by the Baker Funds (the “Registrable Securities”). Under the terms of our registration rights agreement, following a request by the Baker Funds, we will be obligated to file a resale registration statement on Form S- 3, or other appropriate form, covering Registrable Securities. Under our registration rights agreement, the Baker Funds also have the right to up to two underwritten public offerings  or  block  trades  per  calendar  year,  but  no  more  than  three  underwritten  public  offerings  and  eight  block  trades  in  total,  to  effect  the  sale  or  distribution  of  their Registrable Securities, subject to specified exceptions, conditions and limitations. Our registration rights agreement also includes customary indemnification obligations in connection with registrations conducted pursuant to our registration rights agreement. The rights of the Baker Funds under our registration rights agreement terminate automatically upon the earlier to occur of the following events: (i) all Registrable Securities covered by our registration rights agreement have been sold pursuant to an effective registration statement; (ii) all Registrable Securities covered by our registration rights agreement have been sold pursuant to Rule 144, or other similar rule; (iii) at any time after the Baker Funds are no longer our affiliate, all Registrable Securities covered by our registration rights agreement may be resold by the Baker Funds without limitations as to volume or manner of sale pursuant to Rule 144; or (iv) ten (10) years after the date of our registration rights agreement.  Anti-Takeover Provisions The  provisions  of  Delaware  law,  our  restated  certificate  of  incorporation  and  our  amended  and  restated  bylaws  could  have  the  effect  of  delaying,  deferring  or discouraging another person from acquiring control of our company. These provisions, which are summarized below, may have the effect of discouraging takeover bids. They are also designed, in part, to encourage persons seeking to acquire control of us to negotiate first with our board of directors. We believe that the benefits of increased protection of our potential ability to negotiate with an unfriendly or unsolicited acquirer outweigh the disadvantages of discouraging a proposal to acquire us because negotiation of these proposals could result in an improvement of their terms. Delaware law We  are  subject  to  the  provisions  of  Section  203  of  the  Delaware  General  Corporation  Law  regulating  corporate  takeovers.  In  general,  Section  203  prohibits  a publicly-held Delaware corporation from engaging in a business combination with an interested stockholder for a period of three years following the date on which the person became an interested stockholder unless: 2         • • • Prior to the date of the transaction, the board of directors of the corporation approved either the business combination or the transaction which resulted in the stockholder becoming an interested stockholder; The interested stockholder owned at least 85% of the voting stock of the corporation outstanding at the time the transaction commenced, excluding for purposes of  determining  the  voting  stock  outstanding,  but  not  the  outstanding  voting  stock  owned  by  the  interested  stockholder,  (1)  shares  owned  by  persons  who  are directors  and  also  officers  and  (2)  shares  owned  by  employee  stock  plans  in  which  employee  participants  do  not  have  the  right  to  determine  confidentially whether shares held subject to the plan will be tendered in a tender or exchange offer; or At or subsequent to the date of the transaction, the business combination is approved by the board of directors of the corporation and authorized at an annual or special meeting of stockholders, and not by written consent, by the affirmative vote of at least 66.67% of the outstanding voting stock that is not owned by the interested stockholder. Restated Certificate of Incorporation and Amended and Restated Bylaw Provisions Our restated certificate of incorporation and our amended and restated bylaws include a number of provisions that could deter hostile takeovers or delay or prevent changes in control of our company, including the following: • • • • Board  of  Directors  vacancies.  Our  restated  certificate  of  incorporation  and  amended  and  restated  bylaws  authorize  our  board  of  directors  to  fill  vacant directorships, including newly created seats unless the board of directors determines that any such vacancies shall be filled by the stockholders. In addition, the number of directors constituting our board of directors is permitted to be set only by a resolution adopted by a majority vote of our entire board of directors. These provisions  prevent  a  stockholder  from  increasing  the  size  of  our  board  of  directors  and  then  gaining  control  of  our  board  of  directors  by  filling  the  resulting vacancies with its own nominees. This makes it more difficult to change the composition of our board of directors but promotes continuity of management. Classified board. Our restated certificate of incorporation and amended and restated bylaws provide that our board is classified into three classes of directors, each with staggered three-year terms. A third party may be discouraged from making a tender offer or otherwise attempting to obtain control of us as it is more difficult and time consuming for stockholders to replace a majority of the directors on a classified board of directors. Stockholder  action;  special  meetings  of  stockholders.  Our  restated  certificate  of  incorporation  provides  that  our  stockholders  may  not  take  action  by  written consent, but may only take action at annual or special meetings of our stockholders. As a result, a holder controlling a majority of our capital stock would not be able to amend our amended and restated bylaws or remove directors without holding a meeting of our stockholders called in accordance with our amended and restated bylaws. Further, our amended and restated bylaws provide that special meetings of our stockholders may be called only by a majority of our board of directors, the chairperson of our board of directors, our Chief Executive Officer or our President, thus prohibiting a stockholder from calling a special meeting. These provisions might delay the ability of our stockholders to force consideration of a proposal or for stockholders controlling a majority of our capital stock to take any action, including the removal of directors. Advance  notice  requirements  for  stockholder  proposals  and  director  nominations.  Our  amended  and  restated  bylaws  provide  advance  notice  procedures  for stockholders  seeking  to  bring  business  before  our  annual  meeting  of  stockholders  or  to  nominate  candidates  for  election  as  directors  at  our  annual  meeting  of stockholders. Our amended and restated bylaws also specify certain requirements regarding the form and content of a stockholder’s notice. These provisions might preclude our 3                   • • • • • stockholders from bringing matters before our annual meeting of stockholders or from making nominations for directors at our annual meeting of stockholders if the  proper  procedures  are  not  followed.  We  expect  that  these  provisions  might  also  discourage  or  deter  a  potential  acquirer  from  conducting  a  solicitation  of proxies to elect the acquirer’s own slate of directors or otherwise attempting to obtain control of our company. No cumulative voting. The Delaware General Corporation Law provides that stockholders are not entitled to the right to cumulate votes in the election of directors unless a corporation’s certificate of incorporation provides otherwise. Our restated certificate of incorporation and amended and restated bylaws do not provide for cumulative voting. Directors removed only for cause. Our restated certificate of incorporation provides that stockholders may remove directors only for cause. Amendment of charter provisions. Any amendment of the above provisions in our restated certificate of incorporation requires approval by holders of at least two- thirds of our outstanding common stock, provided that if two-thirds of our board of directors approves such an amendment, then only the approval of a majority of holders is required. Issuance of undesignated preferred stock. Our board of directors has the authority, without further action by the stockholders, to issue up to 10,000,000 shares of undesignated  preferred  stock  with  rights  and  preferences,  including  voting  rights,  designated  from  time  to  time  by  our  board  of  directors.  The  existence  of authorized but unissued shares of preferred stock enables our board of directors to render more difficult or to discourage an attempt to obtain control of us by merger, tender offer, proxy contest or other means. Choice of forum. Our restated certificate of incorporation provides that the Court of Chancery of the State of Delaware is the exclusive forum for any derivative action or proceeding brought on our behalf; any action asserting a breach of fiduciary duty; any action asserting a claim against us arising pursuant to the Delaware General Corporation Law, our restated certificate of incorporation or our amended and restated bylaws; or any action asserting a claim against us that is governed by the internal affairs doctrine. Our amended and restated bylaws also provide that the federal district courts of the United States of America will, to the fullest extent permitted by law, be the exclusive forum for resolving any complaint asserting a cause of action arising under the Securities Act. Transfer Agent and Registrar The transfer agent and registrar for our common stock is American Stock Transfer and Trust Company, LLC. The transfer agent’s address is 6201 15th Avenue, Brooklyn, New York 11219, and its telephone number is (800) 937-5449. Exchange Listing Our common stock is listed on The Nasdaq Global Market under the symbol “AGLE.” 4                         REGISTRATION RIGHTS AGREEMENT Exhibit 4.5 This Registration Rights Agreement (this “Agreement”) is made as of March 16, 2021 by and between Aeglea BioTherapeutics, Inc., a Delaware corporation (the “Company”), and the persons listed on the attached Schedule A who are signatories to this Agreement (collectively, the “Investors”).  Unless otherwise defined herein, capitalized terms used in this Agreement have the respective meanings ascribed to them in Section 1. RECITALS WHEREAS, the Company and the Investors wish to provide for certain arrangements with respect to the registration of the Registrable Securities (as defined below) by the Company under the Securities Act (as defined below). NOW, THEREFORE, in consideration of the mutual promises and covenants set forth herein, and other consideration, the receipt and adequacy of which are hereby acknowledged, the parties hereto agree as follows: Section 1. Definitions 1.1. meanings set forth below: Certain Definitions.  In addition to the terms defined elsewhere in this Agreement, as used in this Agreement, the following terms have the respective (a) limited in scope of selling efforts as compared to an Underwritten Offering. “Block Trade” shall mean an offering of Registrable Securities which requires both the Investors and the Company to enter into a sale agreement and is (b) (c) (d)  “Board” shall mean the Board of Directors of the Company. “Commission” shall mean the Securities and Exchange Commission or any other federal agency at the time administering the Securities Act. “Common Stock” shall mean the common stock of the Company, par value $0.0001 per share. (e) thereunder, all as the same shall be in effect from time to time. “Exchange Act” shall mean the Securities Exchange Act of 1934, as amended, or any similar successor federal statute and the rules and regulations (f)  “Governmental Entity” shall mean any federal, state, local or foreign government, or any department, agency, or instrumentality of any government; any public international organization, any transnational governmental organization; any court of competent jurisdiction, arbitral, administrative agency, commission, or other governmental regulatory authority or quasi-governmental authority, any political party; and any national securities exchange or national quotation system. FW/11855139.3 (g) “Other Securities” shall mean securities of the Company, other than Registrable Securities (as defined below).   (h) organization, entity or division, or any government, governmental department or agency or political subdivision thereof.  “Person” shall mean any individual, partnership, corporation, company, association, trust, joint venture, limited liability company, unincorporated “Registrable Securities” shall mean the shares of Common Stock and any Common Stock issued or issuable upon the exercise or conversion of any other (i) securities (whether equity, debt or otherwise) of the Company now owned or hereafter acquired by any of the Investors. Registrable Securities shall cease to be Registrable Securities upon the earliest to occur of the following events: (i) such Registrable Securities have been sold pursuant to an effective Registration Statement; (ii) such Registrable Securities have been sold by the Investors pursuant to Rule 144 (or other similar rule), (iii) such Registrable Securities may be resold by the Investor holding such Registrable Securities without limitations as to volume or manner of sale pursuant to Rule 144; or (iv) ten (10) years after the date of this Agreement.  For purposes of this definition, in order to determine whether an Investor is an “affiliate” (as such term is defined and used in Rule 144, and including for determining whether volume or manner of sale limitations of Rule 144 apply) the parties will assume that all convertible securities (whether equity, debt or otherwise) have been converted into Common Stock without regard to any limitations or conversion applicable thereto. (j) with the Securities Act, and such Registration Statement becoming effective under the Securities Act. The terms “register,” “registered” and “registration” shall refer to a registration effected by preparing and filing a Registration Statement in compliance “Registration Expenses” shall mean all expenses incurred by the Company in effecting any registration pursuant to this Agreement, including, without (k) limitation, all registration, qualification, and filing fees, printing expenses, escrow fees, fees and disbursements of counsel for the Company, blue sky fees and expenses, and expenses of any regular or special audits incident to or required by any such registration, but shall not include Selling Expenses. “Registration Statement” means any registration statement of the Company filed with, or to be filed with, the Commission under the Securities Act, (l) including the related prospectus, amendments and supplements to such registration statement, including pre- and post-effective amendments, and all exhibits and all material incorporated by reference in such registration statement as may be necessary to comply with applicable securities laws other than a registration statement (and related prospectus) filed on Form S-4 or Form S-8 or any successor forms thereto. (m) similar successor rule that may be promulgated by the Commission. “Rule 144” shall mean Rule 144 as promulgated by the Commission under the Securities Act, as such rule may be amended from time to time, or any (n) the same shall be in effect from time to time. “Securities Act” shall mean the Securities Act of 1933, as amended, or any similar successor federal statute and the rules and regulations thereunder, all as 2     “Selling Expenses” shall mean all underwriting discounts and selling commissions applicable to the sale of Registrable Securities, the fees and expenses of (o) any legal counsel and any other advisors any of the Investors engage and all similar fees and commissions relating to the Investors’ disposition of the Registrable Securities. “Underwritten Offering” shall mean a public offering of Registrable Securities pursuant to an effective registration statement under the Securities Act (p) (other than pursuant to a registration statement on Form S-4 or S-8 or any similar or successor form) which requires the Investors and the Company to enter into an underwriting agreement.   Section 2. Resale Registration Rights 2.1. Resale Registration Rights. Following demand by any Investor the Company shall file with the Commission a Registration Statement on Form S-3 (except if the Company is not then (a) eligible to register for resale the Registrable Securities on Form S-3, in which case such registration shall be on another appropriate form in accordance with the Securities Act) covering the resale of the Registrable Securities by the Investors (the “Resale Registration Shelf”), and the Company shall file such Resale Registration Shelf as promptly as reasonably practicable following such demand, and in any event within sixty (60) days of such demand.  Such Resale Registration Shelf shall include a “final” prospectus, including the information required by Item 507 of Regulation S-K of the Securities Act, as provided by the Investors in accordance with Section 2.7.  Notwithstanding the foregoing, before filing the Resale Registration Shelf, the Company shall furnish to the Investors a copy of the Resale Registration Shelf and afford the Investors an opportunity to review and comment on the Resale Registration Shelf.  The Company’s obligation pursuant to this Section 2.1(a) is conditioned upon the Investors providing the information contemplated in Section 2.7.   The Company shall use its reasonable best efforts to cause the Resale Registration Shelf and related prospectuses to become effective as promptly as (b) practicable after filing.  The Company shall use its reasonable best efforts to cause such Registration Statement to remain effective under the Securities Act until the earlier of the date (i) all Registrable Securities covered by the Resale Registration Shelf have been sold or may be sold freely without limitations or restrictions as to volume or manner of sale pursuant to Rule 144 or (ii) all Registrable Securities covered by the Resale Registration Shelf otherwise cease to be Registrable Securities pursuant to the definition of Registrable Securities.  The Company shall promptly, and within two (2) business days after the Company confirms effectiveness of the Resale Registration Shelf with the Commission, notify the Investors of the effectiveness of the Resale Registration Shelf. (c) pursuant to Section 2.1(a): Notwithstanding anything contained herein to the contrary, the Company shall not be obligated to effect, or to take any action to effect, a registration 3       (i) selling stockholders (a “Company Registration Shelf”); if the Company has and maintains an effective Registration Statement on Form S-3ASR that provides for the resale of an unlimited number of securities by (ii) (iii) during the period forty-five (45) days prior to the Company’s good faith estimate of the date of filing of a Company Registration Shelf; or if the Company has caused a Registration Statement to become effective pursuant to this Section 2.1 during the prior twelve (12) month period. If the Company has a Company Registration Shelf in place at any time in which the Investors make a demand pursuant to Section 2.1(a), the Company (d) shall file with the Commission, as promptly as practicable, and in any event within fifteen (15) business days after such demand, a “final” prospectus supplement to its Company Registration Shelf covering the resale of the Registrable Securities by the Investors (the “Prospectus”); provided, however, that the Company shall not be obligated to file more than one Prospectus pursuant to this Section 2.1(d) in any six month period to add additional Registrable Securities to the Company Registration Shelf that were acquired by the Investors other than directly from the Company or in an underwritten public offering by the Company.  The Prospectus shall include the information required under Item 507 of Regulation S-K of the Securities Act, which information shall be provided by the Investors in accordance with Section 2.7.  Notwithstanding the foregoing, before filing the Prospectus, the Company shall furnish to the Investors a copy of the Prospectus and afford the Investors an opportunity to review and comment on the Prospectus. Deferral and Suspension.  At any time after being obligated pursuant to this Agreement to file a Resale Registration Shelf or Prospectus, or after any (e) Resale Registration Shelf has become effective or a Prospectus is filed with the Commission, the Company may defer the filing of or suspend the use of any such Resale Registration Shelf or Prospectus, upon giving written notice of such action to the Investors with a certificate signed by the Principal Executive Officer or Principal Financial Officer of the Company stating that in the good faith judgment of the Board, the filing or use of any such Resale Registration Shelf or Prospectus covering the Registrable Securities would be seriously detrimental to the Company or its stockholders at such time (including, without limitation, because the Company reasonably and in good faith believes that there is or may be in existence material nonpublic information or events involving the Company, the failure of which to be disclosed in the prospectus contained in such Restriction Statement, or such Prospectus, could result in a violation by the Company of the Securities Act, Exchange Act any state securities law, or any rule or regulation promulgated thereunder, and disclosure of such material nonpublic information or events would be seriously detrimental to the Company or its stockholders) and that the Board concludes, as a result, that it is in the best interests of the Company and its stockholders to defer the filing or suspend the use of such Resale Registration Shelf or Prospectus at such time.  The Company shall have the right to defer the filing of or suspend the use of such Resale Registration Shelf or Prospectus for a period of not more than one hundred twenty (120) days from the date the Company notifies the Investors of such deferral or suspension; provided that the Company shall not exercise the right contained in this Section 2.1(e) more than once in any twelve month period.  In the case of the suspension of use of any effective Resale Registration Shelf or Prospectus, the Investors, immediately upon receipt of notice thereof from the Company, shall discontinue any offers or sales of Registrable Securities 4     pursuant to such Resale Registration Shelf or Prospectus until advised in writing by the Company that the use of such Resale Registration Shelf or Prospectus may be resumed.  In the case of a deferred Prospectus or Resale Registration Shelf filing, the Company shall provide prompt written notice to the Investors of (i) the Company’s decision to file or seek effectiveness of the Prospectus or Resale Registration Shelf, as the case may be, following such deferral and (ii) in the case of a Resale Registration Shelf, the effectiveness of such Resale Registration Shelf.  In the case of either a suspension of use of, or deferred filing of, any Resale Registration Shelf or Prospectus, the Company shall not, during the pendency of such suspension or deferral, be required to take any action hereunder (including any action pursuant to Section 2.2 hereof) with respect to the registration or sale of any Registrable Securities pursuant to any such Resale Registration Shelf, Company Registration Shelf or Prospectus. (f) Other Securities.  Subject to Section 2.2(e) below, any Resale Registration Shelf or Prospectus may include Other Securities, and may include securities of the Company being sold for the account of the Company; provided such Other Securities are excluded first from such Registration Statement in order to comply with any applicable laws or request from any Government Entity, Nasdaq or any applicable listing agency.  For the avoidance of doubt, no Other Securities may be included in an Underwritten Offering pursuant to Section 2.2 without the consent of the Investors. 2.2. Sales and Underwritten Offerings of the Registrable Securities. Notwithstanding any provision contained herein to the contrary, the Investors, collectively, shall and subject to the limitations set forth in this Section 2.2, (a) be permitted (i) one Underwritten Offering per calendar year, but no more than three Underwritten Offerings and eight Block Trades in total, and (ii) no more than two Underwritten Offerings or Block Trades in any twelve month period, to effect the sale or distribution of Registrable Securities. If the Investors intend to effect an Underwritten Offering or Block Trade pursuant to a Resale Registration Shelf or Company Registration Shelf to sell or (b) otherwise distribute Registrable Securities, they shall so advise the Company and provide as much notice to the Company as reasonably practicable (and, in either case, not less than fifteen (15) business days prior to the Investors’ request that the Company file a prospectus supplement to a Resale Registration Shelf or Company Registration Shelf). (c) In connection with any offering initiated by the Investors pursuant to this Section 2.2 involving an underwriting of shares of Registrable Securities, the Investors shall be entitled to select the underwriter or underwriters for such offering, subject to the consent of the Company, such consent not to be unreasonably withheld, conditioned or delayed. In connection with any offering initiated by the Investors pursuant to this Section 2.2 involving an Underwritten Offering of Registrable Securities, the (d) Company shall not be required to include any of the Registrable Securities in such underwriting unless the Investors (i) enter into an underwriting agreement in customary form with the underwriter or underwriters, (ii) accept customary terms in such underwriting agreement with regard to representations and warranties relating to ownership of the Registrable Securities and authority and power to enter into such underwriting agreement and (iii) complete and execute all questionnaires, powers of 5     attorney, custody agreements, indemnities and other documents as may be requested by such underwriter or underwriters.  Further, the Company shall not be required to include any of the Registrable Securities in such underwriting if (Y) the underwriting agreement proposed by the underwriter or underwriters contains representations, warranties or conditions that are not reasonable in light of the Company’s then-current business or (Z) the underwriter, underwriters or the Investors require the Company to participate in any marketing, road show or comparable activity that may be required to complete the orderly sale of shares by the underwriter or underwriters. If the total amount of securities to be sold in any offering initiated by the Investors pursuant to this Section 2.2 involving an underwriting of shares of (e) Registrable Securities exceeds the amount that the underwriters determine in their sole discretion is compatible with the success of the offering, then the Company shall be required to include in the offering only that number of such securities, including Registrable Securities (subject in each case to the cutback provisions set forth in this Section 2.2(e)), that the underwriters and the Company determine in their sole discretion shall not jeopardize the success of the offering.  If the Underwritten Offering has been requested pursuant to Section 2.2(a) hereof, the number of shares that are entitled to be included in the registration and underwriting shall be allocated in the following manner: (a) first, shares of Company equity securities that the Company desires to include in such registration shall be excluded and (b) second, Registrable Securities requested to be included in such registration by the Investors shall be excluded.  For the avoidance of doubt, no other person besides the Investors shall be entitled to participate in any Block Trade. To facilitate the allocation of shares in accordance with the above provisions, the Company or the underwriters may round down the number of shares allocated to any of the Investors to the nearest 100 shares. 2.3. Selling Expenses relating to securities registered on behalf of the Investors shall be borne by the Investors. Fees and Expenses.  All Registration Expenses incurred in connection with registrations pursuant to this Agreement shall be borne by the Company.  All Registration Procedures.  In the case of each registration of Registrable Securities effected by the Company pursuant to Section 2.1 hereof, the Company 2.4. shall keep the Investors advised as to the initiation of each such registration and as to the status thereof.  The Company shall use its reasonable best efforts, within the limits set forth in this Section 2.4, to: prepare and file with the Commission such amendments and supplements to such Registration Statement and the prospectuses used in connection with (a) such Registration Statement as may be necessary to keep such Registration Statement effective and current and comply with the provisions of the Securities Act with respect to the disposition of all securities covered by such Registration Statement; (b) Act, and such other documents as the Investors may reasonably request in order to facilitate the disposition of Registrable Securities; furnish to the Investors such numbers of copies of a prospectus, including preliminary prospectuses, in conformity with the requirements of the Securities (c) sky laws of such jurisdictions in use its reasonable best efforts to register and qualify the Registrable Securities covered by such Registration Statement under such other securities or blue 6     the United States as shall be reasonably requested by the Investors, provided that the Company shall not be required in connection therewith or as a condition thereto to qualify to do business or to file a general consent to service of process in any such states or jurisdictions; in the event of an Underwritten Offering or Block Trade, and subject to Section 2.2(d), enter into and perform its obligations under an underwriting (d) agreement or Block Trade sale agreement in usual and customary form (including any “lock-ups” on behalf of the Company and its directors and officers), with the managing underwriter of such offering and take such other usual and customary action as the Investors may reasonably request in order to facilitate the disposition of such Registrable Securities; (e) notify the Investors at any time when a prospectus relating to a Registration Statement covering any Registrable Securities is required to be delivered under the Securities Act of the happening of any event as a result of which the prospectus included in such Registration Statement, as then in effect, includes an untrue statement of a material fact or omits to state a material fact required to be stated therein or necessary to make the statements therein not misleading in the light of the circumstances then existing.  The Company shall use its reasonable best efforts to amend or supplement such prospectus in order to cause such prospectus not to include any untrue statement of a material fact or omit to state a material fact required to be stated therein or necessary to make the statements therein not misleading in the light of the circumstances then existing; (f) all such Registrable Securities, in each case not later than the effective date of such registration; provide a transfer agent and registrar for all Registrable Securities registered pursuant to such Registration Statement and, if required, a CUSIP number for (g) Securities, within two business days following such request; if requested by an Investor, use reasonable best efforts to cause the Company’s transfer agent to remove any restrictive legend from any Registrable (h) cause to be furnished, at the request of the Investors, on the date that Registrable Securities are delivered to underwriters for sale in connection with an Underwritten Offering or Block Trade, (i) an opinion, dated such date, of the counsel representing the Company for the purposes of such registration, in form and substance as is customarily given to underwriters in an underwritten public offering, addressed to the underwriters, and (ii) a letter or letters from the independent certified public accountants of the Company, in form and substance as is customarily given by independent certified public accountants to underwriters in an underwritten public offering, addressed to the underwriters; and (i) securities trading markets on which Common Stock is then listed. cause all such Registrable Securities included in a Registration Statement pursuant to this Agreement to be listed on each securities exchange or other 2.5. The Investors Obligations. (a) described in Section 2.4(e) hereof, the Investors shall immediately discontinue disposition of Registrable Securities pursuant to any Discontinuance of Distribution.  The Investors agree that, upon receipt of any notice from the Company of the occurrence of any event of the kind 7     Registration Statement covering such Registrable Securities until the Investors’ receipt of the copies of the supplemented or amended prospectus contemplated by Section 2.4(e) hereof or receipt of notice that no supplement or amendment is required and that the Investors’ disposition of the Registrable Securities may be resumed.  The Company may provide appropriate stop orders to enforce the provisions of this Section 2.5(a). Compliance with Prospectus Delivery Requirements.  The Investors covenant and agree that they shall comply with the prospectus delivery requirements (b) of the Securities Act as applicable to them or an exemption therefrom in connection with sales of Registrable Securities pursuant to any Registration Statement filed by the Company pursuant to this Agreement. (c) Securities to a third party as promptly as reasonably practicable, and in any event within thirty (30) days, following the sale of such Registrable Securities. Notification of Sale of Registrable Securities.  The Investors covenant and agree that they shall notify the Company following the sale of Registrable 2.6. Indemnification. (a) To the extent permitted by law, the Company shall indemnify the Investors, and, as applicable, their officers, directors, and constituent partners, legal counsel for each Investor and each Person controlling the Investors, with respect to which registration, related qualification, or related compliance of Registrable Securities has been effected pursuant to this Agreement, and each underwriter, if any, and each Person who controls any underwriter within the meaning of the Securities Act against all claims, losses, damages, or liabilities (or actions in respect thereof) to the extent such claims, losses, damages, or liabilities arise out of or are based upon (i) any untrue statement (or alleged untrue statement) of a material fact contained in any prospectus or other document (including any related Registration Statement) incident to any such registration, qualification, or compliance, or (ii) any omission (or alleged omission) to state therein a material fact required to be stated therein or necessary to make the statements therein not misleading, or (iii) any violation or alleged violation by the Company of the Securities Act, the Exchange Act, any state securities law, or any rule or regulation promulgated under the Securities Act, the Exchange Act or any state securities law applicable to the Company and relating to action or inaction required of the Company in connection with any such registration, qualification, or compliance; and the Company shall pay as incurred to the Investors, each such underwriter, and each Person who controls the Investors or underwriter, any legal and any other expenses reasonably incurred in connection with investigating or defending any such claim, loss, damage, liability, or action; provided, however, that the indemnity contained in this Section 2.6(a) shall not apply to amounts paid in settlement of any such claim, loss, damage, liability, or action if settlement is effected without the consent of the Company unless such settlement (x) includes an unconditional release of the Company, in form and substance reasonably satisfactory to the Company, from all liability on claims that are the subject matter of such proceeding and (y) does not include any statement as to or any admission of fault, culpability or a failure to act by or on behalf of the Company; and provided, further, that the Company shall not be liable in any such case to the extent that any such claim, loss, damage, liability, or expense arises out of or is based upon any violation by such Investor of the obligations set forth in Section 2.5 hereof or any untrue statement or omission contained in such prospectus or other document based upon written 8     information furnished to the Company by the Investors, such underwriter, or such controlling Person and stated to be for use therein. To the extent permitted by law, each Investor (severally and not jointly) shall, if Registrable Securities held by such Investor are included for sale in the (b) registration and related qualification and compliance effected pursuant to this Agreement, indemnify the Company, each of its directors, each officer of the Company who signs the applicable Registration Statement, each legal counsel and each underwriter of the Company’s securities covered by such a Registration Statement, each Person who controls the Company or such underwriter within the meaning of the Securities Act against all claims, losses, damages, and liabilities (or actions in respect thereof) arising out of or based upon (i) any untrue statement (or alleged untrue statement) of a material fact contained in any such Registration Statement, or related document, or (ii) any omission (or alleged omission) to state therein a material fact required to be stated therein or necessary to make the statements therein not misleading, or (iii) any violation or alleged violation by such Investor of Section 2.5 hereof, the Securities Act, the Exchange Act, any state securities law, or any rule or regulation promulgated under the Securities Act, the Exchange Act or any state securities law applicable to such Investor and relating to action or inaction required of such Investor in connection with any such registration and related qualification and compliance, and shall pay as incurred to such persons, any legal and any other expenses reasonably incurred in connection with investigating or defending any such claim, loss, damage, liability, or action, in each case only to the extent that such untrue statement (or alleged untrue statement) or omission (or alleged omission) is made in (and such violation pertains to) such Registration Statement or related document in reliance upon and in conformity with written information furnished to the Company by such Investor and stated to be specifically for use therein; provided, however, that the indemnity contained in this Section 2.6(b) shall not apply to amounts paid in settlement of any such claim, loss, damage, liability, or action if settlement is effected without the consent of such Investor unless such settlement (x) includes an unconditional release of such Investor, in form and substance reasonably satisfactory to such Investor, from all liability on claims that are the subject matter of such proceeding and (y) does not include any statement as to or any admission of fault, culpability or a failure to act by or on behalf of such Investor ; provided, further, that such Investor’s liability under this Section 2.6(b) (when combined with any amounts such Investor is liable for under Section 2.6(d)) shall not exceed such Investor’s net proceeds from the offering of securities made in connection with such registration. Promptly after receipt by an indemnified party under this Section 2.6 of notice of the commencement of any action, such indemnified party shall, if a claim (c) in respect thereof is to be made against an indemnifying party under this Section 2.6, notify the indemnifying party in writing of the commencement thereof and generally summarize such action.  The indemnifying party shall have the right to participate in and to assume the defense of such claim; provided, however, that the indemnifying party shall be entitled to select counsel for the defense of such claim with the approval of any parties entitled to indemnification, which approval shall not be unreasonably withheld; provided further, however, that if either party reasonably determines that there may be a conflict between the position of the Company and the Investors in conducting the defense of such action, suit, or proceeding by reason of recognized claims for indemnity under this Section 2.6, then counsel for such party shall be entitled to conduct the defense to the extent reasonably determined by such counsel to be necessary to protect the interest of such party.  The 9     failure to notify an indemnifying party promptly of the commencement of any such action, if prejudicial to the ability of the indemnifying party to defend such action, shall relieve such indemnifying party, to the extent so prejudiced, of any liability to the indemnified party under this Section 2.6, but the omission so to notify the indemnifying party shall not relieve such party of any liability that such party may have to any indemnified party otherwise than under this Section 2.6. If the indemnification provided for in this Section 2.6 is held by a court of competent jurisdiction to be unavailable to an indemnified party with respect to (d) any loss, liability, claim, damage, or expense referred to therein, then the indemnifying party, in lieu of indemnifying such indemnified party hereunder, shall contribute to the amount paid or payable by such indemnified party as a result of such loss, liability, claim, damage, or expense in such proportion as is appropriate to reflect the relative fault of the indemnifying party on the one hand and of the indemnified party on the other in connection with the statements or omissions that resulted in such loss, liability, claim, damage, or expense as well as any other relevant equitable considerations.  The relative fault of the indemnifying party and of the indemnified party shall be determined by reference to, among other things, whether the untrue or alleged untrue statement of a material fact or the omission to state a material fact relates to information supplied by the indemnifying party or by the indemnified party and the parties’ relative intent, knowledge, access to information, and opportunity to correct or prevent such statement or omission.  In no event, however, shall (i) any amount due for contribution hereunder be in excess of the amount that would otherwise be due under Section 2.6(a) or Section 2.6(b), as applicable, based on the limitations of such provisions and (ii) a Person guilty of fraudulent misrepresentation (within the meaning of the Securities Act) be entitled to contribution from a Person who was not guilty of such fraudulent misrepresentation. Notwithstanding the foregoing, to the extent that the provisions on indemnification and contribution contained in the underwriting agreement entered into (e) in connection with an Underwritten Offering, or the Block Trade sale agreement, are in conflict with the foregoing provisions, the provisions in the underwriting agreement or Block Trade sale agreement shall control; provided, however, that the failure of the underwriting agreement to provide for or address a matter provided for or addressed by the foregoing provisions shall not be a conflict between the underwriting agreement or the Block Trade sale agreement and the foregoing provisions.   (f) Registration Statement under this Agreement or otherwise. The obligations of the Company and the Investors under this Section 2.6 shall survive the completion of any offering of Registrable Securities in a Information.  The Investors shall furnish to the Company such information regarding the Investors and the distribution proposed by the Investors as the 2.7. Company may reasonably request and as shall be reasonably required in connection with any registration referred to in this Agreement.  The Investors agree to, as promptly as practicable (and in any event prior to any sales made pursuant to a prospectus), furnish to the Company all information required to be disclosed in order to make the information previously furnished to the Company by the Investors not misleading.  The Investors agree to keep confidential the receipt of any notice received pursuant to Section 2.4(e) and the contents thereof, except as required pursuant to applicable law.   10     Notwithstanding anything to the contrary herein, the Company shall be under no obligation to name the Investors in any Registration Statement if the Investors have not provided the information required by this Section 2.7 with respect to the Investors as a selling securityholder in such Registration Statement or any related prospectus. Rule 144 Requirements.  With a view to making available to the Investors the benefits of Rule 144 and any other rule or regulation of the Commission 2.8. that may at any time permit the Investors to sell Registrable Securities to the public without registration, the Company agrees to use its reasonable best efforts to: (a) (b) make and keep public information available, as those terms are understood and defined in Rule 144 at all times after the date hereof; file with the Commission in a timely manner all reports and other documents required of the Company under the Securities Act and the Exchange Act; (c) prior to the filing of the Registration Statement or any amendment thereto (whether pre‑effective or post‑effective), and prior to the filing of any prospectus or prospectus supplement related thereto, to provide the Investors with copies of all of the pages thereof (if any) that reference the Investors; and furnish to any Investor, so long as the Investor owns any Registrable Securities, forthwith upon request (i) a written statement by the Company that it has (d) complied with the reporting requirements of Rule 144, (ii) a copy of the most recent annual or quarterly report of the Company and such other reports and documents so filed by the Company, and (iii) such other information as may be reasonably requested by an Investor in availing itself of any rule or regulation of the Commission which permits an Investor to sell any such securities without registration. Limitations on Subsequent Registration Rights.  From and after the date of this Agreement, the Company shall not, without prior written consent of the 2.9. Investors, enter into any agreement with any holder or prospective holder of any securities of the Company which would provide to such holder rights with respect to the registration of such securities under the Securities Act or the Exchange Act that would conflict with or adversely affect any of the rights provided to the Investors in this Section 2; it being understood and agreed that any subsequent agreement of the Company with any holder or prospective holder of any securities of the Company of the same class (or convertible into or exchange for securities of the same class) as the Registrable Securities granting such Person rights under this Section 2 equivalent to the rights of the Investors under this Section 2 will not be prohibited by the terms of this Section 2.9. 3.1. each of the Company and the Investors. Amendment.  No amendment, alteration or modification of any of the provisions of this Agreement shall be binding unless made in writing and signed by 11 Section 3. Miscellaneous       Injunctive Relief.  It is hereby agreed and acknowledged that it shall be impossible to measure in money the damages that would be suffered if the parties 3.2. fail to comply with any of the obligations herein imposed on them and that in the event of any such failure, an aggrieved Person shall be irreparably damaged and shall not have an adequate remedy at law.  Any such Person shall, therefore, be entitled (in addition to any other remedy to which it may be entitled in law or in equity) to injunctive relief, including, without limitation, specific performance, to enforce such obligations, and if any action should be brought in equity to enforce any of the provisions of this Agreement, none of the parties hereto shall raise the defense that there is an adequate remedy at law. Notices.  All notices required or permitted under this Agreement must be in writing and sent to the address or email address identified below.  Notices 3.3. must be given: (a) by personal delivery, with receipt acknowledged; (b) by email followed by hard copy delivered by the methods under clause (c) or (d); (c) by prepaid certified or registered mail, return receipt requested; or (d) by prepaid reputable overnight delivery service.  Notices shall be effective upon receipt.  Either party may change its notice address by providing the other party written notice of such change.  Notices shall be delivered as follows: If to the Investors: At such Investor’s address as set forth on Schedule A hereto If to the Company: Aeglea BioTherapeutics, Inc. Attention: Chief Executive Officer E-mail: Address: 805 Las Cimas Parkway, Suite 100, Austin, TX 78746  with a copy to: Fenwick & West LLP Attention: Robert Freedman E-mail: 3.4. Governing Law; Jurisdiction; Venue; Jury Trial. (a) This Agreement shall be governed by, and construed in accordance with, the law of the State of New York without giving effect to any choice or conflict of law provision or rule (whether of the State of New York or any other jurisdiction) that would cause the application of the laws of any jurisdiction other than the State of New York. Each of the Company and the Investors irrevocably and unconditionally submits, for itself and its property, to the nonexclusive jurisdiction of the courts of (b) the State of New York sitting in the Borough of Manhattan, New York and of the United States District Court of the Southern District of New York, and any appellate court from any thereof, in any action or proceeding arising out of or relating to this Agreement and the transactions contemplated herein, or for recognition or enforcement of any judgment, and each of the Company and the Investors irrevocably and unconditionally agrees that all claims in respect of any such action or proceeding may be heard and determined in such New York state court or, to the fullest extent permitted by 12           applicable law, in such federal court.  Each of the Company and the Investors hereto agrees that a final judgment in any such action or proceeding shall be conclusive and may be enforced in other jurisdictions by suit on the judgment or in any other manner provided by law. (c) Each of the Company and the Investors irrevocably and unconditionally waives, to the fullest extent permitted by applicable law, any objection that it may now or hereafter have to the laying of venue of any action or proceeding arising out of or relating to this Agreement and the transactions contemplated herein in any court referred to in Section 3.4(b) hereof.  Each of the Company and the Investors hereby irrevocably waives, to the fullest extent permitted by applicable law, the defense of an inconvenient forum to the maintenance of such action or proceeding in any such court. EACH OF THE COMPANY AND THE INVESTORS HEREBY IRREVOCABLY WAIVES, TO THE FULLEST EXTENT PERMITTED BY (d) APPLICABLE LAW, ANY RIGHT IT MAY HAVE TO A TRIAL BY JURY IN ANY LEGAL PROCEEDING DIRECTLY OR INDIRECTLY ARISING OUT OF OR RELATING TO THIS AGREEMENT OR THE TRANSACTIONS CONTEMPLATED HEREBY (WHETHER BASED ON CONTRACT, TORT OR ANY OTHER THEORY).  EACH OF THE COMPANY AND THE INVESTORS (A) CERTIFIES THAT NO REPRESENTATIVE, AGENT OR ATTORNEY OF ANY OTHER PERSON HAS REPRESENTED, EXPRESSLY OR OTHERWISE, THAT SUCH OTHER PERSON WOULD NOT, IN THE EVENT OF LITIGATION, SEEK TO ENFORCE THE FOREGOING WAIVER AND (B) ACKNOWLEDGES THAT EACH OF THE COMPANY AND THE INVESTORS HAS BEEN INDUCED TO ENTER INTO THIS AGREEMENT BY, AMONG OTHER THINGS, THE MUTUAL WAIVERS AND CERTIFICATIONS IN THIS SECTION. Successors, Assigns and Transferees.  Any and all rights, duties and obligations hereunder shall not be assigned, transferred, delegated or sublicensed by 3.5. any party hereto without the prior written consent of the other party; provided, however, that the Investors shall be entitled to transfer Registrable Securities to one or more of their affiliates and, solely in connection therewith, may assign their rights hereunder in respect of such transferred Registrable Securities, in each case, so long as such Investor is not relieved of any liability or obligations hereunder, without the prior consent of the Company.  Any transfer or assignment made other than as provided in the first sentence of this Section 3.5 shall be null and void.  Subject to the foregoing and except as otherwise provided herein, the provisions of this Agreement shall inure to the benefit of, and be binding upon, the successors, permitted assigns, heirs, executors and administrators of the parties hereto.  The Company shall not consummate any recapitalization, merger, consolidation, reorganization or other similar transaction whereby stockholders of the Company receive (either directly, through an exchange, via dividend from the Company or otherwise) equity (the “Other Equity”) in any other entity (the “Other Entity”) with respect to Registrable Securities hereunder, unless prior to the consummation thereof, the Other Entity assumes, by written instrument, the obligations under this Agreement with respect to such Other Equity as if such Other Equity were Registrable Securities hereunder. 3.6. hereof and all previous Entire Agreement.  This Agreement, together with any exhibits hereto, constitute the entire agreement between the parties relating to the subject matter 13     agreements or arrangements between the parties, written or oral, relating to the subject matter hereof are superseded. Waiver.  No failure on the part of either party hereto to exercise any power, right, privilege or remedy under this Agreement, and no delay on the part of 3.7. either party hereto in exercising any power, right, privilege or remedy under this Agreement, shall operate as a waiver thereof; and no single or partial exercise of any such power, right, privilege or remedy shall preclude any other or further exercise thereof or of any other power, right, privilege or remedy. Severability.  If any part of this Agreement is declared invalid or unenforceable by any court of competent jurisdiction, such declaration shall not affect 3.8. the remainder of the Agreement and the invalidated provision shall be revised in a manner that shall render such provision valid while preserving the parties’ original intent to the maximum extent possible. 3.9. Titles and Subtitles.  The titles and subtitles used in this Agreement are used for convenience only and are not to be considered in construing or interpreting this Agreement.  All references in this Agreement to sections, paragraphs and exhibits shall, unless otherwise provided, refer to sections and paragraphs hereof and exhibits attached hereto. 3.10. counterparts (including by facsimile or other electronic means), and all of which together shall constitute one instrument. Counterparts.  This Agreement may be executed in any number of counterparts, each of which shall be enforceable against the parties that execute such Term and Termination.  The Investors’ rights to demand the registration of the Registrable Securities under this Agreement, as well as the Company’s 3.11. obligations hereunder other than pursuant to Section 2.6 hereof, shall terminate automatically once all Registrable Securities cease to be Registrable Securities pursuant to the terms of this Agreement. [Remainder of Page Intentionally Left Blank; Signature Page Follows] 14         IN WITNESS WHEREOF, the parties hereto have executed this Registration Rights Agreement effective as of the day, month and year first above written. AEGLEA BIOTHERAPEUTICS, INC. By: Quinn         Name: Quinn Title: Chief Executive Officer /s/Anthony Anthony [Signature Page to Registration Rights Agreement]             IN WITNESS WHEREOF, the parties hereto have executed this Registration Rights Agreement effective as of the day, month and year first above written. BAKER BROS. ADVISORS LP, management company and investment adviser to 667, L.P., pursuant to authority granted to it by Baker Biotech Capital, L.P., general partner to 667, L.P., and not as the general partner /s/Scott L. 667, L.P. By: By: Lessing L. Lessing BAKER BROTHERS LIFE SCIENCES, L.P. By: BAKER BROS. ADVISORS LP, management company and investment adviser to BAKER BROTHERS LIFE SCIENCES, L.P., pursuant to authority granted to it by Baker Brothers Life Sciences Capital, L.P., general partner to BAKER BROTHERS LIFE SCIENCES, L.P., and not as the general partner By: Lessing L. Lessing /s/Scott L. Scott President Scott President FW/11855139.3 [Signature Page to Registration Rights Agreement]             Schedule A The Investors 667, L.P. BAKER BROTHERS LIFE SCIENCES, L.P.] To the above Investors: Baker Brothers Investments  860 Washington Street  New York, NY 10014 Attn: Scott Lessing Email: With a copy to: Akin Gump Strauss Hauer & Feld LLP  Attn: Jeffrey Kochian  Email: One Bryant Park  New York, NY 10036-6745 FW/11855139.3             Subsidiaries of Aeglea BioTherapeutics, Inc. Exhibit 21.1 Name of Subsidiary Aeglea Development Company, Inc. AERase, Inc. AECase, Inc. AEMase, Inc. AE4ase, Inc. AE5ase, Inc. AE6ase, Inc. Aeglea Biotherapeutics UK Limited Aeglea Ireland Limited    Jurisdiction    Delaware    Delaware    Delaware    Delaware    Delaware    Delaware    Delaware England and Wales   Ireland                                                          CONSENT OF INDEPENDENT REGISTERED PUBLIC ACCOUNTING FIRM Exhibit 23.1 We hereby consent to the incorporation by reference in the Registration Statements on Form S-3 (No. 333-239706 and 333-228967) and Form S-8 (No. 333-210633, 333-216903, 333- 223614, 333-230137 and 333-236584) of Aeglea BioTherapeutics, Inc. of our report dated March 18, 2021 relating to the financial statements, which appears in this Form 10-K. /s/ PricewaterhouseCoopers LLP Austin, Texas March 18, 2021   Exhibit 31.1 Certification of Periodic Report under Section 302 of the Sarbanes-Oxley Act of 2002 I, Anthony G. Quinn, M.B. Ch.B. Ph.D., certify that: 1. 2. 3. 4. I have reviewed this Annual Report on Form 10-K of Aeglea BioTherapeutics, Inc.; Based on my knowledge, this report does not contain any untrue statement of a material fact or omit to state a material fact necessary to make the statements made, in light of the circumstances under which such statements were made, not misleading with respect to the period covered by this report; Based on my knowledge, the financial statements, and other financial information included in this report, fairly present in all material respects the financial condition, results of operations and cash flows of the registrant as of, and for, the periods presented in this report; I am responsible for establishing and maintaining disclosure controls and procedures (as defined in Exchange Act Rules 13a-15(e) and 15d-15(e)) and internal control over financial reporting (as defined in Exchange Act Rules 13a-15(f) and 15d-15(f)) for the registrant and have: a. b. c. d. Designed such disclosure controls and procedures, or caused such disclosure controls and procedures to be designed under our supervision, to ensure that material information relating to the registrant, including its consolidated subsidiaries, is made known to us by others within those entities, particularly during the period in which this report is being prepared; Designed such internal control over financial reporting, or caused such internal control over financial reporting to be designed under our supervision, to provide reasonable assurance regarding the reliability of financial reporting and the preparation of financial statements for external purposes in accordance with generally accepted accounting principles; Evaluated the effectiveness of the registrant’s disclosure controls and procedures, and presented in this report our conclusions about the effectiveness of the disclosure controls and procedures, as of the end of the period covered by this report based on such evaluation; and Disclosed in this report any change in the registrant’s internal control over financial reporting that occurred during the registrant’s most recent fiscal quarter (the registrant’s fourth fiscal quarter in the case of an annual report) that has materially affected, or is reasonably likely to materially affect, the registrant’s internal control over financial reporting; and 5. I have disclosed, based on our most recent evaluation of internal control over financial reporting, to the registrant’s auditors and the audit committee of the registrant’s board of directors (or persons performing the equivalent functions): a. b. All significant deficiencies and material weaknesses in the design or operation of internal control over financial reporting which are reasonably likely to adversely affect the registrant’s ability to record, process, summarize and report financial information; and Any fraud, whether or not material, that involves management or other employees who have a significant role in the registrant’s internal control over financial reporting. Date: March 18, 2021 /s/ Anthony G. Quinn, M.B. Ch.B, Ph.D. Anthony G. Quinn, M.B. Ch.B, Ph.D. President, Chief Executive Officer and Director (Principal Executive Officer and Principal Financial Officer)                     Certification Of Principal Executive Officer and Principal Financial Officer Pursuant To 18 U.S.C. Section 1350, As Adopted Pursuant To Section 906 of The Sarbanes-Oxley Act Of 2002 Exhibit 32.1 In connection with the Annual Report of Aeglea BioTherapeutics, Inc. (the “Company”) on Form 10-K for the year ended December 31, 2020, as filed with the Securities and Exchange Commission on the date hereof (the “Report”), I, Anthony G. Quinn, M.B. Ch.B. Ph.D., President and Chief Executive Officer of the Company, certify, pursuant to 18 U.S.C. Section 1350, as adopted pursuant to Section 906 of the Sarbanes-Oxley Act of 2002, that to my knowledge: 1) 2) The Report fully complies with the requirements of Section 13(a) or 15(d) of the Securities Exchange Act of 1934; and The information contained in the Report fairly presents, in all material respects, the financial condition of the Company at the end of the period covered by the Report and results of operations of the Company for the period covered by the Report. Date: March 18, 2021 /s/ Anthony G. Quinn, M.B. Ch.B, Ph.D. Anthony G. Quinn, M.B. Ch.B, Ph.D. President, Chief Executive Officer and Director (Principal Executive Officer and Principal Financial Officer)       

Continue reading text version or see original annual report in PDF format above